非洲猪瘟和经典猪瘟综合监测计划—数据处理及附件

译校│刘林青 张淼洁 翟新验（中国动物疫病预防控制中心）

一、数据

1.数据平台。用于数据收集的数据平台应包括以下内容：野生动物服务机构（WS）维护的电子表格；国家动物卫生实验室网络（NAHLN）实验室信息系统（LMS）；国家兽医服务机构实验室（NVSL）诊断数据库的可搜索检测结果应用程序（STRAND）；兽医服务综合监测模块（VSISM）；实验室提交模块（CLSM），用于实验室提交数据；应急管理响应系统（EMRS）。

2.用于非洲猪瘟和经典猪瘟监测的初始数据收集和管理过程（表1）。

非洲猪瘟（ASF）和经典猪瘟（CSF）综合监测计划使用了几个现有的CSF监测采样方式。目前，通过兽医服务机构实验室报告互联网技术（IT）系统对部分CSF监测数据进行管理，而新获得的监测数据收集正在迁移到新开发的CLSM-VSISM数据系统。VSISM建立在通用模块化物种和与疫病无关的软件结构内的CRM框架上，以允许在单次访问期间进行多种疫病采样。由于这种结构，与CSF数据收集相一致地添加ASF监测功能相对简单。随着新的联合监测工作的开展，用户将有机会一次迁移到针对两种疫病的新IT管理系统。对于监管兽医采样，将通过基于Web的CLSM数据门户输入采样数据，该门户将通过下拉列表和受限输入协议来捕获完整和标准化的现场数据。

当前，CLSM基于字段的数据收集模块仅限于收集目标样本的监管人员使用。但是，类似的数据结构和最低限度的要求将被应用到与合格的兽医提交给NAHLN实验室的病例兼容的病猪相关流行病学数据。VS和NAHLN实验室的IT人员将开发标准化的消息结构，以便将最小案例数据以及ASF、CSF检测订单和结果通过LMS传递到VSISM CSF-ASF数据集中。将要求实验室收集或记录任何必填数据字段的条目，无论是来自实验室的加入表格，还是与提交选定进行FAD检测样品的兽医进行沟通。VS将要求所有必需的数据都通过LMS上传给实验室，以符合报销ASF-CSF检测费用的条件。

NVSL-FADDL LMS系统目前无法进行电子消息传递。最初，所需的WS野生猪场提交数据将通过电子表格与VS共享，以包括在监测数据报告中。VS计划经理将通过STRAND从NVSL-FADDL获得WS野生猪样本的ASF、CSF阴性检测结果。

3.ASF-CSF监测样本所需的最小数据元素。在过去的12年中，审查CSF监测数据的一个显著弱点是与样本相关的数据（即与样本结果相关的数据对于评估目标监测效果至关重要）的报告不一致。具有记录风险状况的样品比没有已知风险因素记录的随机监测样品珍贵很多。此外，样本池应代表在该定义里的各种群体（足够的覆盖范围）。

为了记录所需的风险概况，必须获得以下关于样本的数据元素信息（最小数据元素可能因监测方式而异）：采样动物的年龄；与条形码试管或容器编号绑定的动物ID（或组/围栏说明）；收集、检测和报告样品的日期（出厂日期）；猪群的临床体征和病史（如果有的话），尤其是那些符合病例选择标准的；实验室检测；生产现场、屠宰场或市场的场所识别码（PIN）（如果没有PIN，可以输入经纬度，以便于查找或分配PIN）；生产类型；提交者（如果有）；样本选择标准/临床体征（如果有）；样本类型（例如血清、扁桃体、脾脏、淋巴结、全血等）；屠宰场代码（例如FSIS号）；提交方式；要求的检测；检测结果和解释。

4.未来的统一电子数据收集替代方案。VS将与实验室IT，APHIS（动物卫生检验局） IT和主题专家紧密合作，旨在探索避免重复数据输入，改善电子数据收集和传输。

二、数据分析、解释和度量

由以下几方面进行数据分析、解释和度量。

1.代表性。

（1）地理。诊断实验室监测样本的地理分布通常应反映美国猪群的种群分布。此外，抽样的群体数量应反映每个州的群体数量。

屠宰监测样本的地理分布通常应反映该计划针对的猪屠宰场的分布（烘烤市场、聚集点）。商业屠宰场主要位于中西部地区的上游，而较小的屠宰场则分布在美国各地。由于着重在佛罗里达州、得克萨斯州和波多黎各的采样，预计这些州的采样数会高于其他州。

高风险监测样本的地理分布应分布在全国各地，重点是佛罗里达州、得克萨斯州和波多黎各。此外，预计允许垃圾饲喂的州在该监测方式中的样本数量要比根据其猪群养殖量预期的多。如果可以获得详细信息，则可以在县一级评估地理代表性，并且预计会有更多的样本来自垃圾掩埋场或国际港口附近的县。

野猪监测：野猪样本的地理分布应反映野猪种群分布。大多数样品应来自已建立野生猪种群的州。

（2）生产类型/年龄。诊断实验室监测：此监测中的样品应反映商品猪场的年龄和生产类型分布。

屠宰监测：这类监测中生产类型的不同与商品、不合格和高风险生产动物之间样品的大致分布接近。预期年龄分布为4个月，以发现专门针对焙烤市场销售的猪只以及生长速度低于同类群的不合格商品猪。

高风险监测：对于ASF和CSF，此监测中的样本主要是非商品生产类型。其中，应包括后院畜群、垃圾饲喂猪和过渡性群体，其中垃圾饲喂猪占CSF样本的大部分。

野猪监测：预期年龄分布主要是成年动物，少年和幼年的比例较小。生产类型不适用于此监测。

表1 当前用于ASF-CSF监测的类型和业务流程

（3）时间分布。诊断实验室监测：在一年中的各个星期和月中，病猪的提交应均匀分布。

屠宰监测：提交应大约每月平均一次。取决于地区温度差异和庆祝活动/节假日的时间，提交烤肉类样品的时间可能更具季节性。

高风险监测：极端温度下，垃圾饲喂猪样本更有季节性，以减少对动物的压力。

野猪监测：这些样本全年收集，提供具有时间代表性的样本。

2.检测概率。对于每种监测方式、每种疫病，疫病检测概率应该进行研究。表2和表3列出了估计的初始患病率检测水平和潜在感染动物的数量。

3.报告的临床特征与病例定义的相符性。诊断实验室监测样品提交的理由应在一致的临床体征中分配，最少或没有检测到没有提交或“一般猪提交”理由的样品。

屠宰监测应从定罪的动物提交以进行临床迹象或验尸病灶与上述提交原因一致。

高风险监测提交的原因应在一致的临床体征中分配，最少要检查样品或没有样品，没有提交或“一般猪的提交”的理由。

4.及时性。应尽快提交样本，对于各类监测方式，均应采样后48小时内提交。

检测周期：组织样品应尽快进行检测，保存和检测时间不超过1周；血清样本（CSF）应在收到后7～10天内进行检测。

三、附录1：非洲猪瘟病例定义

1.临床体征。ASF是非洲猪瘟病毒（ASFV）引起的家猪和野猪均能感染的传染病，该病毒是非洲猪瘟病毒科里的惟一病毒。它可以通过直接或间接接触或通过钝缘蜱属进行传播。感染类型包括最急性、急性、亚急性或慢性。感染猪恢复过来后，可以成为病毒的持续感染载体。

（1）最急性。由高毒力毒株引起。通常发现时猪已经死亡，有时没有疫病的临床特征或剖检病变。

（2）急性。由高毒力毒株引起。临床特征包括发烧、加重的脉搏和呼吸频率、嗜睡、厌食和卧倒。可能出现黄疸、呕吐、出血性腹泻、眼部有分泌物、鼻腔有出血性分泌物和流产等症状。猪通常表现出红肿、出血和/或瘀斑皮。死亡前一到两天，猪只可能会出现厌食症，精神沉郁或精疲力竭，共济失调。感染后2～13天死亡。死亡率接近100%。尸检后常见病变包括：脾脏肿大、易碎，肝肿大，肾瘀点/出血，淋巴结肿大，以及其他器官的出血/瘀斑，包括膀胱、肺、心脏、胃和肠。

（3）亚急性。由中等毒力毒株引起。临床症状类似于急性型，但不严重。病程5～30天，死亡率较低（30%～70%）。感染后15～45天死亡。临床特征、剖检病变与急性型相似，但通常不太严重。

（4）慢性。由低毒力毒株引起。临床症状超过2～15个月，变化很大，可能包括体重减轻、发烧、呼吸道症状、皮肤坏死、心包炎、肺粘连和关节肿胀。死亡率低。剖检病变包括消瘦和局部干酪样坏死，以及肺硬化。

2.实验室标准。

（1）病原分离和鉴定。收集全血（EDTA和肝素）、脾脏、淋巴结、扁桃体和肾脏。保持样品尽可能低温而不冻结。检测包括：病毒分离（VI）、直接荧光反应（DFA）、测序和实时PCR（rPCR）。

表2 估计的初步流行率检测水平和可能感染的动物数量—ASF监测

表3 估计的初步流行率检测水平和可能感染的动物数量—CSF监测

（2）血清学。通过ELISA检测血清中的抗体、间接荧光抗体（IFA）和免疫过氧化物酶检测（IPT）。抗体会在感染后7～10天出现，并且可以持续一生。感染强毒的猪可能在产生抗体之前死亡。

3.病例定义和报告标准。

（1）可疑病例。可疑病例：符合ASF临床特征和流行病学特点的动物。

（2）推定阳性病例。推定阳性病例：具有非阴性筛查实验室检测的可疑病例经国家兽医服务机构实验室（NVSL）境外动物疫病诊断实验室（FADDL）或国家动物健康局的ASFV（PCR）结果实验室网络实验室获准进行ASF检测，或在NVSL FADDL通过两种不同的抗体检测，可疑病例ASFV抗体呈阳性。

（3）确认阳性病例。确认阳性病例：从其中分离出ASF病毒并由NVSL FADDL或农业部指定的实验室鉴定，或假设阳性病例，经NVSL FADDL检测，ASFV抗原阳性的病例。

注意：在任何ASF暴发中，病例定义都可以在第一个推定阳性或确诊阳性病例（索引病例）后进行修改。整个暴发期间病例定义将被审查，并根据其他信息或根除工作需要的变化进行修改。

四、附录2：经典猪瘟病例定义

1.临床体征。经典猪瘟是由猪瘟病毒引起的，一种很小的黄病毒科和瘟病毒属的囊膜RNA病毒。潜伏期的范围可能从2到15天不等，但通常为7～10天。猪瘟有多种不同的临床症状（急性、慢性和先天性感染），这主要取决于动物之前对病毒的接触情况、病毒毒性（高、中和低）以及诸如年龄之类的宿主因素和营养状况。

与年长动物相比，年幼动物通常受到的影响更大，死亡率可能高达90%；在较老的种猪中，感染通常是轻度甚至亚临床的。年幼动物受到的影响往往更加严重，并且更有可能表现出经典的急性表现。经典的急性表现很少见了。相反，更温和的表现和临床症状占主导。流行的CSF病毒株为中度至低度毒力，使临床诊断变得困难，尤其是在年长动物中。低毒力菌株通常会引起轻度疫病或亚临床感染，这可能导致长期无法发现。除了低毒力菌株，白细胞减少症是一个相当普遍的临床实验室发现。

（1）急性。通常在12周龄以下断奶的对抗生素无反应的断奶仔猪中发生，特征是发烧，精神沉郁，皮肤充血，结膜炎和行动迟缓，后跟轻瘫，流产（稀有）和/或腹泻。

（2）慢性。从急性感染中恢复过来的猪可能会发展成慢性，在这个过程中，会出现厌食、发烧、腹泻、皮炎，并且可能导致群体中出现小个头猪。特征为急性感染，继而在发烧复发之前短暂恢复，厌食导致消瘦，发病后1～3个月死亡。

（3）先天性感染。先天性感染可导致繁殖功能降低表现，群体中出现流产或仔猪虚弱等临床表现。妊娠50～70天后母猪感染，生下的幼猪可能患有先天性震颤或临死前的几个月持续感染并表现出正常，目前临床上发现出生后11个月的存活期（妊娠50～70天之前感染的母猪可能会流产、分娩死产、产木乃伊胎或导致先天性缺陷的猪）。

2.实验室标准。

（1）病原鉴定：扁桃体、脾脏、肾脏、淋巴结或回肠远端应在低温条件下（不冷冻）运输，并且不添加防腐剂。临床患病猪的全血（肝素或EDTA处理）也是合适的样品。检测方法包括对样品组织使用CSF特异性单克隆抗体的免疫组化（IHC）（ABC染色）、PCR（rPCR和RTPCR）以及病毒分离，然后进行ABC染色和/或rPCR或RT-PCR。

（2）血清学检测：血清学检测包括中和过氧化物酶联用检测（也称为免疫过氧化物酶病毒中和检测-IPVN），免疫过氧化物酶检测（IP）和E2抗体ELISA。由于使用强毒株的免疫抑制，在感染后18天之前检测不到动物体内的抗体，后续抗体会至少持续数年。对于慢性感染，如果有抗体的话，可能会在感染第一个月后短暂检测到抗体，但很快就消失了。先天感染的猪持续存在病毒血症，很少产生特异性抗体。

3.病例定义和报告标准。

（1）可疑病例。可疑病例具有以下特征：与经典猪瘟一致的临床体征、病史或流行病学特点；或者常规监测中rPCR/RT-PCR结果阳性或者不确定的，并且没有临床判断依据，其他实验室诊断（测序信息或确认性检测）或流行病学调查结果待定；或者在常规检测过程中对样品进行抗体ELISA监测阳性，随后IP和IP-VN检测均获得阳性结果，但流行病学信息或临床症状与经典猪瘟不一致的。

（2）推定阳性病例。样品初始rPCR/RT-PCR结果阳性，猪群有或没有经典猪瘟的临床体征和/或流行病学特点，在境外动物疫病诊断中心进行重复rPCR/RT-PCR或基因组测序为阳性的可疑病例；或者流行病学信息和/或临床症状与经典猪瘟一致的猪群；rPCR或RT-PCR阳性；或者对组织样本进行ABC检测阳性；或者IP-VN检测阳性的病例称为推定阳性病例。

（3）确诊阳性病例。从猪中分离出CSF病毒，并且经国家兽医服务机构实验室，FADDL或由农业部指定的实验室进行测序确认的病例称为确诊阳性病例。