DNA数据库亲缘关系比对2例分析
2015-05-04刘亚举
刘亚举,张 博
DNA数据库亲缘关系比对2例分析
Analysis of Two Kinship Testing Cases of DNA Database
刘亚举1,张 博2
法医遗传学;DNA数据库;亲缘关系
DNA数据库经过数年的建设发展,库容规模数量日益增加。由于建设初期受一些因素制约,致使入库STR基因座及其数量种类繁多,尤其是STR基因座数量一般维持在16个以下,随着DNA数据库库容的不断递增,就会给随机亲缘关系的匹配带来一定的风险。作者在两起失踪人员认定案例中遇到此类问题,报道如下。
1 案例资料
1.1 简要案情 案例1:1995年2月6日,邵某(男)与人发生口角械斗,杀人后潜逃。案例2:1997年12月15日,李某(男)在本村杀人、砍人后逃跑。启动案件侦破新机制后,遂即采集其“配偶—子女”样本,用Identifiler®Plus PCR扩增试剂盒(美国AB公司)检验后录入全国DNA数据库。1周后,该系统的15个基因座无容差比中数条数据,其中案例1分别比中外省库的1个陌生男和1个陌生女,案例2比中本省库的1个陌生男和外省库的1个陌生男(见表1)。
1.2 复核检验及结果 收集上述样本,使用sbeadex®法医试剂盒(英国LGC公司)提取基因组DNA,采用STRtyper-21G试剂盒(宁波海尔施基因科技有限公司)进行STR检验,发现两个案例所比中的亲缘关系分别在Penta E、Penta D、D12S391、D6S1043、D1S1656等5个基因座不符合遗传规律(见表2)。同时增加Yfiler®Plus试剂盒(美国AB公司)进行Y染色体检验,其中案例1陌生女未检出STR分型,其余均与孩子不符合遗传规律。
表1 Identifiler® Plus试剂盒STR分型结果
注:左侧为案例1,右侧为案例2。
表2 STRtyper-21G试剂盒5个基因座的STR分型结果
注:左侧为案例1,右侧为案例2。
2 讨论
本文案例所涉及的亲缘关系,根据Identifiler®Plus系统15个基因座得到的累计亲权指数远远大于10 000,按《法庭科学DNA亲子鉴定规范》(GA/T965-2011)中有关规定,是支持亲权关系的存在,但STRtyper-21G和Yfiler®Plus系统检验结果却否定了上述结论。案例1中,符合遗传关系的比对对象显示为女性,怀疑是男性系Y片段缺失[1],但后续的检验证明应为错判,由于Amelogenin基因座的Y片段位于Y染色体短臂区,为避免此类现象的出现,建议PCR扩增系统增加长臂区的DYS391(最小单倍型)或Y-indel(缺失/插入)。
随着欧洲标准(ESS)的推广,美国FBI对CODIS基因座重新进行了评估升级,并最终确立了含20个STR基因座的扩展核心基因座。而国内DNA数据库库容也迅猛增加,原有的15个基因座已不能满足亲缘关系比对需要[2],如案例1、2,为了防范此类案件的风险,既要与国际接轨,又要适合中国人群的STR检测体系,同时节约检验成本,可以通过以下措施来进行:①检验体系应包含20个以上的常染色体基因座,在传承原CODIS基因座的基础上,增加非父排除率较高的基因座[3],最好有Penta D和Penta E[4],以此提高系统效能,且基因座的等位基因分布符合中国人群特点。②可以采用6色荧光标记技术,根据SNP和InDel二等位基因标记具有分布广泛、遗传稳定、突变率低、易于分析等优点,再增加5~7个SNP或InDel基因座到上述系统作为补充检验,以此来满足突变的结果解释[5],同时SNP或InDel最小等位基因频率要接近于0.5。③增加线粒体、X-STR、Y-STR辅助检验[6-7],解决复杂亲缘关系鉴定。
总之,随着DNA检验技术的精确化,为使疑难生物检材达到高效、全方位检验和分析,避免后续复核工作无法延续,以利于亲缘关系比对等拓展功能的应用,因此DNA实验室PCR扩增试剂要多样化,且快速方便各种检验数据的入库查询,最终大量的DNA检验信息使生物物证的作用最大化,满足各种DNA信息的传承和利用。
[1] 刘亚举,张俊涛,徐超,等.男性个体Amelogenin基因座变异1例[J].中国法医学杂志,2012,27(6):508-509.
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[6] 刘亚举,张俊涛,李瑾,等.X-STR联合常染色体STR用于亲缘关系鉴定1例[J].中国司法鉴定,2014,76:123-124.
[7] 刘亚举,张俊涛.Y-STR家系排查2例[J].法医学杂志,2014,30(6):476-477.
2014-12-12
1.许昌市公安局刑事科学技术研究所,河南许昌 461000 2.禹州市公安局刑侦大队,河南禹州 461670
刘亚举(1978-),男,河南襄城人,副主任法医师,从事DNA检验及法医遗传学统计工作。
DF795.2
B
1672-688X(2015)01-0070-03