中国吉林省地区朝鲜族及汉族正常人群内皮型一氧化氮合酶基因4a/bVNTR多态性分布的比较研究
2013-11-24刘亚芳丁奎成全成实
李 淼,李 冰,吴 琼,刘亚芳,丁奎成,全成实*
(1.吉林大学第一医院 病理诊断中心,吉林 长春130021;2.吉林大学中日联谊医院 心血管内科,吉林 长春130033;3.吉林大学病理生物学教育部重点实验室,吉林 长春130021)
内皮型一氧化氮合酶(endothelial nitric oxide synthase,eNOS)为依赖钙调蛋白的血管内皮固有酶。eNOS经多步氧化还原反应产生一氧化氮(nitric oxide,NO),从而刺激血管平滑肌产生cGMP,进而维持血管的基础张力[1,2]。人类eNOS基因位于染色体7q35-36区,含26个外显子和25个内含子[1],1994年 Miyahara K 等 人[3]发现eNOS 基 因内含子4上的27bp数目可变的串联重复序列(vari-able number of tandem repeats,VNTR),根据重复次数不同有两种等位基因,重复4次为a等位基因,重复5次为b等位基因。4a/bVNTR多态性形成了3种基因型aa、ab和bb。对eN0S基因4a/bVNTR多态性大量研究发现,eNOS基因多态性与心脑血管等疾病关联。目前,有关eNOS基因多态性的相关研究在中国汉族、蒙族和哈萨克族[4]中已有报道,但在中国朝鲜族人群eNOS基因4a/bVNTR多态性的研究尚未见报道。本研究应用PCR等技术,分析了我国吉林省地区朝鲜族和汉族正常人群eNOS基因4a/bVNTR多态性的分布情况,为不同民族eNOS基因4a/bVNTR多态性分布与慢性病相关性的前瞻性研究提供实验依据。
1 材料和方法
1.1 研究对象 经过体格检查及辅助检查,选取各项指标均在正常范围的吉林省地区正常人群共183人,其中朝鲜族92人(男性42人,女性50人),汉族91人(男性41人,女性50人)。年龄分布在40岁到76岁之间,平均年龄55岁。病史询问主要排除高血压病,糖尿病,心脑血管疾病,肿瘤等目前被证实与遗传有关的疾病。受检者采外周静脉血2ml,4℃保存至提取基因组DNA。
1.2 方法 采用PCR等技术对中国吉林省地区朝鲜族正常人群92人和汉族人群91人的eNOS基因4a/b VNTR多态性进行了检测,同时对其分布特征进行了分析。
1.2.1 基因组DNA提取 保存的含EDTA血样用淋巴细胞提取液(鼎国公司)进行淋巴细胞分离,然后常规进行基因组DNA提取。
1.2.2 PCR扩增eNOS基因的特异片断 参照文献[5]设计引物,引物序列如下;forward:5′-AGG CCC TAT GGT AGT GCC TTT-3′,reverse:5′-TCT CTT AGT GCT GTG GTC AC-3′。引物由上海生工合成。用PCR试剂盒(TAKALA公司)进行PCR反应。PCR反应体系为20μl,其中含上下游引物各0.4μl,模板 DNA0.3μl,TagDNA 聚合酶混合物10μl,加去离子水9μl。在PCR扩增仪(PTC-100,MJ Reseach.公司)上进行如下循环:95℃热启动5min,95℃变性1min,57℃退火1 min,72℃延伸1min,共35个循环后72℃延伸7 min。取PCR扩增产物7μl,在4%的琼脂糖凝胶中电泳1h,在紫外照射仪上观察结果并摄影。
1.2.3 eNOS基因PCR扩增产物的分析及结果判定标准 eNOS基因型多态性表现为数目可变的串联重复序列(VNTR),6次重复等位基因的PCR扩增片断长447bp,包括162bp的重复序列(6*27 bp)和285bp上下游侧翼序列;5次和4次重复等位基因的PCR产物分别为420bp和393bp,其中重复序列分别为135bp(5个27bp的重复序列)和108bp(4个27bp的重复序列)[6]。eNOS基因第4内含子上有两种等位基因,27bpVNTR重复4次为a等位基因,重复5次为b等位基因[7]。eNOS基因4a/bVNTR多态性形成了3种基因型aa,ab和bb。
1.2.4 统计学分析 以基因计数法计算正常人的基因型和等位基因频率。用χ2检验及 Hardy-Weinberg平衡评估标本的群体代表性。并用χ2检验评估等位基因及基因型频率的差异。应用SPSS1 2.0软件包作统计学处理。
2 结果
2.1 Hardy-Weinberg遗传平衡检验 经拟合优度χ2检验,eNOS4a/bVNTR基因的基因型频率在朝鲜族和汉族人群中的分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律,P>0.05,表明样本具有群体代表性。
2.2 吉林省地区朝鲜族和汉族健康人群eNOS4a/bVNTR基因型检测 eNOS基因的PCR产物为420bp和393bp,eNOS基因4a/bVNTR多态性形成了3种基因型aa,ab和bb,见图1。92例朝鲜族正常人群中,aa型4名,ab型28名,bb型60名,3种基因型的频率分别为0.043 48、0.304 3和0.652 2;在91例汉族正常人群中,aa型2名,ab型13名,bb型76名,3种基因型的频率分别为0.021 98、0.142 9和0.835 2。吉林省地区朝鲜族eNOS基因aa+ab基因型频率显著高于汉族(χ2=8.026,P<0.01),见表1。
2.3 吉林省地区朝鲜族和汉族健康人群eNOS基因等位基因检测 吉林朝鲜族a和b两种等位频率分别为0.195 7和0.795 7;汉族a和b等位基因频率分别为0.093 4和0.906 6,两组差异均有统计学意义(χ2=7.724,P<0.01),见表1。
图1 eNOS基因多态性位点电泳图
表1 吉林朝族与汉族人群人eNOS基因4a/bVNTR多态性及等位基因分布
3 讨论
eNOS是左旋精氨酸一氧化氮途径的关键酶,其催化生成的NO具有舒张血管、调节血流、阻止肾素-血管紧张素的产生及抑制血小板聚集等作用[8]。目前认为,eNOS基因多态性与心脑血管等疾病关联。有关朝鲜族和汉族正常人群的基因4a/bVNTR多态性的研究尚未见报道。人类基因多态性具有种族差异,这种差异可以造成不同人群对某些疾病的易感性不同。人类疾病几乎都是遗传因素与环境因素相互作用的结果,只是二者所占的比重在不同的疾病中有所不同。
关于吉林省地区朝鲜族和汉族健康调查研究发现,朝鲜族心脑血管病的死亡率明显高于当地汉族[9]。这种差异可能与不良生活方式有关,但与遗传因素的关系尚未见研究报道。本实验结果显示,92例朝鲜族正常人群中,aa型4名,ab型28名,bb型60名,3种基因型的频率分别为0.043 48、0.304 3和0.652 2。91例汉族正常人群中,aa型2名,ab型13名,bb型76名,3种基因型的频率分别为0.021 98,0.142 9 和 0.835 2。eNOS 基 因 4a/bVNTR多态性在吉林朝鲜族和汉族间存在种族差异,朝鲜族aa+ab基因型频率显著高于汉族,同时发现a等位基因频率明显高于汉族。提示朝鲜族和汉族eNOS基因多态性分布可能与人群的生活习惯等密切相关。黄惠彬等人[10]研究发现,eNOS基因27bp VNTR多态性与中国汉族人高血压的发生有关,携带重复a等位基因的人具有罹患高血压的危险性。他们认为eNOS基因27bp VNTR多态性a等位基因携带者血管内皮的NO合成减少,损伤阻力血管内皮细胞功能,引起外周血管阻力增加从而引起舒张压增高[11]。人们同时发现,NO的缺乏可以加速动脉粥样硬化的发展,eNOS基因的改变可影响NOS蛋白的功能及活性,从而降低NO的合成,加速动脉粥样硬化的发展[12]。Tsukada等[13]实,携带aa基因型者较bb基因型着血清NO水平降低23%,认为内含子4的多态性影响转录后mRNA的剪接过程,因而人群中不同的eNOS基因型有可能决定了不同个体间eNOS的表达与功能上的差异,进而影响到体内eNOS的生物学效应。鉴于中国人心血管病的发病率及死亡率均低于欧美国家,除环境、饮食等因素外,某些遗传因素或许起着重要的作用。因此,获得我国吉林省地区朝鲜族及汉族人群eNOS基因多态性位点的统计资料,对于进一步研究基因多态性与疾病的相关性将具有重要的应用价值。
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