ESR基因多态性与湖羊产羔性能的关系
2017-09-28郭海燕金银李拥军张昊程国虎
郭海燕+金银+李拥军+张昊+程国虎
doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2017.13.035[HT9.]
摘要:利用PCR-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术及基因测序技术对湖羊进行了ESR基因的多态性检测及其与湖羊产羔数的统计分析。测序结果表明,等位基因G与C相比发生了1处碱基突变(G363C)。ESR基因在湖羊中存在多态性(CC、CG和GG);湖羊中C等位基因的频率为0.743,G等位基因的频率为0.257。CC、CG、GG基因型频率分别为0.564、0.357、0.079。湖羊CG、GG、CC基因型的平均产羔数分别为1.98、1.80、1.96只。数据分析结果表明,ESR基因的多态性对湖羊产羔数的影响差异不显著(P≥0.05)。
关键词:湖羊;ESR基因;产羔数
中图分类号: S826.3文献标志码: A[HK]
文章编号:1002-1302(2017)13-0126-03[HS)][HT9.SS]
[HJ1.4mm]
收稿日期:2017-01-03
基金项目:江苏省农业科技自主创新资金[编号:CX(15)1007]。
作者简介:郭海燕(1992—),女,河南洛阳人,硕士研究生,研究方向为遗传育种与繁殖。E-mail:1937750042@qq.com。
通信作者:李拥军,博士,教授,研究方向为养羊生产与羊的繁育。Tel:(0514)87996481;E-mail:liyj@yzu.edu.cn。[HJ]
[ZK)]
湖羊是我国著名的地方多胎品种羊,也是我国一级保护地方畜禽品种,主要分布在江、浙一带。湖羊1年2胎,每胎多羔,其产羔率能达到200%~250%[1]。绵羊的繁殖力是影响其经济效益的重要指标之一,而湖羊又是我国著名的多胎品种,因此研究其多胎的分子机制对于湖羊多胎资源的开发利用、新品种的培育以及生产实践都有着重要意义。
湖羊高产的繁殖性能是得到世界公认的,因此探究并确定影响湖羊多胎的主效基因一直是国内外的研究热点。绵羊的多胎性状是由多种基因控制的,且不同品种间控制多胎的主效基因也是不同的。有研究发现,品种之间繁殖性能的差异主要取決于产仔母羊的基因,与后代个体基因无太大关系,且推断湖羊具有多胎的主基因,并呈显性遗传[2-3]。很多学者已证实了[WTBX][STBX]BMPR-IB[WTBZ][STBZ]可能是湖羊多胎性的主效基因,而[WTBX][STBX]BMP15、GDF9[WTBZ][STBZ]等基因可能也参与并影响了湖羊的多胎机制[4-6]。有研究证明湖羊存在FecB基因,且湖羊全部为FecB基因纯合携带者[7-8]。
雌激素受体(estrogen receptor,简称ESR)是核受体超家族的一员,是一种配体依赖性的转录因子[9]。ESR能够转录调控蛋白质,参与雌性动物性腺基因的表达与调控。ESR结合配体之后与雌激素应答元件相互作用,可以改变受雌激素调控基因的转录,从而影响胚胎发育和系统分化[10]。
许多研究都表明,ESR基因在动物繁殖过程中发挥着重要作用,而且已经确定ESR基因是影响猪产仔数的主效基因[11-17]。研究发现,将小鼠的ESR基因敲除后,小鼠不能排卵,这也证明了ESR基因与繁殖性能的重要联系[18]。张小雪等对绵羊的ESR基因进行了详细的生物信息学分析,发现绵羊的ESR基因主要位于细胞核中,并且参与机体的转录调控过程[19]。有研究认为ESR可能是控制湖羊和小尾寒羊多胎性能的主效基因或与之存在紧密的连锁[9,20]。贾立华等对小尾寒羊的ESR基因外显子4序列进行克隆与序列分析,发现此段序列有很强的保守性[21-22]。冯涛等也得出了相同结论,发现哺乳动物ESR基因外显子1、4序列的保守性较强,因此此段区域可能不是影响山羊高繁殖力的功能结构域[23]。还有研究发现,ESR基因第5外显子Pvu Ⅱ多态性与动物的繁殖性能密切相关,但该位点在不同群体中的效应不一致[24-27]。此外,ESR基因对胚胎发育及黄体期的影响及作用也一直是国内外研究热点[28-30]。本试验通过研究湖羊ESR基因的多态性及其与产羔数的关系,旨在为筛选湖羊多胎性候选基因提供理论依据。
1材料与方法
1.1试验动物及血样采集
选取具有第1胎和第2胎生产记录的湖羊,共342只。采集湖羊颈静脉血液约3 mL,并记录耳标号,羊全部来自江苏省太仓金仓湖羊场。采血用一次性采血盛血器,并且提前在采血管中加入ACD抗凝剂(主要含枸椽酸、枸椽酸三钠、葡萄糖)。血样用冰盒带回实验室后于4 ℃保存,以供提取DNA。
1.2DNA的提取及检测
DNA提取方法参照天根生化科技(北京)有限公司的血液基因组DNA提取试剂盒说明书,提取后于-20 ℃保存。
1.3PCR的扩增
ESR的引物参照毕晓丹的方法[9],由铂尚生物技术(上海)有限公司合成。引物序列如下:
上游引物:5′-TGCACCAGATCCAAGCCAACGA-3′;
下游引物:5′-CGGGTACCTGTAGAAGGCGGGAG-3′。
PCR反应体系25 μL,其中DNA 1 μg,上下游引物(10 μmol/L)各1 μL,2×Taq PCR MasterMix[天根生化科技(北京)有限公司]12.5 μL,ddH2O补至25 μL。PCR反应程序:95 ℃预变性4 min;94 ℃变性1 min,57 ℃复性90 s,72 ℃延伸1 min,34个循环;72 ℃终延伸7 min。产物用2%琼脂糖凝胶检测。
[HTK]1.4单链构象多态性(SSCP)检测多态性[HT]endprint
取5 μL PCR产物,并与5 μL上样缓冲液(90%去离子甲酰胺9 mL,0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青FF,1×TBE 1 mL)混合后置于PCR管内,98 ℃变性10 min,迅速放入 -20 ℃ 冰箱10 min,使之保持变性状态。然后用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测(120 V,3 h),电泳结束银染显色,拍照分析。
1.5公司测序
将提取的DNA全部送到无锡翼和应用生物技术有限公司进行测序及基因型的鉴定,并整理数据结果。
1.6统计分析
收集整理湖羊的生产记录,计算湖羊ESR不同基因型及基因的频率。用SPSS 22.0处理数据,对不同ESR基因型的湖羊产羔数进行LSD多重比较,从而分析比较不同基因型与产羔数之间的关系。
2结果与分析
2.1PCR扩增结果
对PCR产物进行琼脂糖电泳检测,结果表明其特异性良好(图1),目的条带长度符合预期,为419 bp左右,可直接进行SSCP分析。
2.2SSCP检测结果
将PCR产物进行SSCP分析,结果表明ESR基因存在多态性,扩增片段存在3种基因型,将其定义为CC、CG和GG(图2)。其中第10道为CG,第5道为GG,其余几道为CC。
2.3不同基因型测序结果
为确定ESR基因的突变位点,将CC、CG和GG基因型的PCR产物送无锡翼和应用生物技术有限公司测序。根据测序结果可知,等位基因G与C相比,发生了1处突变(G363C),测序结果见图3。[FL)]
[FL(2K2]2.4湖羊ESR基因型及基因频率
检测结果表明,在342只湖羊样本中,193只是CC型,122只是CG型,27只是GG型。经计算,C等位基因的频率为0.743,G等位基因的频率为0.257。CC基因型频率为 0.564,CG基因型频率为0.357,GG基因型频率为0.079。
2.5湖羊ESR不同基因型的产羔数的均值及标准误
由表1可知,根据第1胎产羔记录,GG与CC、CG产羔数差异显著,CC、CG之间差异不显著。根据第2胎湖羊产羔记录,CC、CG、GG基因型的产羔数差异不显著。从整体水平看,CC、CG、GG基因型的产羔数差异不显著。[FL)]
3讨论与结论
毕晓丹通过研究高繁殖力绵羊品种与低繁殖力绵羊品种的ESR基因的多态性,发现ESR基因外显子1的第363处发生了C-G突变,在小尾寒羊中AB、BB基因型比AA基因型多产0.51、0.70只羔羊,并认为ESR基因可能是控制小尾寒羊多胎的主效基因或与之存在紧密的连锁[9]。董文艳等对湖羊ESR基因第一外显子部分序列进行多态性检测[20],结果与毕晓丹的研究结果[9]相似,ESR基因也发生了C-G的突变,并认为ESR基因可能是控制湖羊多羔性能的1个主效基因或与之存在紧密遗传连锁的1个标记。李广录以中国美利奴羊、湖羊、罗米丽羊和罗米丽×中国美利奴(新疆军垦型)为研究对象,检测其ESR基因的5′非翻译区片段的多态性,结果显示4种绵羊均出现多态性[10]。狄冉等采用PCR-[JP2]SSCP技术分析ESR基因外显子4在高繁殖力绵羊品种(小尾寒羊和湖羊)和低繁殖力绵羊品种(特克塞尔、中国美利奴、考力代和杜泊)中的单核苷酸多态性,结果显示ESR基因在这6个绵羊品种中均不存在多态性,说明所检测的ESR基因外显子4序列可能不是影响绵羊高繁殖力的功能结构域[22]。[JP]
本试验使用的所有湖羊均来自江苏省太仓金仓湖羊场,此羊场是新建羊场,羊群刚购进不久,且未经过选育,羊场只有湖羊第1、2胎的生产记录。经统计分析,本次试验羊第1胎平均产羔1.86只,第2胎试验羊平均产羔2.04只,此羊场湖羊的整体生产水平未达到通常文献中报道的每胎 2.30 只羔羊。因此该羊场湖羊的群体构成及其胎次因素可能会對本试验结果造成一定影响。
本试验结果显示,检测的342只湖羊中ESR基因存在多态性,分别为CG、CC和GG。经检测发现ESR基因外显子1的第363处发生了C-G突变。根据湖羊产羔数的统计分析结果可知,CG、CC、GG之间的产羔数并无显著差异。而这一结果与毕晓丹等的研究结果[9,20]相悖,他们的研究结果表明,等位基因B(B等同于本试验中的等位基因G)与绵羊的产羔数呈正相关。笔者认为造成这一现象的原因,与上述提及的该羊场的羊群结构以及胎次因素可能有关。湖羊是世界著名的多胎品种,其多胎性能是由多个主效基因控制的,本试验只是单一地分析了ESR基因与湖羊多胎性能的关系。因此,要确定ESR基因与湖羊繁殖性能的确切关系,还应进行多基因的联合分析,以寻找各个候选基因之间的联系。就本研究而言,笔者认为可以在后续试验中进一步获取该羊场更多的胎次数据以及扩大样本数量,从而进一步验证ESR基因与湖羊产羔数的关系。
[JP3]本试验表明,ESR基因多态性对湖羊产羔性能无显著影响。[JP]
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