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寿光设施番茄死棵病原真菌的分离及鉴定

2023-09-27程琳李珊珊武玉芬李艳青张海娟魏美甜

中国瓜菜 2023年9期

程琳 李珊珊 武玉芬 李艳青 张海娟 魏美甜

摘    要:为了明确寿光地区番茄死棵病害发生分布情况及其真菌病原菌种类,采用随机调查的方法对寿光地区 8 个设施番茄产区进行病害调查,并从死棵病株中分离纯化菌株,通过形态学、分子生物学和人工接种等方法对病原菌进行了鉴定。结果表明,寿光大部分设施番茄产区均有死棵病害发生,平均发病率为 13.3%。共分离获得真菌菌株 249 株,鑒定出 2 种镰刀菌,分别为尖孢镰刀菌和茄病镰刀菌,其中尖孢镰刀菌的分离频率较高,属于优势菌属,又进一步鉴定为尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐病专化型、番茄枯萎病生理小种1 和生理小种3。针对不同的病原菌,可以制定有效的策略,进行针对性的病害防控,为设施番茄安全生产及抗病育种提供重要依据。

关键词:番茄死棵;尖孢镰刀菌;病原菌鉴定;优势菌种

中图分类号:S641.2+S626.5         文献标志码:A 文章编号:1673-2871(2023)09-07-09

Isolation and identification of pathogenic fungi from dead tomato plants in Shouguang facilities

CHENG Lin1, LI Shanshan2, WU Yufen1, LI Yanqing3, ZHANG Haijuan4, WEI Meitian5

(1. Shandong Shouguang Vegetable Seed Industry Group Co.Ltd., Shouguang 262700, Shandong, China; 2. China Agricultural University, Beijing 100083, China; 3. Weifang University of Science & Technology, Shouguang 262700, Shandong, China; 4. Zibo Digital Agriculture Rural Development Center, Zibo 255020, Shandong, China; 5. Shandong Shouguang Vegetable Industry Group Co.Ltd., Shouguang 262700, Shandong, China)

Abstract: In order to clarify the occurrence and distribution of tomato plant dead diseases in Shouguang area and the fungal pathogens, the random method was used to investigate the diseases in 8 facility tomato production fields in Shouguang area, and the strains were isolated and purified from the tomato plant dead . The pathogens were identified by morphology, molecular biology and artificial inoculation. The results showed that tomato plant dead occurred in most of the tomato production areas in Shouguang, with an average incidence rate of 13.3%. A total of 249 fungal strains were isolated and two species of Fusarium were identified, named F. oxysporum and Fusarium solium. Among them, F. oxysporum has a higher isolation frequency and belongs to the dominant genus. F. oxysporum was further identified as F. oxysporum tomato neck rot root rot specialization type, tomato fusarium wilt physiological race 1 and physiological race 3. To sum up, the fungal pathogens that cause tomato plants dead in Shouguang area are F. solanum, F. oxysporum tomato neck rot root rot specialization, Fusarium wilt physiological race 1 and physiological race 3, and there are pathogenic bacteria compound infection. According to different pathogenic bacteria, effective strategies can be formulated to carry out targeted disease prevention and control, which provides important basis for safe production and disease resistance breeding of tomato in facilities.

Key words: Dead tomato plant; F. oxysporum; Pathogen identification; Dominant strain

我国是世界上番茄种植面积最大、产量最高的国家[1]。山东省是我国番茄种植的主产区之一,寿光蔬菜种植面积近4万hm2,其中设施番茄的栽培面积占寿光设施栽培面积的30%左右。近年来,随着农业种植结构调整、商业品种推广单一、田间管理不当以及气候条件的影响,番茄死棵现象的发生及危害逐年加重,成为制约番茄产业发展的重要因素之一[2-3]。

在引起番茄死棵的病害因素中,枯萎病和番茄颈腐根腐病是主要真菌病害。番茄枯萎病是由尖孢镰刀菌番茄专化型 FOL(Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici)侵染所引起的土传病害。尖孢镰刀菌的不同菌株对不同品种的番茄存在致病能力的差异,因此相关研究人员又将番茄枯萎病菌分为不同的生理小种,即生理小种 1、2、3[4-8]。番茄颈腐根腐病( Fusarium crown and root rot, FCRR) 是由尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐病专化型 FORL( Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici ) 引起的一种与番茄枯萎病症状极为相似的真菌土传病害。张斌等[9]对江苏省分离获得的茄病镰刀菌进行回接试验,32个茄病镰刀菌菌株均能引起番茄植株产生根部腐烂、萎蔫等症状。周黎等[10]研究认为引起新疆地区番茄根腐病的病原菌除了尖孢镰刀菌,还有茄病镰刀菌和串珠镰刀菌。程琳[11]、李景富等[12]对山东番茄死棵病害进行研究,经鉴定认为致病菌为尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐病专化型。张秀等[13]对山东省6个地区的病原菌鉴定,发现寿光地区为番茄枯萎病生理小种3。

尖孢镰刀菌分布广、寄主多、侵染能力强,不同地区引起死棵病害的病原菌种类存在一定的差异,在实际的栽培过程中发病症状很难区分,因此加大了该病害的防治难度。为此,笔者的试验拟通过对寿光地区设施番茄死棵病害进行调查,了解目前寿光地区设施番茄死棵病害的发病情况。同时分离番茄死棵真菌病害的病原物,结合形态学观察、分子生物学鉴定和人工接种等方法确定病原菌种类,为今后寿光地区番茄死棵病害防治工作及番茄抗病育种提供一定的参考和理论依据。

1 材料与方法

1.1 材料

试验于2021年5—12月在山东省寿光市寇家坞、田柳镇、稻田镇、古城番茄小鎮、野虎村、王家尧、化龙镇、蔬菜小镇等8个地方进行,在种植番茄的温室大棚中选取发生死棵病害的番茄植株96 株,包括大粉果系列、大红果系列、草莓番茄系列和樱桃番茄系列各24株。

致病性测定所用的番茄为山东寿光蔬菜种业集团提供的黄金明珠,为黄色大果番茄,产自西安市航丰种业有限公司,对番茄枯萎病和番茄颈腐根腐病均为高感。

1.2 方法

1.2.1 番茄死棵病害的发生情况调查 对8个种植番茄的产区进行病害随机调查。调查方法为随机取样法,在每个地区随机选取 3 个温室大棚进行田间调查,每个温室大棚内采取平行线取样法,随机选取 5~6 垄进行番茄死棵病害的调查,并进行病害发生率的统计。同时观察病株的病症并拍照及采集。发病率/% = 发病株数/调查总株数×100。

1.2.2 病原菌的分离纯化 采用组织分离法,用灭菌的剪刀剪取大小为0.5~1.0 cm2根部及根茎部的病健交界处组织,用75%酒精消毒后,放入PDA培养基中,然后放入27 ℃恒温培养箱中培养。3~4 d后观察其生长情况,并用单孢分离法进行纯化。

1.2.3 病原菌的鉴定 采用形态学观察、分子生物学鉴定及致病性测定3种方法对分离到的病原菌进行鉴定。

(1)形态学观察:依据 Booth 分类系统[14]同时参考《常见镰刀菌鉴定指南》[15],观察菌落的大小、形状、颜色,以及分生孢子形态、大小等特征,对分离到的菌株进行形态学鉴定。

(2)分子生物学鉴定:采用真菌DNA快速提取试剂盒提取病原菌DNA,提取物于 -20 ℃保存。利用真菌rDNA 转录间隔区通用引物 ITS1/ITS4[16] 进行PCR扩增,产物采用 1%琼脂糖凝胶电泳检测。后将未纯化的PCR产物送到华大基因青岛分公司进行正向测序,分离所得的菌株的rDNA-ITS序列运用GenBank中的数据库中Nucleotide BLAST进行同源性比对分析,结合病原菌形态特征,判断所分离菌株的种类,确定分类地位。参考Hirano和Arie[17]的方法,用3对特异性引物sp13f/r、sp23f/r、sprlf/r进行尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐病专化型及枯萎病生理小种的鉴定。PCR反应产物采用1%琼脂糖凝胶电泳检测。

(3)致病性测定:根据Koch氏法则进行分离物的回接测定。每种致病菌中选取8个有代表性的菌株,用打孔器在分离纯化培养后的菌落边缘取直径1 cm 菌饼3片,放入装有 150 mL PDB培养基的三角瓶中,在150 r·min-1、27 °C下摇2~3 d后用4层纱布过滤,用血球计数板进行计数,用无菌水配制成孢子浓度为1×107 CFU·mL-1的孢子悬浮液。

采用浸根法接种。待番茄长到2~3叶1心时,将番茄苗连根拔起,用自来水冲去根部土粒,然后用无菌的小刀将主根根基部切一个小伤口,在已配好的孢子悬浮液中浸泡15 min后,转移到装有无菌土的营养钵中定植,放入温度为25~30 °C的温室中培养。每个菌株3个重复,每个重复10个处理,以清水作为对照,15 d后统计其发病情况。病情指数=Σ(病级株数×各病级数值)/(总株数×最高级别)。病情指数分级标准见表1。

1.3 数据处理

采用 DPS(9.01)进行数据处理和完全随机设计单因素试验方差分析。

2 结果与分析

2.1 田间发病症状

发病初期可以观察到整棵番茄植株的下部叶片首先出现变黄、萎蔫的现象(图1-A),病株根茎部会产生深褐色的病斑,在空气湿度大时会有比较浅的粉红色的霉层产生(图1-B),将植株的根茎部剖开,会发现维管束产生褐变,且出现髓部中空的现象(图1-C)。

2.2 寿光地区设施番茄死棵病害发生与分布情况

调查结果见表2,寿光大部分番茄产区均有死棵病害发生,且分布比较广泛,平均发病率为13.3%。其中以大粉果和草莓番茄系列品种发病最重,属于高感品种。田柳镇的平均发病率最高,为37.5%,单个棚内的发病率最高可达57.1%。处于开花坐果期的野虎村和稻田镇发病率较低,平均发病率低于0.5%。不同产区、同一产区不同棚室之间死棵病的发病率存在差异。

2.3 形态学观察

病原菌分离后培养产生菌落的形态大致可分为4种类型,观测结果如图2所示。第Ⅰ种类型的菌株菌落初为粉紫色,菌丝茂密,呈绒毛状,菌落背面带有紫红色色素;第Ⅱ种类型的菌株菌落初为白色,菌丝毛绒状且茂密,略带粉状,菌落中心略有凸起,背面变为浅紫色;第Ⅲ种类型的菌落初为淡粉色,菌丝与前两种类型相比较稀疏,菌落中心也有略微的凸起,菌落背面中心呈现紫色;第Ⅳ种类型的菌落白色,呈圆形,菌丝絮状致密,菌落背面中心呈现枯黄色。Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ菌株初步鉴定为尖孢镰刀菌,Ⅳ为茄病镰刀菌。孢子菌丝和形态显微观察如图3所示,尖孢镰刀菌大型分生孢子纺锤形,有3~5个隔膜,3个的居多,大小为(27~47)μm ×(3~5)μm,无色细胞多;小型分生孢子卵形或长椭圆形,大小(5~12)μm ×(2.2~3.5)μm,无色,单孢;厚垣孢子圆形或椭圆形,单孢顶生或间生于菌丝之上,大小为(11.2~16.0)μm ×(9.5~11.3)μm。茄病镰刀菌分生孢子呈典型的镰刀状,1~5层隔膜。

2.4 分子生物学鉴定

2.4.1 分离病原菌的rDNA-ITS分子生物学鉴定 对所有分离得到的249株病原真菌DNA进行rDNA-ITS区域特异性扩增,将胶回收后测序,在NCBI中进行序列比对,构建进化树,其中稻田镇分离的病原真菌凝胶电泳结果见图4,序列同源性比对结果见表3,进化树构建见图5。结果显示,249株病原真菌中有202株与尖孢镰刀菌的同源性较高,其余的47株与茄病镰刀菌有较高的同源性,且相似度均在97%以上。

2.4.2 尖孢镰刀菌的特异性引物鉴定 对202个已经鉴定为尖孢镰刀菌的菌株进行尖孢镰刀菌的特异性引物 PCR 扩增及琼脂糖凝胶电泳检测,其中稻田镇部分样品电泳检测结果见图6、图7和图8。结果表明,77株为尖孢镰刀菌枯萎病生理小种1,111株为尖孢镰刀菌枯萎病生理小种3,14株为尖孢镰刀菌颈腐根腐病专化型。

2.5 山东寿光地区分离病原菌的种类及发生情况分布

对鉴定到的真菌病原菌的种类和分布分析见表4,发现尖孢镰刀菌的分离频率最高,属于优势菌属,不同地区引起死棵的病原和优势菌种不尽相同,同一地区存在病原菌混合侵染的现象。8个产区中有6个产区的优势菌株都含有枯萎病生理小种1和生理小种3,其中王家尧和化龙镇包含了4种菌种,但优势菌株存在较大差异,分别为茄病镰刀菌和尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐病专化型。

2.6 分离病原菌的致病性鉴定

人工接种试验结果表明,尖孢镰刀菌菌株具有致病性,只是同一类型的不同菌株之间致病力存在较大差异。依据柯赫氏法则,从接种发病番茄苗的病健交界处按照本文材料与方法中病原分离鉴定描述的方法重新分离、纯化和鉴定,得到的尖孢镰刀菌菌株与接种的尖孢镰刀菌形态一致,证明所接菌株为番茄死棵病害的病原真菌。图9显示的是尖孢镰刀菌的发病症状,主要表现为:叶片由下至上逐渐枯黄(图9-B~D、G、H),茎基部有深褐色病斑(图9-B~C),有的会出现溢缩,拔出病株,可见根部发育较差,须根较少,变为黄褐色(图9-C~D)。

2.6.1 尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐病专化型(FORL)人工接种鉴定 试验结果见表5,在尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐病专化型接种试验中,不同菌株的发病率和病情指数存在差异,其中发病率最高可达100%,分别为菌株H1GJ8-2 和H2-6-1,发病率最低为菌株H1-1-3,发病率为0。致病力最强的为H2-6-1,病情指数为85.83。

2.6.2 尖孢镰刀菌番茄枯萎病生理小种1(fol-1)人工接种鉴定 试验结果见表6,在尖孢镰刀菌番茄枯萎病生理小种1接种试验中,不同菌株的发病率和病情指数存在差异,其中发病率最高达到93.33%,有2个菌株,分别为H1GJ 2-11和K1-1,最低为菌株SC9GJ-1-31,发病率为50.00%,致病力最强的为W1GJ-3,发病率和病情指数分别为90.00%和70.00。

2.6.3 尖孢镰刀菌番茄枯萎病生理小种3(fol-3)人工接种鉴定 试验结果见表7,尖孢镰刀菌番茄枯萎病生理小种3接种试验中,不同菌株的发病率和病情指數存在差异,其中发病率最高的为菌株W1-1和K2-2,发病率为100%,病情指数最高的菌株为W1-1,病情指数为80.00。菌株W8-1的发病率和病情指数最低,分别为13.33%和3.33。

2.6.4 茄病镰刀菌人工接种鉴定 试验结果见图10,在茄病镰刀菌的接种试验中,番茄植株生长正常,未见发病症状。

3 讨论与结论

通过对寿光地区日光温室种植的番茄死棵病害田间调查,发现寿光大部分番茄产区均有死棵病害发生。在引起番茄死棵的病害因素中,枯萎病和番茄颈腐根腐病是主要的真菌病害。

由于病原菌的种类繁多,个体多态性丰富,许多种的分生孢子形态相似,如果仅仅是通过形态观察进行鉴定,还很难能够准确地确定其种类。崔萍等[18]根据形态学鉴定和ITS序列同源性分析,准确地将分离得到的镰刀菌鉴定为尖孢镰刀菌。刘晖[19]、郑贵彬等[20]运用特定品种鉴定生理小种,发现造成山东、西安枯萎病发生的病原菌均为生理小种1,但是由于品种存在特殊性,不能普遍适用。Chang等[21]对山西省17个地区的病原菌进行鉴定,发现同时存在生理小种1,2和3,其中生理小种1最普遍。笔者通过借鉴前人的研究,在形态观察的基础上,利用分子生物学手段对病原菌种类进行鉴定,提高了番茄死棵病原真菌鉴定结果的准确性。

张斌等[9]对江苏省分离获得的茄病镰刀菌进行回接试验,32个茄病镰刀菌菌株均能引起番茄植株产生根部腐烂、萎蔫等症状。笔者在对分离菌株进行人工接种鉴定时,发现接种茄病镰刀菌的番茄未发病。笔者的研究结果与前人的相关报道并不相同,可能与病原菌种类、菌株致病力强弱、接种条件等密切相关,与此同时受时间限制和试验条件的影响,笔者的研究未能对分离出来的 47 个茄病镰刀菌菌株全部进行回接验证,关于茄病镰刀菌的致病性还需要进一步探究。

张秀等[13]对山东省6个地区的病原菌进行鉴定,发现寿光地区为番茄枯萎病生理小种3。笔者通过特异性引物对尖孢镰刀菌进行鉴定,发现引起寿光地区番茄死棵的真菌病原菌为尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐病专化型,枯萎病生理小种1和生理小种3,而且存在病原菌复合侵染的情况。而在我国的黑龙江、河北、山西、湖北、四川等地,也有相关的病害研究及报道,说明采集时间及地点不同,在病原菌种类上会存在一定的差异。

综上所述,寿光大部分番茄产区均有死棵病害发生,主要由茄病镰刀菌、尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐病专化型,枯萎病生理小种1和生理小种3引起,而且存在病原菌复合侵染的情况。通过对寿光不同地区番茄死棵病害致病菌种类及优势种群的研究可以制定有效的策略,进行针对性的病害防控,为优质番茄安全生产和抗病育种提供重要依据。

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