科学家深挖表观遗传组鉴别出引发髓母细胞瘤的关键原因
2016-01-24
中华肺部疾病杂志(电子版) 2016年1期
·医学动态·
科学家深挖表观遗传组鉴别出引发髓母细胞瘤的关键原因
近日,来自圣犹大儿童研究医院的研究人员通过研究鉴别出了引发脑部肿瘤亚型4组髓母细胞瘤的细胞,该研究或为开发新型靶向疗法抵御常见脑部肿瘤提供一定帮助和希望。
研究人员利用分析工具Chip-Seq,基于表观遗传调节子的活性鉴别并且追踪了不同亚型髓母细胞瘤的差异性,这些表观遗传调节子包括一些已知的主要调节转录因子,其可以结合名为增强子及超级增强子的DNA序列,这种主要的调节转录因子和超级增强子可以联合作用来调节关键基因的表达,比如负责细胞身份的基因等。
研究者使用的工具对28种髓母细胞瘤肿瘤中超过3 000种超级增强子进行了鉴别,同时他们还根据不同肿瘤亚型鉴别出了超级增强子的活性,这些超级增强子可以开启一些癌症基因,包括ALK、MYC、SMO和OTX2基因等,这些基因都和髓母细胞瘤直接相关。研究者发现,Lmx1A或许是4型髓母细胞瘤亚型的主要转录调节子,Lmx1A被认为在小脑等结构中扮演着重要角色,研究者表示,这项研究是对单一癌症亚型进行的大型表观遗传学研究,更重要的是他们首次对原始的病人肿瘤组织进行了大型的队列梯度研究,此前研究中因为研究对象仅限于细胞系,所以他们仅能对肿瘤的表观遗传组进行研究,而研究中对髓母细胞瘤亚型进行单独的研究或许为后期阐明疾病发生机制,以及开发特殊的个体化疗法提供新的基础和思路。