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胃腺癌组织lncRNA HOTAIR、MEG3表达变化及其临床意义

2019-07-19张晓玲艾尼娃儿巴巴依王小云

山东医药 2019年19期
关键词:甲基化腺癌引物

张晓玲,艾尼娃儿·巴巴依,王小云

(1 无锡市中医医院,江苏无锡214100;2 新疆维吾尔自治区人民医院;3 无锡市第二人民医院)

每年全球大约新发胃癌患者100万例,死亡约80万例,是东亚、东欧以及中美洲和南美洲部分地区最常见的消化系统恶性肿瘤[1]。胃癌是起源于胃黏膜上皮的恶性肿瘤,其组织学类型主要有腺癌、鳞癌、鳞腺癌、未分化癌,以腺癌最为常见。手术切除是目前惟一有可能治愈胃癌的手段。胃癌早期采取根治性手术治疗效果较好,术后5年生存率可达到90%。但由于早期症状不明显,多数患者确诊时已属中晚期并伴有相邻脏器、淋巴结的广泛侵袭或远处转移,手术治疗效果不佳,术后5年生存率较低[2]。分子靶向治疗是近年新兴的一种治疗方法,是在细胞分子水平上针对已明确的致癌位点设计相应的治疗药物,从而精准杀死靶区内肿瘤细胞。因此,深入探索胃癌发生、发展的分子机制,对寻找肿瘤诊断标志物和治疗靶点具有重要意义。长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的RNA调控分子,可作为染色质修饰因子对靶基因进行表观遗传学修饰,从而在转录或转录后水平对靶基因进行表达调控。近年研究发现,lncRNA还参与肿瘤细胞增殖、侵袭、迁移等生物学过程[3]。HOX转录反义RNA(HOTAIR)是2007年由Howard Chang首次发现的lncRNA,长度约2.2 kb,定位于人染色体12q13.13,由哺乳动物HOXC基因簇转录而来[4]。有研究发现,肺癌、胃癌、乳腺癌等肿瘤组织lncRNA HOTAIR异常表达,且其表达变化与肿瘤恶性进展有关[5]。母系印记表达基因3(MEG3)是小鼠母系印记基因Gtl2的人类同系物,是只在母源等位基因上表达的印记基因,长度约35 kb,定位于人染色体14q32.3,由10个外显子组成。有研究发现,在多种肿瘤细胞中lncRNA MEG3低表达或表达缺失,恢复其表达则能抑制肿瘤细胞增殖并诱导其凋亡[6]。本研究观察了胃腺癌组织lncRNA HOTAIR、MEG3表达变化及其临床意义。现报告如下。

1 资料与方法

1.1 临床资料 选择2014年5月~2018年10月无锡市中医医院收治的初诊胃腺癌患者142例。所有患者经术后组织病理检查明确诊断。纳入标准:①符合胃腺癌诊断;②接受胃癌切除手术;③初诊,术前未接受任何抗肿瘤治疗;④临床病理资料完整。排除标准:①合并其他部位恶性肿瘤者;②合并严重肝、肾等重要脏器功能不全者;③有精神系统、自身免疫系统疾病者;④临床病理资料不完整者。其中,男75例、女67例,年龄18~70(59.1±8.7)岁;肿瘤直径:<5 cm 78例,≥5 cm 64例;肿瘤部位:贲门胃底部26例,胃体部24例,幽门胃窦部92例;组织分化程度:高中分化65例,低未分化77例;TNM分期:Ⅰ、Ⅱ期84例,Ⅲ、Ⅳ期58例;有淋巴结转移64例,无淋巴结转移78例。本研究经无锡市中医医院医学伦理委员会批准,患者或其家属知情同意。

1.2 lncRNA HOTAIR、MEG3表达检测 采用RT-qPCR法。将手术切除的胃腺癌组织及其配对的癌旁正常组织(距肿瘤组织边缘>5 cm)置于液氮中速冻,-80 ℃冰箱保存。取冻存的胃腺癌组织与癌旁正常组织约100 mg,室温下解冻,采用TRIzol法提取组织总RNA,经紫外分光光度计鉴定,提取的总RNA浓度和纯度合格。按逆转录试剂盒说明将总RNA逆转录为cDNA,以cDNA为模板,按2×SYBR Green PCR Master Mix说明进行PCR扩增。引物序列:lncRNA HOTAIR上游引物5′-CAGTGGGGAACTCTGACTCG-3′,下游引物5′-GTGCCTGGTGCTCTCTTACC-3′;lncRNA MEG3上游引物5′-CTGCCCATCTACACCTCACG-3′,下游引物5′-CTCTCCGCCGTCTGCGCTAGGGGCT-3′;GAPDH上游引物5′-GGGAGCCAAAAGGGTCAT-3′,下游引物5′-GAGTCCTTCCACGATACCAA-3′。PCR反应体系共20 μL:cDNA模板2 μL,SYBR Green PCR Master Mix 10 μL,上下游引物各0.4 μL,无核酸水7.2 μL;反应条件:95 ℃ 2 min,95 ℃ 15 s、60 ℃ 1 min共40个循环。以GAPDH内参,采用2-ΔΔCt法计算目的基因相对表达量。实验重复3次,取平均值。

2 结果

2.1 胃腺癌组织与癌旁正常组织lncRNA HOTAIR、MEG3表达比较 胃腺癌组织与癌旁正常组织lncRNA HOTAIR相对表达量分别为4.12±0.54、0.32±0.07,lncRNA MEG3相对表达量分别为0.45±0.13、1.17±0.24。胃腺癌组织lncRNA HOTAIR相对表达量明显高于癌旁正常组织,lncRNA MEG3相对表达量明显低于癌旁正常组织(P均<0.01)。

2.2 胃腺癌组织lncRNA HOTAIR表达与lncRNA MEG3表达的关系 Pearson相关分析显示,胃腺癌组织lncRNA HOTAIR相对表达量与lncRNA MEG3相对表达量呈负相关关系(r=-0.626,P<0.01)。

2.3 胃腺癌组织lncRNA HOTAIR、MEG3表达与患者临床病理特征的关系 胃腺癌组织lncRNA HOTAIR、MEG3相对表达量均与肿瘤组织分化程度、TNM分期有关(P均<0.05),与患者性别、年龄、肿瘤直径、肿瘤部位以及淋巴结转移无关(P均>0.05)。见表1。

表1 胃腺癌组织lncRNA HOTAIR、MEG3表达与患者临床病理特征的关系

3 讨论

胃癌是我国最常见的消化系统恶性肿瘤,每年新发病例数和死亡例数分别占全世界的42.6%、45.0%[7]。手术切除是目前惟一有可能治愈胃癌的手段。胃癌早期采取根治性手术治疗效果较好。但多数患者确诊时已属中晚期,手术治疗效果不佳。分子靶向治疗是近年兴起的一种治疗中晚期胃癌的重要手段,其治疗的关键在于靶点定位的准确性。因此,深入探索胃癌发生、发展的分子机制,从而定位分子治疗靶点,对提高治疗效果具有重要意义。

近年研究表明,非编码RNA(ncRNA)可通过影响染色质重塑、转录、转录后修饰和信号转导调节等影响肿瘤的发生、发展[8]。根据核苷酸长度,可将ncRNA分为小RNA(≤200 nt)和lncRNA(>200 nt)。由于lncRNA缺少开放阅读框架,其外显子少,表达水平低于蛋白质编码基因,但其表达具有较高的组织特异性。在功能上,lncRNA可作为分子支架、分子向导或染色质修饰因子等对靶基因表达进行调节,继而调控细胞周期、细胞分化、基因转录和翻译等。HOTAIR最初是在人成纤维细胞的HOX基因中被发现的,是一种具有反式作用的lncRNA,即可通过反式作用沉默染色质中基因表达。近年研究发现,lncRNA HOTAIR能与多梳抑制复合物2相互作用,导致H3K27三甲基化酶(PRC2复合体)功能丧失,从而抑制下游基因表达,继而促进肿瘤细胞浸润和迁移等恶性生物学行为;而在敲除lncRNA HOTAIR表达后,肿瘤细胞增殖、浸润和迁移能力均下降[9]。有研究还发现,胃肠道肿瘤组织lncRNA HOTAIR高表达者多伴有淋巴结转移和血行转移,总体生存时间较短,故lncRNA HOTAIR有可能作为评估患者预后的分子生物标志物[10]。本研究结果发现,胃腺癌组织lncRNA HOTAIR相对表达量明显高于癌旁正常组织,与以往研究[11,12]结果一致。表明lncRNA HOTAIR可能参与胃腺癌的发生、发展。进一步研究发现,胃腺癌组织lncRNA HOTAIR相对表达量与肿瘤组织分化程度、TNM分期有关,而与患者性别、年龄、肿瘤直径、肿瘤部位以及淋巴结转移无关。表明胃腺癌组织lncRNA HOTAIR表达变化与肿瘤恶性进展有关。目前认为,lncRNA HOTAIR可通过5′端结合EED、EZH形成具有H3K27三甲基化能力的PRC2复合体,在3′端形成具有H3K4去甲基化能力的LSD1/CoREST/REST复合体,进而对染色质进行甲基化和去甲基化修饰,影响下游靶基因表达,如MMPs、PTEN等,从而促进肿瘤细胞增殖、浸润和迁移[13]。

lncRNA MEG3最早是作为小鼠Gtl2的同源印记基因被发现的,在垂体和脑组织中表达较高,而在多种肿瘤组织中低表达。有研究表明,lncRNA MEG3表达降低与其编码基因的差异性甲基化区域异常甲基化有关。lncRNA MEG3表达降低后,肿瘤细胞的浸润和迁移能力增强,而通过质粒转染使lncRNA MEG3过表达后,肿瘤细胞的增殖能力明显受到抑制[14],这表明lncRNA MEG3在肿瘤侵袭和转移过程中具有重要作用。此外,lncRNA MEG3低表达者易出现淋巴结或血行转移,且与患者较短的生存时间有关[15]。本研究结果发现,胃腺癌组织lncRNA MEG3相对表达量明显低于癌旁正常组织,其原因可能与lncRNA MEG3的高甲基化有关。lncRNA MEG3定位于14号染色体的DLK1-MEG3印记基因区域,而DLK1-MEG3区域在父本等位基因上有两个关键的甲基化区域,均位于转录起始位点的上游[16],当该区域高甲基化时,lncRNA MEG3表达降低。进一步研究发现,胃腺癌组织lncRNA MEG3相对表达量与肿瘤组织分化程度、TNM分期有关,与患者性别、年龄、肿瘤直径、肿瘤部位以及淋巴结转移无关。表明lncRNA MEG3亦可参与胃腺癌的发生、发展,与以往文献[17]报道一致。lncRNA MEG3可通过RNA-蛋白质相互作用直接激活肿瘤抑制因子RB1,或通过激活CDKN4A间接激活RB1,进而抑制肿瘤的发生、发展[18]。此外,lncRNA MEG3还能通过磷酸化等途径抑制MDM2表达,当lncRNA MEG3表达降低时MDM2表达升高,其与p53蛋白结合,能够抑制p53蛋白的反式激活和转录功能,从而促进肿瘤进展[19]。本研究还发现,胃腺癌组织lncRNA HOTAIR相对表达量与lncRNA MEG3相对表达量呈负相关关系,其原因尚不完全清楚,可能是lncRNA HOTAIR表达升高后,与EZH2、EED、SUZ12等因子结合形成具有甲基化酶功能的复合物,对染色质进行表观遗传学修饰,能够抑制lncRNA MEG3表达[20]。

综上所述,胃腺癌组织lncRNA HOTAIR表达升高、lncRNA MEG3表达降低,二者均参与胃腺癌的发生、发展。lncRNA HOTAIR、MEG3有可能成为胃腺癌诊断的分子生物标志物和潜在的治疗靶点。

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