HPV病毒检测分型芯片的研制和优化
2009-04-29危敏马文丽孙朝晖等
生命科学研究 2009年3期
危 敏 马文丽 孙朝晖等
摘要:研制和优化寡核苷酸芯片以初步实现对多种常见HPv(Human papillomavirus)病毒的分型检测,应用生物学软件对四型常见HPV病毒(6、11、16、18型)的全基因组序列进行分析,设计具有型特异性、熔解温度(Tm)相近的~60mer寡核苷酸撂针,对玻片片基进行优化处理后,点样制备成寡核苷酸基因芯片,将含HPV全长基因序列的质粒作为阳性标准品,利用梯度限制性荧光标记技术对其进行荧光标记,标记好的样品与芯片杂交,结果显示HPV样品与相应的型特异性探针杂交有明显的荧光信号,而与阴性对照探针和空白对照探针没有杂交信号,通过对芯片片基处理和样品荧光标记方法的优化,可以提高芯片检测的杂交特异性和荧光信号强度。
关键词:人乳头瘤病毒(HPV);寡核苷酸芯片;限制性荧光标记技术:检测
中图分类号:R372
文献标识码:A
文章编号:1007-7847(2009)03-0240-06