海南汉族乙型肝炎病毒基因型与BCP区和前 C区基因突变的关系
2011-05-23曾俊涛曾仕平钟良宝
曾俊涛,陈 静,曾仕平,钟良宝
(海南医学院附属医院,海口 570102)
研究发现,不同基因型乙型肝炎病毒(HBV)与感染后临床疾病谱有一定的相关性。迄今为止,海南汉族人群 HBV基因型与前 C区和 BCP区基因突变的关系尚未见报道。为此,本研究通过对慢性乙型肝炎(CHB)患者 HBV基因型和基因序列的检测,探讨海南汉族 HBV基因型与前 C区 G1896A和BCP区 A1762T/G1764A基因突变之间的相互关系。
1 资料与方法
1.1 临床资料 2005年 2月 ~2006年 10月海南医学院附属医院门诊和住院 CHB患者 83例,男 48例、女 35例,年龄 21~58(37.55±9.68)岁。患者诊断均符合 2005年中华医学会肝病学分会、中华医学会感染病学分会联合制定的诊断标准,并排除了其他嗜肝病毒和艾滋病病毒的感染。患者血清 HBV DNA检测均为阳性,入组前均未接受抗病毒治疗。
1.2 HBV基因型检测 采空腹静脉血,分离血清,冻存于 -20℃待检。按照HBV基因分型试剂盒(广州华银生物有限公司)说明书的要求,RT-PCR方法检测患者的 HBV基因型。从 50μl血清中提取 HBV DNA,取 B、C、D型反应液各 23 μl,分别加入 1 U Taq酶和 2μl模板来配制反应体系。PCR反应条件:94℃ 60 s,94℃5 s,60℃ 30 s,40个循环。荧光素设定为 6-羧基荧光素。在反应程序的第 2步 60℃末读取荧光值,样本在哪一型反应液中有扩增即为该型;如果在多型反应液中都有扩增,判为混合感染[1,2]。
1.3 HBV前 C区和 BCP区基因突变的检测 HBV DNA的提取采用北京 Tiangen生物有限公司 DNA提取试剂盒,严格按照说明书的操作要求自200μl血清中提取 HBV DNA作为 PCR模板。PCR扩增上游引物为 5'-CCCAAGGTCTTACATAAGAGG-3',下游引物为5'-GGTGGCCAGATTCATCAACT-3,扩增片段的长度为470 bp,包括 C启动区、前 C区和部分 X基因。 PCR的反应条件:首先 94℃预变性 120 s;然后 94℃变性60 s,55 ℃退火 30 s,72℃延伸 60 s,30个循环;72 ℃延伸 600 s。取 5μl PCR产物,经 1%琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR反应效果。PCR产物经纯化后,送由中国国家人类基因组南方研究中心检测。
1.4 统计学方法 采用 SPSS12.0统计软件,计量资料以±s表示,不同组之间计量资料比较采用t检验。HBV基因型、BCP区和前 C区基因突变在不同组之间分布比较采用 χ2检验。P≤0.05为差异有统计学意义。
2 结果
2.1 HBV C区基因 PCR产物电泳结果 采用 PCR扩增 HBV C基因核苷酸(nt1643-nt2112)。预期片段长度为 470 bp,包括 C启动子、前 C区及部分 X基因。扩增片段阳性者可在 470 bp处见到荧光条带。
2.2 HBV BCP区 A1762T/G1764A、HBV前 C区G1896A突变基因测序结果 见图1、图 2。
图1 BCP区 A1762T/G1764A基因突变
图2 前 C区 1896G→A突变基因
2.3 不同基因型与BCP区A1762T/G1764A和前C区 G1896A突变的关系 34例基因型 C BCP区A1762T/G1764A突变率(58.82%)显著高于基因型B(10.53%)(χ2=18.36,P<0.05)。基因型 C G1896A突变率为 29.41%,基因型 B G1896A突变率为 47.37%,两者之间比较无统计学差异(χ2=2.43,P>0.05)。见表1。
表1 83例汉族CHB患者基因型与 BCP区A 1762T/G1764A和前 C区G 1896A突变的关系[例(%)]
3 讨论
研究显示,不同基因型 HBV在致病性方面存在一定差异[3]。有文献报道[4],基因型 C与较高的HBV DNA水平有关。Lindh等[5]研究也显示,与基因型 B比较,基因型 C更易引起严重的肝脏疾病,且与肝脏组织炎症坏死、纤维化关系密切。
BCP区有 3个 AT富集区,分别位于 nt1752-1755(ATTA),nt1758-1762(TTAAA),nt1789-1795(ATAAATT)。BCP区变异最常见在 1762位核苷酸A→T和 1764位核苷酸 G→A,称为双位点突变。本研究显示,基因型 C BCP区 A1762T/G1764A突变率显著高于基因型 B。我们推测 BCP区 A1762T/G1764A突变可能是影响基因型 C和基因型 B HBV致病力差异的原因之一。BCP区 A1762T/G1764A双突变可能通过以下机理影响 HBV致病性:①突变使 HBV的转录和包装增加,加强病毒复制;②突变增强 HBV DNA与肝细胞 DNA的整合;③BCP区A1762T/G1764A双突变可减少 HBeAg的表达,引发针对 HBcAg的抗体反应,加剧细胞坏死和损伤;④BCP区 A1762T/G1764A突变使 X基因编码区密码子发生改变,导致 X蛋白结构异常,从而影响 X蛋白反式激活,导致肝脏组织损害加剧[6]。
HBV前 C区 mRNA翻译产生一个 25 kD蛋白,其被信号肽序列引导至内质网,形成 HBeAg的前体蛋白。在目前发现的前 C区基因突变位点中,第1896位核苷酸突变最为常见。G1896A的变异可以导致第 28位密码由色氨酸 TGG突变成终止密码TAG,终止或减少 HBeAg合成[7,8]。本研究显示,基因型 C前 C区 G1896A突变率与基因型 B前 C区G1896A突变率比较无差异,提示前 C区 G1896A可能与不同基因型 HBV致病力的差异无关。
综上所述,不同基因型 HBV致病能力可能与病毒基因组 BCP区 A1762T/G1764A突变率的不同有关,而与前 C区 G1896A突变无关。
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