偏穗鹅观草(Roegneria komarovii)的分子核型
2020-09-18王子君李景环
王子君,李景环,金 凤
(内蒙古师范大学生命科学与技术学院,呼和浩特 010020)
小麦族(Triticeae Dumortier)中最大的属是鹅观草属,全世界有130多种,广泛分布于北半球的温寒地带[1],在我国有70多种,主要分布于西北、西南和华北地区[2]。鹅观草属植物多数种类是优良牧草,有些种还具有较强的抗逆性,可以作为小麦和禾本科牧草育种的重要基因资源。但是由于鹅观草属植物形态变异复杂,在与鹅观草属相似的属之间以及鹅观草属内种的划分等方面,至今仍然存在分歧[1-5]。
有关鹅观草属的分类研究报道很多,许多学者采用了染色体核型分析的方法,该方法是染色体组分析的一种比较有效的方法,指对生物的染色体数目、大小、形态和随体等特征进行分析[6-14],因此得到了大多数分类学家和细胞遗传学家的认可。但是,普通的核型分析技术在染色体来源以及同源染色体配对方面,还存在一定的不确定性。近十几年来,染色体荧光原位杂交技术(Fluorescence in situ hybridization,FISH)的发展和应用,使得该方法在物种分类、起源和进化等的研究中得到青睐[15-21]。
45 S rDNA是高度保守的重复序列。FISH技术染色体定位时,45 S rDNA 一般分布于有随体的染色体的次缢痕区域,在核型分析中对区分染色体类型是比较有用的细胞学依据[15-18]。5 S rDNA 也是高度保守的重复序列,但是它在染色体上的位置没有明显特征,是随物种不同而不同[17-20]。pAs 1 DNA一般分布在染色体末端或者着丝粒处,在不同物种中,其差异显示在pAs 1 DNA拷贝数的多少和分布位置上。这几种重复序列常被用来制备染色体荧光原位杂交的探针,从而来研究物种的起源、分类与进化。
偏穗鹅观草(Roegneriakomarovii)是禾本科(Poaceae)小麦族(Triticeae)鹅观草属(Roegneria)多年生优良牧草,在新疆、蒙古、苏联中亚和西伯利亚等地均有分布,大多数生长于海拔1 800~2 900 m处。有关偏穗鹅观草的细胞学研究未见报道。在本试验中,借助荧光原位杂交技术对偏穗鹅观草的染色体进行的5 S rDNA和45 S rDNA以及pAs 1 DNA的定位,进而相对准确地对偏穗鹅观草的染色体组进行分子核型分析,为偏穗鹅观草的遗传育种提供一定的细胞学信息,在细胞学水平上为鹅观草的分类及系统进化补充信息。
1 材料与方法
1.1 材 料
偏穗鹅观草种子由中国农业科学院草原研究所提供。分别带有5 S rDNA、45 S rDNA和pAs 1 DNA的质粒由南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室提供。
图1 偏穗鹅观草染色体5 S rDNA定位的中期染色体形态图和核型图
图2 偏穗鹅观草染色体45 S rDNA定位的中期染色体形态图和核型图
1.2 方 法
1.2.1偏穗鹅观草染色体标本的制备
1) 材料培养及处理。
在加水的培养皿中放置数粒饱满的偏穗鹅观草种子,置于25 ℃的培养箱内萌发,当根尖长度为1.5~2 cm时,将根尖剪下经过预处理、固定、解离、软化、染色和压片等过程,制备染色体玻片。
2) 冰冻揭片。
选择染色体分散较好的玻片放入-20 ℃冰箱中储存24 h后揭片脱水,将玻片放在无水乙醇中20~30 min后取出在室温下晾干备用。
1.2.2探针的标记
通过DNA切口平移法,用地高辛-dUTP标记5 S rDNA探针和pAs 1 DNA探针,用生物素-dUTP标记45 S rDNA探针。
1.2.3原位杂交与图片采集
原位杂交参照李景环等[16]和裴自友等[18]的方法进行。
采用日本产OLYMPUS-BX 53荧光显微成像系统100倍油镜下对染色体分散好的细胞进行图像采集。
1.2.4核型分析
采用Karyo 3.1软件对染色体进行长度测量,结合荧光标记特征对染色体进行配对。选择5个染色体分散好的细胞,测量染色体的短臂(p)长度,长臂(q)长度以及总长度,每条染色体测量3次取平均值,计算每一对染色体短臂(p)长度,长臂(q)长度以及总长度的平均值,得出染色体的绝对长度、相对长度和臂比。用Excel软件分析制作染色体核型模式图。
2 结果与分析
2.1 染色体数目的确定
通过对偏穗鹅观草分散良好且结构清晰的中期染色体进行镜检观察,选择30个细胞进行染色体计数,以85%以上细胞的染色体数确定为偏穗鹅观草的染色体数目2 n=28。
2.2 染色体核型特征
利用Karyo 3.1软件进行染色体长度测量和同源染色体配对。日本产OLYMPUS-BX 53荧光显微成像系统拍摄的染色体图及核型图见图1、图2、图4,对图1和图2进行合并得到图3。
图3 偏穗鹅观草染色体5 S rDNA和45 S rDNA定位的中期染色体形态图和核型图
图4 偏穗鹅观草染色体pAs 1 DNA定位的中期染色体形态图和核型图
由核型图(图1、图2和图4)可以看出,在配对的染色体中,中部着丝粒(m)类型的染色体有13对,近中部着丝粒(sm)类型的染色体有1对,其中m类型染色体中第6号短臂、第14号染色体长臂具随体。
2.3 5 S rDNA、45 S rDNA和pAs 1 DNA在染色体上的定位
从图1到图4可看出,在荧光显微镜下,被DAPI(4,6-二氨基-2-苯基吲哚)复染后,染色体呈现蓝色荧光;被地高辛-dUTP标记的5 S rDNA和pAs 1 DNA应该呈现出红色荧光,但与背景染色体的蓝色组合后,红色变淡,呈现出粉红色荧光;生物素-dUTP标记的45 S rDNA应该呈现的绿色荧光,同样与背景染色体的蓝色组合后呈现出亮绿色荧光。结果显示,5 S rDNA在2对染色体上有杂交信号,分别位于第6对染色体的短臂上和第11对染色体的长臂上(图1);有2对染色体检测到45 S rDNA杂交信号,分别位于第6对染色体的短臂上和第14对染色体的短臂上(图2);有8对染色体检测到明显的pAs 1 DNA的荧光信号,4对染色体表现出较弱的pAs 1 DNA荧光信号,有2对染色体(第8对染色体、第13对染色体)未检测出荧光信号(图4);5 S rDNA和45 S rDNA的双色杂交定位中,可以看出在第6对染色体的短臂上同时出现了5 S rDNA和45 S rDNA的荧光信号。5 S rDNA在远离着丝粒端,45 S rDNA在近着丝粒处,但是5 S rDNA和45 S rDNA紧密连锁。
2.4 偏穗鹅观草染色体核型参数
用Excel软件对染色体相对长度和臂比进行计算,得到偏穗鹅观草中期染色体核型参数表和核型模式图(表1和图5)。
图5 偏穗鹅观草染色体核型模式图
表1 偏穗鹅观草染色体核型参数
由表1可知,偏穗鹅观草的体细胞染色体数为2 n=28,染色体组总长度为104.785μm,染色体的绝对长度变异范围是10.806~5.323μm,平均绝对长度为7.485μm,相对长度范围为10.313 %~5.079%,最长染色体与最短染色体长度比为2.030,偏穗鹅观草染色体核型公式为2 n=4 x=28=26 m(4 SAT)+2 sm。
3 讨论与结论
3.1 偏穗鹅观草核型
本研究表明,偏穗鹅观草染色体数为2 n=28,有2对具随体的染色体,随体分别位于第6号、第14号染色体的短臂上。染色体组总长度为104.785μm,染色体的绝对长度变异范围为10.806~5.323μm,平均绝对长度为7.485μm,相对长度范围为10.313%~5.079%,最长染色体与最短染色体长度比为2.030。臂比大于2∶1的染色体有0组,所占比例为0,根据这2项主要特征可以判断偏穗鹅观草的核型类型属于Stebbins核型分类中的1B型。核型不对称系数为56.01%。因而,偏穗鹅观草染色体核型公式为2 n=4 x=28=26 m(4 SAT)+2 sm。
小麦族牧草染色体基数为x=7[7],本研究中的偏穗鹅观草染色体数为28条,为四倍体(2 n=4 x=28),核型的构成是以中部着丝粒染色体为基础,与多数已知染色体数目的鹅观草属植物相似。
孙根楼等[2]在1992年报道的偏穗鹅观草的核型公式2 n=24 m+2 sm+2 sat,核型类型2 A,以及随体出现于第12对sm型染色体上;本研究结果与之不同。本研究认为,偏穗鹅观草的染色体虽然只有28条,但是有些染色体仅从形态大小特征来看,染色体间的特征差异不明显,如果单纯采用普通染色体制片法进行核型分析,可能会给计算染色体的核型参数带来一定程度的不确定性,因此对染色体进行核型分析时会有一定的误差,可以结合其他的方法手段辅助分类,以便减少误差。如结合特定的荧光标记,进行染色体的配对会相对更加准确,而且更具科学性。
3.2 原位杂交
荧光原位杂交实验中最重要的是有效的探针标记[13,16]。实验中,要根据荧光信号的强弱适当改变探针的使用量,使其在中期染色体上出现清晰且明亮的FISH杂交信号[13-18]。
本研究中,5 S rDNA检测到的FISH杂交信号为4个,分别位于第6对染色体的短臂上和第11对染色体的长臂上,第6对染色体上的荧光信号比较强,第11对染色体上的荧光信号比较微弱;45 S rDNA 在偏穗鹅观草染色体上检测到了6个荧光信号,其中4个清晰且明亮,位于第6对染色体的短臂上和第14对染色体的短臂的端部,2个比较弱的荧光信号,位于第5对染色体的短臂的端部;5 S rDNA和45 S rDNA的双色荧光原位杂交技术结果显示,5 S rDNA和45 S rDNA的杂交信号强弱不同,在第6对染色体的短臂上同时出现了5 S rDNA和45 S rDNA的荧光信号,5 S rDNA在远离着丝粒处,45 S rDNA在近着丝粒处,但是二者间距较短,其余5 S rDNA和45 S rDNA的杂交信号则位于不同染色体上,利用5 S rDNA和45 S rDNA的荧光标记,能够准确识别4对同源染色体,在不同的染色体上5 S rDNA和45 S rDNA不仅存在着量的差异,而且也存在着位置的差异,能够提高核型配对的准确率。而pAs 1 DNA的FISH杂交信号则有28个清晰明亮的点(一条染色体上可能有2个及以上的信号点),以及一些较微弱且弥散的信号。pAs 1 DNA在偏穗鹅观草染色体上的杂交信号强弱不一,有的信号强,有的信号比较弱,是因为拷贝数越多信号相对就越强[20]。以上标记特征为染色体的同源配对提供了明确标识。
根据已检测到的 45 S rDNA、5 S rDNA以及pAs 1 DNA的FISH 杂交信号数目以及位置可以明确地区分开5对同源染色体,一定程度地提高了核型分析的准确度[19]。但是由于pAs 1 DNA有些杂交信号不明晰,而且有一些染色体上没有该标记信号,给同源配对带来了困难。想要对偏穗鹅观草进行更准确地同源配对,有待开发一些其他序列的标记,以确保染色体配对的准确性和核型分析的精确性与一致性。
3.3 结 论
本次研究确定偏穗鹅观草的染色体数目为28,为四倍体。偏穗鹅观草的核型公式为2 n=4 x=28=26 m(4 SAT)+2 sm,核型类型属于1 B型,经过计算得出其核型不对称系数为56.01%,判断偏穗鹅观草染色体属于较保守的类型。
在偏穗鹅观草中,5 S rDNA分别位于第6对染色体的短臂上和第11对染色体的长臂上;45 S rDNA分别位于第6对染色体的短臂上和第14对染色体的短臂上;有8对染色体检测到明显的pAs 1 DNA的荧光信号,大多分布于染色体的端部,少数定位于着丝粒区域。荧光原位杂交技术大大提高了染色体核型分析的可靠性,为鹅观草属植物的属内分类提供了细胞学资料[22]。