油菜抗根肿病资源创新与利用的研究进展与展望
2018-01-20江莹芬战宗祥朴钟云张椿雨
江莹芬 战宗祥 朴钟云 张椿雨
油菜抗根肿病资源创新与利用的研究进展与展望
江莹芬1,2战宗祥2,3朴钟云3,*张椿雨2,*
1安徽省农业科学院作物科学研究所, 安徽合肥 230001;2华中农业大学植物科学技术学院, 湖北武汉 430070;3沈阳农业大学园艺学院, 辽宁沈阳 110866
根肿病是原生动物界根肿菌门根肿菌属芸薹根肿菌(Wor.)侵染引起, 并专性危害十字花科作物的一种传染性强的土传病害。近些年来, 加拿大和我国油菜的安全生产均受到根肿病的严重威胁。本文简要介绍了根肿菌的生物学特性、分类及主要防治途径, 重点总结了在根肿病抗性资源发掘、抗病基因遗传定位和克隆以及抗病育种等方面的进展, 分析了目前我国油菜根肿病综合防控过程中存在的主要问题, 并探讨与展望了相应的对策, 旨在为油菜抗根肿病遗传育种的高效顺利开展提供技术支持, 进而保障油菜产业的可持续发展。
油菜; 根肿病; 资源发掘; 抗性基因定位; 抗根肿病育种; 进展与展望
根肿病是由原生动物界根肿菌门根肿菌属芸薹根肿菌(Wor.)侵染引起, 并专性危害十字花科的一种传染性很强的土传病害, 每年引起十字花科作物产量降低10%~15%[1]。根肿菌在土壤中存活可达10年之久, 主要以流水、带病种苗运输和农事操作等方式传播[2]。芸薹属作物受根肿菌侵染后, 根部组织异常增生、肿大, 根的正常生理机能受损, 营养和水分吸收受阻, 小苗枯死或成株期植株生长迟缓、矮小, 从而产量下降、品质降低, 严重时整株死亡, 造成绝收[3]。
从全球看, 加拿大自2003年在油菜中发现根肿病以来, 发病速度极快, 目前已成为加拿大油菜生产的主要病害[4]。日本、韩国十字花科蔬菜受根肿病危害较重。在我国, 最初是根肿病危害十字花科蔬菜, 近几年根肿病在油菜中迅速扩散, 已经蔓延到四川、云南、贵州、湖北、安徽等油菜主产区, 据不完全统计, 目前我国油菜根肿病发病面积在67万公顷以上, 并且随着机械化程度的不断提高, 发病区域还在迅速扩大。油菜是我国最重要的油料作物, 更是旅游观光农业的重要组成部分, 常年种植面积在670万公顷左右, 根肿病已经成为威胁油菜产业安全的头号杀手。
本文总结了根肿菌的生物学特性、根肿菌分类、根肿病防治途径、油菜抗根肿病资源创新与遗传育种等方面研究进展, 深入分析了油菜根肿病综合防控过程中存在的主要问题, 并探讨与展望了其相应的对策, 旨在有效防控根肿病, 保障油菜产业健康可持续发展。
1 根肿菌生物学特性
1.1 根肿菌的生活史
芸薹属根肿菌属原生动物界、根肿菌门、根肿菌纲、根肿菌目、根肿菌属[5]。目前认为其生活史包括两个世代(休眠孢子、原生质体)和三个阶段(土壤中存活阶段、根毛侵染阶段、皮层侵染阶段)[2]。当被根肿菌侵染形成的根肿裂解腐烂以后, 大量的厚壁休眠孢子释放进入土壤, 并能够在土壤中存活达10年以上。初侵染阶段也称为根毛侵染阶段, 休眠孢子受十字花科根际分泌物诱导萌发后形成具双鞭毛的初生游动孢子, 游动孢子靠近根毛完成初侵染过程, 初侵染产生次生游动孢子, 成熟后再次释放到土壤中[6]。再侵染阶段也称为皮层侵染阶段, 次生游动孢子直接侵染根和下胚轴的皮层和中柱, 在植物真皮组织细胞内形成次生原生质团, 从而产生根肿组织[7]。
1.2 影响根肿菌侵染的主要因素
温度是影响根肿菌初侵染阶段的关键因子, 19~25℃最有利于根肿菌初侵染, 低温或高于26℃均不利于根肿病的发生[8]。根肿菌偏爱pH小于6.5的酸性土壤环境, 高浓度的氢离子有利于根肿菌的侵染[9]。土壤水分也是影响根肿病发生的主要因素, 当土壤含水量为50%~90%时, 病害的发展非常快[10], 因此根肿病一般容易发生在低洼不易排水、土壤结构比较差的田块中。另外, 高浓度的钙能够减少根部细胞膜的渗透性进而影响根肿菌的生长发育与繁殖, 大量的钙离子添加还可以升高pH值进而抑制根肿菌的侵染发病[11]。
2 根肿菌的分类
根肿菌是专性寄生菌, 存在生理小种分化[12]。鉴定根肿菌致病力分化的鉴别系统有4套, 即Williams系统[13]、欧洲根肿菌鉴别系统(European Clubroot Differential, ECD)[14]、Somé系统[15]和Kuginuki系统[16]。目前Williams和ECD两套根肿病生理小种鉴别系统被视为国际通用的鉴别系统[17]。其中Williams系统因其鉴别寄主少, 使用方便, 应用得最为广泛。Williams系统采用2个结球甘蓝(‘Jersey Queen’、‘Badger Shipper’) 和2个芜菁甘蓝品种( ‘Laurentian’、‘Wilhelmsburger’) 作为鉴别寄主, 理论上可以鉴别出16个生理小种。我国学者采用该系统对我国分布的根肿菌鉴定发现, 存在2号、4号、5号、7号、8号、10号、11号、13号等生理小种, 其中以4号生理小种为主[18-20]。应用Williams系统时存在一定局限性, 因根肿菌存在几个生理小种混生的情况, 直接根据鉴别寄主对病菌的抗感反应结果会将混生菌中的优势种群错判为生理小种[21], 如李茜等[22]从原始种群为4号小种进行单孢分离, 分离出2号、4号、8号、11号4个小种[22]; 另外, 培养条件、孢子成熟水平都会影响接种结果。
ECD系统是欧洲目前比较通用的根肿菌鉴别系统, 包括、和三组材料的15个鉴别寄主。因其命名复杂, 鉴定工作量大, 再加上鉴别寄主冬性强, 很难得到种子, 在我国鲜有应用。
3 根肿病的主要防治途径
3.1 农业防治方法
为有效防控根肿病, 学者们开展了一系列研究, 并取得一定效果。第一, 通过大豆、苦荞与油菜轮作可在一定程度上降低土壤中根肿菌休眠孢子浓度, 但由于休眠孢子在土壤中可存活10余年之久, 轮作在应用上受到了较大的限制; 第二, 通过施用生石灰升高土壤pH值也有一定效果, 但成本较高且易造成土壤板结, 另有研究表明, 在温度和湿度适宜发病且土壤中孢子浓度高的情况下, 撒石灰不起作用[23]; 第三, 施硼在蔬菜作物中也被认为能够降低根肿病发病程度, 其在根毛初侵染阶段能够抑制原生质团向孢子囊发展[10]; 此外, 在重病田块种植诱饵作物[24]; 在长江流域冬油菜区适当延迟播期[25]、净土育苗移栽、跨区作业农机具消毒等均对根肿病防治有一定效果。
3.2 生物、化学农药防治方法
使用化学农药(氟啶胺、氰霜唑、磺菌胺等)以及生物农药(枯草芽孢杆菌、粉红粘帚霉)在防控根肿病方面有一定效果(结合种子包衣技术)[26-30], 同时还有利用二硫代氨基甲基盐、威百亩水溶剂等熏剂进行土壤熏蒸等[31], 但是成本均较高, 在产值比较高的高山反季节蔬菜生产中, 结合育苗移栽等措施具有较好优势, 但对油菜根肿病而言, 生物防治和化学防治前景有限。
上述方法虽有一定防控效果, 但不能从根本上解决油菜根肿病的危害。实践证明, 种植抗性品种是防治根肿病最根本、最经济的途径。
4 抗根肿病资源发掘、抗性遗传研究进展
4.1 根肿病抗性资源的发掘
根肿菌存在生理小种分化, 相对应的其抗性基因也表现为生理小种特异性。为了开展抗根肿病育种, 对十字花科芸薹属白菜、甘蓝、油菜及其近缘种拟南芥、萝卜等大量筛选后获得了一些宝贵的抗病资源, 其中欧洲饲用芜菁(ssp., AA, 2= 20)中含有的抗病位点最多, 在抗病育种应用中也最为广泛。Yoshikawa[32]对1062份芸薹属种质资源进行筛选, 只在芜菁中发现了高抗的43份抗病品系, 如‘Siloga’、‘Gelria’、‘Milan White’、‘Debra’等。Peng等[33]也发现高抗或免疫的资源主要存在于中, 在芸薹属植物955份资源中只鉴定出4份高抗油菜材料。此外, 欧洲根肿病鉴别寄主系统(ECD)中的ECD01-04 (芜菁)对根肿病具有广泛抗性, ECD06、ECD08、ECD09和ECD10 (以上寄主均为油菜)也对部分根肿菌生理小种表现出抗性。刘勇等[34]对四川主栽的38个油菜品种和德国引进的8个品种的根肿病抗性筛选发现, 主栽油菜品种中无抗根肿病品种, 引进品种Lisek和Oase病情指数均小于30, 为高抗品种, 但没有筛选到免疫抗性的品种。Manzanares-Dauleux等[35]和Werner等[36]对几个甘蓝型油菜进行全基因组关联分析, 发现在甘蓝型油菜中有20多个抗性QTL。由于甘蓝型油菜是复合种, 其抗性基因被认为主要来源于A基因组。
相对于芸薹属A基因组抗源丰富, C基因组则抗源极少。Crisp等[37]对1000余份甘蓝(, CC, 2= 18)材料进行抗性筛选, 在羽衣甘蓝、卷心菜、花菜中只鉴定到一些低感的品系。Manzanares- Dauleux等[38]在抗性筛选中也发现, 只有一些羽衣甘蓝对根肿病有较高水平的抗性, 所有的卷心菜和花椰菜都表现出感病。司军等[39]对19份结球甘蓝(var.L., CC, 2= 18)材料的抗性鉴定中, 有3份材料对根肿病表现抗病, 认为其可以作为抗根肿病育种的供体材料。
另外, 从十字花科其他属中也筛选到根肿病抗源。如Kamei等[40]发现萝卜(, 2= 18, RR) 中有对根肿病免疫抗性的位点。Chen等[41]通过萝卜(L., 2= 18, RR)与白花芥蓝(Bailey, CC, 2= 18)杂交, 得到的萝卜-芥蓝异源四倍体(, RRCC 2= 36对根肿病部分生理小种也具有免疫抗性, 可作为改良油菜根肿病抗性的桥梁品系。拟南芥生态型Tsu-0和Ze-0有抗根肿病的单个显性位点[42]。
4.2 抗根肿病基因的遗传定位与克隆
迄今为止, 国内外发现的抗病基因主要存在于油菜的近缘种芜菁中, 主要为质量性状位点, 而在芸薹属的另一个基本种甘蓝中, 目前发现的抗病位点都是多基因控制的数量性状位点或不完全显性[43-46]。另外, 在十字花科萝卜中也发现了抗病位点, 已有的基因定位结果表明该抗病位点分布在LG1染色体上, 表现为显性抗病[40]。
目前在欧洲饲用芜菁中至少定位了11个主效基因或QTL。分别定位于A1、A2、A3、A6和A8染色体[47-61]。如‘Siloga’中含有1个主效不完全显性抗病基因(, 位于A8染色体)、1个修饰基因(, 位于A1染色体), 和1个微效QTL (, 位于A6染色体)[48-51]。对根肿菌的抗性表现不完全显性, 只有纯合时才对致病性较弱的菌株有抗性, 但是当C和C同时存在时则对致病性较强的菌株表现出抗性,2单独存在时不对任何生理小种起抗性作用, 因此认为可能在正常的抗病途径中起主要作用, 而则修饰的表达。Hirai等[52]研究指出芜菁品种‘Milan White’含有1个主效基因(位于A3染色体)。Matsumoto等[47]在饲用芜菁ECD02的A3染色体上定位了1个抗病位点; Sakamoto等[54]在‘Debra’中定位了2个抗病位点和, 分别定位于A3和A2染色体; Piao等[53]在一个抗病结球白菜‘Shinki’的A3染色体上定位了1个抗病位点。Chen等[55]利用抗病芜菁ECD04和感病大白菜杂交的BC1F1群体接种不同的生理小种并通过QTL定位, 在A1染色体上定位了抗病位点, 在A3染色体上定位了3个抗病位点、和, 在A8染色体上与相同区域内定位了抗病位点。战宗祥等[62]通过将ECD04与甘蓝型油菜杂交后将抗病位点成功导入甘蓝型油菜, 遗传分析结果表明该位点表现为显性遗传模式, 因此认为该位点与A8染色体上的(表现为不完全显性遗传)可能互为不同或复等位位点。Chu等[56]在小白菜(pak choy) A3染色体上定位了一个主效抗病位点, 并指出可能是不同于和的新位点; Yu等[57]通过genotyping-by- sequencing (GBS)技术, 扫描到对6个生理小种具不同抗性的3个QTL, 其中2个QTL抗新的病原菌5X, 在A3染色体定位的位点, 抗2号、3号、5号、6号、8号生理小种。Pang等[63]在A3染色体位点的上游定位了一个单基因显性抗病位点, 其抗性表现不同于和。由于A3染色体上定位到的位点众多, 并与一些共同标记相连锁, 表明这些基因之间可能是互为同一个等位或复等位基因, 或至少是紧密连锁。由于各实验室所用的抗病材料和病原菌不尽相同, 且这些抗病基因中的绝大多数都还没有被分离克隆, 因此抗病基因间的比较分析工作还有待进一步深入。
是第一个被鉴定出来的抗性位点, 最初来源于ECD02[64]。Hatakeyama等[65]于2017年克隆了, 并且通过序列比较和功能分析表明,和实际上是同一个基因。另一个被克隆的抗病基因是,包含2个抗病位点, 其中是主效位点,是微效位点, 来源于芜菁‘Siloga’[51]。这2个基因均编码具有TIR-NBS-LRR结构的蛋白, 而这种结构的蛋白被认为在植物抗病防御反应中可专一性识别病原物释放的效应子(effector), 并解除其对宿主免疫反应的抑制作用, 从而确保植物能够有效地响应病原菌的入侵并及时启动免疫反应[66], 但其具体到根肿病的抗病机制还有待进一步研究, 目前有关抗根肿病基因介导的抗病机制研究还比较初步, 一般都只从组学的角度进行了分析[67-70]。
5 油菜抗根肿病育种研究进展
种间杂交是转移有利性状的有效途径, 因此, 通过定向转育方法, 将根肿病抗性基因导入油菜是选育抗病品种的最有效途径。
大白菜抗根肿病育种开始的比较早, 相对比较成熟。自1974年起, 日本国立蔬菜花卉研究中心以芜菁的抗病资源如‘Siloga’、‘Gelria’、‘Milan White’和‘Debra’为抗源, 通过连续回交选择方法把抗病基因导入到大白菜中[32]。此后, 自二十世纪八十年代起日本和韩国种苗企业相继培育出了大白菜抗病品种[71]。因油菜根肿病是近些年才发展起来的病害, 抗性品种选育起步较晚, 随着抗性资源的发掘与抗病基因定位工作的不断深入, 油菜的抗病育种也取得了较好进展。如Diederichsen等[72-73]利用ECD04和ECD15, 通过人工种间杂交, 然后染色体加倍, 创制出新型抗根肿病甘蓝型油菜资源。此后, 相继选育出油菜抗病品种‘Mendel’和‘Tosca’。
国内, 华中农业大学战宗祥等以ECD04为供体, 结合回交及分子标记辅助选择, 将ECD04中抗4号生理小种的位点定向地转育到油菜常规品种‘华双5号’中, 由此培育出了我国首个甘蓝型油菜抗根肿病常规新品种‘华双5R’(原始命名为ZHE- 226)[62]; 李倩等(未发表)通过将含的大白菜与国审油菜品种‘华油杂62’的恢复系杂交, 经过回交、前景和背景筛选等过程最终培育出了我国首个抗根肿病油菜新杂交种‘华油杂62R’。田间抗病性鉴定结果表明, 这2个品种对四川、湖北、安徽等地的根肿菌均表现出免疫抗性。此外, Zhan等[74]通过远缘杂交已经成功地将萝卜-芥蓝异源四倍体(RRCC)中的根肿病抗性转育到油菜中。
以上抗病新品种或品系的获得为国内外有效抵御油菜根肿病, 保障油菜安全生产提供了重要的品种保障。
6 油菜根肿病综合防控过程中存在的主要问题与对策
6.1 目前存在的主要问题
我国在油菜抗根肿病资源创新与利用方面虽然取得了初步成效, 但与目前生产上存在的问题和重大需求相比, 油菜根肿病防控形势依然十分严峻, 产业发展仍面临许多亟待解决的重大科学与技术难题。
(1) 抗病资源的种类和育成的抗病品种数量和类型还很有限。目前的根肿病抗源主要来自芜菁, 抗病位点的种类非常有限, 且这些位点均为由少数基因控制的质量性状, 因此必须加大抗病资源的创新。另一方面, 抗病育种方法还有待进一步完善, 已育成抗病品种数量还不能满足不同生态区要求。
(2) 长期种植单一抗病品种容易导致抗性丧失。在白菜和油菜中均有抗性品种抗性丧失的报道[75-76]。根肿病质量抗性基因具生理小种专化性, 而根肿菌大多混生, 繁殖力强且变异快, 随着某一抗病品种的长期种植, 土壤中优势生理小种种群数量降低, 而混生的其他生理小种或变异的生理小种则逐渐成为新的优势种群, 从而造成抗病品种抗病性丧失, 给抗病育种带来了极大挑战。
(3) 抗病基因编码蛋白介导的抗病机制尚不清楚。从全球来看, 从事根肿病抗病机制研究科学家数量非常少, 截止目前尚无抗病基因所介导的抗病机制方面的报道, 这大大限制了通过分子手段创新油菜抗根肿病资源的能力。
(4) 根肿菌分类不清。根肿菌是活体专性寄生菌, 不能离体培养, 不同生理小种经常混生且变异速度快, 对不同生理小种的分类工作仍然处于较低水平, 这不利于有针对性地运用含不同抗病基因的油菜品种有效抵抗油菜根肿病工作的有序开展。
6.2 相应的主要对策
为了更好地推进油菜抗根肿病育种进程, 提高油菜根肿病综合防控水平, 针对上述面临的主要问题, 结合在生产和科研实践中所获得的经验以及对这些主要问题的思考, 提出以下主要对策和建议。
(1) 抗根肿病资源发掘。虽然发现了一些由多基因控制的耐病材料, 但当土壤中病菌浓度较高时这些材料一样表现出高感症状, 说明解决根肿病抗性的出路还在于筛选由质量基因控制的抗性。因此通过继续收集油菜及其近缘种资源、借助各类功能丧失型及功能获得型突变体库, 鉴定出更多质量基因控制的抗性资源并克隆相应抗性基因。鉴于不同抗性基因对不同生理小种的抗性有所差别, 重点筛选出对各种根肿病不同生理小种抗性均佳的抗病基因组合, 为有针对性开展抗性育种提供重要的支撑。
(2) 避病种质资源发掘。我国长江流域冬油菜区一般在9月底10月初播种, 而此时气温正好在25℃左右, 非常适合根肿菌侵染。因此在长江流域油菜产区筛选耐迟播资源, 培育适合在10月20日至11月初播种的耐迟播、耐密植品种以实现合理避病, 这是油菜根肿病综合防控措施中一个重要新生长点。
(3) 根肿菌的分类及分化研究。利用分离的抗病基因, 研究不同抗病基因、不同抗病基因组合与不同生理小种根肿菌的互作关系, 建立根肿菌生理小种鉴别新系统, 对不同根肿菌进行分类, 在建立根肿菌单孢分离技术体系基础上进行全基因组重测序, 鉴定出不同生理小种的差异位点, 为生理小种的分子分类提供重要依据。掌握抗病品种对不同生理小种的消长规律及同一生理小种的变异规律, 为不同病区有针对性地选择种植油菜抗病品种、以及延长品种抗病性提供科学依据。
(4) 抗病基因编码蛋白所介导的抗病机制研究。利用对不同生理小种具不同抗性反应的多种抗病基因类型, 利用蛋白组、转录组等组学技术, 深入研究其抗病代谢途径, 通过比较抗病机制差异与不同生理小种基因组序列差异间的关系, 深入解析不同抗病基因特异抗性产生的内在分子机制, 为通过基因工程手段培育抗根肿病油菜新品种提供理论依据。
(5) 根肿菌专性寄生十字花科植物的致病机制研究。根肿菌专性寄生十字花科植物, 因此探明根肿菌对不同植物致病差异产生的机制, 为利用其他植物的基因资源来改良油菜的抗根肿病特性具有重要意义。
(6) 油菜抗根肿病分子育种平台的创建及抗病品种培育。在油菜抗根肿病资源创新和深入了解其抗病机制的基础上, 建立成熟的抗病分子设计育种平台。根据不同抗病基因序列, 开发基因特异性分子标记, 建立分子标记辅助选择技术体系, 创建含不同抗性基因的油菜轮回选择群体, 结合小孢子培养技术, 通过改良获得一批含不同抗病基因(组合)的优良不育系、恢复系, 为配制优良抗病杂交新品种奠定重要基础; 根据抗病机制研究的最新结论, 利用基因工程技术, 创建具持久、广谱抗性的油菜新资源和新品种。
综上所述, 抗病育种在根肿病综合防治中占有重要地位, 但目前国内外在这方面的研究尚处于初步阶段。相比于加拿大, 我国在研究方向方面比较单一, 集中在资源发掘和利用方面, 缺乏长效的分工、组织协调机制, 相信随着对根肿病防控研究方向及其相互关系理解的不断深入, 在不久的将来定会建立一支分工明确、协作积极的创新团队, 为我国油菜根肿病综合防治及产业的可持续发展提供重要保障。
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Progresses and Prospects of Germplasms Innovation for Clubroot Resistance and Genetic Improvement in
JIANG Ying-Fen1,2, ZHAN Zong-Xiang2,3, PIAO Zhong-Yun3,*, and ZHANG Chun-Yu2,*
1Institute of Crop Science, Anhui Academy of Agricultural Science, Hefei 230001, Anhui, China;2College of Plant Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, Hubei, China;3College of Horticulture, Shenyang Agricultural University, Shenyang 110866, Liaoning, China
Clubroot is one of the most serious soil-borne diseases caused byWoronin in oilseed rape (). Being a major oil crop, the safe production for oilseed rape both in Canada and China is now facing severe threat from clubroot disease in recent years. In this review, after briefly introducing the biological features of this pathogen, the root symptoms after infection, pathogen-type differentiation, strategies usually employed in disease controlling process, and a strategy based on genetic breeding are highlighted in clubroot disease comprehensive control for oilseed rape; furthermore, for sustainable development of oilseed rape industry by avoiding damages caused by clubroot disease, major problems faced are pointed out and some prospects are addressed accordingly.
; clubroot disease; germplasm innovation; resistant gene mapping; resistant breeding; progress and prospect
2018-05-18;
2018-08-20;
2018-09-05.
10.3724/SP.J.1006.2018.01592
通信作者(Corresponding authors): 张椿雨, E-mail: zhchy@mail.hzau.edu.cn; 朴钟云, E-mail: zypiao@syau.edu.cn
E-mail: xiaoyingmm@126.com
本研究由国家重点研发计划项目(2018YFD0100501)和国家现代农业产业技术体系建设专项(nycytx00503)资助。
This study was supported by National Key Research and Development Program of China (2018YFD0100501) and the China Agriculture Research System (nycytx00503).
URL: http://kns.cnki.net/kcms/detail/11.1809.S.20180903.1308.006.html