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基于TCGA鉴定CCNB2在HCC中的临床意义

2022-12-20娟,凌

通化师范学院学报 2022年12期
关键词:生存期癌症病理

董 娟,凌 林

肝细胞癌(HCC)是全球第六大最常见的恶性肿瘤,近几十年来发病率不断上升[1].研究表明[2],HCC 的发生和发展中多种分子表达改变起着关键作用.因此,找到可靠的生物标志物来诊断HCC 并开发新的策略是治疗HCC 的途径.

细胞周期蛋白B2(CCNB2)和肿瘤密切相关[3].CCNB2 是细胞周期蛋白家族成员之一,主要在G2/M 转化中发挥作用,在众多癌症表达中上调[4].CCNB2 在神经胶质瘤中高表达,并和不良预后相关[5],而CCNB2 的表达降低则抑制膀胱癌的侵袭和转移[6].然而,CCNB2在HCC 中研究尚少,本文基于TCGA 数据库鉴定CCNB2 在HCC 中的临床意义,以期为HCC患者治疗提供新的诊断、预后评价,以及靶向治疗的思路.

1 资料与方法

1.1 一般资料

从TCGA(https://portal.gdc.cancer.gov/)获取374 例肝细胞癌和50 例正常病例的样本数据,包括基因表达量和临床资料.

1.2 方法

(1)CCNB2 在癌症中表达情况使用在线网站TIMER2(http://timer.cistrome.org/)了解CCNB2 在多种肿瘤中表达情况.利用ggplot2包提取CCNB2 在HCC 癌和癌旁组织中表达量并进行差异分析.

(2)CCNB2 与癌症分期及预后的相关性分析.使用R 软件分析CCNB2 与HCC 的临床资料的相关性,包括年龄、性别、TNM 分期、病理分期.使用Kaplan-Meier Plotter 探讨CCNB2与预后的关系.创建ROC 曲线、时间相关曲线,pROC 包用于分析,ggplot2 用于可视化.临床数据取自TCGA 数据库,p<0.05 具有统计学意义.

(3)统计分析.R(版本4.1.2)用于数据研究,依据CCNB2 的中位表达将患者分为高、低表达两组.根据数据分布对所有数据采用t检验或用Wilcoxon rank-sum test 进行统计学分析.生存结局包括总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)和无进展生存期(PFS).生存数据中风险评估采用Cox 回归分析,p<0.05 具有统计学意义.

2 结果与分析

2.1 CCNB2 在HCC 中的表达结果

使用TIMER2 获取了CCNB2 在大多数癌症中的表达结果,与癌旁正常组织相比,在BLCA(膀胱尿路上皮癌)、CHOL(胆管癌)、LIHC(肝细胞肝癌)、LUAD(肺腺癌)等中高表达(图1A).此外,利用TCGA 中获取的数据分析了CCNB2 在配对样本和非配对样本中的表达情况,显示CCNB2 在HCC 癌组织中表达高于正常组织,p<0.001 具有统计学意义(图1B、图1C).

图1 CCNB2 在肿瘤中的表达水平

2.2 CCNB2 表达与HCC 分期的相关性结果

结果表明,CCNB2 的表达与性别无相关性(图2B),与年龄(图2A)、T 分期(图2C)病理分期(图2F)相关,此外,N 分期(图2D)和M 分期(图2E)中基因表达水平与正常组织也存在差异表达,但在癌组织组内差异无统计学意义.还对CCNB2 进行单、多因素分析,分别得出HR(95%CI):1.269(1.111-1.449),p<0.001和HR(95%CI):1.307(1.103-1.548),p=0.002,显示CCNB2 可作为独立其他临床特征预测患者预后(图3A、图3B).以上p<0.05 具有统计学意义.

图2 CCNB2 表达与HCC 不同临床病理特征之间的相关性

2.3 CCNB2 在HCC 中的Kaplan-Meier 生存曲线显示结果

在HCC 中,CCNB2 高表达与较差的OS(p=0.001)、DSS(p=0.002)和PFI(p<0.001)相关(图4),表明CCNB2 可成为预测HCC 患者的独立预后因子.最后,进一步根据ROC 曲线分析,曲线下面积(AUC)为0.976,显示CCNB2表达预测肿瘤和正常组织具有较高的准确性(图3D).同时,时间依赖生存曲线显示AUC值均在0.6 以上,表明CCNB2 表达越高,1年、3年、5年的生存可能性越低(图3E).

图3 HCC 中CCNB2 的单变量分析和多变量分析

图4 CCNB2 高表达和低表达在肝癌中Kaplan-Meier 生存率的比较

3 讨论与结论

CCNB2 参与G2/M 的转化作用,该过程涉及有丝分裂的准备和有序地分配到纺锤体[7-8].有丝分裂过程失控,会导致包括肝癌在内的多种组织中的肿瘤形成[9].因此,近年来大量研究发现CCNB2 在肿瘤中的重要作用.例如,在三阴乳腺癌中,CCNB2 过表达和不良预后相关,敲低表达后的癌症细胞侵袭、迁移、增殖能力下降[10];WANG 等[11]证实了肺腺癌中上游基因可以调控CCNB2 的表达,进而抑制癌症的进展.

在本研究中也发现了高表达的CCNB2 可调控制HCC 的进展.首先使用TIMER2 分析了CCNB2 在不同肿瘤中高表达,进一步基于TCGA 获得的样本数据,验证了CCNB2 在HCC中高表达,暗示高表达CCNB2 是促癌基因.TNM 分期是直接预示HCC 患者预后的关键因素,因此,对临床和病理资料分析,结果表明CCNB2 与年龄、T 分期以及病理分期显著相关.尤其是在T 分期和临床病理分期中,处于更晚期癌症阶段的患者倾向于表达更高水平的CCNB2.因此,接下来分析了高表达的CCNB2对于HCC患者OS、DDS、PFI的影响,显示CCNB2高表达的患者预后较差.鉴于CCNB2 在HCC中的重要作用,建立了ROC 曲线和时间预后模型,显示CCNB2 有很好区分正常组织和肿瘤的能力.CCNB2 表达越高,1年、3年、5年的生存可能性越低,这一结果证实了CCNB2 在诊断和预测生存概率上的价值,有望成为新的生物标记物.

虽然借助于数据库分析了CCNB2 对HCC预后和诊断中的价值,但目前的研究也存在一定的局限性.需要进一步通过人体标本和细胞株研究CCNB2 相关的信号通路,以及如何调节免疫功能.

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