苏州地区汉族和哈尼族人群17个STR基因座的遗传多态性
2015-12-23李忠杰吴虎吴海军周如华
李忠杰,吴虎,吴海军,周如华
(1.张家港市公安局刑事科学技术室,江苏张家港 215600;2.苏州市公安局刑事科学技术研究所,江苏苏州 215131)
·研究简报·
苏州地区汉族和哈尼族人群17个STR基因座的遗传多态性
李忠杰1,吴虎1,吴海军1,周如华2
(1.张家港市公安局刑事科学技术室,江苏张家港 215600;2.苏州市公安局刑事科学技术研究所,江苏苏州 215131)
法医遗传学;多态现象,遗传;STR;苏州;哈尼族
本研究采用AGCU 17+1 STR荧光检测试剂盒(无锡中德美联生物技术有限公司),对苏州地区哈尼族人群进行17个STR基因座的遗传多态性调查,获取了相关的群体遗传学参数,并与本地区汉族人群进行比较,旨在为该地区哈尼族人群的法医学个人识别和亲子鉴定以及群体遗传学研究提供基础数据。
图4为不同氧气分压制备样品XRD谱图及二硫化钼、三氧化钼XRD标准谱图。图4中曲线0.5 MPa、0.8 MPa、1.2 MPa与二硫化钼、三氧化钼标准曲线对比知,0.5 MPa曲线与二硫化钼标准曲线完全相同,证明0.5 MPa样品金属钼赋存状态为二硫化钼;0.8 MPa曲线、1.2 MPa曲线与三氧化钼标准曲线基本完全相同,证明氧气分压为0.8 MPa、1.2 MPa条件下制备样品中金属钼赋存状态三氧化钼。
1 材料与方法
苏州地区2 000名汉族无关个体口腔拭子样本(男性1640例,女性360例),215名哈尼族无关个体口腔拭子样本(男性186例,女性29例),均来自实验室日常建库工作积累。PCR扩增采用AGCU 17+1 STR荧光检测试剂盒,总反应体系10μL,在9700型扩增仪(美国AB公司)上对17个基因座进行复合扩增,取1μL扩增产物与0.5μL内标SIZ500和9.5μL去离子甲酰胺混合,置3500XL遗传分析仪(美国AB公司)上进行全自动毛细管电泳,用GeneMapper® ID-X软件进行等位基因分型。应用Modified-Powerstates软件[1]对数据进行处理,得到17个STR基因座的等位基因频率、观察杂合度(Ho)、多态信息含量(PIC)、个人识别率(DP)、非父排除率(PE)、典型亲权指数(TPI)以及Hardy-Weinberg平衡检验的结果。按文献[2]的方法计算期望杂合度(He)、累积个人识别率(CDP)、累积非父排除率(CPE)。不同民族人群间等位基因频率分布差异用SPSS 13.0统计软件进行χ2检验,检验水准α=0.05。
党的十八大以来,以习近平同志为核心的党中央高度重视党的纪律建设,把纪律建设提升到了全面从严治的高度,并不断贯彻落实习近平关于党的纪律建设讲话的精神实质,党的纪律建设全面加强。党的十九大更是在总结历史创新经验基础上,首次将纪律建设纳入党的建设总体布局并写入党章,彰显了以习近平同志为核心的党中央坚持用纪律管党治党的决心和意志。
2 结果与讨论
苏州地区2000名汉族无关个体在17个STR基因座中共观察到227种等位基因和995种基因型,215名哈尼族无关个体在17个STR基因座中共观察到172种等位基因和584种基因型,等位基因及其频率分布见表1,经用Modified-Powerstates软件检验,调查的各基因座符合Hardy-Weinberg平衡(P〉0.05),表明该群体调查资料具有可靠性和科学性。各基因座的常用群体遗传学参数见表2。
表1 苏州地区汉族和哈尼族人群17个STR基因座等位基因频率分布[n(汉族)=2000,n(哈尼族)=215]
续表1
续表1
表2 苏州地区汉族和哈尼族人群17个STR基因座群体遗传学参数[n(汉族)=2000,n(哈尼族)=215]
将苏州地区哈尼族人群与汉族人群进行等位基因分布频率的比对,发现所比较的17个基因座中,除在D7S820、TPOX、D19S433基因座的差异无统计学意义(P〉0.05)外,在CSF1PO等其余14个基因座的差异均有统计学意义(P〈0.05)。由此表明,即使在同一地区,不同民族的等位基因频率分布差异往往也很明显,故不同民族人群之间的基因频率分布资料不宜混用,调查统计不同地区、民族人群的群体遗传学资料十分必要。
上述17个STR基因座中,Ho为0.5514~0.8791,DP为0.772 3~0.970 3,PIC为0.527 9~0.867 4,PE为0.2366~0.7529,TPI为1.1146~4.1346。17个STR基因座的CDP为0.9999999999999999999731154,CPE 为0.999999919705071。按Gill等[3]提出的DP≥0.9、H≥0.7、PIC≥0.7的STR基因座属高度多态性基因座的标准来衡量,D13S317、D7S820、D16S539、Penta E、D2S1338、D19S433、vWA、D5S818、FGA、D6S1043、 D8S1179、D21S11、D18S51共13个基因座属高鉴别能力的基因座,其中FGA基因座的各项指标最优。调查表明,17个STR基因座在苏州地区汉族和哈尼族人群中具有高度多态性,可用于该地区法医学个人识别和亲子鉴定。
[1]赵方,伍新尧,蔡贵庆,等.Modified-Powerstates软件在法医生物统计中应用[J].中国法医学杂志,2003,18(5):297-298,312.
[2]侯一平.法医物证学[M].第3版.北京:人民卫生出版社,2009:21-22,283.
[3]Gill P,Urquhart A,Millican E,et al.A new method of STR interpretation using inferential logic--development of a criminal intelligence database[J].Int J Legal Med,1996,109(1):14-22.
DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2015.02.020
1004-5619(2015)02-0152-04
2014-07-14)
(本文编辑:柳燕)
李忠杰(1981—),男,内蒙古乌海人,硕士,主检法医师,主要从事法医物证学科研与鉴定;E-mail:cmu86k11blzj@163.com