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玉米赤霉烯酮降解酶ZHD795编码基因克隆及降解活性研究

2018-12-06柴成梁常晓娇王楠希孙长坡

食品科学技术学报 2018年6期
关键词:毒素基因组测序

柴成梁, 常晓娇, 王楠希, 孙 晶, 孙长坡

(国家粮食和物质储备局科学研究院, 北京 100037)

玉米赤霉烯酮(zearalenone, ZEN)是世界上污染范围最广的一种镰刀菌毒素,具有强烈的雌性激素毒性及致癌性,严重威胁着人和动物的健康[1-3],其主要污染的粮食作物包括玉米、大麦、小麦、高粱和黑麦等[4-6]。

ZEN的化学名称为6-(10-羟基-6氧基-十一碳烯基)β-雷锁酸内酯。ZEN能引起人畜中毒的原因是其结构与雌性激素雌二醇(estradiol)的结构相似,能竞争结合动物细胞膜上的雌激素受体(estrogen receptor,ER)[7-10]。此生物活性主要是由ZEN的内酯键结构及4位碳原子的羟基引起[11],因此,破坏这些结构可视为对ZEN的有效脱毒[12]。粉红粘帚霉IFO 7063被发现可催化打开ZEN的内酯键[13],并且,负责此催化反应的内酯酶基因ZHD101被成功克隆[14]。目前,ZHD101蛋白的三维结构已经解析出,明确了ZHD101与ZEN分子的结合方式[15],为ZHD101在消减粮食中的ZEN污染提供了重要基础。然而,应用ZHD101水解酶降解粮食中的ZEN毒素,常涉及高温、高盐、强酸等条件,在如此苛刻的工业环境下,ZHD101酶活性极低甚至消失,无法消除粮油食品中的ZEN污染。因此,需要发掘新的ZEN降解微生物以及降解酶,明确此类降解酶的催化机理,提高酶的催化活性及在工业条件下的适应性,为有效消除粮食中的ZEN污染提供基础。本研究旨在开发新的ZEN高效降解酶,并试图理解此类降解酶的催化反应机理,为消减ZEN提供理论依据。

1 实验部分

1.1 实验材料

1.1.1样品采集

筛选ZEN降解菌的样品是采集于四川省的小麦麸皮,样品采集后置于4℃冰箱中保存、备用;筛选ZEN降解菌用的毒素管为含有10 μg ZEN毒素标准品的2 mL EP管。

1.1.2试剂及培养基

用于聚合酶链式反应的引物由金唯智生物科技有限公司合成;用于分子克隆的酶购买于Invitrogen公司;ZEN标准品购买于Sigma公司;培养基及其他生化试剂购自中科天锐(北京)科技有限公司。

无机盐培养基(MSM):MgSO4·7H2O 0.2 g,(NH4)2SO40.5 g,CaCl2·2H2O 0.066 g,Na2HPO4·12H2O 6.15 g,KH2PO41.52 g,加去离子水定容至1 L,调pH值至6.8。

LB培养基:酵母提取物5 g,胰蛋白胨10 g,NaCl 10 g,加去离子水定容至1 L,于121 ℃灭菌20 min,固体培养基加1.5%的琼脂粉。

马铃薯葡萄糖培养基:称取200 g马铃薯切成小块,加水煮沸20~30 min,用6层纱布过滤,加入葡萄糖,搅拌均匀,稍冷却后再补足水分至1000 mL,分装, 115 ℃灭菌20 min。

1.2 仪器与设备

高速离心机,美国贝克曼公司;e2695型高效液相色谱仪、2475型荧光检测器、xbridge C18型色谱柱,美国Waters公司; 6510型Q-TOF LC/MS,美国Agilent公司;亲和层析柱,中科天锐(北京)科技有限公司;核酸蛋白电泳仪及凝胶成像仪,美国Bio-Rad公司;PCR仪,美国ABI公司;恒温摇床,上海知楚仪器有限公司;紫外可见分光光度计,赛默飞世尔公司。

1.3 实验方法

1.3.1ZEN降解菌的筛选

称取小米麸皮样品5 g,加到离心管(50 mL)中,加入30 mL无菌水振荡混匀,使样品中的微生物充分悬浮于水中,放于离心管架上静置1 h;在超净工作台中吸取上清液100 μL于ZEN毒素管中,加入400 μL MSM培养基,30 ℃,220 r/min培养15 d后,吸取100 μL菌液于新的ZEN毒素管中,再培养15 d,如此富集培养3次。吸10 μL培养的菌液,涂布MSM平板,30 ℃培养;挑取平板上长出的单菌落于ZEN毒素管中培养15 d,用高效液相色谱(HPLC)检测菌株对ZEN的降解效果。

1.3.2ZEN降解菌株的基因组测序

采用第三代纳米孔单分子测序技术(测序平台: Pacific Biosciences RS II),对降解菌株的全基因序列信息进行测定,通过对测序数据结果的组装与注释,得到了该降解菌株的基因组编码序列信息。以ZHD101序列为模板,与测序得到的基因组编码序列进行序列比对。

1.3.3ZHD795重组表达质粒的构建

委托上海英潍捷基生物公司对ZHD795基因进行化学全合成。以合成的ZHD795基因为模板,进行PCR体外扩增。利用核酸琼脂糖凝胶电泳回收ZHD795基因,经限制性内切酶双酶切后连入PET30a载体,并转入大肠杆菌感受态细胞,筛选得到阳性重组子。

1.3.4ZHD795重组蛋白的诱导表达及纯化

扩大培养ZHD795重组子,经IPTG诱导,过夜表达ZHD795蛋白。高速离心收集菌体,加入重悬液后超声破碎,高速离心后去除菌体,上清液利用亲和层析纯化ZHD795蛋白,并用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进行ZHD795蛋白的表达纯化分析。

1.3.5ZEN降解酶活性测定

取纯化后的ZHD795蛋白,加入到ZEN毒素管中,放入37 ℃培养箱中,反应3 h后,终止反应,用高效液相色谱检测,根据ZEN色谱峰的变化来判断ZHD795蛋白对ZEN是否具有降解活性;同时,以水代替ZHD795蛋白作为反应对照。经由HPLC检测,对照样品与反应样品的ZEN色谱峰面积之差,即为由ZHD795蛋白催化反应掉的ZEN分子。

1.3.6ZHD795与ZHD101对ZEN降解活性的比较

将表达纯化的ZHD795与ZHD101降解酶稀释至相同浓度,按照已构建好的酶活反应体系进行催化降解反应;经由HPLC检测,比较2个蛋白酶对ZEN的降解活性高低。

2 结果与分析

2.1 ZEN降解菌株活性分析

从四川省采集的小麦麸皮样品,在以ZEN为碳源的无机盐培养基中富集培养,经HPLC检测,得到一株ZEN降解菌,如图1。

图1 筛选得到的ZEN降解菌株Fig.1 Screening of microorganism degrading ZEN

2.2 ZEN降解菌株基因组序列分析

通过对降解菌株的全基因组测序,组装得到了38.98 Mb的序列信息,注释得到12 555个编码基因序列;将此基因组序列信息与ZHD101进行比对,得到了同源性为62%的同源蛋白ZHD795。

2.3 ZHD795蛋白酶的表达纯化分析

ZHD795基因通过PCR方法扩增后,运用核酸琼脂糖凝胶电泳进行分离回收,结果如图2。

1泳道是目的基因ZHD;M为DNA Marker。图2 ZHD795基因琼脂糖凝胶电泳图Fig.2 Agarose gel electrophoresis of ZHD795 gene

将ZHD795基因转入大肠杆菌BL21进行ZHD795蛋白表达,运用亲和层析法纯化目的蛋白,并用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进行ZHD795蛋白的表达纯化分析,结果如图3。

1泳道是表达ZHD795蛋白的菌体超声破碎后的样品;2泳道是高速离心后的上清样品;3、4泳道是从Ni-NTA亲和柱上洗脱下来的样品;M是Protein Marker。图3 ZHD795蛋白聚丙烯酰胺凝胶电泳图Fig.3 SDS-PAGE of ZHD795 protein

2.4 ZHD795蛋白对ZEN的降解活性分析

取ZHD795蛋白液100 μL,加入到ZEN毒素管中作为反应组,以水代替ZHD795蛋白加入ZEN毒素管作为对照组,在37 ℃培养箱反应6 h后,终止反应。HPLC检测结果如图4。图4中对照组样品在保留时间为8.715 min处有强吸收峰,而反应组样品基本无ZEN目标峰检出。

在保留时间8.715 min处,无吸收峰的是反应组样品,有吸收峰的是对照组样品。图4 HPLC检测ZHD795对ZEN的降解活性Fig.4 Detection of degradation activity of ZHD795 to ZEN determined by HPLC

将ZHD795蛋白和ZHD101蛋白均稀释至质量浓度为2.0×10-3mg/mL,加入ZEN毒素管中反应30 min后终止反应。HPLC检测结果见图5。经吸收峰面积计算,在30 min内,ZHD795对ZEN的降解率为96%,而ZHD101对ZEN的降解率为37%;ZHD795对ZEN的降解酶活为ZHD101的2.5倍。

图5 ZHD795与ZHD101对ZEN降解活性比较Fig.5 Comparation of degradation activity of ZEN by ZHD795 and ZHD101

3 结 论

ZEN降解酶ZHD101能催化打开ZEN分子的内酯键,降解产物无毒性,是具有应用前景的ZEN降解酶。如何提高ZEN降解酶的催化活性及在工业条件下的适应性,是需要解决的问题。

本研究通过大量的筛选工作,在小麦麸皮样品中筛选得到一株能高效降解ZEN毒素的微生物菌株;通过第三代纳米孔单分子测序技术进行该菌株的全基因组测序,得到了该菌株的全基因组序列信息;通过与ZEN降解酶ZHD101进行序列比对,得到了一个同源性为62%的基因ZHD795,通过构建ZHD795基因原核表达体系,重组表达纯化得到ZHD795蛋白。构建ZHD795蛋白对ZEN的降解活性检测体系,检测结果表明ZHD795蛋白可降解ZEN毒素分子。通过ZHD795与ZHD101对ZEN的降解活性比较,明确了ZHD795对ZEN的降解酶活为ZHD101的2.5倍,从而得到了一个高效的ZEN降解酶。

ZHD101属于α/β水解酶家族,其活性中心包含α/β水解酶典型的催化三联体——酸- 碱- 亲核三联体,即Ser102- His242- Glu126,此催化三联体残基在一级序列中离得很远,但在三维结构中它们折叠到一起,发挥催化活性。通过一级序列比对发现,ZHD795也存在此催化三联体,下一步工作要解析ZHD795蛋白酶的三维结构,解析其催化反应机理,并与ZHD101进行结构比对,揭示造成2个降解酶对ZEN分子降解活性存在高低差异的原因,明确此类降解酶与ZEN的结合方式和催化特点,进一步通过分子改造提高此类降解酶对ZEN的催化活性及工业条件的适应性,为消减粮食及其副产物中的ZEN污染提供切实可行的技术支撑。

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