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兰州地区IL-15、IL-17A和IL-18基因多态性与复发性流产的相关性研究①

2022-07-25张春花裴建赢刘静婷毛宝宏甘肃省妇幼保健院科研中心兰州730050

中国免疫学杂志 2022年9期
关键词:等位基因多态性基因型

李 静 刘 倩 张春花 裴建赢 刘静婷 毛宝宏 (甘肃省妇幼保健院科研中心,兰州 730050)

复发性自然流产(recurrent spontaneous abortion,RSA)是指孕20周前连续2次或以上的自然流产,是一种常见的病理妊娠,影响1%~2%的妊娠女性[1]。其发病因素众多,包括遗传问题、解剖畸形、内分泌异常、凝血等因素,但目前仍有50%患者原因不明,有研究表明其可能与免疫有关。RSA 患者较正常孕妇辅助型T 细胞(helper T cells,Th)百分比增高。Th 通过增加其分泌的细胞因子,加强免疫调节,促进妊娠维持,但免疫调节细胞因子中,特别是白细胞介素(interleukin,IL),一类能在细胞间传递信息、影响妊娠各阶段的具有免疫调节和效应功能的蛋白质或小分子多肽,对妊娠结局起到至关重要的作用[2-3]。本研究拟采用病例对照研究方法,运用SNaPshot 技术探讨IL-15 基因rs3806798、IL-17A 基因rs2275913、IL-18 基因rs1946518 和rs187238 位点与RSA发病风险的关系。

1 资料与方法

1.1 资料

1.1.1 一般资料 收集2019 年1 月至2020 年8 月于甘肃省妇幼保健院复发性流产门诊就诊的RSA患者150 例设为RSA 组,患者年龄19~41 岁[(29.3±4.0)岁]。纳入标准:流产次数≥2 胎,并且发生于妊娠20周前;无内分泌、感染、解剖、易栓症、夫妻染色体异常;无糖尿病、高血压、风湿免疫性疾病等基础疾病及家族遗传病史;夫妇双方无近亲结婚。对照组为150 例同期体检中心就诊的健康女性,无自然流产史、早产史及妊娠高血压病史,且至少成功分娩1 次1 名健康足月儿,其年龄为20~40 岁(30.0±4.0)岁,两组比较年龄差异无统计学意义(P>0.05)。本研究获得甘肃省妇幼保健院伦理委员会批准,研究对象均签署知情同意书。

1.1.2 主要试剂 引物(上海生工);Hotstar(Taq Qiagen);PCR 反应缓冲液、MgCl2(TaKaRa);dNTP(Generay Biotech);PCR Marker(New England Biola⁃bs);SNaPshot Multiplex、5×Sequencing Buffer、HI-DI、GeneScanTM-120(ABI);SAP(Promega);EXO-Ⅰ(Epicentre)。

1.1.3 数据来源 查阅HapMap dbSNP 数据库(www. hapmap. ncbi. nlm. nih. Gov)及相关文献,选择IL-15 基因rs3806798、IL-17 基因rs2275913、IL-18基因rs1946518 和rs187238 共4 个位点,3 个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点均满足以下条件:选择RSA 相关SNPs;位点在中国人群最小等位基因频率>0.05。

1.2 方法

1.2.1 标本采集及基因组DNA 提取 采集2 组受试者外周静脉血2 ml 置于EDTA-K2真空抗凝管,根据MagenDNA 提取试剂盒说明书提取白细胞基因组DNA,标记并置于-80 ℃低温冰箱保存备用。

1.2.2 SNaPshot基因分型

1.2.2.1 PCR 扩增引物及SNaPshot 引物设计及合成 参照GenBank 中IL-15、IL-17 和IL-18 基因引物序列查找IL-15 rs3806798、IL-17A rs2275913 及IL-18 rs1946518 和rs187238 共4 个位点的引物序列,运用primer5.0设计引物,见表1。

表1 PCR扩增引物Tab.1 PCR primers in multiplex PCR reaction of this study

1.2.2.2 多重PCR 反应体系(20 µl)包含2×GC-Ⅰbuffer 10µl,去离子水5µl,3.0 mmol/L Mg2+0.4µl,0.3 mmol/L dNTP 2.4 µl,1 U HotStarTaq polymerase 0.2 µl,样本DNA 和多重PCR 引物各1 µl。多重PCR 扩增条件为95 ℃预变性2 min,94 ℃变性20 s,65 ℃退火40 s,72 ℃延伸1.5 min,反应11 个循环,再次94 ℃变性20 s,59 ℃退火30 s,72 ℃延伸1.5 min,反应24个循环,最后72 ℃延伸2 min,4 ℃保存。

1.2.2.3 PCR产物纯化 本研究反应体系为17µl,其中PCR 产物为10µl,酶混合液7µl(含生产的5 U SAP和2 U ExoⅠ);反应条件:37 ℃孵育温1 h,然后75 ℃15 min 以灭活SAP 和ExoⅠ酶,纯化完成后进行单碱基延伸反应,预先混好延伸引物,见表2。

表2 SNaPshot多重单碱基延伸反应延伸引物Tab.2 SNaPshot primer for multiple single base extension reaction

1.2.2.4 SNaPshot 反应 采用ABI PRISM SNaP⁃shot Muhiplex Kit 进行。反应体系为10 µl,其中纯化后多重PCR 产物为2 µl,SNaPshot Mix 5 µl,延伸引物混合1µl,超纯水2µl;反应条件为96 ℃预变性1 min,96 ℃变性10 s,55 ℃退火5 s,60 ℃延伸30 s,反应28个循环,4 ℃保存。

1.2.2.5 SNaPshot 反 应 产 物 纯 化 10 µl 上 述SNaPshot PCR 产物中加入1 U SAP,振荡混匀,37 ℃温育1 h,75 ℃灭活15 min。4 ℃保存24 h 或-20 ℃长期保存。

1.2.2.6 ABI 3730XL 测序仪测序分型产物 取0.5 µl 纯 化 后 延 伸 产 物,与0.5 µl Liz120 SIZE STANDARD 和9µl Hi-Di混匀,95 ℃变性5 min 后上ABI3730XL 测序仪,使用GeneMapper 4.1 软件分析峰图结果。测序与基因分型由深圳华大基因科技有限公司完成。

1.3 统计学分析 对IL-15 rs3806798、IL-17A rs2275913 及IL-18 rs1946518 和rs187238 位点基因型分布进行Hardy-Weinberg 平衡检验,P>0.05 表示符合平衡检验。采用χ2检验进行组间对比,Logistic二元逐步回归进行多因素分析,统计分析采用SPSS26.0软件进行,P<0.05为差异具有统计学意义。

2 结果

2.1 样本及SNP 质控 IL-15 rs3806798、IL-17A rs2275913、IL-18 rs1946518 和rs187238 这4 个位点在RSA 组和对照组基因型频率进行Hard-Weinberg遗传平衡检验,结果显示所有位点均符合Hard-Weinberg 遗传平衡定律(P>0.05),说明群体具有代表性,见表3。

表3 4个SNP位点基因型分布的Hardy-Weinberg平衡检验Tab.3 Hardy-Weinberg equilibrium test for genotype distribution of four SNP locus

2.2 4个SNP 位点基因型频率、等位基因频率分布及遗传模式分析 检测RSA 组与对照组IL-15 rs3806798、IL-17A rs2275913、IL-18 rs1946518 3 个SNP 位点基因型频率和等位基因频率分布,差异均无统计学意义(P>0.05);对以上3 个SNP 采用非条件Logistic回归模型分析等位基因隐性、显性遗传模式,结果显示RSA 组和对照组差异均无统计学意义(P>0.05),见表4。但IL-18 rs187238 SNP 位点GG型、CG 型、CC 型在对照组中检出率分别为0、23.3%、76.7%,RSA 组检出率为2.0%、12.0%、86.0%,其构成比差异有统计学意义(χ2=9.256,P=0.010)。通过非条件Logistic回归分析显性、隐性遗传模式,结果显示G 等位型(GC+GG 基因型)与RSA患病风险降低相关(χ2=4.303,OR=0.53,95%CI=0.29~0.97,P=0.038),见表4。但G 等位基因不是RSA的保护性等位基因(χ2=2.275,OR=0.66,95%CI=0.38~1.14,P=0.132),见表4。

表4 两组4个多态性位点基因型和等位基因分布比较及遗传模式分析Tab.4 Comparison of four SNPs's genotype,allele frequency and genetic model analysis in two groups

2.3 连锁不平衡检验和单体型分析 对4 个SNP进行两两间连锁不平衡检验,rs1946518 和rs187238存在完全连锁不平衡(D'=1,r2≥0.152),其余位点两两之间不存在连锁不平衡(图1)。本研究采用SHEsis在线软件进行单体型种类和单体型频率估算[4-5],以最低频率阈值,即单体型频率<0.03 不纳入分析范围,本研究4 个位点可构建7 种单体型(AGGC、TAGC、TATC、TATG、TGGC、TGTC、TGTG),其 中TGTG 单体型在RSA 组与对照组分布差异有统计学意义(P<0.05),同时非条件Logistic 回归分析显示TGTG 单体型是RSA 的保护因素,其OR(95%CI)=0.361(0.158~0.827)[4-5]。但其余各单体型与RSA发病无关(P>0.05)。见表5。

表5 4个位点单体型频率在RSA组与健康对照组分布比较Tab.5 Comparison of haplotype frequencies of four loci between RSA group and healthy control group

图1 4个SNPs位点的LD图Fig.1 LD map of four SNPs

3 讨论

目前RSA 病因尚不明确,但在大量流产相关因素中,涉及异常免疫反应和IL 的因素尤为引人注目[6]。IL是一类在人体中介导多种免疫反应的免疫调节蛋白,其与相应免疫细胞相互作用,维持母胎免疫平衡。在大量胚胎植入失败或流产相关因素中,IL参与异常免疫反应尤为显著[7]。

最新研究发现IL-15 是由髓样细胞和其他类型细胞表达,免疫调节方面具有治疗潜力的一种多功能分子,其可参与T 细胞反应、激活NK 细胞、协助B 细胞归巢、调节炎症反应,特别在诱导和维持T 细胞应答方面,是免疫治疗方面最具治疗潜力的靶点[8]。目前IL-15 基因多态性与RSA 易感性的关联研究相对较少。WU等[9]对1 015例接受新鲜非供者体外受精周期女性进行前瞻性队列分析,探究IL-15基因rs3806798 A/T 对IVF 结局的影响,结果表明临床妊娠率、胚胎移植率和活产率差异无统计学意义。但TOTH 等[8]研究发现患者胎盘组织中IL-15表达增加可能与胚胎丢失后的植入障碍有关。本研究未发现IL-15 基因rs3806798 位点与RSA 发病的风险增加有关,在多个遗传模式(隐性、显性)下差异无统计学意义。目前IL-15 和RSA 的关系研究较少,但鉴于IL-15 免疫治疗的潜力,需要更多数据去支持其与RSA的关联研究。

IL-17A 是IL-17 家族成员,既往研究表明IL-17在防御病菌、自身免疫病发生等过程中发挥重要作用,近年来逐渐成为医学及免疫学的研究热点。rs2275913 位点位于IL-17A 基因上游区域中核因子激活T细胞(NFAT)结合基序内,NFAT 是IL-17表达的关键调节因子。有研究表明rs2275913 可能影响IL-17转录调控,且可提高IL-17分泌[10]。ZIDAN等[11]采用RFLP 对120 例RSA 患者和120 例无流产史且至少生育1 胎的女性为对照探讨rs2275913 与RSA的关联,发现IL-17A(rs2275913)AA 基因型与RPL风险增加有关,其OR=2.440,95%CI=1.140~5.200,P=0.025。蔺静等[12]研究发现RSA 组该位点A 等位基因频率明显高于对照组,rs2275913位点AG和AA基因携带者RSA 相对危险度分别为GG 等位基因的2.012倍和2.545倍,但在本研究中未发现此种关联(OR=1.229,95%CI=0.654~2.307,P=0.521 6)。本研究与BAHADORI 等[13]和NAJAFI 等[14]的研究结果一致,即IL-17A rs2275913 基因型频率与RPL 风险之间无显著相关性。

越来越多的证据表明IL-18 基因可诱导INF-α,使NK 细胞活化,参与子宫血管的形成和着床,该机制在RSA 的发病中发挥重要作用[15]。人IL-18 基因位于染色体11q22.2~q22.3,有6 个外显子和5 个内含子。转录起始点位于外显子-2 上。IL-18 有2 个启动子区,一个位于外显子-2的6.7 kb上游,另一个位于5'-侧。rs187238(-137G/C)、rs1946518(-607A/G)位于启动子-1 区。在基因启动子转录活性分析中,有研究表明-607A、-137C 等位基因可出现低活动性,因此该位点变化可能导致产物功能增强或减弱,或者带来对某些疾病的易感性,也就是遗传因素变化,这对机体免疫机制研究有积极意义[16]。ZHANG 等[17]回顾了2015 年以前的21 项MEDLINE、EMBASE、OVID SP 和PubMed 的研究,以评估RPL相关IL 的基因多态性。对IL-18 基因的rs1946518、rs187238 多 态 性 进 行Meta 分 析 和 综 述[18-23],其 中rs1946518 多态性在两种显性和隐性遗传模型下与RSA 均无关:显性模式P=0.310,OR=0.820,95%CI(0.560~1.210);隐 性 模 式P=0.170,OR=0.730,95%CI(0.470 0~1.140)。但根据rs187238 多态性筛选出来的5项研究,固定效应结果表明,显性遗传模式下,rs187238 多态性与RSA 无关联[P=0.370,OR=1.080,95%CI(0.910 0~1.270)],但在隐性遗传模 型 下 存 在 关 联 性[P<0.01,OR=1.690,95%CI(1.240~2.310)]。SALIMI 等[22]的一项meta 研究中发现,rs1946518位点在等位基因显性、隐性、加性及共显性模式中均未发现该位点与RSA 发病相关[18-19,21,24-25]。而rs187238 位点在纯合子模式下[CCvsGG:OR=1.653,95%CI(1.014~2.694),P=0.004]以及隐性模式下[CCvsCG+GG:OR=1.801,95%CI(1.345~2.411),P=0.001]与RSA 风险之间存在显著关联[15,18-21,23,25]。当按种族分层时,在亚洲人群中,rs187238 多态性与RSA 风险间无显著关联。然而,基于基因分型方法进行的亚组分析显示,在TaqMan分型研究组中,rs187238 位点多态性与RSA 风险间的关联呈阳性结果。本研究首次对甘肃地区人群IL-18 基因的rs1946518、rs187238 多态性进行分析,结果显示本研究中RSA 患者rs1946518 位点基因型和等位基因频率与无RSA 史患者差异无统计学意义(P>0.05),在隐性或显性遗传模式下,利用Logis⁃tic 回归模型分析显示两组间差异均无统计学意义(P>0.05),与既往研究基本一致[18-19,21,25];但针对rs187238 的位点研究发现,在隐性遗传模式下[CCvsCG+GG:OR=0.535,95%CI(0.295~0.971),P=0.0380],结果与我国其他研究不一致[21,23]。YUE等[21]研究未发现该位点CC vs GG+GC 在RSA 患者与对照中存在差异,而王丹等[23]研究表明该位点GC+CC基因型可能是RSA 易感基因型,C 等位基因可能是其发病的遗传易感基因之一。本研究中由于检测出的GG基因型较少,无法计算。

进一步的连锁不平衡和单体型分析发现,rs1946518 和rs187238 存在完全连锁不平衡。TGTG单体型频率在RSA 组及对照组分布差异有统计学意义(P<0.05),同时非条件Logistic 回归分析显示,该单体型与RSA 发病均有关(OR=0.361,95%CI=0.158 0~0.827 0)。

综上所述,本研究发现rs187238 与甘肃地区RSA 患病有关,但不能完全排除IL-15、IL-17A 基因与中国汉族RSA 疾病的相关性,研究结果与既往研究存在差异,可能与种族地域有关。本研究虽仅选取4 个SNPs,不能完全代表IL-15、IL-17A、IL-18 基因。此外由于本研究样本量较少,且未考虑基因-基因和基因-环境相互作用导致的RSA关联性,因此有必要开展更大样本量、更高质量的研究以进一步验证本研究结论。

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