羊乳中牛乳成分的可视化环介导等温扩增检测方法
2020-01-07澹台玮徐秦峰张文娟李艳妮
澹台玮,徐秦峰,张文娟,李艳妮
(陕西科技大学 食品与生物工程学院 国家羊乳制品加工技术研发专业中心,陕西 西安 710021)
0 引言
在我国,乳及其制品已成为人们日常营养的补充剂.并且随着生活水平的提高,对乳及其制品的需求逐渐由数量向质量转变,即人们更倾向于追求一些高营养价值的乳制品,如羊乳及其制品[1].但由于养殖和季节波动等影响,羊乳价格相对偏高[2].一些不法商家为了寻求商业利益,在羊乳中掺入牛乳,以次充好,且掺入手段多样,不仅损害了消费者合法权益,并对羊乳行业的健康发展产生了不利影响[3].由于传统感官检验及常规指标不易辨别,在2016年发布的农业行业标准《羊奶真实性鉴定技术规程》(NY/T3050-2016)中[4],主要通过凝胶电泳、酶联免疫或PCR方法检测羊奶产品是否存在牛源性蛋白或者DNA,来鉴别羊奶产品是否掺入了牛源性奶成分.
相比于蛋白质,DNA对于热加工更为稳定[5],并且由于PCR方法对目标DNA序列的指数扩增,PCR方法适用于生羊奶、UHT灭菌液态羊奶及羊奶粉中掺入牛源性奶成分的高灵敏检测.但是PCR方法需要热循环仪器和凝胶电泳观察实验结果,操作繁琐,无法实现羊奶真实性的现场快速检测,限制了此方法的推广应用.环介导等温扩增技术(Loop mediated isothermal amplification,LAMP)[6]则可实现在恒温条件下,特异、高效、快速地扩增核酸序列.LAMP反应无需热循环仪器,且LAMP产物可通过荧光目视可视化快速简单的鉴别[7].已有的LAMP荧光检测染料主要包括钙黄绿素、SYBR Green I等,普遍存在稳定性差、斯托克斯(stoke′s)位移小导致的颜色区分不明显等问题[8].
为了克服这种局限,本研究中发展了核酸分子“光开关”钌(II)配合物[Ru(bpy)2(dppz)]2+作为可视化LAMP荧光染料.[Ru(bpy)2(dppz)]2+在水溶液中本身不发光,DNA存在时荧光显著增强,具有优良的水溶性、稳定性、生物低毒性、Stoke′s位移大等优点[9-11].通过将金属钌配合物[Ru(bpy)2(dppz)]2+的核酸分子“光开关”特性与LAMP扩增反应结合,建立了羊乳中牛乳成分的可视化LAMP检测方法.该方法直接通过可视化荧光目视比色判定检测结果,具有快速、直观、低成本等优点,可为羊奶真实性现场快速检测提供技术支持,并可通过LAMP引物设计实现其它动植物源性食品的真实性快速检测.
1 材料与方法
1.1 实验材料
鲜牛乳样品采自西安市未央区草滩奶牛场,鲜羊乳样品采自陕西省西安市未央区市场,采集的鲜乳制品于-20℃保存备用.用于验证引物特异性的非目标DNA(鸡、猪、马、兔和鸽子)均购于四川华汉三创有限公司.不同品牌的羊乳产品(液态乳、羊奶片、全脂羊乳粉及配方奶粉)等样品分别购自西安市以及网上不同的超市,用于验证所建立方法的实际应用价值.
1.2 主要试剂和仪器
(1)试剂:磁珠法血液基因组DNA提取试剂盒购自天根有限公司,甜菜碱(Sigma公司),钌(II)配合物[Ru(bpy)2dppz]2+(Jena Bioscience公司),dNTP混合液,Bst 2.0 WarmStarDNA聚合酶,MgSO4,均采自New England Biolabs.
(2)仪器:高速冷冻离心机(5424R,Eppendorf有限公司);琼脂糖水平电泳仪(DYCP-31DN,北京六一生物科技有限公司),电热恒温水槽(DK-8D,上海精宏实验设备有限公司),超微量分光光度计(Q6000,美国Quawell),蓝光透射仪(VE0100,SMOBIO).
1.3 DNA提取
根据实验室前期研究结果[12],本实验中采用磁珠法提取新鲜乳品或羊奶制品中DNA,以超微量核酸定量仪测定DNA浓度和纯度后,将DNA溶液稀释到7 ng/μL,储存在-20 ℃,备用.
1.4 LAMP引物选取
本研究涉及的牛、羊特异性引物以线粒体保守序列为靶基因,选取SN/T 4419.21-2016标准中牛特异性引物及文献报道的羊特异性引物[13],如表1所示.引物由上海生工生物有限公司合成.
表1 本实验中LAMP扩增引物序列
1.5 可视化LAMP方法建立及优化
LAMP反应体系为10μL,包括:1μL 10×Thermol Pol buffer,外引物F3和B3(10μM)各0.2μL,内引物FIP和BIP(40μM)各0.2μL,1.4μL dNTPs(10 mmol/L),1.6μL甜菜碱(0.8 M),0.4μL Bst DNA聚合酶(8 U/μL),加入待测DNA 1.2μL,以双蒸水为空白对照,最后用水补齐到10μL,混匀.在64 ℃下恒温反应45 min.
反应结束后取1μL扩增产物加入50μL钌(II)配合物[Ru(bpy)2(dppz)]2+溶液,在蓝光透射仪下观察颜色变化,出现红色荧光为阳性,无色为阴性,同时结合2%的琼脂糖凝胶电泳分析鉴定.
为了确保颜色区分更明显,对镁离子浓度及钌(II)配合物[Ru(bpy)2(dppz)]2+染料浓度进行优化,其中镁离子浓度分别为2、4、6、8、10、12 mM,钌(II)配合物[Ru(bpy)2(dppz)]2+染料浓度分别为5μM、10μM、15μM、20μM、25μM.
1.6 可视化LAMP方法的特异性与灵敏度
以鸡、猪、马、兔、鸽子的基因组DNA分别作为待测样品模板,奶牛、山羊的乳基因组DNA分别作为模板阳性对照,双蒸水作为模板阴性对照(NTC),按照优化好的条件进行LAMP扩增,反应结束后通过观察颜色变化,验证引物的特异性.
将7 ng/μL的奶牛和山羊DNA原液10倍浓度梯度稀释,浓度依次为:7 ng/μL、0.7 ng/μL、0.07 ng/μL、0.007 ng/μL、0.000 7 ng/μL、0.000 07 ng/μL、0.000 007 ng/μL,每个梯度均取1.2μL为模板,按照优化好的条件进行LAMP扩增,验证方法的灵敏度.
1.7 可视化LAMP方法的掺假比例检出限
为了验证所建立方法的灵敏度及适用性,在提取的羊乳DNA中掺入不同比例的奶牛乳DNA(比例依次为100%、80%、50%、10%、5%、1%、0.1%和0%),取上述混合DNA 1.2μL为模板进行LAMP扩增,确定所建立方法的检出限.
1.8 市售样品的实际检测应用
使用优化好的可视化LAMP方法对市售羊乳样品进行检测,以验证建立方法的实用价值.
2 结果与讨论
2.1 可视化LAMP检测方法的建立
为了确定方法的可行性,在LAMP反应体系中设置有模板与空白对照进行扩增,反应结束后添加[Ru(bpy)2(dppz)]2+染料观察荧光颜色变化,并通过琼脂糖凝胶电泳和荧光光谱扫描进行确认.
实验结果如图1(b)中插图所示,在DNA模板存在时,能够观察到明显的荧光发射;而在没有DNA模板时,几乎观察不到任何的荧光发射.荧光目视比色与图1(a)中琼脂糖凝胶电泳结果一致,表明[Ru(bpy)2(dppz)]2+染料可用于LAMP扩增反应的检测.此外,在图1(b)中[Ru(bpy)2(dppz)]2+染料最大荧光发射处于红光波段,采用可见蓝光激发Stoke′s位移>150 nm,对比明显,目视比色更容易区分,可减小主观误差.
(a)电泳图(M:DNA Marker)(b)荧光光谱图(插图:颜色对比图;1:阳性对照;2:阴性对照)图1 可视化LAMP检测结果
2.2 可视化LAMP反应体系优化
为了建立最优的可视化LAMP检测体系,对镁离子浓度及钌(II)配合物[Ru(bpy)2(dppz)]2+染料浓度进行优化.镁离子浓度优化结果(如图2所示)显示,其浓度为8 mM时,显色反应最为明显.
同时,为了达到最佳的荧光目视比色效果,对钌(II)配合物[Ru(bpy)2(dppz)]2+染料浓度进行优化,结果(如图3所示)显示:当染料浓度大于10μM时即可达到较明显的阳性红色、阴性无色的颜色对比,基于节约试剂和检测效果稳定性考虑,选择15μM钌(II)配合物[Ru(bpy)2(dppz)]2+浓度作为后续试验的染料浓度.
图2 镁离子浓度的优化(1~6分别为2、4、6、8、10、12 mM镁离子浓度)
图3 钌(II)配合物[Ru(bpy)2(dppz)]2+染料浓度的优化(1~5分别为5、10、15、20、25 μM染料浓度)
2.3 特异性检测
采用牛、羊、鸡、猪、马、兔、鸽子等样品DNA为模板,进行LAMP反应,以验证引物的特异性,其结果如图4所示.针对牛、羊源性成分设计的特异性引物,仅含有目标成分DNA时观察到明显的颜色变红,即检测结果为阳性,空白对照和其他动物源性样品均未变色,为阴性结果,表明LAMP引物的特异性良好.
(a)牛源性成分(1~8分别为牛、羊、鸡、猪、马、兔、鸽子和空白对照)
(b)羊源性成分(1~8分别为羊、牛、鸡、猪、马、兔、鸽子和空白对照)图4 牛、羊源性成分LAMP引物特异性验证
2.4 灵敏度检测
为了确定建立的荧光目视比色方法能够检测到牛、羊乳DNA最低含量,将10倍梯度稀释的牛、羊源性成分DNA分别用于LAMP反应,其结果如图5所示.两种目标成分DNA检测可达到0.007 pg/μL和0.7pg/μL的检测限,表明基于钌(II)配合物[Ru(bpy)2(dppz)]2+染料的目视比色检测方法具有较高的检测灵敏度;颜色对比方面显示出红色和无色的明显区分效果.
(a)牛源性成分
(b)羊源性成分图5 牛、羊源性成分LAMP反应灵敏度检测(1~8为7、0.7、0.07、0.007、0.000 7、0.000 07、0.000 007 ng/μL DNA和空白对照)
2.5 检出限的确定
用可视化LAMP技术检测8种不同比例奶牛乳和羊乳DNA混合样品,结果(如图6所示)显示,在所有混合比例的样品中,该方法能检测出羊乳中掺假0.1%的牛乳,高于标准中PCR方法的2%检出限[4].
图6 羊乳中掺入不同比例牛乳的可视化LAMP检测(1~8分别为掺入牛乳DNA比例为100%、80%、50%、10%、5%、1%、0.1%、0%)
2.6 实际样品检测结果
为了验证方法的实用价值,选取市售不同品牌的全脂奶粉、脱脂奶粉、羊奶片及配方奶粉等13个羊奶样品,分别以奶牛、羊特异性引物对这些样品提取的DNA进行扩增.结果(如图7、表2所示)显示,标注为纯羊乳的样品(5、6、9)检测出牛乳成分,显示了在羊乳中掺入不同程度的牛乳成分;而样品13(标识有生羊乳、牛乳清粉)仅检测出牛乳成分,与标识的主成分不符.同时利用实时荧光LAMP及琼脂糖凝胶电泳进行对比验证,其结果与可视化LAMP结果一致,证明了该可视化LAMP方法可在实际检测中进行应用,且检测结果可靠.
(a)牛源性成分
(b)羊源性成分图7 市售羊乳制品中牛、羊源性成分检测结果(1:牛源性成分阳性对照;2:羊源性成分阳性对照;3~15为不同品牌的市售样品;16:空白对照)
表2 市售羊乳制品中牛、羊源性成分检测结果
注:“+”代表检测出该目标DNA;“-”代表未检测出目标DNA.
3 结论
根据线粒体保守序列选取牛、羊特异性引物,将金属钌配合物[Ru(bpy)2(dppz)]2+的核酸分子“光开关”特性与LAMP扩增反应相结合,建立了快速鉴别羊乳及其制品掺假牛乳的可视化LAMP检测方法.
结果表明,[Ru(bpy)2(dppz)]2+染料可用于LAMP扩增反应的荧光目视检测,并且其具有的大Stoke′s位移使得LAMP扩增DNA呈现红色荧光发射,与激发的蓝光对比明显,目视比色更容易区分.该方法具有良好的特异性和灵敏性,在混合样品中可检测羊乳中掺假0.1%牛乳,完全满足实际市场掺入量5%的检测需要[14],并成功应用于市售样品的掺假检测.
相对于现有的基于其他荧光染料的可视化LAMP技术[15-17],其节约了检测成本,操作简便,检测时限短,结果准确,而且克服了其他染料荧光目视比色时颜色对比不明显,以至可能无法区分其所对应的物种的缺点,更适用于大批量样品的快速掺假鉴别,可以作为乳品市场监督和检验鉴定的可行性方法.