当归DNA提取及其分子鉴定研究
2020-01-06任永超
摘要:本文通过综述当归分子的基因组DNA提取方法及其检测方法以及其分子鉴定的方法,提供给大家有效提取当归基因组DNA分子的一些改进思路,有望为当归分子基因组DNA提取的方法及其分子鉴定方法的完善提供一些理论依据。
关键词:当归;DNA分子;分子鉴定
1.取样
当归作为重要的中草药成分,经过加工,加入到药品中,不同相态的药品中的当归成分取样方法各不相同,基因组DNA不同的提取方法也不同。传统的十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法现在多以这些方式对不同相态中的药品进行取样:药片、散剂和药丸,称量后用研磨法取样;胶囊类药品脱去外壳后,直接称量即可;液体药剂直接用移液枪抽取合适的量即可。
2.DNA分子提取
DNA分子的提取方法较多:十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法,十二烷基磺酸钠(SDS)法以及磁珠法等,这三种提取方法在中草药成分的基因组DNA提取中都比较常用。其中CTAB法为经典的DNA提取方法,许多物种的DNA都可以用它来提取,且经济易得,但其在当归DNA分子提取中一直难以应用。
最近几年,当归基因组DNA分子的提取一直是一个研究热点,有研究者将中草药中提取DNA的方法在当归基因组DNA分子提取中都做了实验,尤其是对传统CTAB法进行了深入的研究,研究结果显示:单一的使用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取药品中当归基因组DNA分子的方法不可取,提取杂质多甚至于难以提出,但先用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取药品中当归基因组DNA分子,然后再用试剂盒进行后续提纯处理,会大大提高实验的完成度和准确性,远胜于其他一些提取药物中当归基因组DNA分子的提取方法。
3.DNA分子检测
3.1设计引物
根据目标基因片段的碱基序列按引物设计的一般原则设计引物,引物设计的好坏直接关系到PCR扩增的结果。
3.2PCR扩增
PCR技术是现代分子生物学的常用的技术,是在体外模拟基因序列扩增的技术,可实现基因组序列短期内的快速扩增,放大特定的基因序列,便于检测。这项技术大致可分为三个部分:高温变性,使目的基因的双链在95°C高温下被打开;低温退火,使引物与单链按照碱基互补配对选择进行结合,一般需要自己进行温度梯度,寻找合适的退火温度,通常退火温度在60°C左右;适温延伸,在DNA聚合酶的最适温度72°C下,DNA聚合酶可以沿着磷酸到五碳糖(5-3)的方向合成互补链,最终完成目的基因序列的扩增。
3.3琼脂糖凝胶电泳与紫外分光光度计测量法
琼脂糖凝胶电泳技术是检测DNA完整性和浓度比较好的一项技术,可以通过与PCR技术的结合,完成多种检测任务,比如:目的基因的鉴定。该方法采用琼脂糖凝胶作为介质,提供以碱性缓冲液环境来检测大分子量的核酸,可以用大一点的点样孔进行电泳检测。电泳完成后有后续实验需要可进行目的条带的切胶回收。同样,紫外分光光度计也可以检测微量基因组DNA的浓度,但对特异性DNA的检测没有琼脂糖凝胶电泳效果好,两者可以结合用于当归基因组DNA的检测。
4.当归分子的鉴定研究
DNA条码技术是中草药成分鉴定最为普遍的一项技术,通过对提取的样本基因组DNA中的线粒体细胞色素C氧化酶亚基1(CO1)基因序列进行PCR扩增,并与其数据库进行对比分析,从而实现物种的快速、准确的鉴定与分离。这项技术同时涉及到了当归基因组DNA的提取和其CO1基因序列的扩增,所以能很好的从药物中提出当归分子的基因组DNA和进行目的基因的扩增仍是基础,包括检测特异性条带的琼脂糖凝胶电泳技术。
除了可以快速鉴别与分离出物种的DNA条码技术之外,有研究者提出,用叶绿体中的trnL-F序列也可以实现当归的分子鉴定。当归分子制成药品的加工过程中,基因组DNA偶有损伤,而叶绿体基因组相对于核基因组来说容易保留,不易被破坏,其基因序列更易得到扩增,从而完成对当归分子的鉴定。因此,我们可以鉴此思路,从线粒体和叶绿体的基因组中,寻找适合做当归分子鉴定的基因序列,也就是在药品加工过程中最不易被破坏的那部分基因序列,提高鉴定效率。
展望
当归是重要的中草药成分,在治疗方面发挥着重要的作用。因此,从含有当归成分的药中成功检测出当归DNA分子显得尤为重要。一方面要综合现在分子生物学技术:PCR技术,琼脂糖凝胶电泳技术等,保证DNA分子的完整性和成功鉴定;另一方面利用DNA条码技术,实现当归分子的特异性鉴定。本文综述了当归DNA分子提取及其分子鉴定中用到的一些技术,希望为药物中当归成分的有效鉴定提供一些理论依据。
基金项目:贵州省2017年度黔南州社会发展科技计划项目“黔南地区当归道地性相关的遗传信息研究”(编号:黔南科合社字(2017)1号)
作者簡介:任永超(1989-),男,贵州都匀人,汉族,研究生,工程师,研究方向:生物化学与分子生物学。