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烟草拮抗内生细菌的筛选与防病促生长效果

2014-06-01杨珍福吴毅歆陈映岚何月秋

中国烟草科学 2014年6期
关键词:烟苗菌液内生

杨珍福,吴毅歆,陈映岚,何月秋,2*

(1.云南农业大学农业生物多样性应用技术国家工程研究中心,昆明 650201;2.云南农业大学农学与生物技术学院,

昆明 650201;3.微生物菌种筛选与应用国家地方联合工程研究中心,昆明 650217;4.云南省禄劝县农业技术推广总站,云南 禄劝 651500)

烟草拮抗内生细菌的筛选与防病促生长效果

杨珍福1,吴毅歆2,3,陈映岚4,何月秋1,2*

(1.云南农业大学农业生物多样性应用技术国家工程研究中心,昆明 650201;2.云南农业大学农学与生物技术学院,

昆明 650201;3.微生物菌种筛选与应用国家地方联合工程研究中心,昆明 650217;4.云南省禄劝县农业技术推广总站,云南 禄劝 651500)

为了获得能促进烟草生长和防治黑胫病的稳定菌株,通过常规方法从烟草茎、叶中分离到 478 株内生细菌,其中65 株能拮抗烟草黑胫病菌,占 13.60%。菌株 YN201408、YN201442、YN201448 和 YN201458 对烟草疫霉的抑菌率分别为63.85%、60.82%、64.72%和 76.07%,用 1.0×107cfu/mL 拮抗菌液浸烟苗根系 30 min,移栽后浇灌 1 次,在温室盆栽试验中控病效果分别为 68.24%、65.47%、69.12 和 41.40%。YN201448 对烟草种子萌芽率和烟草的生长都有促进作用,烟草的发芽率、第 5~6 真叶期苗高和地上部鲜重分别高于清水对照 10.95%、29.31%和 67.24%。依据菌体形态、生理生化特征和 16S rDNA序列,YN201408、YN201442 和 YN201448 鉴定为解淀粉芽孢杆菌,YN201458 为铜绿假单胞菌。YN201448 因良好的促生长和控病效果而具有继续开发应用的潜力。

烟草;黑胫病菌;解淀粉芽孢杆菌;生物防治;促生长

烟 草 黑 胫 病 是 由 烟 草 疫 霉 ( Phytophthora parasitica var. nicotianae)引起的烟草真菌性土传病害之一。该病常与烟草青枯病混合发生,导致烟草矮化、萎蔫、叶片发黄、根和茎基部坏死,发病率3%~12%,重者损失达 50%[1-2]。目前除东北烟区零星发生外,我国其他烟草主栽区均普遍发生[3-4]。该病的防治主要依赖化学农药,但长期反复施用,造成烟株药害、农药残留和病原菌产生抗药性[5-6]。近年来,随着烟草及烟草制品逐渐向更加安全化方向发展,生物防治已成为烟草病害防治研究的热点。

关于植物病害生防细菌的筛选,过去主要是从土壤或植物根际土壤微生物中分离,但由于易受外界条件的影响,这些土壤微生物防病效果时常不稳定[7]。近年来的研究表明,植物体是一个复杂的微生态系统,植株体内广泛分布大量内生细菌,其中许多内生细菌不仅可以抑制病原菌的生长,还具有促生、固氮等生物功能[8-9],展示了很好的开发应用前景。为得到良好内生菌株,本研究开展了对烟草黑胫病菌有拮抗作用且具有促生作用的烟草内生细菌的分离筛选和鉴定。

1 材料与方法

1.1 供试材料

烟草黑胫病菌于 2012 年分离自玉溪烟区感病烟株,具强致病力。LB 培养基用于分离和保存内生细菌,燕麦培养基用于培养烟草黑胫病菌和对峙培养。云烟 97 种子由云南省烟草公司提供,烟草在育苗基质中培育至5~6片真叶备用。

1.2 试验方法

1.2.1 烟草内生细菌的分离 健康烟草茎、叶经酒精消毒后,用灭菌水冲洗3次,于灭菌的研钵中研磨,将研磨汁液涂布于 LB 平板上。用印迹法[10]检测样品表面消毒是否彻底,如长菌落,研磨液所涂平板上长的菌落为非内生细菌,弃去;若对照中无菌落,在研磨液中长出的菌落可能是内生细菌,随机挑取形态不同的菌落进行纯化培养并保存[11]。

1.2.2 拮抗内生细菌筛选 以烟草黑胫病菌为指示菌,采用燕麦平板对峙培养法[10],在平板中央倒置直径为 0.5 cm 的烟草黑胫病菌的琼脂块,再将分离到的细菌点接在距烟草黑胫病菌的琼脂块 3 cm处的 4 个角点上,置于 28 ℃培养箱培养 7 d,选出对病原菌生长有抑制作用的菌株进入复筛。每个菌株3次重复,记录并保存。将拮抗性好的菌株转接5代以上,继续观察其对烟草黑胫病菌的抑菌作用,并测定其抑菌带宽度。对抑菌效果好的菌株,采用抗利福平标记法标记菌株[8],灌根[12]测定其在烟草内的定殖能力。

1.2.3 拮抗内生细菌对烟草黑胫病的温室控病作用 温室控病试验于 2013 年在云南农业大学植保学院温室中进行。挑选出抑菌圈较大且抑菌作用稳定的拮抗菌,活化后在 37 ℃、170 r/min 摇瓶发酵培养 3 d,用无菌水稀释至 1.0×107cfu/mL。黑胫病菌采用郑小波[13]方法,制备成浓度为 1.0×104个/mL游动孢子悬液。选择长势一致的 5~6 片真叶期的烟苗,移栽前将烟草幼苗在 1.0×107cfu/mL 浓度的相应菌液中浸根 30 min,然后将烟苗移栽至盆中,空白对照采用清水浸根。3次重复,每重复5株烟苗。移栽 3 d 后用相应拮抗菌悬液(1.0×107cfu/mL)灌根一次,对照浇等量清水。3 d 后将配制好的黑胫病游动孢子菌悬液(104个/mL)灌接于各处理烟苗根部,接种量为 5 mL/株。温室温度 28 ℃,浇水保湿以利于发病。接种病原菌 20 d 后,调查各处理烟株的发病情况,计算病情指数、发病率和相对防效。分级标准和防治效果计算方法参照文献[3,14]。

1.2.4 拮抗内生细菌的促生作用测定 (1)发芽率测定试验 云烟 97 种子经酒精消毒后,用菌株YN201448 菌悬液(1.0×106cfu/mL)浸泡 24 h,取出种子置于垫有湿润滤纸的培养皿内,于 28 ℃保湿培养,第7天时检测种子的萌芽率。每皿处理 30粒种子,3次重复,用清水和 LB 液体培养基作对照。

(2)漂浮育苗试验 试验于 2013 年在云南省微生物发酵工程中心大棚内进行。烟草种子用YN201448 菌液进行浸种处理,出芽后播种到装有漂浮育苗基质的育苗盘中,烟草出苗后用浓度为107cfu/mL 的 YN201448 菌液喷雾 1 次,待烟草长到 5~6 片真叶时,测定株高、最大叶长、最大叶宽及地上部鲜重。每处理 50株,3次重复,用清水和LB液体培养基作对照。

1.2.5 生理生化与分子生物学鉴定 参照文献[15],对 4 株拮抗菌进行生理生化特性的测定。菌株 YN201448 基因组总 DNA 的提取采用冻融法[16]。16S rDNA 基因片段的 PCR 扩增采用由上海生工公司合成的细菌通用引物 P0(5′GAG AGT TTG ATC CTG GCT CAG-3′)和 P6(5′- CTA CGG CTA CCT TGT TAC GA-3′)。PCR 扩增采用 20 μL 反应体系:10×EasyTaq Buffer(含 Mg2+)2.0 μL,dNTPs(10 mmol/L)1.6 μL,P0(10 mmol/μL)和 P6(10 mmol/μL)均为 1.0 μL,EasyTaq DNA Polymerase (5 U/μL,Transgene)0.2 μL,模板 DNA(10~50 ng/μL)0.5 μL,补充 ddH2O 至总体积 20 μL。PCR 反应程序为:94 ℃预变性 5 min,94 ℃ 1 min ,55 ℃ 1 min,72 ℃ 2 min,30 个循环,最后 72 ℃延伸 10 min。PCR 产物经 0.8%的琼脂糖凝胶电泳,目标条带切胶后,利用试剂盒回收,将回收后的 16S rDNA 片段连接到 pMD18-T 载体上,将连接产物转化到大肠杆菌(E.coli)DH5α 中,以蓝白斑特征挑取阳性克隆,再以 PCR 验证阳性克隆[17]。被确认的克隆送至北京华大基因公司测序,测序结果在 NCBI分子生物学数据库中比对同源性。结合形态、生理生化反应及 16S rDNA 基因片段序列,鉴定菌株的分类地位。

2 结 果

2.1 拮抗内生细菌的分离与筛选结果

从采自玉溪、昆明的烟草茎、叶中共分离到 478株内生细菌,包括从茎部分离到 358 株,从叶部分离到 120 株。抑菌实验结果表明,478 株内生细菌中有 65 株能拮抗烟草黑胫病菌,占总数 13.60%,但它们都来自烟草茎秆。其中,YN201408、YN201442、YN201448 和 YN201458 等有较强的抑菌作用(图1),对烟草疫霉的抑菌率分别为 63.85%、60.82%、64.72%和 76.07%。各菌株在转移 5 代后,其抑菌能力无明显变化。另外,烟草幼苗经利福平标记菌株菌液分别灌根处理后,在含利福平的 LB培养 基上 均能 从植 株 里 分 离 到 YN201408 、YN201442、YN201448 和 YN201458 细菌,而清水处理中未获得细菌。各回收菌株的基本形态和原菌株相同,测定菌株对烟草黑胫病菌的抑制作用也与原菌株接近,表明这4 个菌株均能在烟株体内定殖。

图1 内生细菌对烟草黑胫病病原菌生长的抑制Fig. 1 The effect of endophytic bacteria on growth of Phytophthora parasitica var. nicotianae

2.2 温室控病试验

温室控病试验中,拮抗内生菌菌液处理烟草幼苗后,烟草黑胫病发病率和病情指数均显著低于空白对照,温室盆栽防治效果达 41.40%~69.12%(表1)。对照烟苗发病严重,植株生长受到抑制;经拮抗菌悬液处理的烟苗发病程度较轻,植株生长发育正常(图2)。4 个菌株处理中,YN201448 菌液处理的防效最高,达到 69.12%。

表1 拮抗内生细菌对烟草黑胫病的温室防治效果Table 1 The effect of antagonistic endophytic bacteria on control tobacco black shank in the greenhouse

2.3 拮抗细菌悬液对烟草苗期促生作用的测定

图2 YN201448 菌株对烟草黑胫病的温室防治效果Fig. 2 The effect of YN201448 against tobacco black shank in greenhouse

从表2 可以看出,烟草种子经 YN201448 菌液处理后,发芽率高达 97.33%,显著高于清水和 LB培养液处理的发芽率 87.67%和 89.00%,分别高于后两者 9.66%和 8.33%。在漂浮育苗试验中,在烟草 5~6 叶期,YN201448 菌液处理的烟草苗高 15.31 cm,地上部分鲜重 3.88 g,亦显著高于清水和 LB培养液处理的苗高 11.84 cm 和 11.63 cm,地上部分鲜重 2.32 g 和 2.74 g,其中苗高分别高于后两者29.31%和 31.64%,鲜重分别高出 67.24%和 41.61%。YN201448 菌液处理的烟草株高、最大叶长、最大叶宽和地上部分鲜重显著优于对照(图3)。菌株YN201448 处理的烟草幼苗长势明显好于对照,叶片宽厚、叶色更为浓绿,表明 YN201448 不仅能有效促进烟草种子萌发而且对烟草生长也有促进作用。

表2 YN201448 菌液对烟苗生长的影响Table 2 The effect of antagonistic endophytic bacterium YN201448 on tobacco seedling growth

图3 YN201448 处理的烟苗Fig. 3 Seedlings treated with YN201448

2.4 生理生化与分子鉴定结果

生理生化试验鉴定了 YN201408、YN201442、YN201448 和 YN201458 等4 个拮抗菌株的 12 个生理生化特征(表3)。其中 YN201408、YN201442和 YN201448 的革兰氏染色、芽孢染色、淀粉水解、葡萄糖利用、柠檬酸盐利用、V-P 试验、硝酸盐还原、明胶液化等均呈阳性;而 YN201458 菌株的KOH 反应、葡萄糖利用、柠檬酸盐利用、V-P 试验、明胶液化等呈阳性,其余反应均为阴性。根据形态特征和生理生化特性测定,初步确定 YN201408、YN201442、YN201448 为芽孢杆菌,YN201458 为假单胞菌。对提取的细菌基因组 DNA 进行 PCR 扩增,得到了约为 1500 bp 的明亮条带(图4)。YN201408、YN201442 和 YN201448 菌株的 16S rDNA 序列经与 NCBI 数据库 BLAST 比对,与其同源性较高的菌株均属于芽孢杆菌属,其中菌株YN201448 与 Bacillus amyloliquefaciens CC178(CP006845.1)、B. amyloliquefaciens subsp. plantarum str. FZB42(CP00560.1)、 B. amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 相似度均达 99%,菌株 YN201408 和 YN201442 均与 B. amyloliquefaciens subsp. plantarum CAUB946(HE617159)和 B. amyloliquefaciens LFB112(CP006952)相似度达 98%,而菌株 YN201458 与Pseudomonas aeruginosa CNU082141( KF979144.1 )、 P. aeruginosa CNU082137( KF979142.1 ) 和 P. aeruginosa C1501(KF976394.1)等的相似度都达到 99%。结合菌株的形态特征,生理生化特性及 16S rDNA 序列,将YN201408、YN201442 和 YN201448 鉴定为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens),YN201458鉴定为铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)。

表3 四种拮抗菌株的生理生化鉴定结果Table 3 Identification of 4 antagonistic bacteria in morphology, biology, and biochemistry

图4 四株拮抗菌的 PCR 扩增图Fig. 4 The agarose gel electrophoresis of 4 antagonistic bacteria

3 讨 论

生物防治已成为现代农业生产中有害生物防治的一项重要措施。很多相关试验表明,生防菌对烟草黑胫病具有一定的防治效果。赵秀香等[18]研究发现侧孢短芽孢杆菌对烟草黑胫病菌有拮抗作用;易有金等[19]研究发现,短短芽孢杆菌对烟草黑胫病具有显著防治效果。在植物病害生防中,若将防病作用与促生作用相结合,可起到更理想的效果[20]。目前,已 有学者[20-22]对防病促生的内生菌进行研究,但绝大多数研究成果都还没有应用于实际生产。

在平板和温室拮抗测定试验中发现,平板拮抗活性较高的菌株在温室也呈现出防效较高的趋势,但也有些菌株例外。如本研究中菌株 YN201458 在平板对峙试验中有很好的抑菌活性,但其在盆栽试验中防效低于 YN201448,表明拮抗细菌对环境的适应性直接影响到其对有害生物的控制效果[21],即拮抗菌对烟草黑胫病菌的拮抗能力并不等同于防治能力,因此筛选拮抗菌时应采用平板对峙与温室防效及田间试验相结合的方法。

4 结 论

本研究从烟草中分离获得 478 株内生细菌,其中有 13.60%在平板上对烟草黑胫病菌有抑制作用,四株内生细菌在盆栽试验中表现出较好的防病效果,且具有促生作用。本研究通过室内筛选、盆栽试验和漂浮育苗试验,筛选到1株对烟草黑胫病有较好防治效果且显著促生作用的解淀粉芽孢杆菌YN201448,展现出了用于种子包衣、制作烟草漂浮育苗基质和微生物肥料及药剂的应用前景。在盆栽试验中,它对黑胫病的防治效果达 69.24%。特别值得一提的是,烟苗是处在高接种菌量和有利于发病的接种室中,在田间条件下,病菌孢子量不可能达到 104个/mL 剂量。然而,YN201448 在田间控病效果还有待进一步验证。

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Screening, Growth Promotion, and Disease Control of Antagonistic and Endophytic Bacteria in Tobacco

YANG Zhenfu1, WU Yixin2,3, CHEN Yinglan4, HE Yueqiu1,2*
(1. National Engineering Center for Applied Techniques of Agricultural Biodiversity, Yunnan Agricultural University(YAU), Kunming 650201, China; 2. College of Agronomy and Biotechnology, YAU, Kunming 650201, China; 3. National and Local Joint Engineering Research Center for Screening and Application of Microbial Strains, Kunming 650217, China; 4. Extension Station of Agricultural Techniques, Luquan County, Luquan, Yunnan 651500, China)

To obtain stable bacterial strains with good growth promotion of tobacco and black shrank disease control effect, 478 endophytic bacterial strains were isolated from tobacco leaves and stems. Among them 65 of strains ( accounting for 13.60%) could inhibit Phytophthora parasitica var. nicotianae by the traditional methodology. Especially, the four strains, YN201408, YN201442, YN201448 and YN201458 inhibited 63.85%, 60.82%, 64.72% and 76.07% of mycelia growth of the pathogen and controlled 68.24%, 65.47%, 69.12 and 41.40% of disease severity by soaking the seedling root in 1.0×107cfu/mL of the bacterial suspension for 30 min and drenching once after transplanting in the pot experiment in the greenhouse, respectively. YN201448 could promote seed germination and growth of tobacco, showing 10.95%, 29.31% and 67.24% higher than water control in germination rate, seedling height during 5-6 leaf stage and fresh weight on the ground. YN201408, YN201442 and YN201448 were classified into Bacillus amyloliquefaciens, and YN201458 into Pseudomonas aeruginosa based on their morphology, physiological and biochemical traits and 16S rDNA sequences. YN201448 showed good potential for application based on its growth promotion and disease control effect.

tobacco; Phytophthora parasitica var. nicotianae; Bacillus amyloliquefaciens; biocontrol; growth promotion

S572.08

1007-5119(2014)06-0048-06

10.13496/j.issn.1007-5119.2014.06.010

科技部国际科技合作项目(2009DFA32360);昆明市科技局项目(09H130301)

杨珍福,女,硕士研究生,主要从事植物病理学研究。E-mail:ynjcyzf152@126.com。*通信作者,E-mail:ynfh2007@163.com

2014-04-21

2014-08-13

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