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piRNA在生殖系统中的研究进展

2016-03-09赵鸿娟王亚楠高树军张媛媛李光鹏王煜

国际妇产科学杂志 2016年5期
关键词:转座子生殖细胞果蝇

赵鸿娟,王亚楠,高树军,张媛媛,李光鹏,王煜

普通妇科疾病及相关研究

piRNA在生殖系统中的研究进展

赵鸿娟,王亚楠,高树军,张媛媛,李光鹏,王煜△

Piwi蛋白相互作用RNA(piRNA)是一类长度约为30个核苷酸的非编码RNA。目前研究提示piRNA通过与PIWI蛋白家族成员结合后,参与异染色质形成、生殖细胞的发育和维持DNA的完整性。piRNA与小干扰RNA(siRNA)及微小RNA(miRNA)均是近些年发现的非编码小RNA,在功能、分布和分子特征等方面存在着显著不同。piRNA在精子的发生过程中起着重要的生理调节作用,目前对于piRNA的研究逐渐深入,认识也进一步提高。例如,piRNA的结构特点,发挥功能相关作用蛋白,在体内的分布与表达,在生物体内与PIWI发挥作用的方式以及功能。piRNA数据库的建立将对此类小分子RNA的研究有很大的促进作用。

RNA,未翻译;生殖细胞;微RNAs;RNA,小分子干扰;piRNA

(JInt Obstet Gynecol,2016,43:576-580)

近年来,RNA的研究已成为生命科学领域的一个重要的热点,作为一类新型的小RNA,Piwi蛋白相互作用RNA(Piwi-interacting RNA,piRNA)受到了广泛关注。piRNA主要分布在动物体睾丸的精原细胞和卵巢的卵母细胞内,果蝇卵巢体细胞(卵泡细胞)也存在少量的piRNA。从2006年发现至今,科研工作者对piRNA的发生和功能做了大量的推测、探索和验证,例如在生殖细胞、干细胞及肿瘤的发生等方面。piRNA的功能主要是维持基因组中转座子的正常沉默状态,以防止基因组中转座子爆发而引起相应基因的改变。Piwi蛋白是Argonaute(AGO)蛋白家族的一个亚家族,文献表明piRNA通过与PIWI蛋白形成复合物调控基因表达,但其具体功能和机制尚在探索中。

1 piRNA的发现及结构特点

piRNA是一类长度约24~33个核苷酸(nt)的小RNA[1],2006年,Aravin等[2]通过吸附柱法从3个月大的C57BL/6J雄性小鼠生殖细胞中发现了piRNA,产生于精子发生的粗线期精母细胞到圆形精子细胞的过程中,每个生殖细胞中约有100万个piRNA分子。

piRNA在体细胞中的生物发生过程相对简单,在卵泡细胞中的初级生物合成过程中,解旋酶Armitage(Arm)、解旋酶/tudor结构域蛋白Yb(Y-box Binding)和核酸酶Zucchini(Zucc)都是必需的[3],缺少其一,piRNA的合成将受到抑制。此外,Zucc还参与piRNA的成熟过程。“乒乓模型”是果蝇卵母细胞中从转座子衍生piRNA中发现的,在动物生殖细胞中普遍存在。Betel等[4]通过分析比较一系列已知的小鼠精子发生过程粗线期piRNA的序列,表明piRNA的序列多样性和生物起源机制。得出如下结论:①在小鼠睾丸中的piRNA至少有4个时期;②piRNA来源于长的前体合成,由位于5′末端的微弱序列信号产生大量的不同序列所引导的拟随机的酶催化过程而产生的;③许多piRNA簇包括反相重复序列,从而能够形成反相折叠的双股RNA片段,也可能起始piRNA的过程类似于转位子沉默。

与微小RNA(microRNA,miRNA)和小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)一样,piRNA的5′端富含尿嘧啶(U,约86%),对U呈高度保守。而与miRNA和siRNA不同的是,piRNA以高度特异链的方式对应于基因组,且主要是单链基因组位点,其表达有组织特异性,调控生殖细胞及干细胞的生长发育;在染色体上的分布极其不均匀,在基因区及基因序列区少见,多见于在基因间隔区[5]。piRNA的3′端甲基化现象明显,甲基化限制了3′端的加工范围,影响piRNA与通路中其他组分的相互作用,增加了piRNA的稳定性,但国外学者通过由BmN4细胞体系(一种蚕卵巢来源的细胞系)的裂解液建立的无细胞体系证明3′端甲基化并不是决定成熟piRNA长度的必要条件[6]。

2 piRNA功能发挥相关蛋白

目前研究认为,Tudor蛋白家族、Arm、Yb,Zucc,Miwi2(小鼠)、Mili(Miwi亚族成员),Aub、Ago3(果蝇)都是与piRNA功能相关的蛋白;MVH(mouse vasa homologue)是一个ATP依赖的RNA解旋酶。Vasa/MVH对于“乒乓循环”及Miwi2与piRNA的结合是必需的。Rhino是果蝇转座子沉默以及通过“乒乓循环”有效扩增piRNA所必需的。Kowalezykiewicz等[7]通过研究比较猪发育过程中piwi与piRNA的选择性表达,发现piRNA与Argonaute蛋白家族形成复合体发挥作用,后者主要包括Piwil1、Piwi4和Piwi2。目前发现它们只在性腺组织中表达,调控精子的发生、敲除Piwil1、Piwi4或Piwi2基因的小鼠表现为雄性不育。

piRNA蛋白与雄性生殖密切相关,其突变可以导致不育,并呈现出完全基因敲除的症状。国外学者建立MitoPLD突变小鼠模型,精子发生过程中减数分裂中断,转座子去甲基化和去抑制发生,初级piRNA生物合成发生缺陷,由此推论MitoPLD/Zuc在piRNA生物合成通路及线粒体细胞膜代谢或信号中发挥不可或缺的保障作用[8]。果蝇基因Spindle E(Spn-E)、Maelstrom(Mael)和Krimper的突变会降低基因组的稳定性及生殖细胞不同程度发育障碍。Piwil2基因启动子区高度甲基化能导致其蛋白表达沉默,并影响piRNA的产生,导致人类精子发生异常[9]。重复相关小干扰RNA(repeat-associated siRNAs,rasiRNA)相关的蛋白质PIWI是调节果蝇卵巢体细胞中gypsy序列沉默的必要条件[10]。

Piwi/piRNA在雄性生殖细胞发育过程中起重要作用,单链特异性的核酸内切酶Zuc(或MitoPLD)可能参与了初级piRNA 5′端的加工成熟;MOV10L1(a putative DExD-box helicaseMOV10-like-1)在生殖细胞中特异性表达,与Miwi、Mili及HSPA2(heatshock 70-kD protein 2)等存在相互作用;Mael是一种HMG-box(highmobility group box)蛋白,与Miwi和Mili存在相互作用,并且定位在拟染色体中;GASZ(Germ cell protein with Ankyrin repeats,Sterile alpha motif,and leucine Zipper)与Mili共同定位于线粒体中,并且对于稳定Mili是至关重要的[11]。

此外,piwi基因的突变可使干细胞分化和卵子生成终止。在生殖细胞中,PIWI蛋白的突变可以减少干细胞的分裂能力,但不会完全阻滞卵细胞的演进。Miwi突变并不影响雌鼠生育能力。最近研究表明,雌性生殖细胞中的其他通路可能对PIWI蛋白的缺失起到弥补作用[12],但具体机制尚不明确。Lim等[13]研究发现,Piwil2、Piwil4及Mael在人、大鼠及鸭嘴兽卵巢的卵母细胞及支持细胞中存在表达,而大鼠及鸡的卵巢中不表达Piwil。

3 piRNA的分布与表达

piRNA在生殖系统中发挥重要作用,雄鼠胚胎睾丸中,Mili独立参与piRNA的“乒乓模型”扩增,而在成年小鼠卵巢获取的cDNA中未能检测到Miwi的存在,而在初级和次级卵泡中却仍发现MIWI蛋白存在,因此认为MIWI蛋白的翻译可能发生在原始卵泡中。

Kwon等[14]研究对比29份来自于人体不同部位线粒体基因组中的piRNA序列,其中12个piRNA与7个不同的tRNA的茎环结构相匹配,通过检测线粒体中特异性小RNA序列数据集分析其在线粒体这样的亚细胞结构中的实际表达情况,其中大多数piRNA与人线粒体基因组所特有的多能长转录体(表达序列标签)有重叠区。

Yan等[15]通过高通量分析超过130只果蝇、小鼠和恒河猴的小RNA序列,结果证实了piRNA在这3种生物中的广泛分布,在小鼠胰腺和恒河猴附睾,piRNA在生殖细胞中是相互兼容的。原位杂交实验显示,piRNA与Piwi家族基因mRNA的表达在恒河猴组织中共定位,通过蛋白质印迹(Western blot)了解到小鼠胰腺Miwi蛋白的表达。这些发现均显示piRNA可能在生殖细胞之外也发挥重要作用。戴爱琴等[16]采用实时聚合酶链反应(RT-PCR)克隆了狼山鸡睾丸组织中Piwi基因的CDS,构建含有增强型绿色荧光蛋白(EGFP)报告基因的融合表达载体pEGFP-C1-Piwi,脂质体PEI介导基因转染NIH-3T3细胞,同时构建pcDNA 3.1-Piwi真核细胞表达载体,采用细胞间接免疫荧光方法检测PIWI蛋白在NIH-3T3细胞的表达部位,研究发现,融合表达载体pEGFP-C1-Piwi在整个细胞中都有表达;而间接免疫荧光法检测到pcDNA 3.1-Piwi载体主要在NIH-3T3细胞质中表达,PIWI蛋白主要在细胞质中表达。

4 piRNA的作用方式

piRNA特异与Piwi家族蛋白相互作用形成Piwi/piRNA信号通路,再通过沉默转座元件和调控编码mRNA等方式在动物生殖细胞发育分化过程中发挥重要作用[9]。piRNA招募组蛋白甲基化酶使常染色质发生异染色质化后,可指导细胞核中PIWI蛋白转录[17]。piRNA簇与PIWI蛋白结合后可引导抑制性标记物组蛋白H3的三甲基化赖氨酸9(trimethylated lysine 9 ofhistone 3,H3K9me3)在靶基因上定位,H3K9me3能识别piRNA簇,被组蛋白甲基化转移酶SetDB1(histone methyltransferase SetDB1)催化后储存于piRNA簇中。

Piwi是母源性极性颗粒的组成部分,在果蝇生殖细胞系中发挥决定性作用,Megosh等[18]发现,母源性Piwi的减少会阻碍原始生殖细胞的形成,而Osk(Oskar)或Vasa的表达及腹部构造并不受其影响。母源性Piwi成双倍或三倍时会相应地提升Osk和Vasa的水平,原始生殖细胞数量也会相应增加。PIWI蛋白可与piRNA形成piRNA诱导的复合物(piRNA-induced silencing complex,pi-RISC)沉默同源的转座子,对生殖干细胞的自我更新和配子的发育有重要作用。piRNA指导PIWI蛋白逆转录转座子的合成,通过“乒乓循环”逐渐被分解至转录后沉默[19]。逆转录转座子转录物的分解表明,次级piRNA 5′末端会指导PIWI蛋白结合到初级piRNA,因此放大初级piRNA。

piRNA对于生殖系干细胞性的维持及DNA完整性的保持发挥重要作用,在果蝇早期胚胎时期母源性mRNA通过piRNA途径脱腺苷酸和降解。卵母细胞到合子期转变的过程中,一系列的母源性mRNA逐渐降解,RNA结合蛋白Smaug和脱腺苷酸激酶CCR4以及小RNA簇在合子中的表达决定了果蝇母源性mRNA的降解。例如,CCR-4调节Nanos(nos)腺苷酸化依赖于piRNA途径的组成,包括piRNA对于nos 3′端非翻译区的特定补充。Aubergine是piRNA途径当中Argonaute蛋白的一种,与Smaug、CCR4、nosmRNA以及piRNA相结合,并且在大多数胚胎当中其目标区域为nos3′端非翻译区。因此提出如下可能性,即piRNA和相关蛋白与Smaug共同发挥作用,使CCR4脱腺苷酸化与特异性mRNA结合,从而促进其降解。

Mili和Miwi也都与piRNA结合,敲除这2个基因可以阻滞piRNA的产生。在精子形成过程中,两者的突变不影响倍增,但是在染色体分离阶段有着巨大的影响。Miwi表达在粗线期精母细胞到长形精子细胞形成的过程中,Zhao等[20]发现,精子发生晚期piRNA引起Miwi泛素化,并通过后期促进复合物/细胞周期体(anaphase-promoting complex/cyclosome,APC/C)途径将其移除;Miwi是APC/C的底物,piRNA结合到Miwi上才能通过APC/C途径进行泛素降解,同时Miwi的构象会发生改变,APC10与其相互结合的能力也得到加强,进而引发APC/C途径所介导的泛素水解效应。piRNA是泛素蛋白体系清除MIWI/piRNA系统的关键组成部分,适时调节雄性生殖细胞中的Miwi/piRNA对生殖的细胞发育十分重要。Miwi2在精子成熟阶段一过性表达,其突变可以导致组蛋白2A变异体(histone family 2A variant,H2AX)的染色,DNA断裂受损。

对来源于3种哺乳动物的小RNA进行分析,进一步了解piRNA扩增机制,发现这些动物中分离得到的指导piRNA的目标序列上都伴随着短序列核苷酸的产生,这些短序列核苷酸都有着准确的长度(19 nt),对指导piRNA有着特殊的空间关系。Stat3/ Bcl-xL和Stat3/Cyclin D1作为Piwil2的两个信号通路,与Piwil2的作用是相互独立的,Piwil2的过度表达使内源性RNA干扰机制被激活,从而直接导致Stat3/Bcl-xL的激活与Stat3/Cyclin D1的增强,使凋亡抑制因子和细胞分裂调控因子表达增加。Lu等[21]的实验证明Piwil2能抑制细胞凋亡,引起肿瘤发生,主要是因为抑制p53调节STAT3信号转导通路。由此可以考虑能否通过抑制Piwil2的表达来治疗肿瘤。

5 piRNA的功能研究

自piRNA发现以来,对于其功能的探究也从未间断,推测其功能主要有3个方面[5]:①沉默转录基因过程,维持转座子沉默,果蝇中存在Aub-associatepiRNA的沉默机制,蛋白Piwi和Aub两种亚型可作为早期胚胎生殖细胞建立中的母系因子。卵巢中的Aub来源于基因间的重复元件,包括逆转录转座子,而睾丸中的Aub联合着不同的piRNA。②维持生殖系和干细胞功能,Piwi是一个表观遗传因子,雄性生殖系中,PIWI蛋白能够阻止逆转录转座子的转录,表明piRNA可能与后生调控有关。Piwi基因的突变可以使得干细胞分化和卵子生成终止。③调节翻译和mRNA的稳定性。Vourekas等[22]证明精子细胞中Miwi参与一些基因mRNA的正向调控,敲除Miwi会下调这些mRNA稳定性和翻译活性。

piRNA与雄性生殖能力密切相关,陈蓉等[23]研究发现鹌鹑Piwi1具有睾丸特异性,除精原细胞外,主要存在于生殖细胞的细胞质中,表明Piwi1蛋白有可能参与调控精子发生过程。在果蝇生殖细胞系中,piRNA通过调节转录后逆转录因子沉默来调控生殖细胞的发育;在黑腹果蝇生殖细胞系中,piRNA引起核染色质沉默,对核染色质靶位点进行修饰[24]。李洁等[25]通过检测男性不育症患者精浆中存在的睾丸特异piRNA与精子DNA损伤程度的关系,探讨其对精子DNA完整性及辅助生殖技术(ART)效果的影响,发现男性不育症患者存在精子DNA不同程度的损伤,精浆中piRNA的水平与精子DNA完整性有关,DNA完整性差的患者精浆piRNA表达降低可能影响ART结局。Atikukke等[26]通过探究果蝇周期蛋白J(Cyclin J,CycJ)在卵子发生过程中基因与piRNA途径的互相作用,发现CycJ与piRNA存在相互作用,推测CycJ在卵泡发生早期的发生作用,表明CycJ在piRNA途径中对于卵子生成和成熟有调节作用。Rajan等[27]研究发现,miRNA和piRNA对于Akt信号通路有调节作用,miRNA/piRNA的修饰都会造成Akt通路改变。

此外,piRNA在癌症治疗中的应用研究也从未间断,piRNA-Piwi通路作为肿瘤治疗靶点得到广泛关注,piRNA-Piwi通路在肿瘤干细胞(tumor stem cell,TSC)中高表达,可能在肿瘤发生发展中抑制凋亡通路、提高耐药性、扰乱miRNA系统以及维持TSC的干性与过度甲基化[28]。Piwi蛋白可广泛表达于多种肿瘤组织和细胞系中,如乳腺癌、宫颈癌等[29]。乳腺癌中发现了Piwil2蛋白的高表达,Piwil2启动核苷酸切除修复的机制,直接修复损伤的DNA片段,一定程度上提高了肿瘤的耐药性[30]。使用甲基化酶抑制剂与热休克蛋白90抑制剂可抑制piRNAPiwi通路[28]。Chu等[31]通过检测piRNA微序列探究3个膀胱癌组织及其邻近正常组织中总体piRNAs的表达,通过3′非翻译区序列互补的方法,预测piRNA目标基因。结果显示,在膀胱癌组织中,106个piRNA的表达水平上调,91个下调。

6 结语

综上所述,随着发现多个piRNA在生殖系统、其他组织器官以及病理生理状态的差异表达,piRNA可能发挥着重要的调控作用,有可能成为疾病诊断或预测的小分子标记物。

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Research Progressof piRNA in the Reproductive System

ZHAOHong-juan,WANGYa-nan,GAOShu-jun,ZHANGYuan-

yuan,LIGuang-peng,WANGYu.InnerMongoliaMedicalUniversity Affiliated Hospital,Hohhot010050,China(ZHAOHong-juan,WANGYu);Research Center for Laboratory AnimalScienceof InnerMongoliaUniversity,Hohhot010070,China(WANGYa-nan,LI Guang-peng);Collegeof Life Science,InnerMongoliaUniversity,Hohhot010021,China(GAOShu-jun,ZHANGYuan-yuan)

WANGYu,E-mail:wuai1544@163.com

Piwi-interacting RNA(piRNA)is a group of small RNAs about 30 nucleotides length that isolated from mammalian reproductive cells,which could bind to the Piwi proteins and regulate its corresponding function.piRNA mainly participates in the process of development of germ cells,silence of transposon,formation of heterochromatin,DNA integrity of germ cells,and so on.It contributes to steady heredity of hereditary substance.As small interfering RNA(siRNA),microRNA(miRNA)and piRNA is a kind of non-coding small RNAs founded in recent years.However,they are different in functions,gene distributionsand characteristics.piRNA isessential for physiologicalmodulation ofspermiogenesis.The research of piRNA was further investigated,such as structural features,distribution and interactionswith PIWIproteins.Furthermore,establishment ofpiRNA databasewill facilitate scientific research ofpiRNA.

RNA,untranslated;Germ cells;MicroRNAs;RNA,small interfering;PiRNA

2015-07-29)

[本文编辑王琳]

国家自然科学基金(81560260);内蒙古自治区自然科学基金[2014MS0346,2015MS08125,2016MS(LH)0813];MERCK CREATE基金(2014)

010050呼和浩特,内蒙古医科大学附属医院(赵鸿娟,王煜);内蒙古大学实验动物中心(王亚楠,李光鹏);内蒙古大学生命科学学院(高树军,张媛媛)

王煜,E-mail:wuai1544@163.com

△审校者

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