新疆甜瓜地方品种（Cucumis melo L.）的SSR遗传多样性

张永兵 范向斌 牙生·艾尔肯 马新力 伊鸿平 吴明珠

张永兵，吴明珠（编译）

（新疆农业科学院哈密瓜研究中心 乌鲁木齐 830091）

目的与意义： 适应于原产地的地方品种是甜瓜种质保存和遗传改良的重要资源，详细了解这些地方品种的遗传变异对于新疆甜瓜种质资源的多样性保护和重要农艺性状的遗传改良具有重要的意义。本文利用SSR标记方法对新疆甜瓜地方品种进行遗传多样性分析，并比较新疆3个主要生态地区东疆、南疆和北疆地方品种的遗传关系，为更好的理解我国甜瓜地方种质资源遗传变异的分布提供依据。

材料与方法： 利用36个已在甜瓜遗传特性鉴定中应用的SSR标记，对35份新疆甜瓜地方品种进行扩增检测，SSR扩增位点的电泳检测结果最终转化为“0”、“1”数据矩阵。利用软件PowerMarker （3.25） 计算等位位点数量、基因多样性指数（GD）、观察杂合度和多态性信息量（PIC）等参数，利用软件NTSYS-PC （2.10e）计算供试材料间的Jaccard遗传相似系数（JC），基于JC数据的UPGMA聚类分析和PCA主成分分析分别在软件NTSYS-PC （2.10e）的SAHN模块和DCENTER、EIGEN、MOD3D算法下完成。

结果与分析： 36个SSR标记中，分布在甜瓜9个连锁群上的19个SSR标记具有多态性，共扩增出55个等位基因。通过分析19个多态性SSR位点的55个等位基因，表明：（1）每个位点扩增的等位基因数2～5个、平均2.8个，GD指数的范围0.06～0.71、平均值为0.42，PIC值的范围0.05～0.65、平均0.36。除了CMTC168、CMCTN4、CMCTN35、CMTCN41和CMCTN65 5个位点外，其余14个位点均能检测到表现杂合的地方品种，杂合度数值范围为0.06～0.97，平均杂合度为0.22。（2）3个生态地区中，东疆的地方品种扩增的多态性位点比例和等位基因数量最高，分别达89.47%和2.75个，GD指数和PIC值最高，分别为0.45和0.39;而来自南疆的地方品种杂合度最高。（3）来自东疆的地方品种中扩增出11个特异的等位基因，特异等位基因占20.0%;而来自南疆和北疆的地方品种则分别扩增出2个特异等位基因，比例为3.6%。（4）地方品种间的JC系数为0.20～0.96，平均值为0.51，‘黄旦子和‘哈密野瓜之间的JC值最小、‘塞里拜尔和‘阿合奇晚熟间的JC值最大，表明‘黄旦子和‘哈密野瓜遗传距离较远，而来自南疆的‘塞里拜尔和‘阿合奇晚熟具有相似的遗传背景。（5）UPGMA聚类分析中，除野生甜瓜‘哈密野瓜外，其余地方品种被聚为3个类群，类群一与另外2个类群遗传距离较远，类群一内有2个东疆的地方品种;类群二包含了大部分地方品种，这些地方品种分别来自3个生态地区，又被划分为5个亚群，除亚群一和亚群五内的地方品种均来自南疆外，其余3个亚群的地方品种来自2个生态地区;类群三内的3个地方品种分别来自3个生态地区。（6）PCA分析的第一、二和三维度分别代表了12.4%、9.4%和8.1%的可解释变异百分比，分析结果与聚类结果一致，大多数来自南疆地区的地方品种具有聚在一起的趨势，但与另外2个生态地区的地方品种间没有明显的界线;来自东疆的地方品种散布区域较大，呈现出较大的遗传变异。

结 论： 除野生甜瓜‘哈密野瓜外，新疆甜瓜地方品种应被划分为栽培甜瓜中var. inodorus 和 var. cantalupensis 2个变种，由于收集保存前这些地方品种都是开放授粉，因此这2种基因型的地方品种间没有显著的差异界限。新疆甜瓜地方品种资源具有较高的遗传变异和遗传多样性，表明我国西部是栽培甜瓜的初生或次生中心之一。此外，新疆不同生态地区的地方品种中检测到一定数量的特异等位基因，以上结果说明新疆甜瓜地方品种资源是甜瓜种质多样性维持和今后育种研究的重要基础。