青岛市主要农作物种质资源信息网的建立
2016-12-04青岛农业大学青岛市主要农作物种质创新与应用重点实验室山东青岛6609青岛农业大学农学与植物保护学院山东省旱作农业技术重点实验室山东青岛6609青岛农业大学经济与管理学院山东青岛6609
, , , , , , , , (.青岛农业大学青岛市主要农作物种质创新与应用重点实验室, 山东 青岛 6609;.青岛农业大学农学与植物保护学院/山东省旱作农业技术重点实验室, 山东 青岛 6609;.青岛农业大学经济与管理学院, 山东 青岛 6609)
·经验交流·
青岛市主要农作物种质资源信息网的建立
江绪文1,2,赵美爱1,裴玉贺1,郭新梅1,潘顺祥1,李贺勤2,李长忠3,韩辉3,宋希云1
(1.青岛农业大学青岛市主要农作物种质创新与应用重点实验室, 山东 青岛 266109;2.青岛农业大学农学与植物保护学院/山东省旱作农业技术重点实验室, 山东 青岛 266109;3.青岛农业大学经济与管理学院, 山东 青岛 266109)
利用Windows Server 2008+ASP.NET+Microsoft SQL Server开发技术体系建立了“青岛市玉米种质资源信息网”,提供玉米种质资源的信息检索查询、动态管理及应用,并实现种质资源保存信息、图像信息、评价鉴定数据等的网络化共享,为推动现代种业快速发展奠定基础。
青岛; 农作物; 种质资源; 信息网
粮安天下,种铸基石。作物种质资源是培育作物优质、高产、高抗新品种的物质基础,也是我国农业可持续性发展的战略资源[1]。2016年中央一号文《关于落实发展新理念加快农业现代化 实现全面小康目标的若干意见》[2]、2016年《中华人民共和国国民经济和社会发展第十三个五年规划纲要》[3]等均着重强调了开展种质资源普查,建立种质资源收集保存和研究体系对加快农业现代化及国民经济发展具有重大意义。
随着计算机及数据库在现代种业中的广泛应用,种质网络数据库功能日益凸显。我国现已建立形成了一批重要种质资源信息数据库,为种质研究应用、信息管理、种业信息发布和交流等方面发挥了巨大作用[4-6]。张兴伟等[7]建立了中国烟草种质资源信息网,加快了中国烟草种质资源的创新应用。宁静等[8]将数据库技术与网络技术相结合,建立了植物种质信息图像数据库,方便用户信息查询。
青岛市主要农作物种质创新与应用重点实验室近年来开展了大量的种质资源研究工作,已收集、鉴定、保存玉米等主要农作物种质资源3 000余份,获得种质资源信息10万条以上,主要包括农艺性状、品质性状、抗病逆性状以及种子活力性状。新形势下,通过学习吸收国内外优秀种质资源数据信息系统建设设计经验[7-9],并结合青岛及其周边地区作物种质实况及研究需求着手,建设青岛市主要农作物种质资源信息系统。其中包括的种质资源信息网已具备了检索查询、分析对比、信息管理和发布等功能,实现了种质实物和信息的共享交流,为青岛地区现代种业的快速发展奠定了基础。
1 系统设计
1.1 系统概况
为满足日益增长的数据信息管理需求,提高信息交流效率,降低系统维护、更新、升级和运行的成本。利用Windows Server 2008+ASP.NET + Microsoft SQL Server开发技术体系建设种质资源中心的种质信息网络平台,主要包括系统介绍、系统登录、种质资源信息、农业知识、种质数据查询、种业信息、友情连接等部分,开发中突出人性化技术特点。根据用户需求,可免登录进入数据库进行种质资源基本信息查询,若需获得更多种质信息及后期种质实物的获得则需注册授权后密码登录。图1为青岛市主要农作物种质资源信息网免登录查询界面;图2为青岛市主要农作物种质资源信息网数据库后台管理界面。
图1 青岛市主要农作物种质资源信息网免登录查询界面
图2 青岛市主要农作物种质资源信息网数据库后台管理界面
1.2 系统工作流程
系统工作流程如图3。用户登录方式分2种,一种是免登录进入查询界面,选择作物类型后,填写种质编号、种质名称、目标性状即可进行综合查询,以获得种质共性描述数据信息;另一种是注册授权后,密码登录,可查询种质核心特性数据全部信息,并可填写种质获得单,申请获得相应种质。此外,系统欢迎用户反馈种质使用信息和新种质交流。
1.3 系统设计
系统设计如图4。青岛市主要农作物种质资源信息网设计包括用户端和服务端。用户端可实现用户免登录或注册登录选择作物类型,进行检索查询、保存打印目标数据等功能;服务端可实现计算机管理员后台数据维护(数据补充更新、库结构维护等)、中期库管理等功能。
2 系统开发环境
2.1 硬件环境
X 3650 M 5服务器(Intel Xeon E 5-2603 V 3六核CPU×2、32 GB DDR 3 1333 ECC内存、3×1 TB SAS硬盘组成RAID 5存储系统、以太1 000 M网卡)及附属网络设备等。
图3 青岛市主要农作物种质资源信息网系统工作流程
图4 青岛市主要农作物种质资源信息网系统设计
2.2 软件环境
在Windows Sever 2008操作系统下,采用ASP.NET 语言开发应用系统集成软件,并建立SQL数据库。界面制作、系统集成开发工具选用Microsoft Visual Stido 2013、Macromedia DreamWeaver 8、Macromedia FireWoks 8、Adobe Photoshop CS 3 等进行。数据按系统设定格式通过Microsoft Excel进行录入与整理。
3 系统运行环境
系统运行环境采用B/S结构,即由服务(Server)端(应用服务器、数据库服务器、交换机等)、因特网和浏览器(Browse)端组成,其中以Windows Server 2008为服务端操作系统,IIS(Microsoft internet information server)为Web 服务器。利用因特网将用户端与服务端相连以实现数据库访问。
4 系统功能
4.1 查询与分析
为方便用户数据查询检索,系统将查询检索方式分成5种,分别为种质基本信息(种质名称、收集年份、收集地点、种质编号等)、形态及生物学特性、品质性状、抗病虫性、其他性状。此外,用户可通过系统对查询获得的性状数据进行统计分析,如:均值、方差、相关性、聚类等。查询分析结果可视化输出。
4.2 系统维护
计算机管理员密码登录数据后台管理界面定期对用户反馈信息进行归纳、总结、分析和答复,同时可进行数据添加、修改、更新、删除等操作。此外,系统会定期自动备份数据,以提高数据安全性。
4.3 网站内容
从交流层来看,通过不同栏目向用户提供青岛市主要农作物种质及其相关信息,主要包括“系统介绍”、“种质资源”、“种业信息”、“友情连接”、“数据查询”等栏目;从功能层来看,具有浏览、查询、保存、种质获取等功能。用户可免登录种质信息查询检索,也可注册授权后,密码登陆以查询种质资源的全部信息,并通过申请以获得相关种质;从数据层来看,不同作物种质数据库共同形成信息系统的核心。
4.4 使用方法
点击http://www.qdmcgr.cn 网址登陆青岛市主要农作物种质资源中心主页进入信息网,用户可免登录直接查询公性数据库等;注册授权后密码登入数据库核心层,按照系统提示查询更全面的种质信息,通过填写种质交流单可申请获取共享种质,同时欢迎用户即时反馈用种信息和向资源中心提供新种质。此外,有特殊要求的可电话、邮箱直接联系我们。
5 小 结
农作物种质资源收集与共享是现代农业发展的重要内容。近年来,国家对作物种质资源收集及其数据库建设高度重视[2-3]。新形势下,青岛市主要农作物种质资源信息网的建立,实现了对青岛及其周边地区主要农作物种质资源信息的集中管理,以“数据查询+交流共享”为系统设计目标,方便用户对种质信息查询检索,通过种质资源信息交流和实物共享极大提高了种质资源的交流利用率,为种质创新和应用奠定了基础,在促进青岛现代种业科技快速发展中将发挥重要作用。
[1]卢新雄,陈晓玲.我国作物种质资源保存与研究进展[J].中国农业科学,2003,36(10):1 125-1 132.
[2]中共中央.国务院关于落实发展新理念加快农业现代化实现全面小康目标的若干意见[J].中华人民共和国农业部公报,2016(6):7-17.
[3]中华人民共和国第十二届全国人民代表大会第四次会议和中国人民政治协商会议第十二届全国委员会第四次会议.中华人民共和国国民经济和社会发展第十三个五年规划纲要[A].中华人民共和国全国人民代表大会常务委员会公报,2016(2):243-322.
[4]曹永生,方沩.国家农作物种质资源平台的建设和应用[J].生物多样性,2010,18(5):454-460.
[5]曹永生,陈育,孔繁胜.中国作物种质资源信息共享网络的建立[J].资源科学,2001,32(1):46-48.
[6]刘继芬,聂凤英,王平,等.世界主要国家农业数据库及其网络系统应用现状[J].农业网络信息,2004(3):28-30.
[7]张兴伟,王志德,张久权,等.中国烟草种质资源信息网的开发与应用[J].中国烟草科学,2009,30(增刊):32-36.
[8]宁静,杜中赫,刘雅慧,等.植物种子信息图像数据库的建立[J].种子,2016,35(4):126-129.
[9]杨坤,张新明,刘平,等.植物已知品种数据库构建方法的研究[J].中国农学通报,2011,27(33):283-287.
(本栏目责任编辑:申 晓)
Development and Application of Main Crops Germplasm Resources Information System in Qingdao
JIANGXuwen1,2,ZHAOMeiai1,PEIYuhe1,GUOXinmei1,PANShunxiang1,LIHeqin2,LIChangzhong3,HANHui3,SONGXiyun1
2016-06-02
青岛市科技成果转化引导计划(应用基础研究)(课题号:14-2-4-13-jch);公益性行业(农业)科研专项(编号:201303002);山东省优秀中青年科学家科研奖励基金(编号:BS 2014 NY 007);青岛市自主创新计划(编号:15-9-1-86-jch);山东省旱地作物水分高效利用创新团队项目资助(编号:62112 N 5)。
江绪文(1982—),男,博士,讲师,主要从事种子科学、玉米分子生物学研究;E-mail:mjxw888@163.com。
宋希云(1961—),博士,教授,主要从事玉米遗传育种研究;E-mail:songxy@qau.edu.cn。
10.16590/j.cnki.1001-4705.2016.10.132
S 324
B
1001-4705(2016)10-0132-03