白细胞介素-23R Arg381Gln基因多态性与炎症性肠病相关性研究*
2016-10-14徐旭张恒斌钟丽梅
徐旭张恒斌钟丽梅
白细胞介素-23R Arg381Gln基因多态性与炎症性肠病相关性研究*
徐旭①张恒斌①钟丽梅①
目的:探讨白细胞介素-23R Arg381Gln基因多态性与炎症性肠病(Inflammatory Bowel Disease,IBD)相关性。方法:采用序列特异性引物配合聚合酶链反应(polymerasechain reaction with sequence specific primers,PCR-SSP)技术对125例炎症性肠病患者(研究组:UC组78例,CD组47例)与120例健康体检者(对照组)IL-23R基因非同义单核苷酸多态性(IL-23R Arg381Gln)进行分析,计算等位基因的表现频率,评估IL-23R Arg381Gln基因多态性与炎症性肠病相关性。结果:UC组、CD组、对照组A等位基因的表现频率分别为5.13%、2.13%、5.83%,三者比较差异无统计学意义(P>0.05),但CD组A等位基因的表现频率稍低于UC组与对照组。UC组、CD组、对照组G等位基因的表现频率分别为6.41%、6.38%、5.83%,比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论:白细胞介素-23R Arg381Gln基因多态性与炎症性肠病无显著的关系,个体遗传差异性可能决定炎症性肠病的易感性。
白细胞介素-23R; Arg381Gln; 基因多态性; 炎症性肠病
炎 症 性 肠 病(Inflammatory Bowel Disease,IBD)是指机体肠道非特异性炎症反应导致的自身免疫性疾病。本病的疾病类型主要有溃疡性结肠炎(Ulcerative Colitis,UC)与克罗恩病(Crohn’s Disease,CD)。文献[1-2]证实,IBD与遗传因素具有紧密的关系。IL-23R Arg381Gln基因多态性可能对IBD发生发展具有重要的作用[3]。本研究通过分析IL-23R Arg381Gln基因多态性与IBD的关系,以探讨IL-23R Arg381Gln对IBD患者发病机制的调控作用,现报道如下。
1 资料与方法
1.1一般资料 选取2012年1月-2015年1月本院确诊为IBD汉族患者125例作为研究组,男60例,女65例,年龄12~87岁,平均(45.62±15.23)岁,其中溃疡性结肠炎78例作为UC组,克罗恩病47例作为CD组。同期选取健康体检者120例作为对照组,男58例,女62例,年龄11~85岁,平均(45.59±15.17)岁。各组患者在性别、年龄等一般资料方面比较差异均无统计学意义(P>0.05),具有可比性。全部研究对象临床资料完整,自愿参加本研究试验并签署知情同意书。本研究经本院医学伦理委员会批准。
1.2纳入与排除标准 (1)纳入标准:IBD的诊断标准参照中华医学会IBD诊治共识意见[4]。(2)排除标准:合并系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎与哮喘等自身免疫性疾病,合并肝肾功能障碍,心肺功能不全与精神性疾病患者。
1.3方法 (1)制备基因组DNA:全部研究对象收集外周血样本5 mL,置于二乙胺四乙酸二钾(Ethylenediaminetetraacetic Acid-K2,EDTA-K2)抗凝试管内,采用基因组DNA提取试剂盒 (Tiangen BioTech Beijing Co.LTD公司,中国)提取基因组DNA,根据吸光度明确DNA产物纯度与浓度,采用去离子稀释基因组DNA样品至50 ng/μL。(2)IL-23R基因PCR反应:序列特异性引物配合聚合酶链反应(polymerasechain reaction with sequence specific primers,PCR-SSP)技术,参照基因库(GenBank)中IL-23R基 因 序 列(NC_000001.10), 采 用primer5.0设计引物以包含目标位点(rsl 1209026):正义:5’-GAGCAGAGTAAAGAGAATAGTAA-3’,反义:5’-TGGGCTGAGGACTTAGCCTCTTTAAGC CTC-3’(中国上海Sangon公司合成),PCR总体系10 μL(水2 μL+PCR主要混合物5 μL+正义反义引物2 μL+模板DNA 1 μL),反应条件:95 ℃预变性1 min;33个循环(95 ℃ 10 s,60 ℃30 s);72 ℃ 15 s;4 ℃ 30 min,目标基因片段长约461 bp。(3)PCR测序反应:PCR测序引物:5’-GAGCAGAGTAAAGAGAATAGTAA-3’;目的基因片段扩增(rsl 1209026),测序反应条件:96 ℃变性2 min,PCR循环(参数:96 ℃ 10 s;50 ℃ 5 s;60 ℃ 4 min;25个循环),扩增完成后4 ℃保温。醋酸钠/乙醇法纯化PCR产物,电泳,采集测序图谱(上海纳欣生物有限公司)。(4)计算等位基因频率:采用Chromas软件,根据IL-23R目标基因位点正常碱基排列序列采集目标位点的等位基因,计算等位基因的表现频率。
1.4统计学处理 本研究数据采用SPSS 18.0统计学软件进行分析,计量资料以()表示,比较采用t检验,计数资料的比较采用 χ2检验,全部等位基因的表现频率的相关数据均符合Hardy-Weinberg平衡定律,以P<0.05表示差异有统计学意义。
2 结果
2.1基因组DNA与IL-23R基因PCR扩增产物 基因组DNA中A260/A280比值为1.7~1.85,0.8%琼脂糖凝胶电泳分析结果见图1;IL-23R基因PCR扩增产物于2%琼脂糖凝胶电泳分析结果见图2。
2.2IL-23R Arg381Gln基因多态性分析 PCR测序反应结果为单峰、纯合基因型,rsl 1209026,C.1142 G>A,P.Arg381Gln存在单核苷酸多态性G/A,见图3。CD组A等位基因的表现频率稍低于UC组与对照组,组间比较差异无统计学意义(P>0.05),提示等位基因A可能对CD具有保护作用。UC组与对照组A等位基因的表现频率相近,三组IL-23R Arg381GlnGG等位基因的表现频率比较差异无统计学意义(P>0.05),见表1。
表1 各组IL-23R Arg381Gln基因多态性比较 例(%)
图1 IL-23R 基因组DNA电泳图(0.8%琼脂糖凝胶)
图2 IL-23R 基因PCR扩增产物电泳图(2%琼脂糖凝胶)
图3 IL-23R Arg381G1n等位基因G/A测序图谱
3 讨论
目前,关于炎症性肠病(Inflammatory Bowel Disease,IBD)的病理原因与病理机制尚未完全明确。但遗传因素在IBD发生与发展中具有重要的作用。文献[5]表明,同卵双生人群UC发生率为5%~20%,CD发生率为40%~60%。同时,文献[6]显示,当一级亲属患有IBD,则IBD发生风险则可能增加15倍。IBD是多基因参与的自身免疫性疾病,IBD易感基因位点已经成为了IBD研究的热门领域之一。白细胞介素-23(Interleukin-23, IL-23)是目前针对自身免疫性疾病的重要细胞因子,IL-23功能的实现有赖于白细胞介素-23受体(Interleukin-23 Receptor,IL-23R)[7]。IL-23R非同义单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism. SNP)RSL 1209026,C.1142 G>A,P.Arg381Gln基因可能与IBD的发生与发展具有紧密的关系[8-10]。IL-23R定位 于染色体IP32.1-p31.2,编 码 区2.9×103,由11个外显子组成[11]。IL-23R通过与lL-23/IL-23R/Thl7/IL-17途径导致肠黏膜非特异性炎症反应[12]。SNP是人类最为常见的可遗传变异基因,占已知基因多态性的90%以上[13]。通过比较CD与对照人群的全基因组扫描结果发现,IL-23R 1142位点上具有一个改变IL-23R氨基酸编码的基因多态性(1142 G>A)。1142 G>A是一个非同义SNP,碱基G由A替代,使IL-23R氨基酸编码的蛋白质中的一个精氨酸转变为谷氮酰胺(RSL 1209026,C.1142 G>A,P.Arg381Gln),从而导致蛋白质功能异常[14-16]。Arg381Gln基因在IBD患者家族中存在明显不平衡传递现象,从而导致IBD疾病的发生与发展[17]。但国际上关于IL-23R Arg381Gln 与IBD的相关性研究结果差异显著。部分研究肯定了IL-23R Arg381Gln与非犹太人群IBD患儿具有紧密的关系[18]。但部分研究则否认IL-23R Arg381Gln与智利、日本IBD患者的关系[19]。因此,IL-23R Arg381Gln可能存在个体遗传差异性,但关于我国关于IL-23R Arg381Gln基因多态性与炎症性肠病相关性研究较为罕见。
本研究结果显示,我国IL-23R Arg381Gln存在单核苷酸多态性G/A,其中CD患者IL-23R Arg381Gln的A等位基因的表现频率为2.13%,稍低于UC患者(5.13%)与健康体检者(5.83%),因此,IL-23R Arg381Gln的A等位基因可能对CD具有一定程度的保护作用。分析其原因主要为IL-23R Arg381Gln基因多态性(C.1142 G>A)使IL-23R氨基酸编码的蛋白质中的某一个精氨酸转变为谷氨酰胺,而谷氨酰胺可作为物质代谢的关键营养物质,其对肠道黏膜生长具有重要的免疫调节功能,在维持肠道黏膜屏障功能与结构中具有重要的价值[20-21]。结合本研究结果,UC、CD患者与健康体检者IL-23R Arg381Gln等位基因的表现频率比较差异无统计学意义(P>0.05),提示IL-23R Arg381Gln基因多态性与IBD无显著的关系。但相关文献证实,IL-23R Arg381Gln具有个体遗传差异性。同时,由于本研究样本量较小,进一步确切的研究结果尚有待进一步的研究探讨。
综上所述,我国IL-23R Arg381Gln基因多态性(l209026,C.1142G>A,P.Arg381Gln) 与 炎 症性肠病无显著的关系,个体遗传差异性可能决定炎症性肠病的易感性。但由于样本量较小,IL-23R Arg381Gln基因多态性与IBD的确切关系尚有待进一步探讨。
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The Correlation Study between Interleukin-23R Arg381Gln Gene Polymorphism and Inflammatory Bowel Disease/
XU Xu,ZHANG Heng-bin,ZHONG Li-mei.//Medical Innovation of China,2016,13(26):009-012
Objective:To study the correlation between interleukin-23R Arg381Gln gene polymorphism and inflammatory bowel disease.Method:By sequence specific primers and PCR technique in 125 cases of inflammatory bowel disease(study team:UC group of 78 cases,CD group of 47 cases)and 120 healthy checkup (control group)IL-23R genes non-synonymous single-nucleotide polymorphisms were analyzed and the allele performance frequency were calculated.The correlation between IL-23R Arg381Gln gene polymorphism and inflammatory bowel disease was evaluated.Result:The allele performance frequency of UC group,CD group and control group were 5.13%,2.13%,5.83%,the comparison difference among groups had no statistical significance (P>0.05),but A allele performance frequency of CD group was slightly lower than UC group and control group.The G allele performance frequency of UC group,CD group and control group were 6.41%,6.38%,5.83%,compared among groups with no significant difference(P>0.05).Conclusion:It has no significant correlation between IL-23R Arg381Gln gene polymorphism and inflammatory bowel disease,the individual genetic differences may determine the susceptibility of inflammatory bowel disease.
Interleukin-23R; Arg381Gln; Genetic polymorphism; Inflammatory bowel disease
10.3969/j.issn.1674-4985.2016.26.003
2016-01-19) (本文编辑:蔡元元)
深圳市宝安区科技计划项目(2013242)
①广东省深圳市宝安区中心医院 广东 深圳 518102
徐旭
First-author’s address:Shenzhen Baoan District Central Hospital,Shenzhen 518102,China