microRNAs在肿瘤病理学研究中的进展
2014-04-16李玉军
李玉军
专家述评
microRNAs在肿瘤病理学研究中的进展
李玉军
microRNAs(miRNAs)是一类长度约为20~23 nt的内源性小分子单链非编码RNA,其位于基因组内非编码区,进化上高度保守,可在转录后水平对基因表达进行调节[1-3]。miRNAs通过调控基因表达、在细胞增殖、凋亡、分化及个体发育等过程中发挥着非常重要的作用。近十多年的研究[4,5]已证实,miRNAs与肿瘤的发生及发展关系密切,通过调控其靶基因的表达从而影响肿瘤的发生发展,发挥着类似癌基因或抑癌基因的作用。这些与肿瘤相关的miRNAs对肿瘤的诊断、治疗及判断预后都具有重要的意义及应用前景。
1 miRNAs的发现、产生、成熟及作用机制
1993年,Lee等[6]首先在线虫的胚胎发育期发现一种长度约为22 nt的小分子非编码RNA,能调节线虫细胞发育时序,将其命名为lin-4。随后研究者发现lin-4通过碱基配对的方式结合到lin14mRNA的3'末端非翻译区(3'untranslational region,3'UTR),可以抑制lin14蛋白表达。2000年Reinhart等[7]发现另一小分子单链非编码RNA-let-7。与lin-4的作用机制相似,let-7通过与lin-41和lin-57mRNA的3'UTR结合实现转录抑制功能,从而影响线虫的时序性发育。从此以后,lin-4和let-7很快引起人们的关注,许多实验室从家鼠、拟南芥、线虫、果蝇及人类等多种真核生物的细胞中陆续发现了超过300余种此类小分子非编码RNA,科学家以miRNAs来命名这些呈现时空特异性表达模式的非编码小分子。
miRNAs的产生及成熟过程大致可分为核内及核外两个阶段。miRNAs基因经RNA聚合酶II或III转录形成长度约1000 bp的长链RNA初始转录产物(pri-miRNAs)。在细胞核中,Drosha及DGCR8酶对pri-miRNAs的基部进行剪切,形成约60~70 nt带有茎环结构的pre-miRNAs,然后通过转运蛋白Exportin-5运输到细胞质。在细胞质中,由Dicer酶识别并切割pre-miRNAs双链的3'末端及5'末端,形成19~23 nt的小分子RNA,即成熟的miRNAs[8]。
成熟的miRNAs在细胞中通过RNA诱导沉默复合体发挥作用[9,10]。成熟miRNAs通过种子序列匹配而结合到靶mRNAs上,通过与3'UTR完全或不完全互补结合,对靶mRNAs进行降解或抑制其蛋白翻译,从而抑制靶基因的表达,发挥其生物学作用(图1)。多个miRNAs可以协同调节单个靶基因,一个miRNA也可以调节若干个靶基因。因此,miRNAs和靶基因之间形成了复杂的调控网络,维系着细胞正常功能的运转。
图1 miRNAs的产生及作用机制
2 miRNAs与肿瘤基础研究
2.1 肿瘤细胞miRNAs表达差异及其机制与正常细胞相比,肿瘤细胞中有大量的miRNAs存在表达差异。miRNAs表达失调最先在慢性B淋巴细胞性白血病(B chronic lymphoblastic leukemia,B-CLL)中被发现。在50%~60%的BCLL患者中,定位于淋巴细胞染色体13q14位置上的miRNA-15和miRNA-16的2个基因有缺失或表达下调现象[3]。随后,在人类多种肿瘤中都检测到miRNAs表达水平的变化。另有研究[12]分析了取自乳腺、结肠、肺、前列腺、胰腺、胃等6种常见肿瘤的标本和正常组织对照,发现研究的228个miRNAs中,有26种miRNAs表达上调,表达下调的只有17种。在甲状腺乳头状癌中,miRNA-221、miR NA-222和miRNA-146表达显著上调[12]。儿童Burkitt淋巴瘤及霍奇金淋巴瘤中,miR NA-155/BIC的前体出现高表达[13]。Bloomston等[14]对胰腺癌miRNAs表达谱进行分析,共发现21个miRNAs表达上调,4个miRNAs表达下调。miR NA-125b、miR NA-145、miR NA-21和miR NA-155在乳腺癌中均出现表达下调[15]。miR NA-143和miR NA-145在结肠肿瘤中均表达下调[16]。miR NA-21在肝癌、乳腺癌、恶性胶质瘤以及胰腺癌中均出现高表达[17-23]。这些发现表明miRNAs的差异表达在肿瘤发病中具有重要作用,有望用于肿瘤诊断。
miRNAs在肿瘤组织中为什么会出现表达失调?其机制目前已发现至少有4种:(1)许多miRNAs基因被证实定位在肿瘤相关的基因组区域,即位于基因组中易伴随肿瘤发生的变异区域。Calin等[24]研究了186个miRNAs在人类染色体上的定位与肿瘤发生的相关性,发现50%的miRNAs基因频繁地出现在与肿瘤相关的基因区域或是脆性位点上,如纯合性缺失区、杂合性缺失区、扩增区、断裂点区、靠近抑癌基因或癌基因的部位等;(2)miRNAs转录水平的调控。如miRNA-34家族是抑癌基因p53的直接转录调控靶标[25]。miR NA-17-92多顺反子基因受原癌基因c-myc的调控[26];(3)miRNAs表达的表观遗传调控。细胞发生恶性转化的表观遗传标志包括:DNA整体甲基化水平异常、CpG岛甲基化以及组蛋白修饰失调等。表观遗传调控异常会影响miRNAs的表达水平。在乳腺癌细胞中,组蛋白去乙酰化酶受抑制会引起miRNAs表达水平出现广泛而迅速的改变[27]。用组蛋白去乙酰化酶的抑制物4-苯丁酸和5-氮杂脱氧胞苷联合作用于膀胱癌细胞后检测313个miRNAs表达情况,发现有17个miRNAs出现3倍以上的表达上调,其中miRNA-127的表达水平变化最大[28]。miRNAs也可调控外在体系的表达。miRNA-148直接作用于DNA转甲基酶Ⅲ,催化DNA的甲基化[29];miR NA-1调控组蛋白转甲酰基酶Ⅳ,而后者是一个重要的组蛋白修饰物[30];(4)与miRNAs加工相关的基因及其蛋白异常变化。对非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者的大规模研究发现,在部分NSCLC中Dicer蛋白出现下调,而Drosha蛋白水平没有发生改变。Dicer酶的失效与miRNAs表达下调相关[31]。上述几种机制可独立发挥作用,也可以协同作用。另外,miRNAs和mRNA之间的黏合性也可因突变或多态性受到影响,并干扰其转录过程。研究[32]已发现miR NA-146前体上存在G/C单核苷酸多态性位点,该位点可影响miRNAs的成熟效率,并与肝细胞癌的发病风险相关。
2.2 miRNAs参与肿瘤发生发展过程正常细胞的生长、增殖、发育、分化和死亡是高度有序的过程,这一过程发生紊乱可导致肿瘤的产生。miRNAs在肿瘤发生发展的各个阶段均发挥了重要作用。
细胞增殖异常是肿瘤的重要特征,miRNAs可调控与细胞增殖相关的基因,改变细胞的正常周期,从而诱发了肿瘤。Yu等[33]研究发现,let-7可调节H-RAS和HMGA2基因而影响乳腺癌起始细胞的自我更新能力,从而影响乳腺癌细胞的成瘤能力。let-7还可通过下调pan-RAS、N-RAS和K-RAS,从而抑制胶质瘤细胞增殖[34]。miR NA-155是由人BIC基因编码的miRNA,miR NA-155可通过抑制MAD1、MX11、ROX/MNT等基因的表达,促进MYC基因的活性,从而促进细胞增殖,并且过表达miR NA-155的转基因小鼠可出现B细胞异常增殖[35]。
抵抗凋亡也是促进肿瘤发展的重要因素。miR NA-15a/16、miR NA-34、miR NA-29等均可抑制BCL-2蛋白的表达,使肿瘤细胞抗凋亡能力增高[36-38]。在人类上皮性肿瘤细胞中过表达miR NA-143/145可抑制MDM2表达,通过干扰miRNAs-MDM2-p53环路可促进细胞凋亡[39]。
侵袭和转移也是恶性肿瘤发展的重要生物学特征,miRNAs广泛参与肿瘤侵袭转移过程的调控。miRNA-21是目前报道较多的可调控肿瘤转移的miRNA,其对乳腺癌、肝细胞性肝癌、胆管癌、食管鳞癌、前列腺癌、结直肠癌以及黑色素瘤细胞的转移均有促进作用[40-46]。miR NA-126参与调控非小细胞肺癌细胞的黏附、侵袭和迁移,这一过程可能是由接头蛋白Crk介导的[47]。Nakada等[48]通过微阵列和定量PCR技术,对肾透明细胞癌和嫌色细胞癌中的470个人类miRNAs进行检测,发现miR NA-141和miR NA-200c可能通过调控ZFHX1B而抑制E-钙黏蛋白的转录,进而影响肿瘤细胞的黏附和迁移。
新生血管的生成,可以为肿瘤生长提供营养和氧气。miRNAs可通过直接或间接调节肿瘤血管生成来影响肿瘤的进展。多个研究小组的报道都证实miRNAs可影响肿瘤血管生成。miR NA-221/222可通过负性调节c-kit的表达从而抑制脐带血管内皮细胞形成管的能力,也可通过下调eNOS抑制血管内皮细胞增殖和迁移[49,50]。miR NA-17-92簇可通过影响凝血酶敏感蛋白1的表达而调节血管生成[51]。
3 miRNAs与肿瘤的诊断、预后和治疗
miRNAs的表达具有明显的组织特异性和肿瘤发生的阶段特异性,肿瘤发生发展的不同阶段具有不同的miRNAs表达谱。miRNAs也可作为癌基因或抑癌基因参与肿瘤发生发展过程。因此,miRNAs在肿瘤的诊断和分类、预后判断以及治疗方面具有潜在的临床应用价值。
3.1 miRNAs与肿瘤诊断肿瘤细胞和正常细胞miRNAs表达谱的差别,以及不同类型肿瘤miRNAs表达谱的特异性,为肿瘤的诊断及鉴别诊断提供了非常有益的参考指标。Lu等[52]使用流式微球细胞分析技术表达谱的方法对334例样本中的217种人类miRNAs进行检测,发现miRNAs的表达谱可较准确地区分正常细胞和癌细胞,并可鉴别分化不良的肿瘤。miR NA-205及miR NA-21在胰腺导管腺癌中会出现过多表达,由于这两种miRNA表达的上调发生于胰腺导管细胞的表型改变,因此miR NA-205和miR NA-21被认为可以作为诊断胰腺导管腺癌的标志物[53]。Volinia等[3]聚类分析了363个来自于6种常见的实体瘤(乳腺癌、结肠癌、肺癌、胰腺癌、胃癌以及前列腺癌)以及177个正常对照样本,结果显示不同组织器官表达的miRNAs各异。
随着miRNAs检测手段的不断发展,近年来检测血液样本中miRNAs可以为癌症的诊断提供无创性的检测方法。相对肿瘤组织而言,外周血血清较易获得和检测,临床应用便捷,且miRNAs在血清中可长期稳定存在。因此,血清miRNAs表达谱检测有可能成为一种癌症无创诊断的手段。文献研究[54]发现,血清miR NA-92可用作结直肠癌的分子标志物,可以诊断Ⅰ~Ⅳ期的结直肠癌,灵敏度可达89%,特异性达到70%。血清中miR NA-141的表达水平可作为前列腺癌的诊断标志物[55]。目前,尽管miRNAs有助于临床肿瘤的诊断,但是距离真正应用于临床仍有很大距离,仍需大量临床病例资料的系统研究。
3.2 miRNAs与肿瘤预后利用恶性肿瘤中的miRNAs表达谱可鉴定出许多与癌症预后预测相关的信号。研究[20,56,57]显示,miR NA-21高表达的乳腺癌、结肠癌、前列腺癌患者预后较差。Takamizawa等[58]报道肺癌中let-7的表达水平下降,且与更低的术后存活率密切相关。在胰腺癌的miRNAs表达谱中,一共包含6个miRNAs的亚群,在有较长生存期的患者和24个月内死亡的患者中出现表达差异;另外,高表达miRNA-196a-2预示较差的预后[15]。Li等[59]报道,一个包括miR NA-10b、miR NA-21、miR NA-223、miR NA-338、let-7a、miR NA-30a-5p、miR NA-126这7个miRNAs在内的miRNAs谱可用于胃癌患者的生存预测。在肝癌中,miR NA-221的表达上调与患者更短的复发时间相关[60]。另有研究[61]发现,miR NA-199a/b-3p在肝癌患者中的低表达与较差的生存预后有关。以上研究说明,miRNAs表达谱不仅可以作为肿瘤的诊断标志,同时也可作为肿瘤的预后标志。
3.3 miRNAs与肿瘤治疗miRNAs在诸多肿瘤中表达的研究证实了miRNAs在肿瘤发生发展中的作用,并显示miRNAs有可能作为肿瘤治疗的新靶点。例如,Elyakim等[62]在原位移植肝癌细胞的小鼠腹腔内注射miR NA-191抑制物,40 d后发现实验组的移植瘤块明显比对照组小。利用慢病毒载体可将let-7导入乳腺癌干细胞,可以明显降低乳腺癌干细胞的体外自我更新能力和增殖能力,且显著抑制其体内成瘤和转移能力[33]。Kim等[63]发现,在乳腺癌细胞系及乳腺癌患者的癌组织中,miR NA-145与其靶基因如c-MYC、IGF-1R、Fascin-1表达量之间存在着负相关性。他们将腺病毒表达的miR NA-145导入乳腺癌细胞系以及乳腺癌小鼠进行体内外试验,发现腺病毒构建的miRNA-145均能抑制乳腺癌细胞的生长,而且miRNA-145与5-氟尿嘧啶联合使用显现出更加强烈的抑癌作用,因此研究者认为miR NA-145在乳腺癌的治疗中具有应用价值。将脂质纳米与miR NA-34a模拟物的制剂分别经瘤内和尾静脉注射入非小细胞肺癌荷瘤小鼠,均能有效抑制肿瘤的生长并诱导肿瘤细胞凋亡,且发现经尾静脉注射后小鼠瘤块更小[64]。
4 小结
miRNAs作为一类新的分子靶标显现出了广阔的应用前景。目前,miRNAs应用于肿瘤的治疗仍然存在许多难题和弊端。因为细胞内每个miRNA分子可调控上千个靶基因,所以单纯进行某些特定的miRNA转染及单纯对某一个内源性miRNA进行基因打靶或拮抗都可能会导致非特异性的靶基因mRNA的降解或转录后翻译阻遏,从而产生多种副作用。其次RNA不稳定,易降解。如何提高miRNAs治疗转染的高效性、稳定性及特异性等都是需要面对和解决的问题。以miRNAs为策略的抗肿瘤治疗为肿瘤的生物治疗开辟了新途径,但miRNAs从实验室到用于肿瘤的治疗应用还有很长的路要走。
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2013-12-15)
(本文编辑:杨军)
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10.3969/j.issn.1674-7151.2014.01.001