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美国《Emerging Infectious Diseases》2022年第5期有关人兽共患病论文摘译

2022-08-11江典伟

中国人兽共患病学报 2022年7期
关键词:估计值变体青霉

P915 英国2018-2019年与家庭医疗相关的侵袭性A组链球菌疫情//Laura E. Nabarro, Colin S. Brown, Sooria Balasegaram,等

疫情日益与医疗保健等服务相关,但emm分型和全基因组测序可以帮助确定病例群。医疗保健相关侵袭性A组链球菌(iGAS)疫情在世界范围内普遍存在,但只有英国报道了与家庭健康护理(HHC)相关的疫情。2018-2019年英国发生10次疫情,累计96例iGAS病例(2~39例/次),28例死亡(病死率29%)。疫情暴发持续时间3~517 d;病例间隔中位数20.5 d(1~225 d)。疫情甄别较为困难,但emm分型和全基因组测序提高了鉴别能力。网络分析表明此类疫情存在多条潜在的传播途径。筛查9起疫情中的366名HHC工人,发现仅1名工人携带A组链球菌。控制此类疫情暴发需要多种干预措施,包括感染预防的改进、设备消杀和人员抗菌等。iGAS疫情未得到充分认识,尚不明确有效的干预措施和传播途径。公共卫生机构应关注HHC相关iGAS疫情,保障患者健康并减少死亡。

P924 2015-2017年全球产碳青霉烯酶肠杆菌基因组流行病学//Gisele Peirano, Liang Chen, Diego Nobrega,等

具有不同地理分布大肠杆菌种群具有不同的主要基因序列类型,提示需进行持续的基因组监测。2015-2017年对36个国家229株产碳青霉烯酶大肠杆菌进行全球分子流行病学描述。常见碳青霉烯酶有苯唑西林酶(OXA)181(23%)、新德里金属β-内酰胺酶(NDM)5(20%)、OXA-48(17%)、肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶2(15%)和NDM-1(10%)。已确定5种显性序列类型(STs);4个是全球性的(ST410、ST131、ST167和ST405),1个(ST1284)仅限于土耳其。OXA-181在约旦(因ST410-B4/H24RxC子代码)和土耳其(因ST1284子代码)较常见。在12个国家的11个STs中发现了几乎相同的IncX3-blaOXA-181质粒。NDM-5在埃及、泰国(与ST410-B4/H24RxC和ST167-B子代码相关)和越南(因ST448子代码)频繁出现。OXA-48在土耳其较常见(与ST11260子代码相关)。全球肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶与ST131 C1/H30亚型相关,NDM-1与各种STs相关。具有不同特征和不同地理分布的不同STs序列类型决定全球碳青霉烯酶大肠杆菌种群,提示需进行持续的基因组监测。

P940 美国2个大城市污水处理厂污水监测估算2种SARS-CoV-2变体的相对丰度//Alexander T. Yu,1 Bridgette Hughes,1 Marlene K. Wolfe,等

监测急性重症呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)变异毒株(VOCs)对于冠状病毒病的公共卫生管理意义重大。基因测序具集约和不典型性特征,并非所有的分离株都能进行基因测序。废水SARS-CoV-2 RNA浓度与棚屋区冠状病毒病的发病率相关,因此监测废水中的VOCs较有价值。开发反转录PCR检测废水沉淀物中α和δVOC变体的丰度,将其应用于美国两个大型城市棚屋区2020年7月至2021年8月的样本,并与病例分离的VOC丰度值进行估计比较。废水测量值与病例分离的VOC丰度估计值密切相关(α,rp 0.82-0.88;δ,rp 0.97)。即使在SARS-CoV-2总RNA水平<5%的废水和病例隔离前可分离到的样本的1~3周中也可检测到突变。重症急性呼吸综合征的比较见图1。废水中SARS-CoV-2变体监测策略有助于完善病例分离测序。

2021年2月1日至7月31日,美国加利福尼亚州圣何塞和萨克拉门托,与冠状病毒病病例分离株相关的废水固体中值得关注的冠状病毒2变异(A、 B)根据圣何塞(A)和萨克拉门托(B)污水厂过去14 d收集和测序的病例分离物测序数据估计,循环严重急性呼吸综合征冠状病毒2型异毒株中归因于α和δ变体的比例。(C、 D)在圣何塞(C)和萨克拉门托(D)通过废水中的N基因浓度标准化,α(HV69-70)和δ(Del156-157/R158G)变异病毒中发现的突变浓度,过去14 d的平均值。未显示前14 d内未进行测量的日期的数据。N:核蛋白图1 重症急性呼吸综合征的比较

P948 以色列BNT162b2疫苗增强剂对SARS-CoV-2感染和突破病例并发症的有效性研究//Aharona Glatman-Freedman, Michal Bromberg, Yael Hershkovitz,等

在以色列,对年龄大于16岁且病程持续时间小于20周的突破病例进行疫苗BNT162b2(辉瑞生物技术公司,https://www.pfizer.com) 增强剂后并发症(住院、重症和死亡)效果评估。第3周,16~59岁人群的VE估计值达到96.8%(95%CI: 96.0%~97.5%)保持抗体水平8周,60岁以上人群的VE估计值达到93.1%(95%CI: 91.8%~94.2%)保持抗体水平11周。随后缓慢下降,最后2~3周下降明显。最后一周的评估显示16~59岁和60岁以上人群的VE估计值分别为77.6%(95%CI: 68.4%~84.2%)和61.3%(52.5%~68.4%)。VE估计值下降明显的同时,Omicron变异体活性同时迅速增加。整个评估过程中突破病例并发症的减少率保持在中等至较高水平。

P957 美国纽约市住宅区蜱虫控制干预措施对蜱虫数量、人类接触蜱虫和蜱媒疾病发病率的影响//Felicia Keesing,1 Stacy Mowry, William Bremer,等

莱姆病等蜱传疾病(TBD)导致美国每年约50万病例。各种能在较小空间上减少蜱虫数量的方法措施能否降低TBD的发病率尚不清楚。为测试2种环境无害干预措施进行了一项随机、重复、完全交叉、安慰剂对照、双盲试验,即蜱虫控制系统(TCS)和Met52真菌喷雾剂,两者单独或联合使用,在24个居民区进行人及宠物的TBD风险和发病率试验。所有参与的社区人员及物业同等对待。TCS与更少的蜱虫和更少的寄生啮齿动物蜱有关。干预措施未形成人群TBDs发病率的显著差异,但显著降低了宠物TBDs的发病率。与之前的研究证据相同,减少居住区蜱虫数量可能不会减少人群TBD的发生。

P977 测试将现有人群免疫力作为猪流感大流行风险评估的一部分//Jonathan Tin Lai Cheung, Tim K. Tsang, Hui-ling Yen,等

人兽共患流感不断地威胁着人类健康。防范大流行则需要对动物病毒进行持续监测和风险评估,而群体免疫是风险评估的一个重要组成部分。我们测定了在中国香港和广州流行的按年龄分层的5种猪流感病毒的血凝素抑制抗体血清阳性率。使用血凝素抑制抗体血清阳性率及滴度,我们模拟了如果每种病毒在人类中传播,人群免疫对基本繁殖数(R0)的影响。在353份人血清样本中,我们报告3组重组H1N2和欧亚禽类H1N1流感病毒的血清阳性率均较低,这使R0仅降低18%~20%。引起大流行所需的最小R0为1.22~1.24,这意味着现有的人群免疫力不足以阻止这些H1N1或H1N2变体的传播。对于起源于人类的H3N2,现有的群体免疫可将R0抑制到47%,从而降低大流行风险。

P986 美国5-11岁儿童首剂2019冠状病毒疫苗接种率差异//Neil Chandra Murthy, Elizabeth Zell, Hannah E. Fast,等

分析了美国2021年11-12月5-11岁儿童首剂冠状病毒疫苗的接种率。儿童疫苗接种率因辖区司法、年龄组和种族/族裔影响而存在差异,结果显示在疫苗推出的前两个月,5~11岁儿童首剂冠状病毒疫苗的接种率显著落后于12~15岁青少年的疫苗接种率。

P998 感染SARS-CoV-2 Omicron变异体的疫苗接种者脱落病毒持续时间//Kenichiro Takahashi, Masahiro Ishikane, Mugen Ujiie,等

为了确定病毒脱落的持续时间,检查日本2021年 11月29日-12月18日感染严重急性呼吸综合征冠状病毒2 Omicron变体的患者上呼吸道采集的临床样本。轻度或无症状感染的疫苗接种者在发病或诊断后,甚至在症状缓解后病毒脱落仍会持续6~9 d。

蜱媒脑炎病毒(TBEV)主要通过蜱虫叮咬传播,但人类可因食用未经高温消毒的受染动物奶而感染。尚未证实或排除母乳喂养传播TBEV的可能性。一例可能通过母乳喂养从未接种疫苗的母亲传播给婴儿的TBEV病例报告。

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