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肝窦内皮细胞相关文献的可视化分析

2020-04-03闫晓宇刘俞彤吕文良

中国医药导报 2020年6期
关键词:文献计量学可视化分析

闫晓宇 刘俞彤 吕文良

[摘要] 目的 通过对相关文献的可视化分析,探索近47年关于肝窦内皮细胞的主要研究方向及热点。 方法 运用顺查法检索WOS中的SCI-E中1972年1月~2018年12月相关文献,关键词:“hapatic sinusoidal endothelial cell”OR“liver sinusoidal endothelial cell”OR“HSEC”OR“LSEC”,索引:SCI-EXPANDED。以纯文本的格式导出检索结果的全记录与引用的参考文献。应用CiteSpace5.4.R3对作者、机构、关键词共现等进行可视化分析。 结果 共获得3474篇相关文献,2018年达到近47年的引文峰值。最高产的机构为悉尼大学,发文量最高的作者为Smedsrod B。被引频次最高的期刊是HEPATOLOGY。热点关键词为肝窦内皮细胞、储脂细胞、肝脏再生等,可形成9个聚类群。结论 应用CiteSpace分析肝窦内皮细胞相关文献,展示出了目前合作的国家和机构,揭示了研究的热点,为后续研究提供了参考,对肝窦内皮细胞的研究具有重要意义。

[关键词] 肝窦内皮细胞;慢性肝病;文献计量学;可视化分析;CiteSpace

[中图分类号] R575          [文献标识码] A          [文章编号] 1673-7210(2020)02(c)-0168-06

[Abstract] Objective Through visual analysis of related literature, the main research directions and hot spots of sinusoidal endothelial cells in recent 47 years were explored. Methods The forward search method was used to search the relevant literature of SCI-E in WOS from January 1972 to December 2018, the key words were “hapatic sinusoidal endothelial cell” or “liver sinusoidal endothelial cell” or “HSEC” or “LSEC”, index: SCI-EXPANDED. The full records and references of search results were exported in plain text format. The co-occurrence of authors, organizations and keywords were analyzed by using CiteSpace 5.4.R3. Results A total of 3474 related literatures were obtained, reaching the peak of citations in nearly 47 years in 2018. The most productive institution was the University of Sydney, and the most prolific author was Smedsrod B. The most cited journal was HEPATOLOGY. The hot key words were sinusoidal endothelial cells, lipid storage cells, liver regeneration, etc., which could form 9 clusters. Conclusion CiteSpace is used to analyze the literature related to sinusoidal endothelial cells, showing the current cooperation countries and institutions, revealing the research hotspot, providing a reference for the follow-up research, which is of great significance for the research of sinusoidal endothelial cells.

[Key words] Sinusoid endothelial cells; Chronic liver disease; Bibliometrics; Visual analysis; CiteSpace

肝纖维化为多种急慢性肝脏疾病的恢复性瘢痕,大量细胞外基质在肝内过度淤积的病理过程。肝纤维化与炎性反应有关,是各种原因引起的急慢性肝病向肝硬化及肝癌发展的必经之路。每年约有103万人死于慢性肝病,而中国患有慢性肝脏疾病的人数有3亿左右。伴随LSECs表型异常的肝窦毛细血管化的形成早于慢性肝病早期炎症并促进肝纤维化形成与发展。LSECs表型微观结构的改变对肝纤维化的防治具有重要意义和价值,因此众多国家和机构通过对肝窦内皮细胞的研究,来探索肝纤维化可能的逆转途径。CiteSpace是一款信息可视化软件,能够通过对文献进行计量分析及可视化图谱的绘制,以发掘某个研究领域的探索热点和前沿方向。本文采用软件CiteSpace5.4.R3对近47年关于肝窦内皮细胞的文献进行可视化分析,探究目前国内外相关的研究热点及现状,为肝脏疾病防治机制的进一步研究指引方向。

1 资料与方法

1.1 检索方法

1.1.1 文献来源及检索策略

文献来源:WOSCC数据库;检索策略:主题“hapatic sinusoidal endothelial cell”OR“liver sinusoidal endothelial cell”OR “HSEC”OR“LSEC”。时间跨度:1900年1月~2018年12月。索引:SCI-EXPANDED。以纯文本的格式导出检索结果的全记录与引用的参考文献。所有检索结果及导出在1 d内完成。新建两个文件夹,分别以“project”和“data”为名。将导出的结果以“download_***.txt”的格式命名后存入“data”文件夹中。

1.1.2 分析方法

运用CiteSpace5.4.R3进行可视化分析。因1900年以来首篇文献于1972年发表,故时间分区选择:1972年1月~2018年12月,时间切片:2年。根据不同的目的设置不同的节点类型。选择标准:选择TOPN,设置为20或50,即从每个时间切片中选择最常被引用或最常出现的前20或50个条目。剪切方式采用Pathfinder法。

2 结果

2.1 检索结果

检索获得1972年1月~2018年12月关于肝窦内皮细胞的文献3474篇,其中主要包括论著类文献2665篇、综述类文献420篇、会议摘要322篇、会议论文152篇、编辑素材类文献36篇等。被引频次总计122 693,h-index 147,每项平均引用次数35.32。

2.2 可视化分析

2.2.1 发文年度分析

分析近47年发表的肝窦内皮细胞相关文献,平均年发文量73篇,自1995年起每年发文量总体呈现上升趋势,年发文量均在101篇以上(图1),说明对肝窦内皮细胞的研究呈现逐年兴盛的趋势,2017年及2018年发文量达到高峰,均为173篇,为肝窦内皮细胞研究热点阶段。关于肝窦内皮细胞的研究逐渐增多,说明了广大研究人员及机构对此热点的认可。分析年度引文数,被引频次总计数122 693次,每年的引文数目呈现逐年增长的趋势,2018年度达到近47年的引文峰值(图2:2019年还未统计完全,故不做分析),反映出该领域近年来正处于研究热点阶段。

2.2.2 作者合作和作者共被引

作者合作与作者共被引的可视化图谱可以提供研究肝窦内皮细胞领域中较有影响力的研究团队和具有潜在合作可能的作者信息,可以帮助研究人员和不同研究小组之间建立合作关系。用CiteSpace分析后得到N = 914,E = 1842(N表示网络节点数量,E表示连线数量)的作者合作关系图谱(图3)。作者合作图谱显示发文量前3的作者分别为Smedsrod B[1]、Le Couteur DG[2]、Adams DH[3],但是作者合作的中心性均不高,說明作者合作关系可以进一步加强。作者共被引图谱中N = 135、E = 184(图4),按中心性排序(表1),Wisse E[4]、Knook DL[5]、Irving MG[6]、Friedman SL[7]、Smedsrod B[1]中心性较高,在肝窦内皮细胞相关研究中具有一定的影响力。

2.2.3 国家和机构分布

用CiteSpace生成国家和机构可视化图谱(图5),中心性前5的机构(表2):北卡罗莱纳大学、美因茨约翰内斯古滕贝格大学、柏林自由大学、巴斯克地区大学、大阪大学。发文量排名前5的机构(表3):悉尼大学、哈佛大学、伯明翰大学、匹兹堡大学、北卡罗莱纳大学。中心性排名前5的国家(表4):德国、西班牙、美国、日本、法国;发文量前5的国家(表5):美国、日本、德国、中国、英国。综合分析:在该领域占主要地位的国家是美国、日本、德国,这些国家文献产量较多,且图谱的连线情况体现出这三个国家的机构之间的合作较为密切。综合发文量及中心性分析可知,北卡罗莱纳大学是该领域的权威机构,主要研究方向:卡罗来纳冲洗液对大鼠肝脏缺血后再灌注损伤的保护作用[8]。

2.2.4 关键词可视化分析

2.2.4.1 关键词共现分析  用CitesSpace构建关键词共现图谱(图6:N = 83,E = 87),可反映在WOS中与肝窦内皮细胞相关的研究热点。按中心性排序排名前5的关键词(表6):枯氏细胞、离体、内毒素、巨噬细胞、释放。按出现频次排序排名前5的关键词(表7):肝窦内皮细胞、鼠肝、肝脏、内皮细胞、枯氏细胞。

2.2.4.2 关键词聚类分析  用CiteSpace对关键词进行聚类(图7),采用对数似然率算法,通过提取文献的关键词进行聚类命名,最终形成了9个聚类,其中MeanSilhouette值是用来衡量网络同质性的指标,越接近于1,反映网络的同质性越高。Modularity表示网络的模块度,值越大表示网络的聚类结果越好,本次聚类MeanSilhouette值S=0.9455,Modularity值Q=0.7799,聚类结果较好。按每个聚类的MeanSilhouette值由高到低排序,可以反映该聚类的主要研究内容及方向,具体分析见表8所示。

2.2.5 期刊及文献共被引

运用CiteSpace对期刊共被引分析得到图8可视化图谱,表9~10为中心性排名前5的期刊及共被引频次排名前5的期刊。综合分析,Hepatology、Gastroenterology等期刊可以反映近47年来与肝窦内皮细胞相关的研究进展。运用CiteSpace进行文献共被引分析得到可视化图谱见图9,共被引频次最多的文献(表11)为Xie G于2012年在Gastroenterology上发表的关于肝窦内皮细胞分化在大鼠肝纤维化进程和消退中的作用机制的文章,阐述了LSEC的分化状态在HSC的活化和纤维化过程中起着至关重要的作用,解释了维持肝窦内皮细胞的分化需要血管内皮生长因子、恢复肝窦内皮细胞分化的影响机制[9]。中心性排名最高的文献(表12)为Knolle PA[10]于2000年在Immunol Rev上发表的关于肝脏免疫反应的局部控制的文献。其认为在肝脏中,抗原从血液中清除主要是由窦状内皮细胞进行的,阐明了肝窦内皮细胞在肝脏的生理过程中可能进行的局部调节,奠定了肝血窦通路研究的基础。

[9]  Xie G,Wang X,Wang L,et al. Role of differentiation of liver sinusoidal endothelial cells in progression and regression of hepatic fibrosis in rats [J]. Gastroenterology,2012,142(4):918-927.

[10]  Knolle PA,Gerken G. Local control of the immune response in the liver [J]. Immunol Rev,2000,4(174):21-34.

[11]  Fraser R,Cogger VC,Dobbs B,et al. The Liver Sieve and Atherosclerosis [J]. Pathology,2012,44(3):181-186.

[12]  Rogers GW,Dobbs BR,Fraser R. Decreased hepatic uptake of cholesterol and retinol in the dimethylnitrosamine rat model of cirrhosis [J]. Liver,1992,12(5):326-329.

[13]  Fraser R,Dobbs BR,Rogers GW. Lipoproteins and the liver sieve:the role of the fenestrated sinusoidal endothelium in lipoproteinmetabolism,atherosclerosis,and cirrhosis [J]. Hepatology,1995,21(3):863-874.

[14]  Kanazawa H,Obara H,Yoshikawa R,et al. Impact of machine perfusion on sinusoid microcirculation of liver graft donated after cardiac death [J]. J Surg Res,2019, 19(245):410-419.

[15]  Yang XQ,Ye J,Li X,et al. Pyrrolizidine alkaloids-induced hepatic sinusoidal obstruction syndrome: Pathogenesis,clinical manifestations,diagnosis,treatment,and outcomes [J]. World J Gastroenterol,2019,25(28):3753-3763.

[16]  Gracia-Sancho J,Manicardi N,Ortega-Ribera M,et al. Emricasan ameliorates portal hypertension and liver fibrosis in cirrhotic rats through a hepatocyte-mediated paracrine mechanism [J]. Hepatol Commun,2019,3(7):987-1000.

(收稿日期:2019-09-03  本文編辑:李亚聪)

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