β—甘露聚糖酶基因的克隆及原核表达载体的构建
2016-05-14张云晖关珍贞王霞
张云晖 关珍贞 王霞
摘要:目的:克隆β-甘露聚糖酶基因并构建其原核表达载体。方法:提取地衣芽孢杆菌ATCC 14580基因组,PCR法扩增该菌基因组中的β-甘露聚糖酶基因,与表达载体pET-28a连接并转化到E.coli BL21中,构建原核表达载体,并对阳性重组菌进行PCR和酶切鉴定。结果:成功克隆β-甘露聚糖酶基因并构建其原核表达载体,β-甘露聚糖酶基因全长1008bp,编码336个氨基酸,蛋白质分子量约为38KDa。SDS-PAGE检测显示重组酶分子量约为38KDa。结论:成功构建β-甘露聚糖酶基因的原核表达载体为基因的重组表达奠定基础。
关键词:地衣芽孢杆菌;β-甘露聚糖酶基因;克隆;原核表达载体
项目基金:吉林农业科技学院校级微生物重点学科培育项目(编号:吉农院合字〔2013〕第X006 号);大学生科技创新科研项目(编号:吉农院合字〔2009〕第112号)
中图分类号: Q943.2 文献标识码: A DOI编号: 10.14025/j.cnki.jlny.2016.11.023
β-甘露聚糖酶(β-mannanase,EC.3.2.1.78)是一类半纤维素水解酶,能够催化甘露多糖(如半乳甘露聚糖、甘露聚糖等)的β-1,4甘露糖苷键随机水解,生成一系列低分子量的寡糖[1]。作为一种新型的酶制剂,β-甘露聚糖酶已经广泛应用于医药、食品、饲料、纺织、印染、洗涤、农业、造纸、石油开采及环境治理等诸多领域[2]。
对β-甘露聚糖酶的早期研究主要集中在产酶菌株的选育、提纯、发酵条件优化等方面,随着分子生物学技术的飞速发展,自20世纪90年代起,人们开始在分子水平上研究β-甘露聚糖酶,并迅速取得了丰硕的成果,目前已有多种微生物来源的β-甘露聚糖酶基因被分离、克隆,甚至实现异源表达[3,4],但是关于地衣芽孢杆菌ATCC 14580 β-甘露聚糖酶基因的克隆及异源表达则尚无报导。本研究克隆了产地衣芽孢杆菌ATCC 14580 β-甘露聚糖酶基因,并构建其原核表达载体,为研究β-甘露聚糖酶的分子遗传学基础,开辟β-甘露聚糖酶工业化生产的新途径,提供了理论依据。
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.1.1 菌种与载体 地衣芽孢杆菌ATCC14580购自上海北诺生物科技有限公司,E.coli BL21为实验室保存,pMD18-T质粒购自宝生物工程(大连)有限公司,pET-28a质粒购自上海佳和生物科技有限公司。
1.1.2 主要试剂 Bam HⅠ、HindⅢ、T4 DNA 连接酶、Taq DNA聚合酶、dNTPs、DNA marker,均购自宝生物工程(大连)有限公司,IPTG购自生工生物工程(上海)股份有限公司,其他试剂均为国产分析纯,培养基为常规LB培养基。
1.2方法
1.2.1 β-甘露聚糖酶基因的克隆 参照精编分子生物学实验指南的方法提取地衣芽孢杆菌ATCC 14580的基因组[5]。根据已报道的地衣芽孢杆菌ATCC 14580全基因组序列以及其它芽孢杆菌的β-甘露聚糖酶基因序列,利用LaserGene软件寻找地衣芽孢杆菌ATCCC14580的β-甘露聚糖酶基因序列,并设计引物,引物中分别加入Bam HⅠ和HindⅢ(下划线部分)的酶切位点,引物序列分别:5'-GGATCCACACCGTT
TCTCCGGTG -AAC-3',5'-AAGCTTCCACGA CAGGCGT。
以地衣芽孢杆菌ATCC14580基因组为模板,扩增β-甘露聚糖酶基因。PCR反应体系为:94℃预热5分钟;94℃,45 秒,50℃,45秒,72℃,1分钟,30个循环;最后,72℃延伸10分钟。回收PCR产物并与pMD18-T载体连接,重组DNA转化至E.coli DH5α中,进行蓝白斑筛选,提取白色菌落质粒,送上海生物工程技术服务有限公司测序,同时进行PCR验证[6]。
1.2.2 β-man基因原核表达载体的构建 用BamHⅠ、HindⅢ分别双酶切pET-28a质粒和经验证正确的克隆基因,回收酶切后的大片段,用T4 DNA liganase连接,重组DNA命名为pET-28a-man,转化到E.coli BL21中,在含有卡那霉素的LB培养基中初筛阳性重组菌,提取质粒进行PCR和酶切鉴定。
2 结果分析
2.1 β-man基因的克隆
PCR产物电泳结果如图1所示,扩增产物约为1008bp的基因片段,条带单一,特异性强,与预期1008bp大小一致。
2.2重组克隆质粒pMD18-T-man鉴定
测序结果表明该基因全长1008bp,DNA MAN 软件分析出该基因编码336个氨基酸,分子量约为38KDa。以初筛阳性重组菌质粒为模板,进行PCR扩增并电泳检测,结果如图2所示,PCR产物为大约1008bp的DNA片段,与预期大小一致,表明pMD18-T-man构建成功。
2.3 原核表达载体pET-28a-man鉴定
提取抗性初筛存活的E.coli BL21质粒,并以其为模板进行PCR鉴定,结果如图3所示,获得了大小约1008bp DNA片段,说明构建的重组载体中含有β-man基因。BamHⅠ和HindⅢ双酶切重组质粒并电泳检测,分别获得了一大一小两个DNA片段,大片段为5343bp的pET28a部分片段,小片段为克隆的β-man基因,说明原核表达载体pET-28a-man构建成功。
3 讨论
β-甘露聚糖酶在自然界中广泛存在,目前在动物、植物和微生物中都有发现,其中微生物是该酶的主要来源,也是工业化生产β-甘露聚糖酶的主要来源[7]。研究发现,β-甘露聚糖酶在原始菌株中一般分泌量比较低,提纯困难,因此,利用基因工程技术克隆β-甘露聚糖酶基因,并使之在大肠杆菌、酵母等细胞中高效稳定表达是该酶生产的有效途径[8]。本研究首次将地衣芽孢杆菌ATCC14580的β-甘露聚糖酶基因与原核表达载体pET-28a连接,并转入E.coli BL21中,成功构建了该基因的原核表达载体。后续将研究该基因在重组菌中的原核表达和酶学性质,并对其发酵条件进行优化,以期获得高产量、高品质β-甘露聚糖酶。
参考文献
[1]Schombug D, Salzmann M. Enzyme handbook(04) [M].Berlin:Springer Verlay Berlin Heideberg, 1991,1-5.
[2]李剑芳,邬敏辰,夏文水.微生物β-甘露聚糖酶的研究进展[J].江苏食品与发酵,2004,118(03):4-9.
[3]Ma Y H, Xue Y F, Dou Y T, et al. Characterization and gene cloning of a novel β-mannanase from alkaliphilic Bacillus sp.
N16-5[J]. Extremophiles,2004,8(06): 447-454.
[4]刘小丹,杨培龙,刘永超,等.一种来源于Paenibacillus sp.A1的中性β-甘露聚糖酶基因克隆及其酶学性质研究[J].中国农业科技导报,2009,11(05):60-65.
[5] F M·奥斯伯, R·布伦特, R E·金斯顿, 等. 精编分子生物学实验指南[M]. 北京: 科学出版社,1998.
[6]何冬兰,张莹,彭宝玉.重组谷氨酞胺转胺酶基因的原核表达研究[J]. 中南民族大学学报(自然科学版),2010,29(4):32-36.
[7] Hasan F, Ali Shah A, Javed S, et al. Enzymes used in detergents: Lipases[J]. African Journal of Biotechnology, 2010,9(31): 4836-4844.
[8]龚月生,刘锦妮,王晶.耐热尽半乳糖普酶基因在大肠杆菌中的表达及酶学性质研究[J].西北农林科技大学学报(自然科学版),2008,36(10):59-65.
作者简介:张云晖,吉林农业科技学院,在读本科生,研究方向:分子生物学。
通讯作者:王霞,硕士,吉林农业科技学院,讲师,研究方向:
分子生物学。