镉胁迫对大豆细胞周期G2/M阻滞调控的影响
2021-09-02曹霞王春雷李志刚崔天宇王晓东
曹霞,王春雷,李志刚,崔天宇,王晓东
(1.内蒙古民族大学 农学院,内蒙古 通辽028043;2.通辽市农牧业科学研究所,内蒙古 通辽028000)
大豆(Glycine max)起源于中国,是全球主要栽培的农作物之一,栽培大豆是野生大豆(G.soja)经历了5 000多年的时间驯化而来的[1],截止到目前,在大豆重要农艺性状方面,关于基因克隆和基因功能解析等已有较多研究[2-5].随着工业的迅速发展,我国土壤受重金属污染日趋严重,其中最为明显的是镉(Cd)污染,有研究发现,Cd对植物的毒害效应在很多方面都有表现,例如抑制种子萌发、影响细胞分裂、幼苗生长、植物的代谢(如水分代谢、矿质营养、光合与呼吸等)、破坏活性氧的防御系统等[6-8].镉胁迫还会导致大豆叶片畸形、变黄,茎秆、叶脉和叶片呈红褐色,植株矮化、茎秆纤细、生长缓慢、枯萎死亡.ANDRES等[9]和SCEBBA等[10]研究指出,镉胁迫不仅能引起大豆基因组DNA甲基化水平和模式的改变[11],还对基因产生毒性.LIU等[12]和吴庆钰等[13]研究分别指出,随着Cd浓度的增加,大麦根尖基因组DNA的RAPD图谱(包括RAPD谱带的缺失、增加及其荧光强度)和水稻叶片DNA的损伤均发生显著变化,这些变化可能直接或间接与细胞周期的调控机制有关.到目前为止,有关细胞周期调控机制的报道很少,大部分研究集中在各种目标基因功能的鉴定及表达,如CIPK基因[14]、GmMP基因[15]、Gm DAO1基因[16],或者是基因家族全基因组的鉴定和分类,如OSCA基因家族[17]、KUP/HAK/KT钾转运体基因家族[18]、DNA甲基化酶的分析[19]等,而ROBERT等[20-21]研究表明,Cd胁迫引起大豆悬浮液细胞周期基因CyclinB1和CDK-A的表达差异,导致DNA损伤,细胞周期阻滞期发生在G1/S期和G2/M期,但是对于其损伤反应和细胞周期阻滞调控机制尚不清楚,而DNA错配修复系统中MSH2和MSH6蛋白能够识别由Cd胁迫引起拟南芥DNA损伤,并参与细胞周期调控,那么在大豆中是否也是如此,目前鲜见报道.本试验选取2个对Cd有不同耐性的品种,分析Cd胁迫对大豆细胞周期阻滞调控的影响,研究细胞周期阻滞发生的时期和相关基因表达的相关性,以期为大豆抗性育种、遗传改良育种提供潜在的基因突变风险评估.
1 材料与方法
1.1 试验材料
试验材料由沈阳农业大学大豆研究所提供,分别为“辽豆10号”(对Cd敏感)和“沈农豆20”(对Cd顿感).
1.2 试验设计
采用培养皿双层滤纸培养法.Cd浓度分别设为0、0.25、0.50和2.50 mg·L-1等4个梯度,每个浓度重复5次,共40个处理;放置于光照培养箱里25±1℃培养4 d,光周期为16 h/8 h.
1.3 测定指标及方法
1.3.1 幼苗形态指标测定及方法
取不同Cd浓度处理下的大豆幼苗,观察发芽情况,计算发芽率;分别测量其根长、鲜重,计算根长抑制率,公式如下:n=(1-x/y)×100%(式中,x为各处理组幼苗初生根平均根长;y为对照组幼苗初生根平均根长).
1.3.2 细胞周期测定及方法
取不同Cd浓度处理后的幼苗,剪取根尖(约0.5 cm),用滤纸吸干水分后放入盛有200 μL细胞核解离液的培养皿中,迅速用锋利的刀片将其切碎,转移到2 mL的离心管中,室温下静置5~10 min,然后过50 μm和30 μm的尼龙筛,向滤液中加入解离液体积1.4倍的DAPI(Partec,Germany)染液,室温下暗处放置30~45 min,然后采用倍性分析仪CyFlow flow cytometer(Partec,Germany)在365 nm波长处进行测定.
测定结果使用Flowjo 10 win 64 software(BD Biosciences,San Jose,CA)进行分析.
1.3.3 大豆幼苗根尖RNA提取和qRT-PCR测定及方法
(1)总RNA提取:采用RNA提取试剂盒,名称为EZ-10DNAaway RNA Mini-prep Kit,用蛋白质核酸分析测定仪测定OD260/OD280和OD260/OD230的比值来确定所提取RNA的纯度,并用1%的普通琼脂糖凝胶电泳在120~130 V的电压下快速电泳检测RNA的完整性.
(2)RNA反转录cDNA:采用cDNA试剂盒,名称为PrimeScriptTM 1st strand cDNA Sythesis kit.
(3)PCR扩增体系采用SYBR Green Mix:20 μL反应体系为SYBR(缓冲液)10 μL,RF(引物)2 μL,cDAN模板量1 μL,无菌水7 μL.
(4)PCR扩增流程:95℃预变性30 s,95℃变性5 s,60℃退火30 s,75℃退火5 s,40个循环,60℃延伸10 min.
每个反应结束后采集荧光,每个处理做3个重复,并建立实时扩增曲线和溶解曲线.上述基因转录水平变化的计算公式为:2-△△Ct,其中,△△Ct=(Ct target-Ct control)Sample2-(Ct target-Ct control)Sample1.以大豆UBQ10基因为内参基因,所用引物序列见表1.PCR扩增后用QPCR分析数据模板进行基因表达的变化规律分析.
表1 引物序列Tab.1 Sequences of primers
1.3.4 根尖DNA提取及RAPD测定
(1)DNA提取采用新型植物基因组DNA提取试剂盒(CW0531)(北京康维世纪生物科技有限公司)提取幼苗根尖全基因组DNA.使用核酸蛋白仪测定其纯度及含量,用1%琼脂糖凝胶电泳及Takara DL2000 DNA Marker进行含量校准及其完整性检测.
(2)RAPD分析方法参照LIU等[23]和李珊珊[24],引物选用Primer 3和Primer 11(表2).
表2 试验中使用的2种随机引物序列Tab.2 Two random primer sequences used in the experiment
1.4 数据处理分析
采用SPSS软件(版本20.0)和Microsoft Excel 2003进行数据统计分析.
2 结果与分析
2.1 Cd胁迫对大豆幼苗根长生长的影响
与对照组相比,辽豆10号处理组的鲜重除了在Cd浓度为2.50 mg·L-1时达到了显著性差异(P<0.05)外,其他均无显著差异,发芽率均无显著差异,而沈农豆20处理组的发芽率和鲜重均没有达到显著性差异;与对照组相比,辽豆10号和沈农豆20处理组的根长均达到了显著性差异(P<0.05);辽豆10号的根长+胚轴在Cd浓度为0.50和2.50 mg·L-1时达到了显著性差异(P<0.05),而沈农豆20则是在Cd浓度为0.25 mg·L-1达到了显著性差异(P<0.05);在Cd浓度为0.25 mg·L-1时辽豆10号和沈农豆20均表现为促进作用,其抑制率分别为-13.42%和-15.67%,在0.50 mg·L-1和2.50 mg·L-1Cd处理下辽豆10号和沈农豆20均表现为抑制作用,抑制率分别为25.92%、54.21%和19.52%、23.64%,根长与Cd水平呈明显的倒U字型—剂量关系(表3),说明辽豆10号较沈农豆20对Cd毒性更敏感.
表3 Cd胁迫对大豆发芽率、根长、鲜重的影响Tab.3 Effects of Cd stress on germination,root length,and fresh weight of soybean
2.2 Cd胁迫对大豆根尖细胞周期阻滞调控的影响
辽豆10号在Cd胁迫下其根尖细胞核DNA含量分布比例在2C(细胞核内有2组DNA)水平呈递增变化,DNA含量比例的增加量达5%~50%,4C(4个组DNA数目)呈递减变化,均有显著性差异(P<0.05),而8C(8个组DNA数目)水平DNA含量分布比例无显著变化,说明在Cd胁迫下辽豆10号(敏感型)幼苗根尖细胞周期是被阻滞在G1/S期(图1a);沈农豆20根尖细胞核DNA含量分布比例在2C水平呈递减变化,4C呈递增变化,且DNA含量比例的增加量达13%~18%,而8C水平DNA含量分布比例同样没有达到显著性差异,说明沈农豆20(钝感型)幼苗根尖细胞周期是被阻滞在G2/M期(图1b).试验结果表明,在受Cd胁迫后,对重金属Cd耐性不同的品种,其细胞周期阻滞的时期也不相同,这可能与品种本身对Cd胁迫应答反应机制及抵御胁迫机制不同有关.
图1 FCM流式细胞术对Cd(0~2.50 mg·L-1)处理4 d后的大豆根尖细胞核DNA含量分析Fig.1 Analysis of nuclear DNA content in root tips of soybean seeds Liaodou 10 and Shennongdou 20 treated with CD(0~2.50 mg·L-1)for 4 d by FCM flow cytometry
2.3 与细胞周期相关基因的qRT-PCR表达分析
2.3.1 Cd胁迫影响大豆幼苗根尖细胞周期G2/M期相关基因表达
辽豆10号细胞周期G2/M期相关的基因表达呈递减的变化趋势,CYCB1;1、WEE1和CyclinB基因的表达量随着Cd浓度的增加呈下调变化趋势,除了WEE1基因的0.25 mg·L-1Cd处理外,其他处理达到了显著或极显著差异(P<0.05或P<0.01),其中,在2.50 mg·L-1Cd处理下,CYCB1;1、WEE1和CyclinB基因的表达量分别较对照组下调了0.749、0.878和0.564(图2a);沈农豆20的细胞周期G2/M期相关的基因表达与辽豆10号呈现不同的变化趋势,与对照组相比,CYCB1;1、WEE1和CyclinB基因的表达量在0.25 mg·L-1Cd胁迫下显著增加,达到极显著性差异(P<0.01),其增加量分别是对照组的1.6倍、5.5倍和1.5倍,随着镉浓度的增加,其表达量显著降低,整体来看,随着Cd胁迫浓度的增加,CYCB1;1、WEE1和CyclinB基因的表达量呈典型的倒U型,与辽豆10号对照组相比,在0~2.50 mg·L-1Cd处理下CYCB1;1、WEE1和CyclinB基因的表达量均显著降低,0~0.50 mg·L-1Cd处理下降低量在对照组0.107~0.723之间,而在2.50 mg·L-1Cd处理下,CYCB1;1、WEE1和CyclinB基因的表达量分别降低到对照组的0.052、0.071和0.187(图2b).试验结果表明,Cd胁迫下沈农豆20根尖DNA损伤修复能力较辽豆10号强,其中有一部分参与G2/M期阻滞.
图2 Cd胁迫4 d后对大豆幼苗根尖细胞周期相关基因转录水平表达的影响Fig.2 Effect of Cd stress on cell cycle related gene expression in root tips of soybean seedling after 4 d
2.3.2 Cd胁迫影响大豆幼苗根尖DNA损伤相关基因表达
关于DNA损伤修复基因RAD51、MRE11和KU70的表达量,辽豆10号和沈农豆20表现出相似的变化规律,即除了沈农豆20的RAD51基因之外,基因RAD51、MRE11和KU70的表达量与Cd浓度呈典型的倒U型剂量-效应关系,在0.25 mg·L-1Cd胁迫下,辽豆10号和沈农豆20较对照组均增加,增加量为1.4~2.0倍.随着Cd浓度的增加,辽豆10号表达量均受到抑制,呈下调趋势,在2.50 mg·L-1Cd时均达到极显著性差异(P<0.01),其中,RAD51和MRE11基因的表达量仅为对照组的0.108和0.288(图3a).而沈农豆20的RAD51基因表达量随Cd浓度的增加呈递减变化趋势,下调比例在0.2~0.8之间,MRE11和KU70基因表达量则呈典型的倒U型,在0.25~0.50 mg·L-1Cd时表现为增加,达到了显著性差异;与辽豆10号对照组相比,RAD51基因的表达量在0 mg·L-1Cd时表现为增加,但无显著差异,随着Cd浓度(0.25~2.50 mg·L-1)的增加其表达量均表现为下降;MRE11基因的表达量随着Cd浓度(0.25~2.50 mg·L-1)的增加表现为上调,KU70基因的表达量随着Cd浓度(0.25~2.50 mg·L-1)的增加表现为先上调后下调的变化,上调量是对照组的1.4~1.9倍(图3b);试验结果表明,Cd胁迫对辽豆10号和沈农豆20幼苗根尖细胞DNA均能够造成严重的损伤,主要包括非同源末端连接(NHEJ)和同源重组(HR),并且有一部分参与细胞周期阻滞.
图3 Cd胁迫4 d后对大豆幼苗根尖DNA损伤修复基因转录水平表达的影响Fig.3 Effects of Cd stress on DNA damage repair genes expression in root tips of soybean seedling after 4 d
2.3.3 Cd胁迫影响大豆幼苗根尖MMR相关基因表达
辽豆10号DNA错配修复基因MLH1、MSH2和MSH6的表达量随Cd浓度的增加均表现为下调,且达到显著性差异,在2.50 mg·L-1Cd处理下,基因MLH1、MSH2和MSH6的表达量下调分别仅为对照组的0.191、0.128和0.261(图4a).沈农豆20的DNA错配修复基因MLH1和MSH6基因的表达量在0.25~2.50 mg·L-1Cd浓度胁迫下与对照组相比均表现为下调;而MSH2基因的表达量与Cd浓度呈典型的倒U型剂量-效应关系,在0.25 mg·L-1Cd时上调量为1.11倍,在0.50~2.50 mg·L-1Cd时MSH2和MSH6基因的表达量下调达到极显著差异,其中,MSH2基因下调到对照组的0.342和0.123,而MSH6基因下调到对照组的0.112和0.085;与辽豆10号对照组相比,MLH1基因的表达量在0~2.50 mg·L-1Cd胁迫下均显著降低,其中,在2.50 mg·L-1Cd浓度处理下调量仅是对照组的0.204,MSH2基因表达量在0.25 mg·L-1Cd时上调了约1.3倍,0.50~2.50 mg·L-1Cd时,MSH2和MSH6的表达量均显著降低,且在2.50 mg·L-1Cd时达到最小,仅为对照组的0.14(图4b).试验结果表明,Cd胁迫都能引起辽豆10号和沈农豆20根尖细胞DNA的损伤,但是在2个品种间这些基因的表达量达到显著差异,说明Cd胁迫对不同的品种造成DNA损伤类型是不同的.
图4 Cd胁迫4 d后对大豆幼苗根尖DNA错配修复基因转录水平表达的影响Fig.4 Effects of Cd stress on DNA mismatch repair genes expression in root tips of soybean seedling after 4 d
2.4 Cd胁迫对辽豆10号和沈农豆20基因组DNA多态性(RAPD)分析
与对照组相比,在0.25 mg·L-1Cd胁迫下,辽豆10号和沈农豆20幼苗根尖中可检测出的条带数分别为5和11.5,达到显著差异,在0.50 mg·L-1Cd胁迫下,辽豆10号和沈农豆20幼苗根尖中可检测出的条带数分别为6.5和13,在2.50 mg·L-1Cd胁迫下,可检测出的条带数分别为8和17(图5).试验结果表明,中低浓度的Cd处理就已经对基因组DNA造成了一定的损伤,而高浓度Cd处理对基因组DNA造成的则是直接性损伤,这种损伤很难修复,从而增加了基因组的不稳定性.Cd胁迫下RAPD图谱中辽豆10号和沈农豆20检测到不同的多态性条带数,说明辽豆10号DNA损伤不会导致继发性的形成;而沈农豆20的DNA损伤程度显著高于辽豆10号,说明沈农豆20幼苗根尖DNA损伤可能会有级联反应,说明Cd胁迫下诱导辽豆10号和沈农豆20细胞周期阻滞存在基因型差异.
3 讨论与结论
镉胁迫对植物有不同的损害,在生理生化方面表现在叶绿素的合成和光合作用、细胞生长,碳、水、营养物质的转换和吸收等方面[11,25];同时镉还会破坏细胞内营养物质稳定性,比如钙稳态、激活蛋白激酶C、诱导氧化胁迫引起细胞周期阻滞[25-26].镉还可以造成DNA单、双链断裂、碱基错配、碱基插入/丢失及DNA链内和链间相互交联、序列改变、甲基化损伤等.DNA损害后有2种选择,一种是修复,另外一种是凋亡,前者是细胞周期检查点监测到DNA损伤并被激活,细胞周期停滞,通过运行各种途径修复细胞,以及在修复损伤后细胞周期恢复;后者是损伤太严重无法修复最终走向死亡[27-28].本试验结果表明,不同的Cd浓度暴露均能引起大豆幼苗根尖DNA的损伤,造成基因组的不稳定性,Cd处理后辽豆10号细胞周期阻滞在G1/S期,而沈农豆20则是阻滞在G2/M期,说明由Cd诱导的细胞周期阻滞在这2个品种之间存在基因型差异,从而对Cd胁迫响应机制存在基因型差异,损伤类型因品种不同而不同.
研究报道指出Cd胁迫引起大豆DNA损伤,诱导细胞周期阻滞发生在G1/S期[20],而CyclinB1mRNA水平降低使细胞周期阻滞发生在G2/M期.本研究结果表明,辽豆10号在Cd胁迫下细胞周期阻滞发生在G1/S期,而G1/S期检验点在整个细胞周期进程中起着至关重要的作用,因为它是细胞增殖期开始周期,一旦细胞周期事件开始就进入不可逆事件中,无论环境和条件如何改变,细胞都会正常增殖[29].CAO等[30]采用real-time qRT-PCR分析了细胞周期相关基因的相对表达,与对照组相比,Cd处理组的错配修复基因MLH1、MSH2和MSH6相对表达量显著降低.这和拟南芥试验中基因表达量的结果相似,说明MSH2和MSH6蛋白是Cd诱导DNA损伤的直接传感器.本研究结果显示,DNA损伤修复基因MRE11、KU70和RAD51在0.25 mg·L-1Cd时其表达量整体呈上调趋势,表明MRE11、KU70和RAD51监测到DNA损伤,然后将损伤信号转导,经过复杂的信号通路对Cd胁迫作出响应,使细胞周期阻滞在G1/S期.徐忠伟等[31]研究显示,华蟾毒可引起肝癌细胞DNA双链断裂,感知DNA损伤的蛋白(Mre11,Nbs1和Rad50基因)及负调控因子p53,通过Mre11/Rad50/Nbs1(MRN)复合体将检测到的DNA损伤情况传导给效应蛋白分子ATM激酶,对DNA双链断裂作出应答响应,再将信息传导给p53蛋白,p53激活,延长半衰期,促进p21CIP1表达,p21CIP1与CyclinA/CDK2/PCNA激酶复合体结合,活性被抑制,细胞周期阻滞在S期[32-33].
G2/M期和M期转换点,只是延长或缩短细胞周期事件的时间.本研究结果表明,Cd胁迫下沈农豆20的细胞周期阻滞的时期发生在G2/M期,而辽豆10号是阻滞在G1/S期,由此推测沈农豆20细胞内可能存在跨损伤复制机制,沈农豆20的DNA错配修复基因MLH1、MSH2和MSH6的表达量均下调,Cd胁迫拟南芥幼苗根尖细胞周期阻滞试验[30]证实了基因MSH2和MSH6是拟南芥DNA损伤直接传感器,并且介导G2/M期阻滞,与G2/M期相关的标志性基因CYCB1;1的表达量显著下调,基因WEE1的表达量呈典型倒U型,与本试验结果一致.禹黎[34]关于水稻中籽粒Cd积累的QTL定位研究表明,水稻高、低镉QTL分别与耐镉QTL和镉敏感QTL对应,低积累的水稻品种对镉更加敏感.本研究结果表明,MMR系统的组成部分中MSH2和MSH6蛋白参与了大豆幼苗根尖Cd胁迫诱导的G2期阻滞,可以作为Cd诱导DNA损伤的直接传感器.同时MSH2和MSH6基因可以作为选育Cd耐性大豆品种的指示标志物.大豆对Cd胁迫响应机制存在基因型差异,这与李沛然等[35]研究大豆对Cd的吸收和转运存在基因型差异结果相符.通过这种差异可以快速鉴定出大豆品种间的Cd敏感性,且简单易操作,辅助分子育种,为大豆新品种选育提供理论基础,为在中、轻度镉污染的区域从事安全食品生产合理选择品种提供参考依据,同时,也为后续敏感低积累品种选育及生理、表观研究等提供可靠的理论基础.