HBx抑制RASSF1A表达参与肝细胞癌发生的可能机制
2018-06-28宋蕴薇仇雪梅陆森樊红
宋蕴薇,仇雪梅,陆森,樊红
(1. 东南大学医学院 遗传与发育生物学系,江苏 南京 210009; 2. 江苏省中医药研究院,江苏 南京210028; 3. 枣庄市妇幼保健院,山东 枣庄 277100; 4. 江苏省人民医院,江苏 南京 210029)
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是一种常见的恶性肿瘤,乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)慢性感染是我国HCC重要的致病因素之一[1]。HBx基因是HBV病毒基因组中最小的开放性阅读框,其蛋白作为多功能蛋白,广泛参与病毒的复制、宿主细胞的基因调控和表达等过程[2]。在HBx致肝癌发生的研究中发现,HBx可以通过上调DNA甲基化转移酶(DNA methyltransferases,DNMTs)的表达使抑癌基因的启动子区发生甲基化从而抑制其表达[3]。
RAS相关结构域家族1A(RASSF1A)是近年发现的一个重要抑癌基因。其启动子区DNA甲基化引起的基因失活,与多种癌症的发展有关[4-6]。HBx可能通过激活DNMT1的表达[7],造成RASSF1A启动子区DNA甲基化状态改变致其失活,参与肝癌的发生和发展。本研究分析了肝细胞永生化细胞系及HCC细胞系中HBx的表达水平与RASSF1A基因表达水平之间的相关性,进而分析HBx对RASSF1A表达抑制的可能机制以及RASSF1A基因的低表达是否受其启动子区甲基化的影响。
1 材料与方法
1.1 细胞系
正常肝细胞永生化细胞系L02、Chang liver,HCC癌旁细胞系QSG-7701,HCC细胞系SMMC-7721、BEL-7405、MHCC-97H、MHCC-97L、HepG2,稳定转染HBV病毒的HCC细胞系HepG2.2.15,稳定转染HBx基因的正常肝细胞永生化细胞系L02-X1#1、L02-X1#8及转染空白载体的对照细胞系L02-TR#19。
1.2 RT-PCR及qPCR
抽提细胞系的总RNA,以制备cDNA第一链,进行PCR扩增,所用引物如下:β-肌动蛋白:正向引物5′-AAAGACCTGTACGCCAACAC-3′,反向引物5′-GTCATACTCCTGCTTGCTGAT-3′;RASSF1A:正向引物5′-TCATCTGGGGCGTCGTG-3′,反向引物5′-CGTTCGTGTCCCGCTCC-3′;HBx:正向引物5′-GACGTCCTTTGTCTACGTCC-3′,反向引物5′-GTCATACTCCTGCTTGCTGAT-3′;DNMT1:正向引物5′-CCGAGTTGGTGATGGTGTGTAC-3′,反向引物5′-AGGTTGATGCTGCGTGGTAGC-3′。
1.3 转染细胞系
HCC癌旁细胞系QSG-7701、HCC细胞系SMMC-7721中转染HBx基因构建细胞模型QSG-7701-X1(转染了HBx全长基因表达载体)、QSG-7701-X2(转染了HBx截短序列表达载体)、转染空白载体的对照细胞系QSG-7701-空白对照、SMMC-7721-X1(转染了HBx全长基因表达载体)、SMMC-7721-X2(转染了HBx截短序列表达载体)及转染空白载体的对照细胞系SMMC-7721-空白对照;建立稳定转染DNMT1 siRNA载体的HCC细胞系SMMC-7721-DNMT1 siRNA,及其对照细胞系SMMC-7721-DNMT1。
1.4 DNA甲基转移酶抑制剂5-氮杂胞苷(5′-aza)处理细胞
将携有HBx基因的HCC细胞系MHCC-97H培养至汇合率30%时,分别以含有0、5、10、25及50 μmol·L-1的5′-aza RPMI 1640培养基继续培养48 h后,更换为正常的培养基培养24 h使细胞回复生长。
1.5 亚硫酸氢盐基因组测序(bisulfite genomic sequencing, BGS)
将用亚硫酸氢盐法修饰纯化过的DNA为模板,以半巢氏PCR方式扩增,引物分别为:MU379:5′-GTTTTGGTAGTTTAATGAGTTTAGGTTTTTT-3′; ML730:5′-ACCCTCTTCCTCTAACACAATAAAACTAACC-3′;ML561:5′-CCCCACAATCCCTACACCCAAAT-3′。其中MU379和ML730行第1轮PCR扩增,MU379和ML561行第2轮PCR扩增。扩增的PCR产物连接转化入感受态的DH5α大肠杆菌中,挑取单克隆菌落,培养后进行菌液PCR,取8个阳性克隆过夜培养后菌液送华大基因公司测序。
2 结 果
2.1 RASSF1A在HCC细胞系中表达水平分析
在正常肝细胞永生化细胞系L02、Chang liver,HCC癌旁细胞系QSG-7701,HCC细胞系SMMC-7721、BEL-7405、MHCC-97H、MHCC-97L、HepG2与HepG2.215中,应用RT-PCR与qPCR方法检测RASSF1A的表达水平。结果发现,与正常肝细胞永生化细胞系L02、Chang liver和HCC癌旁细胞系QSG-7701相比,RASSF1A在HCC细胞系SMMC-7721、BEL-7405、MHCC-97H、MHCC-97L、HepG2和HepG2.215中的表达水平明显降低,且在MHCC-97H、MHCC-97L和HepG2.215细胞中均可检测出HBx的表达(图1A、B)。
图1RASSF1A及HBx基因在HCC细胞系中的表达分析
A.qPCR方法检测RASSF1A在HCC细胞系中的表达水平; B.RT-PCR结果显示RASSF1A及HBx在HCC细胞系中的表达水平
Fig1ExpressionanalysisofRASSF1AandHBxinHCCcelllines
2.2 HBx基因表达载体的转染抑制了RASSF1A基因的表达
与转染对照空载体的L02-X1#19细胞系相比,RASSF1A在转染HBx基因全长表达载体细胞系L02-X1#8中表达水平下降(图2A)。在转染HBx基因全长的细胞系QSG-7701-X1、SMMC-7721-X1及转染HBx截短序列的细胞系QSG-7701-X2中,RASSF1A的表达水平亦存在下降趋势(图2B)。
图2HBx基因的导入影响了RASSF1A的表达水平
A.转染HBx表达载体的L02细胞系中RASSF1A的表达变化; B.转染HBx表达载体的QSG-7701和SMMC-7721细胞系中RASSF1A的表达变化
Fig2ThetransformationofHBxaffectedtheexpressionlevelofRASSF1A
2.3 DNA甲基转移酶抑制剂5′-aza使RASSF1A基因出现回复表达
为了检测HCC细胞中RASSF1A的表达水平是否受DNA甲基化的影响,本研究在表达HBx基因的HCC细胞系MHCC-97H中行浓度梯度式5′-aza处理。提取处理组总RNA,以RT-PCR检测RASSF1A表达水平,结果显示,MHCC-97H细胞系中,5′-aza的处理升高了RASSF1A的表达水平,且表现为RASSF1A的表达水平与5′-aza的处理剂量的依赖关系(图3A)。
图3干预DNA甲基化转移酶的表达与活性影响了RASSF1A的表达水平
A.RT-PCR检测MHCC-97H细胞系在5′-aza处理后RASSF1A的表达情况; B.在DNMT1敲低的SMMC-7721细胞系中分析RASSF1A的表达变化
Fig3InterferenceofDNAmethyltransferasesexpressionandactivitychangedtheexpressionlevelofRASSF1A
2.4 敲低DNMT1能够诱导RASSF1A的表达
由于DNA甲基转移酶抑制剂5′-aza主要作用于DNMT1,本研究在转染DNMT1 siRNA及其对照载体的HCC细胞系SMMC-7721中,应用RT-PCR检测了RASSF1A表达水平的变化,结果发现,在DNMT1表达抑制的细胞系中,RASSF1A的表达水平升高(图3B)。
2.5 DNMT1参与调控RASSF1A启动子区DNA甲基化状态
运用BGS及半巢氏PCR扩增DNMT1抑制前后细胞中RASSF1A启动子区,行克隆测序分析。利用DNA甲基化分析软件BiQAnalyzer分析所克隆序列中CpG位点甲基化变化情况,所检测区域中包含16个CpG位点(图4)。16个CpG位点总的测序结果分析显示,DNMT1的抑制没有明显改变RASSF1A启动子区的甲基化程度(P>0.05)。RASSF1A启动子区序列16个CpG位点经转录因子结合位点在线预测软件TFSEARCH预测其转录因子结合情况,发现第8、9个CpG位点和第14个CpG位点存在转录因子Sp1和USF结合的核苷酸序列(图4)。这些CpG位点在DNMT1抑制的细胞系SMMC-7721-DNMT siRNA中呈半甲基化状态,在其对照细胞系SMMC-7721-DNMT1对照组中呈完全甲基化状态。
图4BGS检测SMMC-7721-DNMT1siRNA细胞系及其的对照细胞中RASSF1A启动子区DNA甲基化状态变化
Fig4CpGsitesmethylationstatusoftheRASSF1ApromoterregionwasdetectedbyBGSinSMMC-7721celllinesthatknockdownDNMT1andthecontrolcells
3 讨 论
本研究发现,在HCC细胞系中,RASSF1A的表达水平明显低于正常肝细胞永生化细胞系及癌旁细胞系。该结果与前期文献中所报道的RASSF1A在HCC细胞系中的表达变化情况[8]一致,提示RASSF1A失活在肝癌的发生中可能发挥一定作用。此外,我们的研究还发现,在表达HBx的HCC细胞系MHCC-97H、MHCC-97L及HepG 2.215中,RASSF1A表达水平降低,暗示了RASSF1A的表达可能受HBx的影响。进一步研究发现,正常肝细胞永生化细胞系L02、HCC癌旁细胞系QSG-7701和HCC细胞系SMMC-7721中转染HBx基因使RASSF1A的表达水平也均有下降,提示HBx抑制了抑癌基因RASSF1A的表达,可能是HBx致HCC发生的分子机制之一。
在HCC中RASSF1A的启动子区DNA异常甲基化比率达到了80%以上[9],启动子区DNA的异常甲基化被认为是RASSF1A失活的主要机制。基于此,本研究发现转染了HBx之后RASSF1A的表达水平均有所下降。以往研究显示,HBx可以诱导DNMT1的表达[10],提示HBx影响RASSF1A的表达可能与DNMT1有关。我们在研究中发现,抑制DNMT1后RASSF1A的表达水平有所回复,提示RASSF1A的表达受DNMT1的调控。随后研究发现,DNMT1调节了RASSF1A启动子区DNA的甲基化状态,尤其改变了RASSF1A启动子区转录因子Sp1和USF结合位点的甲基化程度。Sp1是属于Sp/KLF家族的一类转录因子,由785个氨基酸构成,分子质量为100~110 kDa[11];它可与DNA直接结合并增强基因的转录,其异常表达与多种肿瘤的发生发展有关[12]。USF是一类HLH(Helix-Loop-Helix)结构的转录因子,可以通过二聚体的形式与DNA结合,增强基因的转录活性[13]。USF是一种在细胞质中广泛分布的转录因子,在黑色素瘤中USF表达增强[14]。而CpG位点的甲基化可抑制USF与DNA序列的结合,进而使下游基因表达下调[15]。启动子区结合位点的DNA甲基化有可能对以上两种转录因子和DNA的结合产生抑制,从而导致RASSF1A表达的下调。
综上所述,在肝细胞及HCC细胞系中,HBx可能通过上调DNMT1的表达,进而改变RASSF1A的启动子区DNA甲基化状态以调控其表达。DNMT1影响RASSF1A启动子区DNA甲基化程度主要集中在其启动子区转录因子Sp1和USF结合位点,其具体机制尚需进一步探究。除此之外,HBx亦可能通过miRNA影响RASSF1A的表达[16]。尽管如此,DNMT1可能还存在其他途径调节RASSF1A的表达,尚需进一步的研究。
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