浙江大学绘制全球首张榨菜全基因图谱

浙江大学农业与生物技术学院园艺系张明方教授团队通过高通量测序技术，绘制了世界上第一张榨菜全基因图谱，这一进展将对芥菜类蔬菜作物的改良产生重要意义。

菜用芥菜是我国重要的加工蔬菜，榨菜和雪里蕻、大头菜等都属于不同的变种。通过高通量测序技术，结合构建的高密度遗传图谱，首次完成了芸薹属中异源多倍体榨菜（AABB基因组）的高质量基因组图谱，并进一步丰富和深化了对榨菜的“家谱”的认识。研究发现，芥菜物种形成于3.9万～5.5万年前，为单一地理起源，其A亚基因组与白菜型油菜亲缘关系更近，然后演化成蔬菜用和油用芥菜2个主要类群。

榨菜、梅干菜为什么会有一种独特的“中国味”？课题组找到了2组同源基因序列，其中一组与硫代葡糖糖苷代谢有关，它们发生了差异化进化，这就是为什么有的榨菜闻起来香，有的香味不明显。另外一组则与油脂代谢有关，决定着油用芥菜的产油量和油脂的组分。据介绍，50多年来，众多学者以小麦、棉花、油菜等为模式作物，对复杂基因组组装和同源基因表达进行了广泛研究，但尚未揭示多倍体物种中同源基因表达与选择的机制。这种机制，终于通过我国的“乡土”作物榨菜得到了揭示：异源多倍体芥菜亚基因组间呈非对称进化，亚基因组间同源基因中具有显著表达差异的基因表现出更快的进化速率，这些基因在菜用和油用芥菜分化中受到选择。研究成果不但可以推动芥菜类蔬菜作物分子育种的进程，同时，还能从理论上预测重要农业性状，推动对基因组育种的认识和应用，还有望用于作物改良过程中目标基因的定向选择。