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双峰驼体尺性状的聚类分析

2015-02-28乌仁套迪张文彬照日格图白俊艳钟自然翟亚格袁文华张春豪贾百威高森岩

安徽农业科学 2015年2期
关键词:双峰驼管围亚类

乌仁套迪, 巴 拉, 张文彬, 宝 迪, 照日格图, 白俊艳, 苏 含, 刘 茜, 钟自然, 翟亚格, 袁文华, 王 静, 杨 峰, 张春豪, 贾百威, 高森岩, 楚 猛

(1.内蒙古阿拉善盟畜牧研究所,内蒙古巴彦浩特750306;2.河南科技大学动物科技学院,河南洛阳 471003)



双峰驼体尺性状的聚类分析

乌仁套迪1, 巴 拉1, 张文彬1, 宝 迪1, 照日格图1, 白俊艳2*, 苏 含2, 刘 茜2, 钟自然2, 翟亚格2, 袁文华2, 王 静2, 杨 峰2, 张春豪2, 贾百威2, 高森岩2, 楚 猛2

(1.内蒙古阿拉善盟畜牧研究所,内蒙古巴彦浩特750306;2.河南科技大学动物科技学院,河南洛阳 471003)

[目的]了解双峰驼的体尺性状。[方法]选取阿拉善戈壁双峰驼、苏尼特双峰驼、阿拉善沙漠双峰驼、青海双峰驼4个地方双峰驼共计161峰,测量其体长、体高、体重、胸围、管围等性状,利用SPSS软件对以上5个体尺指标进行聚类分析。[结果]双峰驼的体高、体长、胸围、管围、体重之间的相关系数均达到极显著水平,尤其是体重与胸围、体重与体长的相关系数为强正相关。双峰驼的体尺性状聚类结果为3亚类,第1亚类包括体重、体长、胸围,第2亚类只包括体高,第3亚类只包括管围。[结论]试验结果为双峰驼选种选育提供了理论依据。

双峰驼;相关系数;聚类分析

体尺测量是衡量家畜品种优劣、生产性能、发育、健康状况和结实性的重要指标[1],在家畜育种工作中有着重要意义。体尺之间往往有着很强的相关性,为了明确体尺之间的主次关系,可对体尺进行聚类分析。聚类分析是研究样品或变量(指标)的分类问题,对样品的分类称为Q型聚类分析,对变量的分类称为R型聚类分析。赵宗胜等[2]对3个不同类型杂交肉羊的体尺指标进行主成分和聚类分析,将所分析的17项体尺指标分为3大类,即特征类、围度类和高长度类。唐爱发等[3]应用聚类与主成分分析对488头撒坝猪的6月龄体尺性状进行了研究,结果表明其体尺性状大致分为体重、体型、围度3类。白俊艳等[4]对豫西脂尾羊的7 个体尺指标聚为 3 个亚类,第 1 类包括体高、肩高、体长、管围,第 2 类包括胸围和胸宽,第 3 类只有胸深。

我国是世界上双峰驼资源丰富的国家之一,主要分布在我国的骆驼品种有4个,分别是阿拉善双峰驼、苏尼特双峰驼、青海双峰驼和新疆双峰驼[5]。笔者对我国4个地方双峰驼的体高、体长、胸围、管围、体重5项体尺性状进行了聚类分析,以期为双峰驼的保种与选育利用提供理论依据。

1 材料与方法

1.1 供试动物选择了阿拉善沙漠双峰驼(阿拉善右旗)、阿拉善戈壁双峰驼(阿拉善左旗)、苏尼特双峰驼(锡林郭勒盟苏尼特右旗)、青海双峰驼(青海省海西州)供试,共计有161峰。

1.2 方法

1.2.1体重与体尺测定。体重:在骆驼饮水前用地磅称取的活体重。体高:从骆驼前峰后缘基部到地面的垂直距离,用测杖测量。体长(体斜长):从肩端到臀端的距离,用测杖测量。胸围:从前峰后缘基部起向下经过胸底角质垫的中心绕体一周所成的垂直周径,用皮尺测量。管围:左前肢管部的上三分之一处绕管一周所形成的水平周径,用皮尺测量。

1.2.2分析方法。 将双峰驼体尺指标的Excel数据文件转化为SPSS数据文件后,从菜单栏上依次点选“统计分析→聚类分析→系统聚类”,弹出系统聚类分析主对话框,导入变量,选择按变量分类,显示勾选统计量、作图;单击“统计量”按钮,勾选“凝聚状态表”,作图子对话框中勾选“系统树图”;方法子对话框中聚类方法分别选类平均法,间距选“欧氏距离”, 转换数值选“Z scores”,单击“确定”执行。

2 结果与分析

2.1 各个性状的描述统计量由表1可知,样本大小是161个,其中体重的变异系数为20.90%,相对于其他性状而言,体重的变异程度较大,说明体重的测量值比较离散。而体高的变异系数最小,为7.34%,相对于其他性状的变异程度较小,说明体高的测量值分布比较集中在均值附近。

2.2 相关分析由表2可知,体高、体长、胸围、管围、体重之间的相关系数均达到极显著水平。尤其是体重与胸围、体重与体长的相关系数为强正相关,而且相关系数都达到极显著水平,说明体重较大的个体胸围、体长也较大。其次是体高与体长、体长与胸围之间的相关系数也为较强的正相关。

注:样本数为161个。

注:**表示P<0.01。

2.3 聚类分析表3是体尺聚类过程中各个体尺之间的近似矩阵,以殴氏距离的平方来衡量,即各个体尺之间的距离越小,就越早聚为一类。结果表明,体重和胸围的欧氏距离的平方最小为7.551,说明该2个性状的距离最小,最先聚为一类。

表3 体尺之间的近似矩阵

由图1可知,相似程度较高的首先聚为一大类,而且随着相似性程度的降低,所聚的类别也有所增多。当类间距取20时,双峰驼的体高、体长、胸围、管围和体重5个体尺聚为3亚类,第1亚类包括体重、体长、胸围,第2亚类只包括体高,第3亚类包括管围。该聚类结果与表3的结果较吻合。

3 讨论

聚类分析的目标就是在相似的基础上收集数据并分类,关系密切的对象聚为一个小的分类单位,关系疏远的对象聚为一个大的分类单位,最终把所有的样品或指标聚类完毕,即可形成一个由小到大的分类系统[6]。聚类结果体现数据的分布特征,聚类方法多种多样,针对不同的问题应该采取不同的方法[7]。由于生物体各性状间的遗传相关,或者说控制这些性状基因的连锁或一因多效,使得对某一性状的选择往往会导致另一性状的选择反应[8]。该研究运用SPSS统计软件的组间联结方法对双峰驼的5个体尺性状进行聚类分析,5个体尺聚为3亚类,第1亚类包括体重、体长、胸围,第2亚类只包括体高,第3亚类只包括管围。上述研究结果可应用于双峰驼的体尺性状选择上,由于体重、体长、胸围聚为一类,而且它们直接具有极显著正相关,对于双峰驼来说,体重是不易测量的性状,因此在选择过程中可通过选择体长或胸围达到对体重的间接选择效果。由于该研究样本数量较小且所测量的体尺性状也较少,对结果可能有影响,可通过扩大样本数量和所测体尺性状种类来进一步提高结果的稳定性和参考价值。

[1] 冯明廷,安海燕,樊炳,等.河西绒山羊应用“双羔素”的效果观察[J]. 内蒙古畜牧科学,2003(5):27-28.

[2] 赵宗胜,李大全,杨晶,等.不同类型肉羊体尺的聚类与主成分分析[J].石河子大学学报:自然科学版,1999,3(2):111-118.

[3] 唐爱发,连林生,李爱云.撒坝猪体尺性状的聚类与主成分分析[J].辽宁畜牧兽医,2000(3):1-2.

[4] 白俊艳,张省林,徐廷生,等.豫西脂尾羊体尺指标的聚类和主成分分析[J].黑龙江畜牧兽医,2012(12):56-58.

[5] 何晓红,韩秀丽,马月辉. 双峰驼遗传多样性研究进展[J]. 家畜生态学报,2009,30(4):9-13.

[6] 张帆,颜亭玉,杨佐君,等.多元统计分析方法在羊体质量与体尺研究中的应用[J].北京农学院学报,2012,27(4):16-19.

[7] 颜亭玉,杜晓林.SAS聚类分析过程在农业试验统计分析中的应用[J].北京农学院学报,2009,24(1):73-75.

[8] 叶昌辉,何启聪,谢为天,等.雷州山羊体尺性状的主因子分析[J].西南农业大学学报,2002,24(1):61-63.

Cluster Analysis of Body Size in Bactrian Camel

WU Ren-tao-di1, BA La1, ZHANG Wen-bin1, BAI Jun-yan2*et al

(1. Alxa Institute of Animal of Inner Mongolia, Bayanhaote, Inner Mongolia 750306; 2. College of Animal Science and Technology, Henan University of Science and Technology, Luoyang, Henan 471003)

[Objective] The aim was to understand the body size of bactrian camel. [Method] Four varieties like Alashan gobi bactrian camel, Sunit bactrian camel, Alashan desert bactrian camel and Qinghai bactrian camel were selected, totally 161 peaks, and their body length, body height, body weight, chest circumference, pipe circumference and other traits were measured; cluster analysis was carried out for the five body size indexes by using SPSS software. [Result] The correlation coefficients among body height, body length, chest tube circumference and body weight reached very significant level, especially body weight and chest circumference, body weight and body length reached strong positive correlation coefficient. Bactrian camel body measurements traits clustering resulted into three classes, among them the first class included body weight, body length and chest circumference, the second class only included body height, and the third class only included pipe circumference. [Conclusion] The results provide theoretical basis for selection and breeding of bactrian camel.

Bactrian camel; Correlation coefficient; Cluster analysis

内蒙古阿拉善盟科技项目(2012-12)。

乌仁套迪(1974- ),女,内蒙古通辽人,高级兽医师,硕士,从事双峰驼遗传资源保护与利用研究。*通讯作者,副教授,博士,从事动物遗传育种研究。

2014-12-02

S 865.3+1

A

0517-6611(2015)02-084-02

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