单细胞测序预测化疗的有效性

在最近一项研究中，来自密歇根大学的Jun Hee Lee 博士课题组使用一种单细胞RNA 测序的技术，首次展示了单个癌细胞群中的各个细胞对化学疗法引起的DNA 损伤的基因表达差异。他们发现，这些反应可以被分为三类：激控制细胞死亡，细胞分裂或应激反应。相关结果发表在最近的《Cell Reports》杂志上。

“不同命运的细胞实际上具有完全不同的基因激活图谱，而这些不同的‘转录组学格局’决定了化疗对DNA 造成损伤后细胞的命运。”

该研究分析了来自三种结肠癌细胞系的10,000 多个细胞。这些细胞首先接受化学药物治氟尿嘧啶的处理，之后对其基因表达图谱进行了分别分析。“以前我们认为，DNA 损伤会导致相当均匀的转录反应，而我们的发现表明，不同的DNA 损伤反应基因伴随着不同的细胞命运走向。如果我们了解到某些亚群具有特定特征的细胞能够在其他细胞死亡时存活下来，那么科学家们可能会寻找专门针对这些细胞的治疗方法”。

由公共卫生学院生物统计学副教授Hyun Min Kang 博士领导的研究小组，也正在在线提供其数据供其他研究人员使用。“例如，其他科学家可以检查化学疗法治疗前后在单个细胞中如何表达单个基因，以及特定基因的表达与化疗剂量或其他基因的表达如何相关，研究人员还可以使用该在线工具测试新的假设并生成新的数据，因此有可能促进对DNA 损伤反应的未来研究。”