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基于光谱指数的博斯腾湖西岸湖滨绿洲土壤有机碳含量估算模型

2022-05-16牛芳鹏李新国麦麦提吐尔逊·艾则孜赵慧江远东

江苏农业学报 2022年2期
关键词:随机森林

牛芳鹏 李新国 麦麦提吐尔逊·艾则孜 赵慧 江远东

摘要:以博斯腾湖西岸湖滨绿洲为研究区,将野外原位高光谱实测数据和土壤有机碳(SOC)含量作为基础数据,通过对原始光谱进行4种数学变换,探索不同光谱变换形式下的弓曲差(C)、差值光谱指数(DSI)、简单比值土壤指数(RSI)、亮度光谱指数(BSI)、归一化土壤指数(NDSI)与SOC含量的关系,并建立基于随机森林法(RF)的SOC含量估算模型。结果表明:(1)研究区SOC含量主要集中在5.25~78.76 g/kg,平均值为21.82 g/kg,变异系数为69.11%,呈中等变异性;(2)在光谱数据lgR下,SOC含量与DIS指数相关系数最高,相关系数为0.80,最佳组合波段为(1 758 nm,1 752 nm);(3)基于不同光谱指数与弓曲差(C)建立的模型验证集精度R2和RMSE分别介于0.67~0.84和5.85~8.45 g/kg,模型的RPD均在1.66以上;在基于光谱数据lg(1/R)变换下,模型的验证集R2=0.82、RMSE=3.52 g/kg、RPD=3.99,可以较好地估算研究区SOC含量,为干旱半干旱地区湖滨绿洲SOC含量反演提供依据和参考。

关键词:土壤有机碳含量;估算模型;光谱指数;随机森林;湖滨绿洲

中图分类号:S153.6文献标识码:A文章编号:1000-4440(2022)02-0414-08

Estimation model of soil organic carbon content in lakeside oasis on the west coast of Bosten Lake based on spectral index

NIU Fang-peng LI Xin-guo MAMATTURSUN·Eziz ZHAO Hui JIANG Yuan-dong

Abstract:Taking the lakeside oasis on the west coast of Bosten Lake as the study area, and the in situ hyperspectral data and soil organic carbon (SOC) content were taken as the basic data. Four mathematical transformations were performed on the original spectrum to explore the relationships between bow curvature difference (C), difference spectral index (DSI), simple ratio soil index (RSI), brightness spectral index (BSI), normalized soil index (NDSI) and SOC content. A SOC content estimation model based on random forest method was established. The results indicated that the content of SOC was mainly concentrated in 5.25-78.76 g/kg, the average value was 21.82 g/kg, the coefficient of variation was 69.11%, showing moderate variability. Under the spectral data lgR, the correlation coefficient between SOC content and DIS index was the highest, the correlation coefficient was 0.80, and the best combination band was (1 758 nm, 1 752 nm). The R2 and RMSE of the model validation set based on different spectral indices and C were 0.67-0.84 and 5.85-8.45 g/kg, respectively, and the RPD of the model was above 1.66. Based on the transformation of spectral data lg(1/R), the R2, RMSE and RPD of the model validation set were 0.82, 3.52 g/kg and 3.99, respectively. The model can better estimate the SOC content in the study area, and the research results can provide the basis and reference for the inversion of SOC content in lakeside oasis in arid and semi-arid regions.

Key words:soil organic carbon content;estimation model;spectral index;random forest;lakeside oasis

江蘇农业学报2022年第38卷第2期

牛芳鹏等:基于光谱指数的博斯腾湖西岸湖滨绿洲土壤有机碳含量估算模型

土壤有机碳(Soil organic carbon,SOC)含量是评价土壤质量的关键参数,对维护区域生态平衡有重要意义[1]。在人类活动的影响下,SOC循环的加速变化引起了土壤环境的改变,其储量、密度和分布特征等问题受到学者们的高度关注[2-3]。传统的土壤SOC含量估算方法繁琐,成本高,高光谱技术可以满足大面积地区快速、准确地估算SOC含量的需要。国内外学者对干旱、半干旱地区森林、草地、湿地和农田等不同生态系统类型的SOC估测作了大量研究[4-6]。早期学者们通过相关分析法与机器算法研究了SOC含量与不同变换形式下土壤光谱反射率的关系,并挑选特征波段进行SOC估算模型构建。叶勤等采用光谱变换与相关分析方法,基于主成分分析结果构建了土壤有机质含量(Soil organic matter,SOM)的BP神经网络模型,验证结果决定系数(R2)为0.893 0,均方根误差(RMSE)为0.118 5%[7]。AMIN等通过对光谱数据转换分析,得到了一个在SOC含量3.80~6.71 g/kg范围内比较精确的模型,R2、RMSE和相对分析误差(RPD)分别为0.85、3.77 g/kg和2.54[8]。近年来光谱指数、弓曲差、多变量回归建模方法广泛应用于SOC含量定量估算模型中,基于不同预处理构建的二维光谱指数能有效地削弱噪声干扰[9-10]。赵明松等建立了光谱特征指数、弓曲差与SOM含量的预测模型,经检验R2介于0.67~0.73,RMSE介于3.21~3.51 g/kg [11]。张子鹏等比较了不同维度光谱指数下支持向量机(Support vector machine,SVM)对SOM含量估测的建模效果[12]。HONG等研究结果表明随机森林(Random forest,RF)和连续小波变换(Continuous wavelet transform,CWT)构建的SOC含量预测模型具有很好的鲁棒性,交叉验证结果R2=0.87[13]。张智韬等利用RF与SVM分类方法构建了荒漠区SOC含量预测模型,验证集R2=0.979,RMSEP=0.481 g/kg,RPD=7.004[14]。

与以往采土后室内测量光谱相比较,基于野外原位测量土壤高光谱数据能保持土壤原有属性,建立的光谱模型更加准确;室内光谱测量土样需要将其进行研磨和过筛[15],破坏了土壤原有结构,尽管有利于土壤有机碳光谱特征研究,但实用性较差,难以用于野外快速测量土壤理化性质。野外原位测量时为将影响土壤光谱的因素(成土母质、土壤水分、粗糙度等)降到最低,选择土壤干燥程度、土块大小相对均一的样地进行测量,并通过光谱预处理技术进一步减弱反射光谱受到的噪声影响[12]。基于此本研究以新疆博斯腾湖西岸湖滨绿洲为靶区,以野外原位实测光谱数据为基础,探索不同光谱预处理下二维光谱指数、弓曲差与SOC含量间的关系,并在此基础上利用偏最小二乘回归(Partial least squares regression,PLSR)和随机森林(RF)2种机器学习算法构建研究区SOC含量高光谱估算模型,以期提高研究区土壤SOC含量的估算精度,为快速有效测定湖滨绿洲SOC含量提供技术支持。

1材料与方法

1.1研究区概况

博斯腾湖西岸湖滨绿洲(41°45′~42°10′ N,86°15′~86°55′ E)是典型的山前湖泊绿洲,地处新疆焉耆盆地,隶属于新疆维吾尔自治区博湖县(图1)。地势由西北向东南倾斜,夏季月平均气温22.8 ℃,冬季平均气温9.0 ℃,无霜期176~200 d,多年平均降水量83.55 mm,年均温8.0~8.6 ℃,季节过渡快,属于大陆性荒漠气候。主要植被类型有山杨、柽柳和梭梭等,主要土壤类型有草甸土、绿洲潮土、沼泽土和荒漠林土等[16]。

1.2材料与方法

1.2.1样品采集与光谱处理分析样品采集时间为2020年10月,均匀布点,共采集土壤样品47个,涵盖研究区主要土地利用类型,包括耕地、林地、盐渍地和非利用地。采集深度为0~20 cm,剔除杂物后,采用四分法称取200 g土壤,装袋,带回实验室进行自然干燥,研磨后过0.25 mm孔筛。SOC含量测定采用重铬酸钾容量法(外加热法),单位为g/kg[17]。光谱数据通过ASD FieldSpec3地物光谱仪于野外原位采集,在无风或风力小于3级,云量小于5%的晴朗天气,北京时间12∶00-14∶00进行测定,测量地点选择较为开阔地块,且尽量远离可能干扰土壤光谱的物体,光纤探头的视场角不大于25°,垂直放置在土样表面15 cm处,使用前仪器预热30 min,并进行白板校正,以消除暗电流影响。测试过程中,为减少外部环境带来的误差,每个采样点随机选择2个测试点,每个测试点测量5次,对10条光谱曲线取均值后作为该土样的反射光谱值[18]。为提高光谱数据的信噪比,增强光谱曲线的峰谷变化,采用Savitaky-Golay(2次多项式,5个点)平滑去噪,对原始光谱反射率进行对数变换(lgR)、对数的倒数变换[lg(1/R)]、均方根变换(R )和包络线去除(RC)。统一去除受大气水汽影响较大的1 300~1 450 nm和1 800~1 950 nm波段以及噪聲较大的尾部波段(2 451~2 500 nm)[19-20]。运用MATLAB软件进行光谱指数的构建与模型的建立。

1.2.2土壤光谱指数的构建

1.2.2.1弓曲差(600 nm处)计算弓曲差(C)即光谱曲线550 nm和650 nm处的光谱反射率均值与600 nm处的光谱反射率之差值[21]。

1.2.2.2光谱指数构建采用以下指数构建土壤光谱指数:差值光谱指数(DSI)、简单比值土壤指数(RSI)、亮度光谱指数(BSI)、归一化土壤指数(NDSI)[22-23]。

1.3随机森林模型

随机森林是一种基于分类树的算法,主要利用随机森林分类器(RF)对新数据进行判别和分类,并通过总结大量的分类树来提高模型的预测精度[24]。在处理比较大的数据时,运算速度非常快,不需要变量选择。在计算变量的非线性效应时,它对异常值不敏感,能够充分反映变量之间的相互作用。与一般分类算法相比,RF算法结合了随机特征选择和Bagging算法2种技术,能够很好地容忍噪声和离群点的影响,能够同时处理连续和离散数据[25]。

1.4估测模型构建与验证

在47个样本中,随机抽取31个作为建模集,16个作为验证集。采用Matlab软件构建PLSR模型与RF模型。选取决定系数(R2)、均方根误差(RMSE)和相对分析误差(RPD)检验模型的准确性。R2取值为0~1.00,当R2越大、RMSE越小,模型的预测能力越好,适用性越高。RPD值可以用来解释模型的预测能力,当RPD<1.40时,模型不能准确预测;当1.40≤RPD<2.00时,模型的预测能力一般;RPD≥2.00时,模型具有较高的预测能力[26]。

2结果与分析

2.1土壤有机碳含量统计分析

由表1可知,研究区SOC含量主要集中在5.25~78.76 g/kg,平均值为21.82 g/kg,呈中等变异性,变异系数为69.11%。随机划分建模集与验证集,SOC含量平均值分别为22.03 g/kg和21.42 g/kg,变异系数分别为71.77%和65.50%,两者相差不大,能较好地反映研究区SOC含量平均水平。

2.2基于弓曲差的土壤有机碳含量建模

利用5种不同光谱数据的弓曲差建立研究区SOC含量的PLSR和RF模型。由表2可知,原始光谱数据(R)的弓曲差构建的PLSR与RF模型效果较差,验证集R2分别为0.65和0.69,RPD分别为1.14和2.07。PLSR线性模型中,光谱数据lg(1/R)的弓曲差模型效果最好,模型R2为0.69,RMSE为12.75 g/kg,RPD为1.10;光谱数据RC的弓曲差模型效果最差,R2为0.51,RMSE为13.03 g/kg,RPD为1.08。与PLSR模型相比较,RF模型预测能力均有所提升,RPD均大于2.00;基于光谱数据R的弓曲差构建的RF模型效果最好,R2为0.83,RMSE为6.14 g/kg,RPD为2.29。

2.3光谱指数与土壤有机碳含量相关性分析

由图2可知,不同光谱数据变换下,不同光谱指数与土壤有机碳含量相关系数二维图存在明显差异。在原始光谱反射率R中,SOC含量与DSI指数、RSI指数和NDSI指数的最佳组合波段均为(481 nm,480 nm)、(942 nm,941 nm)、(999 nm,993 nm),最大相关系数分别为-0.68、0.66、0.77;与BSI指数的最大相关系数为-0.65,最佳组合波段为(1 955 nm,1 851 nm)。与DSI指数相关性较高的组合波段主要分布在412~548 nm、586~701 nm、794~871 nm和2 112~2 162 nm。在lgR光谱数据数据下,SOC含量与DIS指数、RSI指数、BSI指数和NDSI指数最大相关系数分别为0.80、-0.70、0.76、-0.69,最佳组合波段分别为(1 758 nm,1 752 nm)、(943 nm,941 nm)、(1 833 nm,677 nm)、(999 nm,993 nm);在lg(1/R)光谱数据下,SOC含量与DIS指数、RSI指数、BSI指数和NDSI指数最大相关系数分别为-0.77、-0.68、0.76、-0.70,最佳组合波段分别为(1 047 nm,1 046 nm)、(942 nm,941 nm)、(1 838 nm,676 nm)、(943 nm,941 nm);在R光谱数据下,SOC含量与DIS指数、RSI指数、BSI指数和NDSI指数最大相关系数分别为0.77、0.77、0.76、-0.68,最佳组合波段分别为(1 757 nm,1 752 nm)、(1 047 nm,1 045 nm)、(1 838 nm,676 nm)、(1 851 nm,677 nm);在RC光谱数据下,SOC含量与DIS指数、RSI指数、BSI指数和NDSI指数最大相关系数分别为0.75、0.76、0.69、0.73,最佳组合波段分别为(942 nm,941 nm)、(945 nm,944 nm)、(2 494 nm,1 861 nm)、(1 756 nm,1 753 nm)。

2.4基于光谱指数的土壤有机碳含量建模

分别将光谱数据R、lgR、lg(1/R)、R和RC的DIS指数、RSI指数、BSI指数和NDSI指数及其弓曲差组合作为SOC含量估算模型所需的独立变量,基于RF方法分别构建SOC含量的高光谱估算模型。由表3可知,在原始光谱数据R中,DSI指数与NDSI指数的SOC模型精度最高,R2均为0.75,RPD>2.00;在光谱数据lgR中,BSI指数的SOC模型精度最高,R2为0.84,RPD为2.14,DSI指数的SOC模型精度最低,R2为0.73;在光谱数据lg(1/R)中,DSI指数的SOC模型精度最高,R2为0.82,RMSE为6.44 g/kg,RPD为2.18;在光谱数据R与RC中,RSI指数的SOC模型精度最高,R2分别为0.81、0.76,RMSE分别为6.67 g/kg、5.67 g/kg,RPD分别为2.10、2.47。20个预测模型中,基于光谱R的RSI指数RF模型的预测能力最优,能够粗略估算研究区的SOC含量。将5种光谱数据的DIS指数、RSI指数、BSI指数和NDSI指数分别与弓曲差组合进行SOC的RF建模。结果表明,由于采用了较多的光谱特征指数,SOC含量的建模效果整体上有不同程度的提升,建模集的R2和RMSE分别介于0.69~0.81和7.99~9.01 g/kg,验证集的R2和RMSE分别介于0.67~0.84和5.85~8.45 g/kg,模型的RPD均在1.66以上,其预测能力有不同程度的提升,基于R光谱指数和弓曲差的SOC含量估算模型的泛化能力最高。

光谱数据变换形式见表2注。R2:决定系数;RMSE:均方根误差;RPD:相对分析误差。DSI:差值光谱指数;RSI:简单比值土壤指数;NDSI:归一化土壤指数;BSI:亮度光谱指数;C:弓曲差。

在光谱数据变换的基础上,联合4种光谱指数与弓曲差为变量,进行模型的构建,由表4可知,光谱数据RC建立的模型验证集R2为0.63,RMSE为8.42 g/kg,RPD为1.67,相比于其他光谱数据建立的模型估算效果较差;光谱数据R建立的模型效果最好,R2为0.79,但验证集R2为0.81,估算效果较弱于lg(1/R)模型;光谱数据lg(1/R)建立的模型的验证集R2为0.82,RMSE为3.52 g/kg,RPD为3.99。通过综合评估5种光谱数据建立的模型评价参数可知,对SOC含量估算的建模效果依次为lg(1/R)>R>lgR>R>RC,说明利用光谱数据lg(1/R)建立的模型可以很好地估算研究区SOC含量。

3讨论

现有的研究大多是基于典型特征波段或单一光谱指数建立SOC含量估算模型,但这些数据的光谱信息往往是饱和的,通过对光谱数据进行数学变换和二维指数提取,可以有效地压缩噪声对目标光谱的影响,充分考虑波段间的相关性。张娟娟等基于DSI指数对土壤有机质含量进行了预测,R2为0.79,RMSE为4.71 g/kg,RPD为2.30[27]。洪永胜等以江汉平原公安县为研究区,發现二维相关性分析提取的敏感光谱指数的PLSR建模效果优于一维相关性分析提取的敏感波段,其中NDSI指数模型的鲁棒性最好,验证集R2为0.82,RPD值为2.46,模型稳定可靠[28]。焦彩霞等认为,由三波段建立的600 nm弓曲差光谱指数对数函数模型可以更好地实现土壤有机质含量的预测[29]。以上学者采用土壤光谱指数作为模型因子来估算土壤有机质含量,但由于没有考虑各种预处理方法对光谱指数的影响,因此模型的构建具有局限性。基于光谱数据不同变换形式,本研究以2种思路构建了SOC含量模型,第一种方法利用弓曲差与光谱指数构建PLSR线性与RF非线性的估算模型,另一种方法利用基于光谱数据变换的多种指数与弓曲差联合建模,效果显著,利用光谱数据变换形式lg(1/R)构建的模型的验证集R2达到0.82,这与曹肖奕等[30]、WANG等[31]的研究结果基本一致。在后续研究工作中将进一步探讨野外原位光谱测量中土地类型、土壤质地等因素对估算结果的影响。

4结论

与PLSR线性模型相比较,基于光谱数据R的弓曲差构建的RF模型效果最好,R2为0.83,RMSE为6.14 g/kg,RPD为2.29。在lgR光谱数据下,SOC含量与DIS指数相关系数最高,相关系数为0.80,最佳组合波段为(1 758 nm,1 752 nm)。

基于不同光谱指数与弓曲差的建模精度R2和RMSE分别介于0.67~0.84和5.85~8.45 g/kg,模型的RPD均在1.66以上。基于光谱数据R和弓曲差的SOC预测模型的泛化能力较高。基于光谱数据lg(1/R)变换,模型的验证集R2=0.82,RMSE=3.52 g/kg,RPD=3.99,可以较好地估算研究区土壤有机碳含量。

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(责任编辑:张震林)

收稿日期:2021-07-11

基金项目:国家自然科学基金项目(41661047、U2003301);新疆维吾尔自治区重点实验室开放课题(2018D04026)

作者简介:牛芳鹏(1995-),男,甘肃庄浪人,硕士研究生,研究方向为干旱区土壤资源变化及其遥感应用研究。(E-mail)niufp0225@163.com

通讯作者:李新国,(E-mail)onlinelxg@sina.com

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