实时荧光聚合酶链式反应检测肉制品中的鸭源性成分
2018-11-20张秀平
摘 要:通过鸭的肌动蛋白β-actin保守基因设计可特异检测鸭肉成分的引物和探针,建立实时荧光聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术检测鸭肉的方法,并通过模拟肉样和市售样品检测方法的准确性和适用性。结果表明:该方法可以特异性检测出麻鸭和草鸭成分,而对猪、牛、羊、鸡等DNA均没有扩增,检测灵敏度可达到1 pg DNA;通过模拟肉样检测确定最低质量分数检测限为0.01%;市售样品的检测结果表明,该方法能很好地应用于市场,满足市场检测需求。
关键词:实时荧光聚合酶链式反应;鸭肉;灵敏度;检测限
Detection of Duck-Derived Ingredients in Meat Products by Real-time Fluorescent Polymerase Chain Reaction
ZHANG Xiuping1, MIAO Li2,*
(1.Identification Consulting Center of Henan Inspection and Quarantine, Zhengzhou 450003, China;
2.Henan Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Zhengzhou 450003, China)
Abstract: According to the conserved sequence of the duck β-actin gene, specific primers and probes were designed, and a real-time polymerase chain reaction (PCR) assay was developed for detecting duck-derived ingredients in meat products. Its accuracy and applicability were evaluated using model and commercial meat samples. Results showed that this method could specifically detect duck-derived ingredients and could not amplify porcine, bovine, ovine and chicken DNA. Its limit of detection was 1 pg of DNA. The minimum detectable level was 0.01% for model meat samples. The results obtained from detection of commercial meat samples showed that this method can meet the requirements for the requirements for the detection of duck-derived components in meat products.
Keywords: real-time fluorescent polymerase chain reaction; duck; sensitivity; detection limit
DOI:10.7506/rlyj1001-8123-201807007
中圖分类号:TS207.3 文献标志码:A 文章编号:1001-8123(2018)07-0037-05
引文格式:
食品的质量和安全问题日益成为社会关注的焦点,随着人们生活水平的提高,肉制品消费已经成为食品消费的重要组成[1-3],而目前利用掺杂掺假、以次充好等手段制造“假羊肉”、“假牛肉”事件屡屡出现[4]。检验检疫部门有必要加强对于肉及肉制品的检测,以确保国内消费者的权益得到保护。
在食品中动物源性成分鉴定方面,实时荧光聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术凭借其高度灵敏性和特异性,已逐步成为肉类成分鉴别的重要技术[5-7]。杨丽霞等[8]根据鸭线粒体基因序列的位点差异设计特异性引物,采用SYBR Green Ⅰ染料,通过溶解曲线分析,建立荧光定量PCR检测方法。史艳宇等[9]以鸭线粒体基因全序列为靶位点设计引物和探针,建立鸭源性成分检测方法,检测灵敏度可达0.1 μg/kg。
β-actin基因是构成细胞骨架的主要成分,具有基因序列高保守性,并且在不同组织间可以稳定表达[10-12]。当前研究中多选用线粒体基因,线粒体DNA由于丰度高且在不同组织部位的含量不一致,容易导致定量结果偏差较大,而β-actin基因作为单拷贝基因,具有基因序列高保守性,在肉源性成分定性及定量方面具有重要参考价值。
本研究通过从GenBank数据库中查找序列并设计鸭特异的PCR引物和探针,建立快速、准确的实时荧光PCR技术检测方法,为食品市场检测构建技术平台。
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
生鲜鸭肉、猪肉、牛肉、羊肉、鸡肉以及鸭肉制品
郑州市某农贸市场;蛋白酶K(20 mg/mL) 日本TaKaRa公司;Tris-饱和酚、氯仿-异戊醇(24∶1) 北京
索莱宝生物科技有限公司;组织裂解液(1 mol/L Tris-HCl、0.5 mol/L乙二胺四乙酸(elhylene diamine tetraacetic acid,EDTA)、10%十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS))、75%无水乙醇 自配;所有试剂均为分析纯。
1.2 仪器与设备
ABI 7500荧光定量PCR仪 美国应用生物系统公司;DT500电子天平 江苏常熟长青仪器厂;Hermle Z36HK高速冷冻离心机 德国哈默公司;NTS-4000AM恒温振荡水槽 上海斯信有限公司。
1.3 方法
1.3.1 DNA提取
采用酚-氯仿法提取样品的基因组DNA,具体步骤参考文献[13-14]进行,最后加入100 μL TE缓冲液溶解DNA,然后采用核酸定量测定仪测定提取肉样的DNA含量。
1.3.2 引物和探针设计
通过核酸比对软件DnamaN对GenBank中公布的多个物种的β-actin基因共17 个序列进行比对,其中包括5 个鸭源β-actin基因(GenBank中的登录号分别为EF667345.1、NM_001310421.1、GU564232.1、AY251275.1和DQ675572.1)、3 个鸡源β-actin基因(GenBank中的登录号分别为L08165.1、NM_205518.1和JF436880.1)、3 个猪源β-actin基因(GenBank中的登录号分别为DQ452569.1、DQ845171.1和U07786.1)、3 个羊源β-actin基因(GenBank中的登录号分别为NM_001009784.1、U39357.1和AF035422.1)、2 个牛源β-actin基因(GenBank中的登录号分别为AY141970.1和BT030480.1)和1 个鹅源β-actin基因(GenBank中的登录号为M26111.1),筛选出鸭β-actin基因的特异序列,并运用Primer 5.0软件(加拿大Premier开发公司)设计鸭源性成分的特异性引物和探针。引物和探针均由上海辉睿生物科技有限公司合成。引物和探针序列如表1所示。
1.3.3 荧光PCR反应程序
反应体系为25 μL:2×Premix Ex Taq(Probe qPCR)12.5 μL,上、下游引物各0.5 μL(反应体系终浓度0.2 μmol/L)、探针1 μL(反应体系终浓度
0.4 μmol/L)、DNA模板2 μL,其余用滅菌双蒸水补齐。反应循环参数为:95 ℃、5 min,95 ℃、10 s,58 ℃、45 s;40 个循环。
1.3.4 引物与探针的特异性验证
以从猪、牛、羊、马、鸡、驴、狐狸、狗、老鼠、鹌鹑中提取的DNA作为模板,进行实时荧光PCR反应,以验证所设计各引物和探针体系的特异性。
1.3.5 灵敏度实验
提取纯鸭肉粉DNA,调整DNA模板的初始质量浓度为100 ng/μL,用灭菌双蒸水分别进行10 倍倍比稀释,然后分别取2 μL各稀释度的稀释液为模板,同时设置阴性对照,进行实时荧光PCR,检测所设计引物、探针的灵敏度。
1.3.6 检测下限的确定
取总质量为10 g的肉粉,在鸡肉基质中添加质量分数为0.001%、0.01%、0.1%、1%、10%的鸭肉粉,用研磨机进行混样,得到梯度质量分数的鸭肉粉样品;称取100 mg样品进行DNA提取和荧光PCR扩增,根据实验结果确定检测下限。
1.3.7 市售样品的检测
为验证该方法在实际样品检测中的可应用性,购买市售的10 个生产厂家的鸭肉加工制品,运用本方法进行验证,同时运用SN/T 3731.5—2013《食品及饲料中常见禽类品种的鉴定方法 第5部分 鸭成分检测 PCR法》[15]中的方法进行验证,比较实验结果是否一致。
1.4 数据处理
所有结果采用SPSS 17.0软件进行统计学分析,利用Excel软件进行图表编辑,采用联合国粮农组织(United Nations Food and Agriculture Organization,FAO)方法规定统一的检测数据评价标准,即相对标准偏差(relative standard deviation,RSD)≤25%。
2 结果与分析
2.1 DNA提取与浓度测定
提取DNA的OD260 nm/OD280 nm值在1.7~2.0之间,完全符合实时荧光PCR的要求。
2.2 特异性测定结果
由图1可知,麻鸭和草鸭的DNA均有扩增,而猪、牛、羊、马、鸡、驴、狐狸、狗、老鼠、鹌鹑等其他物种的DNA均没有扩增,表明鸭的引物和探针特异性良好,可以用于荧光PCR检测。
2.3 灵敏度测定结果
分别利用麻鸭和草鸭的5 个质量浓度梯度的DNA稀释液(0.1、0.01、0.001、0.000 5、0.000 1 ng/?L)为模板,对建立的实时荧光PCR检测体系进行灵敏度实验和可重复性分析。
由表2~3可知:当样品质量浓度为0.000 1 ng/?L时,在20 次扩增反应中,麻鸭和草鸭阳性扩增次数分别为4 次和9 次,不满足检出率≥95%(即20 次扩增,阳性结果≥19 次);当样品质量浓度为0.000 5 ng/?L时,在20 次扩增反应中,所有鸭样本均得到20 次阳性结果,满足检出率≥95%,且RSD≤25%,故鸭样品可稳定检出的最低质量浓度均为0.000 5 ng/?L,即最低DNA质量浓度为1 pg DNA(模板量2 ?L)。
2.4 方法检测限
由图2和表4可知:当鸡肉粉中的鸭肉粉质量分数为0.01%时,3 次平行测定中均能够检出鸭源性成分,平均Ct值34.97;而当鸡肉粉中的鸭肉粉质量分数为0.001%时,平均Ct值38.18,数值较高,不利于判定,因此本方法检测鸡肉粉中的鸭肉粉质量分数检出限为0.01%。
2.5 市售样品的检测
由图3可知,6 份标识有鸭成分的加工品中能够检出鸭源性的为5 份,其中1 份未检出麻鸭和草鸭成分,与标准检测结果一致,表明市面上可能存在假冒的鸭肉产品。
3 讨 论
动物产品的质量安全涉及畜牧业的健康发展,其安全和质量越来越受到公众的关注,而传统的依靠感官和经验鉴别的手段已经不能满足市场需求,建立准确、快速、有效的动物源性成分检测方法是研究热点[16-18]。
基于PCR和实时荧光PCR方法检测饲料和肉制品中的动物源性成分已得到了较多关注和研究[19-20]。何玮玲等[21]运用动物细胞色素b(cytochrome b,cytb)基因的差异性位点,建立了猪、牛、羊和鸡的快速鉴别方法;陈冬等[22]运用牛线粒体12S rRNA基因设计通用引物,成功鉴别混合鲜牛肉及制品中的牛种来源,但是对于鸭源成分的检测研究不多。曲莉等[23]采用改良盐析法和柱层析法有效提取鸭肉的mtDNA,通过在GenBank中下载绿头鸭线粒体cytb基因序列进行比对,设计检测鸭源成分的引物,扩增产物大小为223 bp。SN/T 3731.5—2013以及杨滴等[24]的研究主要应用普通PCR技术对鸭源性成分进行检测,普通PCR技术费时费力,容易污染,逐步被荧光定量PCR方法取代[25-27]。因此,迫切需要建立新的鸭源性成分检测方法及标准,以满足实际检测的需要。
动物特异性基因具有物种特异性,有望成为肉类成分定性检测的良好靶点[28-30]。本研究根据羊、牛、猪、鸡、鹅5 种动物肌动蛋白β-actin基因序列的位点差异设计鸭特异性引物和探针,进行荧光定量PCR扩增检测。结果表明,所筛选的引物和探针只对鸭的DNA产生特异性扩增曲线,而与猪、牛、羊、马、鸡、驴、狐狸、狗、老鼠、鹌鹑10 种动物的DNA无扩增,特异性较好。通过对DNA梯度稀释液进行测定显示,该方法的重复性好,灵敏度可低至1 pg,避免了因提取过程中DNA含量过低而出现假阴性的现象。而在实际检测中,肉制品中鸭源成分的质量分数更能接近市场需求,因此,本研究通过制作模拟肉样,确定了最低检出质量分数,为我国肉制品市场的规范化和有序化管理提供了必要的技术支撑,对政府部门的监督管理工作具有重要意义。
4 结 论
本研究利用鸭的β-actin基因保守序列,建立用于检测鸭成分的实时荧光PCR方法。经测试,建立的检测方法特异性强、灵敏度高,方法检测限为1 pg DNA和质量分数0.01%,且具有良好的可重复性,能够满足日常检测的需求。对于市售样品的检测结果表明,5 份标注含鸭成分的实际样本中均能检出鸭成分,有1 份包装卤鸭肉产品未检出鸭成分,表明产品可能存在掺假现象。
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