基因工程方法增加微藻脂质积累研究进展
2020-02-19李俊磊张红兵
李俊磊,张红兵
(河北经贸大学 生物科学与工程学院,河北 石家庄 050061)
随着经济发展和人口增长,人们对能源的依赖日趋加剧,但石油、天然气等石化能源燃烧会产生大量的CO2,加速温室效应,产生的NO2、SO2和PM 2.5会造成大气污染,成为亟待解决的问题。以生物油脂为原料生产的生物柴油(脂肪酸甲酯)含硫低、润滑好、易燃烧,有替代传统柴油的潜力,成为近年来生物能源研发的热点。与传统能源作物大豆、玉米、油菜、麻风树等相比,微藻生长速率快、适应性强、不占用耕地,可与废气废水治理相结合,是理想的生物能源制备原料。
微藻的油脂含量是影响终产品成本的关键因素之一,目前微藻型生物柴油的价格较高,难以推动其商业化应用。随着人们对微藻脂质合成与代谢途径研究的不断深入,从现有微藻出发,利用基因工程方法对相关基因进行改造,增加微藻脂质积累水平,相比传统的微藻培养优化无疑是一条捷径。本文从微藻脂质的合成途径出发,综述了国内外利用基因工程技术改造微藻,提高脂质积累的方法,并对应用前景进行了展望。
1 TAG的合成途径
TAG是微藻中组成中性脂质的主要成分,在藻细胞处于静止生长期或压力条件下容易积累。TAG在酸、碱或酶等存在的条件下,可以与甲醇进行酯交换生成生物柴油和甘油。微藻内TAG的合成可分为叶绿体内脂肪酸合成途径、游离脂肪酸跨膜、内质网上的Kennedy途径和包装油脂小滴四个阶段。其中脂肪酸合成途径和Kennedy途径是TAG合成的关键,调控这两个途径是提高微藻脂质积累的突破口。
1.1 脂肪酸合成途径
1.2 Kennedy途径
脂酰辅酶A(acyl-CoA)和3-磷酸甘油(G3P)是Kennedy途径的直接前体,acyl-CoA由穿过叶绿体膜的FFA经脂肪酸硫激酶催化形成,G3P由磷酸二羟基丙酮(DHAP)经3-磷酸甘油脱氢酶(G3PDH)催化产生。甘油三磷酸酰基转移酶(GPAT)催化acyl-CoA的脂酰基转移到G3P的sn-1位,酯化生成溶血磷脂酸(LPA)。溶血磷脂酸酰基转移酶(LPAAT)继续催化LPA的sn-2位酯化生成磷脂酸(PA)。PA在磷脂酸磷酸酶(PAP)的作用下脱去磷酸形成二酰甘油(DAG)。最后DAG在二酰甘油酰基转移酶(DGAT)作用下sn-3位酯化形成TAG。
2 基因工程方法增加微藻脂质积累
生物信息学研究发现微藻与植物的脂质合成过程高度相似,可借鉴现有高等植物对TAG合成的研究结果,利用基因工程方法从增强脂肪酸合成、增强Kennedy途径和抑制脂肪的合成竞争三类途径提高微藻脂质的积累。
2.1 增强脂肪酸合成途径
脂肪酸合成途径中的关键酶主要包括PDH、ACCase、FAS、碳酸酐酶(CA)。
PDH的活性与TAG的积累具有很强的相关性,并受丙酮酸脱氢酶激酶(PDK)负调控,Ma等[1]通过RNA干扰敲低了微藻内的PDK基因(NsPDK),使碳通量转向TAG积累,且改造后的基因工程藻细胞不受高光抑制。
ACCase抑制剂的存在会导致TAG累积水平显著下降,但研究发现过表达ACCase却不能提高微藻脂质积累,推测可能是受到了反馈抑制,其后续的研究不多[2-3]。
FAS催化脂肪酸碳链的加长,但目前尚未见到成功高表达FAS的报道。
2.2 增强Kennedy途径
相对于脂肪酸合成途径,Kennedy途径相对更靠近目标产物,因此更容易影响TAG的合成。与Kennedy途径相关的限速酶主要包括:GPAT、LPAAT、PAP、DGAT、G3PDH。
Niu等[6]在三角褐指藻中过表达GPAT基因,经尼罗红荧光染色发现其中性脂质含量增加了2倍,GC-MS分析显示不饱和脂肪酸比例与野生型相比显著提高,更有利于生产生物柴油。Balamurugan等[7]发现AGPAT1的过表达会促进富油新绿藻中参与TAG合成的其他关键基因如DGAT2和GPAT的表达,使TAG含量增加1.81倍,同时多不饱和脂肪酸中的EPA和DHA显著增加,而总碳水化合物和可溶性蛋白质含量低。
LPAAT是Kennedy途径的第二个酰基转移酶,Chungjatupornchai等[8]将莱茵衣藻的NeoLPAAT1稳定过表达至原始藻株的2倍,使TAG含量增加2.1~2.2倍,产率增加1.9~2.8倍。Wang等提出了一种结合遗传操作与间歇性热休克结合的新策略,将其它藻源的c-LPAAT和c-GPD1插入到莱茵衣藻的DNA中,3次热休克后c-LPAAT和c-GPD1的转录水平增加了5.3和8.6倍,脂质含量分别增加44.5%和67.5%。
PAP催化PA的去磷酸化,形成DAG和无机正磷酸盐,该反应在TAG的合成中是不可或缺的。Deng等[9]发现三角褐指藻中CrPAP2的mRNA水平比无氮培养条件时高,使用RNA干扰方法沉默CrPAP2基因后可导致脂质含量下降2.4%~17.4%,而过表达CrPAP2基因则导致脂质含量增加7.5%~21.8%,证明CRPAP2具有影响脂质合成的潜力。
DGAT是催化TAG生物合成最后步骤的关键酶。为了增加TAG含量,Klaitong等[10]在富油新绿藻中过表达NeoDGAT2,使其转录水平提高2倍,发现脂质积累加速,转化后TAG含量增加1.8~3.2倍,产率提高1.6~4.3倍。Niu[11]在三角褐指藻中过表达DGAT2后中性脂质含量增加了35%,多不饱和脂肪酸比例显著增加,且生长速率保持在较高水平,与Li等[12]的报告相似。
除了过表达单个或数个靶基因,Zou等[13]尝试在三角褐指藻中引入高效的组成型启动子Pt211来增加多个靶基因的表达水平。QPCR分析表明参与TAG生物合成的GUS、GPAT和DGAT2等基因在Pt211驱动下显示更高的转录丰度,并且不影响藻类的生长和光合作用。
2.3 抑制脂肪合成的竞争途径
淀粉合成途径会与Kennedy途径竞争共同前体G3P,抑制脂肪合成的竞争途径,改变碳分配方向,也能够提高微藻脂质积累水平。研究表明,莱茵衣藻的CONSTANS基因具有调节淀粉含量的作用,Deng等[14]敲低CONSTANS基因的表达,发现TAG生物合成相关基因(DGAT2、PAP2和PDAT3)的表达水平提高,使TAG含量增加24.5%。
微绿球藻是一种高产油的藻种,Ajjawi等[15]用RNA-seq分析在氮剥夺期间作为脂质合成负调节剂的多种转录因子,利用CRISPR-Cas9敲除真菌 Zn(II)2Cys6 编码基因的同源物,发现能够改善微藻在营养充足条件下总碳与脂质的分配,虽然突变体生长不良,但产生的脂质却是野生型的2倍。
3 总结与展望
微藻在非胁迫条件下进行碳捕获,合成和储存淀粉以支持生长和细胞分裂,只有在胁迫条件下倾向于以生长为代价积累大量的储存脂质,因此有必要对微藻TAG的生物合成途径和代谢调控进行深入的研究,在保持高生长速度的同时增加脂质积累,这对于生物柴油的生产是至关重要的。已有的研究成果表明,增强脂肪酸合成途径、增强Kennedy途径和抑制脂肪合成的竞争途径都能够影响TAG的合成。
与此同时,也要考虑基因工程微藻对生态系统的潜在风险,在将新型突变菌株作为工业用途之前,必需通过环境风险评估,防止具有优势的转基因微藻如果借助开放的水域中逃逸到外部环境,打破原有的生态平衡。
虽然基因工程手段增加微藻油脂积累的相关研究才刚刚起步,但鉴于其针对性强、效率高、潜在的经济效益突出,其科学意义和应用价值明显,成为越来越多的研究人员的关注焦点和研究热点,随着新发现和新成果的不断涌出,微藻产油的商业化应用必定会实现。