从分子学角度探讨柴胡-郁金对卒中后抑郁潜在作用机制
2021-02-27张梓琪高才植殷晓莉
张梓琪,高才植,殷晓莉
1 辽宁中医药大学 辽宁沈阳 110032
2 辽宁中医药大学附属第二医院 辽宁沈阳 110032
卒中后抑郁(Post-Stroke Depression,PSD)是发生于中风后的一种情感障碍,临床表现主要为情绪低落、思维迟缓、兴趣减退,早在1977年由Folstein等[1]首次提出脑卒中后继发抑郁的可能,目前发病机制尚不明确,主要有生物学机制和社会心理学机制这两方面解释。卒中后抑郁不仅影响了卒中患者的康复进程,还提高了卒中患者的致死率,给家庭社会造成极大的负担。中医学认为卒中后抑郁属于“郁证”范畴,属因病致郁,中药治疗在减轻患者症状、缩短病程方面发挥了相当的优势,且极大的减少了毒副作用,为卒中患者后续的康复治疗提供了保障。“柴胡-郁金”治疗卒中后抑郁有较好的疗效,且基于文献数据挖掘,统计出“柴胡-郁金”为近15年中药治疗PSD频次最多的药物,两者配伍可以加强调节脏腑气机升降出入的功能[2]。
柴胡[3]为伞形科植物柴胡或狭叶柴胡的干燥根,按性状差异,分为“北柴胡”及“南柴胡”,味苦,性微寒,归胆、肝经,柴胡的主要成分为柴胡皂苷,药理作用有解热镇痛、抗炎、抗病毒、调节免疫系统、抗肿瘤等作用[4];郁金[3]为姜科属,是温郁金、姜黄、蓬莪术、广西莪术的干燥块根,味辛、苦,性微寒,归肝、心、肺经,药理作用有调节脂质代谢、保肝利胆、调节血液循环、调节消化系统[5]。中医学以“整体观念、辨证论治”贯穿始终,中药作用于疾病更是多成分、多途径、多靶点,如何用更加科学的方法解释中药作用于疾病的机理,成为了中医药的研究热点[6]。网络药理学探讨的是相互之间关系网络,与中药作用疾病机理不谋而合。“网络药理学”的概念由Hopkins等于2007年提出[7],是基于系统生物学理论,对生物系统进行的网络剖析,更强调从多途径对信号进行调节,揭示了“药物-基因-靶点-疾病”之间复杂的网络关系,从多维视角理解疾病的分子学机制,预测药理作用[8]。本文将从网络药理学角度探讨“柴胡-郁金”对卒中后抑郁的潜在分子作用机制,为后续卒中后抑郁的研究治疗提供有效帮助。
材料与方法
1 数据库及软件
中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP,http://tcmspw.com/tcmspsearch.php)、疾病靶点数据库(Genecards,https://www.genecards.org/)、在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM,https://www.omim.org/)、Cytoscape3.6.2软件、蛋白-蛋白相互作用平台数据库(String,https://string-db.org/)、Venny绘图软件、富集分析metascape(https://metascape.org/gp/index.html#/)。
2 药物靶点及活性成分筛选
将TCMSP数据库分别输入“柴胡”“郁金”,搜索得到各药化学成分,通过设置口服生物利用度OB(OB≥30%)及类药性DL(DL≥0.18)进行筛选,再结合文献搜集,将潜在的有效靶点整合一起。
3 疾病靶点收集
通过Genecards、OMIM软件,以疾病名称“Post-Stroke Depression”为检索词进行检索,将不同数据库的检索结果归纳在一起,得到PSD的靶标。
4 药物疾病靶点标准化及药物-靶点-疾病网络构建
将药物作用靶点(Target name)通过输入软件Uniport进行规范,添加symbol,同时将柴胡-郁金所有基因靶点与卒中后抑郁(PSD)基因靶点筛选后,通过Venny软件绘制出疾病和药物共同作用靶点图,将疾病药物共同作用靶点导入cytoscape3.7.2软件,通过R语言,绘制疾病-药物-成分-靶点网络图。
5 蛋白相互作用网络构建(PPI)
将筛选得到的药物和疾病的共同靶点上传到String平台,基因类型设置“Homo sapiens”,最低相互作用阈值设置为0.7,其余参数不变,构建PPI网络图,展示出“柴胡-郁金”药对靶点蛋白与卒中后抑郁靶点蛋白之间的相互作用。
6 GO功能富集分析和KEGG通路富集分析
将药物疾病共同靶点上传到metascape,物种选择“H.sapiens 36”,依次进行GO(gene ontology)分析和KEGG(pathway analysis)分析,P值设置<0.01,筛选结果最终以条形图呈现[9]。
结 果
1 柴胡-郁金作用靶点及潜在有效成分
通过TCMSP筛选(OB≥30%、DL≥0.18)的到柴胡化学成分共17个,作用靶点276个,郁金的得到的化学成分15个,作用靶点60个,最后删除重复项,最终的到“柴胡-郁金”总共的化学成分为32个,作用靶点为190个。(化学成分见表1,由于结果较多,仅列出部分)
2 PSD疾病作用靶点
通过GeneCards(https://www.genecards.org/cgibin/carddisp.pl)输入“Post-stroke Depression”筛选得到的疾病靶点为210个,通过OMIM得到疾病靶点为6个,删除重复,最终通过这两个数据库的到PSD疾病靶点为213个。
3 “柴胡-郁金”与PSD共同靶点以及疾病-靶点-药物网络图
将药物与疾病靶点通过Venny软件,绘制出韦恩图,得到共有靶点为36个(结果如图1所示);将得到的标准化的共同靶点和化学成分导入cytoscape3.7.2中,绘制药物-成分-靶点-疾病图,见图2。图中内圈为有效成分,外圈为疾病、药物共同靶点,图中共有节点(nodes)47个,其中靶基因节点36个,成分节点8个,平均度值为4.1,度值反映了节点与节点相互连接的情况,根据度值高低排序,依次是槲皮素、柚皮素、山柰酚、β-谷固醇、异鼠李素、茵陈黄酮、豆甾醇、3,5,6,7-四甲氧基-2-(3,4,5-三甲氧基苯基)色酮,度值排名前6位靶基因依次为PPARG、F7、CASP3、AKT1、PON1、CASP9。
表1 柴胡-郁金潜在活性成分
图1 药物疾病共同靶点韦恩图
4 PPI网络构建
将上过程得到的药物疾病共同靶点输入String,设置最低相互作用阈值为0.7,其余设置不变,得到药物-疾病的PPI网络,共有节点数36个,边数为139条,平均节点度为7.72,并将得到的tsv文件导入Cytoscape3.7.2,然后选择NetworkAnalyzer,得到图3,图中每一个节点相当于一个蛋白,节点大小、颜色亮度代表Degree的值,Degree值越大则节点越大,颜色越亮,边的宽度代表节点和节点相互作用的强度,边越宽,则节点之间互相作用越强。通过图3得到“柴胡-郁金”与PSD潜在核心蛋白是IL6、AKT1、VEGFA、CRP、CCL2、MMP9、SERPINE1。
5 GO生物学功能富集分析和KEGG代谢通路富集分析
将药物疾病共同靶点导入Metascape,物种选择“homo sapiens”,选择个性化分析,设置P值<0.01,最小计数为3,富集因子> 1.5,然后进行GO生物学功能富集分析,包括3部分,生物学过程(Biological Process,BP)、细胞组成(Cellular Component,CC)和分子功能(Molecular Function,MF)分析[10],如图4、5、6(仅列出部分,图中颜色根据P值着色,P值越高,颜色越深)。“柴胡-郁金”与PSD共有靶点的分子功能主要为细胞因子活性、内肽酶活性、蛋白酶结合、NADP绑定等;主要的生物学功能为调节细胞因子介导的信号通路、对脂多糖的反应、对酸性化学物质的反应、调节对受伤的反应、对外部刺激反应的负面调节、对雌二醇的反应等;主要细胞组成为细胞外基质、血浆脂蛋白颗粒、膜筏、早期核内体等;KEGG代谢通路的分析主要系统分析了基因产物在细胞中的代谢途径,如图7所示,主要代谢途径为AGE-RAGE信号通路、弓形虫病、TNF信号通路、肿瘤中转录失调通路、血清素(5-HT)信号通路、NF-κB信号通路等。这可能为“柴胡-郁金”作用于PSD的关键通路。
图2 药物-成分-靶点-疾病图
图3 PPI网络图
图4 细胞组成
图5 分子功能
图6 生物学过程
讨 论
柴胡和郁金在临床上作为治疗卒中后抑郁经常出现的药物,具有疏肝解郁,调节人体气机升降的功能。有关药理学研究也证实“柴胡-郁金”内含有多种单体成分能够对抑郁起到治疗作用[11,12]。通过药物-成分-靶点-疾病图,得到柴胡潜在化合物为异鼠李素、茵陈黄酮、槲皮素、豆甾醇、3,5,6,7-四甲氧基-2-(3,4,5-三甲氧基苯基)色酮,郁金潜在化合物为β-谷固醇、柚皮素。柴胡中的多种化合物属于黄酮类化合物,近些年随着人们对黄酮类化合物的研究,发现他对中枢系统具有显著影响,具有神经保护、抗抑郁、抗焦虑的作用[13],N. SAMAD等[14]通过将槲皮素溶于25%乙醇溶液中,实验组抑郁小鼠予以注射,对照组只注射25%乙醇,研究结果表明槲皮素逆转了小鼠的应激引起的抑郁和焦虑;柚皮素属于类黄酮化合物,具有很强的抗氧化和抗炎作用,动物研究表明[15]柚皮素减少了小鼠静止时间,增加了社会探索偏好,表明具有抗抑郁的活性。柚皮素通过增强胆碱能传递、抗氧化防御系统、抑制脂质过氧化和亚硝化过程的机制,实现功能行为效应和神经精神疾病的预防。PPI网络中潜在核心靶点为IL6、AKT1、VEGFA、CRP、CCL2、MMP9、SERPINE1,IL6(白细胞介素-6)和CRP(C反应蛋白)同属于炎性细胞因子,有研究表明,卒中急性期炎性细胞因子水平增高,并且炎性细胞因子水平和PSD的发生率成正相关,提示IL6、CRP可能在卒中后抑郁的发病机制中起重要作用,而药物可能通过该靶点作用于疾病而起到治疗效果[16]。VEGFA(血管内皮生长因子A)属于神经营养因子(NF)家族中的一种,对神经细胞的再生以及神经系统的发育起着重要作用,可以诱导内皮细胞增生分化,进而促使新血管生成及侧支循环的建立[17]。AKT1属于AKT家族中的一员,属于蛋白激酶,是神经元存活的关键因子,有研究提出[18]AKT1基因参与调节人脑纹状体多巴胺信号的过程,可以猜测AKT1通过调节多巴胺的含量来影响情绪,但尚缺乏大量证据。CCL2属于趋化因子,因有使白细胞聚集的功能而得名,趋化因子的释放还可刺激释放炎症细胞因子,进而影响PSD的发生。
图7 KEGG代谢通路
GO生物过程提示“柴胡-郁金”靶点涉及炎性细胞因子信号通路、雌二醇的反应、上皮细胞凋亡、调节内皮细胞增殖等,这可能与卒中后抑郁发生的病理生理有关联。虽然卒中后抑郁的发病机制尚不明确,大量研究表明[19],炎性刺激因子可能为重要危险因素,并且与PSD的发生成正相关;雌二醇是由卵巢成熟滤泡分泌的一种自然雌激素,而雌激素是有效的情绪调节器,能够调节5-HT的含量和保护神经,促进神经再生,起到抗抑郁作用[20]。KEGG代谢通路提示“柴胡-郁金”主要通过糖尿病并发症AGE-RAGE途径、肿瘤途径、血清素能途径等途径发挥作用,血清素(5-HT)是中枢神经系统的传递物质,在海马区内调节膜电位、兴奋性和抑制性突触传递,位于突触前膜的5-HT转运体通过再摄取突触间隙的5-HT而在代谢及功能精细调节中起关键作用[21]。由此可以猜测“柴胡-郁金”其中成分可能通过5-HT转运通路,来影响雌激素合成,进而起到治疗作用。AGE-RAGE[22]细胞通路中,AGE是细胞因子,RAGE是受体,AGE通过其受体RAGE发出信号以激活NF-kB细胞程序,NF-kB受到激活后进而影响TNF-α,IL-1、 IL-2、IL-6等从而产生炎症。
综上,“柴胡-郁金”对卒中后抑郁的治疗为多成分、多靶点、多通路,通过网络药理学发现靶点之间可以相互作用,而且许多靶点虽然度值非常低,也能起很大的作用,这为后来的研究提供了新的参考方向。