高职医学生化蛋白质结构教学中计算机辅助软件的应用

彭盼盼

摘要：在进行蛋白质结构的教学过程中，将通过三种类型的计算机软件逐步显示蛋白质结构，并分析各种方法的优缺点，以实现视觉和视觉教育效果并提高学生的抽象度去做，让学生可以充分的理解分子结构。

关键词：高职医学生 化蛋白质结构教学 计算机辅助软件

引言：随着信息时代的发展，现代教室已经从传统的单一教育教室转变为基于多媒体信息的教育教室。如何实现多媒体教室课程的知识化，信息化和现代化，实现信息技术与学科教育的紧密融合目标已成为当前课程中的重要研究方向。根据教学实践，计算机辅助软件可以帮助您解释蛋白质在各种角度和尺寸上的分子结构，实现精细分子的可视化和可视化，并帮助学生理解记忆并取得出色的教学效果。

一、高职医学生化蛋白质结构教学中使用计算机辅助软件的意义

生物体的结构和功能是生化过程的重点。根据蛋白质和核酸分子结构的教学目标，学生不仅需要了解分子结构特征，还需要了解蛋白质与核酸结构和功能之间的关系。由于蛋白质的复杂和抽象的微观结构，简单的手写训练很难获得出色的训练效果。通过使用计算机技术，通过集成网络资源并通过课件显示和可视化抽象分子结构，学生可以加深对分子世界学习的理解并激发强烈的兴趣。在教学过程中，可以通过视频，FLASH动画，3D分子结构等多角度，多层次显示视频的微观结构，以实现微观世界的可视化，并以简单的方式达到教学目的。

二、chembio draw繪制人胰岛素一级结构

以蛋白质结构教育为例，分析了如何在实际的课堂教学课件的制作中绘制蛋白质分子结构，并选择了适合便捷的计算机软件，这些软件通常用作微分子的可视化和可视化工具。蛋白质的结构通常可以分为一级结构和空间结构，一级结构是指氨基酸序列的序列，其是空间结构的基础。蛋白质的空间构象包括氨基酸链在空间中的折叠和旋转以及多肽链之间的相互作用。使用的计算机软件逐步显示蛋白质结构，并分析各种方法的优缺点。在课堂教学中，单分子链蛋白可以直接利用上述步骤进行示教，不仅可以快速绘制肽链，还可以使学生直接看到三维结构。当改变蛋白质的基本结构时，空间结构会立即发生变化，加深了学生对教科书的理解：“蛋白质的基本结构是空间结构的基础。”可以使用简单快速的chembiodraw3D方法在三个维度上模拟单分子链蛋白，但是大多数蛋白的肽链不是完全线性的，而是在空间中折叠，展开和缠绕形成独特的空间结构。这些复杂蛋白质的结构不能仅仅依靠chembio draw3D来获得，需要一个蛋白质数据库来查找结构数据和三维视图，蛋白质数据库的应用为了解复杂蛋白质的分子结构打开了大门。

例如：多肽链的氨基酸序列是透明的。以人胰岛素为例，两条多肽链A链包含21个氨基酸，B链包含30个氨基酸。单击ChembioDraw工具栏上的序列工具以创建蛋白质结构式。单击序列工具栏上的3个字母的标签工具“ Gly-”，单击甘氨酸-异亮氨酸-缬氨酸，等等。对于A链，打印出A链的所有氨基酸缩写，然后打印B该链的氨基酸序列如图1-1所示。最后，单击主工具栏上的实际键合工具以将A链中位置6的半胱氨酸残基与位置11处的半胱氨酸残基连接起来以形成二硫键。

三、PDB数据库应用于蛋白质结构教学

PDB（蛋白质数据库）是一个包含生物大分子（例如蛋白质和核酸）的数据库，该数据库与生物学家和化学家研究世界大分子结构的研究结果同时更新。大分子的结构数据，核磁或X射线衍射数据。其中大多数是来自蛋白质的结构数据，可以满足科学研究和教育的需求。每种蛋白质在文库中都有一个唯一的ID（PDB-ID），由大写字母和数字组成，并且易于查找和存储。PDB数据库资源很复杂，数据信息是完整的，界面是英文的，如果实际使用它，则只能考虑培训所需的内容。从PDB数据库下载的数据包含文本数据格式的结构数据，例如蛋白质主链数量，二级结构信息和二硫键位置，因此使用文本编辑器会使初学者更加困难。特别是，课堂演示有局限性，并且学生无法直观地了解分子的空间结构。因此，PDB数据库开发中心集成了分子图形软件和分子结构数据，还具有分析和图形显示功能。从蛋白质数据库下载某些蛋白质大分子的结构数据后，您可以使用可视化插件显示教学中的分子结构和关键部分，从而方便显示分子结构的动态变化。这样，教师就可以吸引学生的注意力并且很好的发展学生的空间思维。计算机辅助训练软件不仅可以用于蛋白质结构训练，而且在核苷酸链序列，DNA双螺旋结构，RNA，多糖和脂质方面也能获得出色的训练效果。

例如：例如，如果需要查找人脱氧血红蛋白的三维结构，则可以执行以下步骤。（1）进入PDB网站进入查找，其中只限于人类和血红蛋白;（3）如搜索结果“ PDBID=2D60”是符合教室培训要求的人脱氧血红蛋白的晶体结构。通过单击蛋白质名称来输入2D60的特定界面。可以查看标题内容，包括摘要（序列），序列（序列），注释（注释），序列相似性（相似序列），3D相似性（相似三维结构），方法（方法），链接（链接）等。通过单击适当的内容，根据需要查看和下载数据信息。

总结：蛋白质的结构和功能是生化研究的重要内容之一，尤其是蛋白质分子结构的教学。本文选择的软件相对易于操作，信息丰富，为PPT制作和教室展示，钓鱼，教学生如何使用和赋予学生收集信息的能力提供了很好的材料。计算机辅助软件使教学过程更加生动生动，激发了学生对微观分子世界的兴趣。

参考文献

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