山东地区汉族人群34个Y-STR基因座的遗传多态性
2017-03-28王新杰高智伟黄磊许欣
王新杰,高智伟,黄磊,许欣
(1.潍坊市公安局,山东潍坊 261061;2.山东省公安厅,山东济南 250001)
·研究简报·
山东地区汉族人群34个Y-STR基因座的遗传多态性
王新杰1,高智伟1,黄磊2,许欣1
(1.潍坊市公安局,山东潍坊 261061;2.山东省公安厅,山东济南 250001)
法医遗传学;多态现象,遗传;Y染色体;短串联重复序列;汉族;山东
Y染色体具有男性特有、父系遗传及单倍型遗传的特征,在法医学检验中作用独特。本研究调查了山东地区汉族男性34个Y-STR基因座的遗传多态性,以期为法医学应用及相关研究与实践提供基础数据。
1 材料与方法
收集山东地区1000名身体健康、无父系亲缘关系的汉族男性个体FTA卡血样(均知情同意),采用Chelex-100法提取DNA。复合扩增引物序列参照基因库及相关文献[1,2],由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。PCR扩增程序同AmpFℓSTR®MiniFilerTMPCR扩增试剂盒(美国AB公司),扩增体积为10μL。使用5Dye Matrix标准品(无锡中德美联生物技术有限公司)对3130xl DNA测序仪进行光谱校正,以DNA标准品007、9948的分型结果作为对照,自行制备Ladder并编写panel及Bin,用GeneMapper ID 3.2软件进行基因分析。基因多样性(gene diversity,GD)按照公式GD=[n(1-∑Pi2)]/(n-1)计算,其中n为所检验的样本数量,Pi为等位基因频率。
2 结果与讨论
1000 名山东地区无父系亲缘关系汉族男性个体在34个Y-STR基因座中检出的等位基因及GD值见表1~2。34个Y-STR基因座共检出999种单倍型,GD值达0.999 998 999,高于目前报道的商品化试剂盒[3],且该复合扩增体系易于扩增,因此在法医学上有重要应用价值,适合于性犯罪案件中混合斑男性成分检测及男性家系亲缘鉴定及家族排查。在部分样品中,发现在一个基因座上有多个等位基因,与有关文献[4]报道一致,为Y染色体复制异常所致。
表1 山东地区汉族男性34个Y-STR基因座等位基因频率和基因多样性(n=1000)
续表1
续表1
表2 山东地区汉族男性34个Y-STR基因座的GD值(n=1000)
[1]Hanson EK,Ballantyne J.An ultra-high discriminationYchromosomeshorttandemrepeatmultiplex DNA typing system[J].PLoS One,2007,2(8):e688.
[2]李保林,高玉振,谷振勇.华东地区汉族人群6个Y-STR遗传多态性[J].中国法医学杂志,2010,25(4):274-275.
[3]王新杰,罗莉静,黄磊,等.29个Y-STR基因座复合扩增体系的建立[J].法医学杂志,2015,31(6):456-461.
[4]Butler JM.法医DNA分型专论:方法学[M].第3版.侯一平,李成涛,译.北京:科学出版社,2012:328.
DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2017.01.018
1004-5619(2017)01-0077-03
2015-07-01)
(本文编辑:李成涛)
王新杰(1973—),男,副主任法医师,主要从事法医物证学检验;E-mail:wfxjfy@aliyun.com