植物类钙调素CML37 的转录激活活性分析
2020-09-24苏智宏黎圣金田长恩周玉萍
苏智宏 黎圣金 田长恩 周玉萍
植物钙调素和类钙调素是细胞内最重要的一类Ca2+感受器,CaM/CML 通过与钙调素结合蛋白结合来调节细胞生理过程[1]。拟南芥有4 个CaM 蛋白和50 个CML 基因,干旱胁迫下类钙调素CML37 突变体积累的ABA含量显著低于野生型,表明CML37 正向调节植物对生物和非生物胁迫的响应,参与JA和ABA信号调节[2]。拟南芥IQM4 是一个Ca2+不依赖型钙调素结合蛋白,通过参与ABA合成调节种子休眠和萌发,但IQM4 上游CaM 或CML尚未鉴定[3]。在通过酵母双杂交实验来研究CML37 与IQM4 的相互作用时,观察到转化了pGBKT7- CML37 和pGADT7 质粒的酵母菌在四缺培养基(SD- Ade/His/Leu /Trp)上正常生长并激活了报告基因LacZ 的表达。同时,酵母单杂交实验也证实了拟南芥类钙调素CML37 具有转录激活活性。
1 材料与方法
1.1 材料
拟南芥为Columbia 生态型;大肠杆菌为E.coli DH5α;酵母双杂交系统为Clontech公司的Matchmaker Gal4 Two- Hybrid System3;Carrier DNA 购自Sigma 公司;实验所使用的胶回收试剂盒、DNA 片段纯化试剂盒、限制性核酸内切酶、DNA 连接酶、PRIMER STAR 高保真DNA 聚合酶、rTaq DNA 聚合酶均为TaKaRa 公司产品。
1.2 方法
1.2.1 拟南芥CML37 与IQM4 基因克隆
从TAIR 数据库获取CML37 和IQM4 的CDS 序列,分别设计克隆引物。以拟南芥cDNA 为模板,利用PRIMERSTAR 高保真DNA 聚合酶进行PCR 扩增,PCR 反应结束后,取少量产物进行琼脂糖凝胶电泳分析。
1.2.2 酵母表达载体构建
PCR 产物分别用DNA 片段纯化试剂盒纯化后,其中AD- CML37 片段用EcoR I 和BamH I 定向插入酵母表达载体pGADT7 质粒,BD- CML37 片段用EcoR I 和Pst I 定向插入pGBKT7 质粒,而IQM4 片段用Nde I 和Xma I 分别定向插入pGADT7 和pGBKT7 质粒。4 种连接产物分别转化E.coli DH5α 感受态细胞,涂布至含相应抗生素的LB 固体培养基(pGADT7 为氨苄青霉素抗性;pGBKT7为硫酸卡那霉素抗性),使用克隆用引物直接菌落PCR 鉴定阳性转化子并送至华大公司测序证实。
1.2.3 酵母单杂交分析
采用PEG/LiAC 法将BD- CML37 和BD 质粒分别转化酵母感受态细胞AH109(图1),涂布于SD- Trp;将AD- CML37和AD 质粒分别转化酵母感受态细胞并涂布于SD- Leu,30℃培养4 d 至菌落形成。从SD- Trp 平板上挑取长势良好的单菌落接种于SD- Ade/His/Trp,从SD- Leu 平板挑取长势良好的单菌落接种于SD- Ade/His/Leu,30℃继续培养4 d。
2 结果
2.1 拟南芥CML37 与IQM4 基因克隆及载体构建
拟南芥CML37 的CDS 序列长558bp,IQM4 的CDS 序列长1599bp,克隆产物经PCR 扩增和琼脂糖凝胶电泳后,得到的条带符合预期。连接产物转化E.coliDH5α 感受态细胞,采用菌落直接PCR 鉴定阳性转化子,阳性克隆送至华大公司测序,测序结果证明CML37、IQM4 基因序列内部没有发生改变。
2.2 酵母双杂交分析
前期酵母双杂交实验结果表明,含有AD- IQM4+BD- CM L37 和AD+BD- CML37 质粒组合的酵母菌不仅在四缺培养基上正常生长,还能分解X- α- gal 产生蓝色菌落;但AD- CML 37+BD- IQM4 质粒组合的酵母不能在四缺培养基上生长。结果表明:在酵母细胞内,CML37 不能与IQM4 蛋白相互作用,BD- CML37 融合蛋白具有转录因子功能,而AD- CML37 不具备转录因子功能。
2.3 酵母单杂交分析
酵母单杂交实验中将AD- CML37 质粒转化酵母细胞后,涂布于SD- Leu 上培养4d 后,将转化酵母转接到SD- Leu/His/Ade 上继续培养4d 后没有观察到酵母菌落(图1A);将BD- CML37 质粒转化酵母细胞后,涂布于SD- Trp 上培养4d 后,挑取筛选培养基上的酵母接种另一种三缺培养基SD- Trp/His/Ade 上继续培养4d 后观察到酵母菌落(图1B)。转化有BD- CML37 质粒的酵母菌能够在三缺培养基上生长,但转化AD- CML37 质粒的酵母菌不能生长。酵母单杂交分析表明,拟南芥CML37 蛋白缺少DNA 结合活性,但具有激活活性;在酵母细胞中,CML37 与BD(DNA 结合域)融合后具有转录因子的功能。
图1 CML37 的酵母单杂交分析
3 结论和讨论
酵母双杂交技术交广泛应用于蛋白分子之间相互作用的研,酵母单杂交实验能够应用于验证转录因子的DNA 结合活性和自激活活性[4],拟南芥CML37 蛋白有3 个EF- hand 基序,没有其他功能结构域,但酵母双杂交和单杂交分析都证明CML37具有转录激活功能,说明CML37 基因功能研究还存在未认识的问题。