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基于DNA条形码的藏药洪连鉴定研究△

2020-06-10尼玛潘多李婷胡小松刘春生

中国现代中药 2020年4期
关键词:藏药碱基条形码

尼玛潘多,李婷,胡小松,刘春生*

1.西藏自治区食品药品检验研究院 西藏自治区藏药标准化研究重点实验室,西藏 拉萨 850000;2.北京中医药大学 中药学院,北京 102488

洪连为藏族习用药材,始载于《四部医典》。《鲜明注释》云:“洪连门巴随处皆有”;《度母本草》云:“洪连门巴产自南方者为上品;下品分雌、雄两类:能开花者为雄,无花者为雌。”《图谱》云:“雌洪连生于草坪和海滨,叶厚而具皱纹,下垂;花白色,状如狼尾巴;根如松鸡粪,枝被长毛。”《蓝琉璃》云:“随处皆生,分雌雄两种,雄者花蓝色,状如松鸡粪;根状如虫。”《甘露本草明镜》云:“本品根呈灰色,圆锥形,具须根;叶绿色,厚具皱纹,微粗糙,叶背微灰色,卵形或剑形,边缘有锯齿,先端急尖或钝圆;叶柄紫红色,细面长;花紫红色,果实小,黄紫色。”各地藏医多用玄参科的兔耳草、短管兔耳草、全缘兔耳草等植物为洪连门巴,其中,短管兔耳草的形态特征与上述文献记载更相近,故为兔耳草的正品[1]。具有清热解毒、行血调经的作用,在传统藏医中用于治疗全身发热、肾炎、肺病、高血压、动脉粥样硬化、月经不调、综合物中毒及“心热”等症[2]。洪连在临床上的应用较为广泛,是不少藏成药的主要组成,如二十味沉香丸、二十五味大汤丸、二十六味通经丸、八味沉香利尿丸、二十五味獐芽菜丸等。

2015年版《中华人民共和国药典》收载的洪连为玄参科短筒兔耳草LagotisbrevitbaMaxim.的干燥全草,1995年版《中华人民共和国卫生部药品标准》藏药第一册收载玄参科短管兔耳草LagotisbrevitubaMaxim或全缘兔耳草LagotisintegraW.W.Smith的干燥全草,《云南省中药材标准》1996年版收载革叶兔耳草LagotisalutaceaW. W. Smith.全缘兔耳草LagotisintegraW.W.Smith的干燥全草。

但各地藏区(西藏、四川、青海、云南、甘肃)除使用上述标准规定的品种外也有使用其他种的兔耳草。鉴于洪连药材来源复杂,品种繁多,极易造成药材混乱,加之兔耳草属的植物形态相似,不能准确区分。因此,对兔耳草属药材进行准确鉴定有着非常重要的意义。

目前对兔耳草的研究多集中在对短筒兔耳草的研究,且对其化学成分[3-7]研究较多,未见其有采用DNA条形码对其鉴定的报道。近年来,DNA条形码越来越受到关注。与传统鉴定方法相比,DNA条形码技术以物种的遗传信息为鉴定依据,不受植物生长环境、发育阶段、样品形态和组织部位的限制,具有通用性、客观性、准确性等特点[8]。因此DNA条形码已经广泛应用于药材鉴定的各个领域,如植物药、动物药等。

本研究收集了12批来源于各藏区的洪连药材,采用ITS及其叶绿体序列对其进行DNA鉴定,旨在对洪连进行准确鉴定,为进一步藏药资源的开发与合理利用提供支持。

1 材料

1.1 仪器

BIO-RAD T100 Thermal Cycler PCR仪(德国Biomerta公司),Bio-Rad 型电泳仪,(北京六一仪器厂),JY-SPDT型水平电泳槽(北京君意东方电泳设备有限公司),BG-gdsAUTD520凝胶成像分析系统(南京华奥仪器有限公司),MM400冷冻混合球磨仪(德国RETSCH公司)。

1.2 试药

广谱植物基因组DNA快速提取试剂盒(TIANGEN),2×Taqplus per mastermix(含染料)(北京博迈德发展有限公司);样品收集于各藏区,具体样品信息见表1。其中11、12号样品由四川省食品药品检验检测院黎跃成老师提供,经北京中医药大学刘春生教授鉴定为玄参科兔耳草属植物。

表1 12份洪连样品信息

2 方法

2.1 DNA提取

取适量药材用75%乙醇进行表面擦拭,加入液氮,用球磨仪迅速将其研成粉末,采用光谱植物基因组DNA快速提取试剂盒提取DNA,具体操作见说明书。提取的样品DNA于-20 ℃保存备用。

2.2 PCR扩增

采用30 μL反应体系,样品总DNA 2 μL,正反向引物(ITS引物:F-5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′,R-5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′;psbA-trnH引物:F-5′-GTTATGCATGAACGTAATGCTC-3′R-5′-CGCGCA-TGGTGGATTCACAATCC-3′;引物各1 μL,2×Mix聚合酶15 μL,ddH2O补足。

PCR反应程序:ITS序列:94 ℃ 3 min,94 ℃ 1 min,55 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,共30个循环,至72 ℃ 5 min;psbA序列:94 ℃ 5 min,94 ℃ 1 min,55 ℃ 1 min,72 ℃ 1.5 min,共30个循环,至72 ℃ 7 min。

2.3 测序分析

将所得PCR产物经1.0%~1.5%琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下检测于500~750 bp可见单一明亮的条带。剩余PCR产物经北京小师弟商贸有限公司进行一代测序分析。

2.4 数据处理

测序结果进行ContigExpress进行正反拼接,DNAMAN拼接及序列比对,采用BLAST方法对获得的DNA序列在GenBank-NCBI中进行相似性同源查询,采用MEGA5.0对得到的序列进行比对,分析种内、种间的遗传变异,计算Kimura2-parameter(K2-P)遗传距离,构建NJ进化树。

3 结果

3.1 ITS序列数据分析结果

经DNAMAN多序列比对,序列总长552 bp,各序列相似度达到97.43%,存在34个变异位点,见表2。从表中可得出在107 bp时短管兔耳草无碱基,全缘兔耳草为碱基T,紫叶兔耳草为碱基A,故能将三者进行区分。

根据其遗传距离构建N-J树,由图1可知,1、2、5、9、10共5个样品与下载序列短筒兔耳草聚为1支,3、4、7、8、11、12共6个样与全缘兔耳草聚为1支,6号样与紫叶兔耳草聚为1支。

图1 洪连样品ITS N-J树

3.2 psbA-trnH序列数据分析结果

序列长度约为250 bp,存在12个变异位点,见表3。在136 bp处,全缘兔耳草为碱基T,紫叶兔耳草为碱基A,短筒兔耳草无碱基,因此能将3个种很好地区分。根据遗传距离构建N-J树。由图3可知,与ITS结果鉴定结果相同,1、2、5、9、10共5个样品与下载序列短筒兔耳草聚为1支,3、4、7、8、11、12共6个样与全缘兔耳草聚为1支,6号样与紫叶兔耳草聚为1支。

表2 ITS序列变异位点

注:A .腺嘌呤;T.胸腺嘧啶;C.胞嘧啶;*表示在此处未有碱基。

表3 psbA-trnH序列变异位点

注:A .腺嘌呤;T.胸腺嘧啶;C.胞嘧啶;G.鸟嘌呤。

图2 洪连样品psbA-trnHN-J树

4 讨论

准确的基原鉴定是保障药材质量的根本,因各种原因,民族药材基础研究薄弱,基础工作不足,质量控制及监管整体水平较低,存在的主要问题是实际使用的药材与标准不相符,标准执行上存在一定问题[9-10],目前洪连药材的临床用药与现有标准存在很大差距,市售药材的来源较多,药材在流通中以同属多种植物作为替代品的现象很常见[11]。因此对洪连药材进行准确鉴别具有非常重要的意义。

本研究采用ITS及psbA-trnH序列对12批兔耳草属的药材进行鉴别,结果显示,12批的兔耳草来源于3个种,分别是短管兔耳草、全缘兔耳草与紫叶兔耳草。根据遗传距离构建N-J树3种兔耳草明显聚为3支,表明DNA条形码能准确区分兔耳草属的各个种,并且鉴定结果与形态鉴别结果相吻合。但鉴于本研究所选取样本有限,想要实现快速精准鉴别,还需要对更多样本的DNA进行扩增,以便积累更多的数据。

本研究以藏药洪连的精准鉴别为切入点,解决了洪连药材受样品形态、植物生长期、有花无花以及人为主观因素等限制的问题[12],为藏药的准确鉴别提供了可靠的方法,为藏药资源进一步的开发与利用奠定基础,同时为藏药的质量与临床安全用药提供了参考。

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