生物医学期刊ePub3的应用展望*

■邹 强 袁 庆 康 林 盛晓阳 王永武

1）上海交通大学医学院附属新华医院，上海市儿科医学研究所 《临床儿科杂志》编辑部，上海市控江路1665号 200092，E-mail：zooqiang@126.com

2）《中华健康管理学杂志》编辑部，北京东四西大街42号 100710，E-mail：yuanqing@cma.org.cn

3）《外科研究与新技术》编辑部，上海市普陀区新村路389号 200065，E-mail：wangyongwu993@sohu.com

2011年10月，第63届法兰克福书展上国际数字出版论坛（International Digital Publishing Forum，IDPF）发布了全新的数字出版技术——ePub3。这一被视为出版变革的重要技术，是否能再次改变整个出版行业，对生物医学期刊出版有何影响，是生物医学期刊出版人关心的问题。

1 新的焦点

法国阿歇特出版集团（Hachette Livre）是该标准的坚定支持者，其数字出版部主任Luc Adrain则参与了该标准的起草和编辑等工作。该集团的电子出版物也全面支持这一新的电子书标准。在2013年4月伦敦书展上，麦克米伦（Macmillan）旗下的MPS有限公司与英格拉姆内容集团（Ingram Content Group）下属公司VitalSource Technologies就采用ePub3格式标准达成了协议。同时，该格式得到了多家著名互联网公司的支持，如开放平台的坚定支持者——Google、排版软件巨头——Adobe等。拥有300多家会员单位的美国出版商协会（The Association of American Publishers）也宣布支持 ePub3［1］。

但ePub3没有获得所有网络阅读器生产商如亚马逊、KOBO和索尼等公司的支持，在 iOS和Android系统上它们的应用软件没有支持该标准。在IDPF的成员内也未找到微软的身影［2］。而现有的技术CSS3与HTML5是ePub3的潜在替代者，因为该类型电子出版物同样也可以在 PC、MAC、Android和iOS上任何一种浏览器上进行阅读，而不需要采用专门数字阅读应用软件。目前，ePub3的大部分功能都没有得到主流阅读软件的支持。

在生物医学领域，2012年12月11日，BioMed Central（BMC）通过其官方博客宣布，在今后的论文将增加对ePub格式的支持，并附上了一篇以ePub3格式呈现的论文截图［3］。作为生物医学信息的领导者，美国国立医学图书馆（National Library of Medicine，NLM）下属的生物技术信息中心（National Center for Biotechnology，NCBI）其开发的开放获取期刊平台PubMed Central（PMC）发布了基于全新的HTML5和 CSS3技术的PubReader—— PMC全新的呈现样式［4］。 同时也推出了 ePub（beta），目前为ePub的测试版，以期通过HTML5与ePub互补，完善对数字出版各类主流格式的支持。在2013年的期刊文档标签套件（The Journal Article Tag Suite，JATS）大会上，Dean［5］介绍了如何将 NLM DTD自动转换为ePub3，相信NLM很快将在其PMC开放获取平台上正式推出基于ePub3格式的全文免费论文。

2 新的传播模式及格式规范

一个ePub3文件其实是一个压缩文档（通过解压缩工具打开），包含了一本书的所有内容：元数据、文字、图片、各种媒体素材等［6］。也可以简单地把ePub3理解成一个封装好的、打好包的网站。这样既可以满足读者在线阅读的要求，又能满足读者下载收藏的需求［7］。

ePub3规范定义了一套建立XHTML内容文件。ePub3 元数据是 XML，ePub3 内容是 XHTML［8］。ePub3规范所定义的XHTML文件类型符合W3C的HTML5规范。XHTML文件类型皆继承所有来自HTML 5的语义、结构和处理行为。也就是说ePub3兼容HTML5。此外，ePub3规范为W3C HTML5文件类型定义了一组扩展，让程序员可以将这些扩展纳入XHTML内容文件之中［8］。

3 新的特性

3.1 对多媒体的支持

在HTML4.0时代，如果想要在网页中嵌入音频、视频文件，必须使用第三方插件，比如 Flash Player。其代码复杂，且与浏览器等兼容性等问题，一直是广为诟病的问题［9］。ePub3引入 Trigger元件（符合HTML 5标记）将音频、视频内容可以嵌入到电子书文件中，包含了所有触发该事件时所要执行的动作（允许值：show|hide|play|pause|resume|mute|unmute等）。生物医学期刊，如外科等涉及到具体手术操作等技术，特别是三维立体的介入技术、内镜技术等，传统的图文已很难对此做出清楚描述，更无法有效的呈现。此时引入动态视频和解说，将内容很好的呈现给读者，可以让读者充分领会作者的意图。

3.2 对数学公式的支持

在ePub3中增加了对数学置标语言（mathematicalmarkup language， MathML）的支持，一种基于XML，描述数学符号，捕捉其结构和内容的语言［5］。在生物医学期刊中经常会遇到各种数学公式，在进行期刊的数字化过程中，对数学公式的处理往往是将其转换为图片格式，处理繁琐且损失了其原始的矢量特性。增加了对该语言的支持ePub3可以像处理文本一样处理数学公式，使数字化出版更便捷。

3.3 对内嵌字体的支持

ePub3同时支持OpenType和Web开放字体格式（web open font format，WOFF），以满足传统印刷版排版和网页排版。对于生物医学期刊来说，加入全文数据库，提高文献的被引次数，是其编辑出版最重要的工作之一。期刊的出版，既要保证印刷版的按时出版，又要保证期刊全文电子版内容的及时上线。同时对OpenType和WOFF的支持，将免去二次排版，减少重复劳动。

3.4 对矢量图形的支持

传统的点阵图可以很好的适应传统纸质出版的需求，然而在高分辨率触摸屏时代，亟需一种更好的阅读体验的图像格式。可伸缩矢量图形（scalable vector graphic，SVG）作为一种矢量图像图形网络标准发布推出后，受到了空间位置信息领域的关注［10］，其提供了目前网络流行的GIF和JPEG格式无法具备的优势：1）可以任意放大图形显示，但绝不会以牺牲图像质量为代价；2）可在SVG图像中保留可编辑和可搜寻的状态；3）比JPEG和GIF格式的文件要小很多，因而有下载优势。对于生物医学期刊中的DNA模型、蛋白质组、药物的分子结构等，已经很难用点阵图来描述了，SVG这一矢量运算的图形可以很好地解决这一问题。Etherington等［11］详细描述了SVG这一开发的标准，在生物信息领域，应用前景广阔。

3.5 对元数据（metadata）的支持

元数据为描述数据的数据（data about data），主要是描述数据属性（property）的信息，用来支持如指示存储位置、历史数据、资源查找、文件记录等功能。ePub3中元数据主要用于对文献的标识，以便馆藏的需要。有了对元数据的支持，生物医学期刊所发布的文献，在数据库中可以更好地被利用。

4 ePub3与HTML4.0、PDF的比较

ePub3与HTML4.0、PDF均是目前互联网出版物比较流行的格式，其技术的比较见表1。

5 新的挑战

5.1 新的销售和营销模式

通过将JavaScript嵌入到ePub3电子书中，将支持起像桌面互联网那样的广告生态系统，理论上说，可以在任何时间利用电子书中的某个空间嵌入广告。而对于生物医学期刊来说，是否符合国家工商总局《药品广告审查发布标准》呢？而这样的互联网广告是否对传统印刷期刊广告造成冲击呢？

5.2 新呈现方式

ePub3将在浏览器、本地应用程序中呈现，并且可以推广到不同尺寸的屏幕上。可以实现“一份内容，多次发布”。随着平板电脑和智能手机普及率的不断提高，读者将期待更丰富的功能。其对于生物医学文献内容的呈现是否能为读者带来创新性的改变？

表1 ePub3与HTM L4.0、PDF技术的比较

5.3 新的工作流程

作为全球最大的生物医学期刊开放获取平台之一的PMC，正积极为ePub3的出版工作流程努力着［5，12］。 美国生物技术信息中心（National Center for Biotechnology，NCBI）于 2012年 8月发布了JATS——一组集XML元素、期刊文献标记属性、三种DTDs的标准［13］，并成为美国国家标准（NISO Z39.96-2012）。有了这一标准，可以很好的为生物医学期刊的数字化服务，从HTML4到HTML5、从PDF到ePub。而国内的生物医学期刊如何紧追期刊数字化出版的步伐，应尽快完成基于结构化排版的生产流程再造［14］。目前上海医学期刊数字化平台正在加紧建设，这一平台可以让各成员期刊以开放获取（OA）宗旨，基于XML排版，继而提供多种数字化出版。然而目前尚缺乏一套与我国国情相适应的XML标准。

5.4 高额的开发费用

虽然ePub3“一份内容，多次发布”的特性得到了出版商的欢迎，但是，作为出版界的新技术，对于许多开发者来说还不是一个常规的技能，人才存在一定短缺。如果建立一个开发团队，对于我国生物医学期刊编辑部来说，是很难实现的；而对此进行产品外包，其费用又是想当昂贵的。如果真如Dean［5］所说，将来可以实现将 JATS自动化转化为ePub3，这将带领生物医学期刊的数字化出版又向前迈出了一大步。

6 结语

ePub3是一种新兴的数字化出版标准，在生物医学领域，也有多家机构纷纷加入尝试。在这新的发展契机中，我国的生物医学期刊应尽快建立和（或）引入一套符合中国国情的JATS，并以此标准为基础开发出多种数字化出版的文献类型，以适应数字化出版发展潮流。

1 The Association of American Publishers.EPUB 3 Implementation Project White Paper Now Online［EB/OL］.［2013-11-20］.http：//publishers.org/press/117/

2 International Digital Publishing Forum.ePub3 Overview［EB/OL］.［2013-04-28 ］.http：//www.idpf.org/epub/30/spec/epub30-overview.html

3 BioMed Central blog.BioMed Central now publishes in ePUB format［EB/OL］.http：//blogs.biomedcentral.com/bmcblog/2012/12/11/biomed-central-now-publishes-in-epub-format/

4 National Center for Biotechnology Information.New in PMC［EB/OL］.［2013-04-28］.http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/about/new-in-pmc/day26

5 Dean M.The Challenges and Benefits of Automating NLM-to-ePub3 File Conversion ［M/OL］.［2013-11-20］.http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK159966/

6 施勇勤.ePub3格式对我国电子书标准制定的启示.国际交流，2012，（2）：78-83

7 Idan O.EPUB3 vs.HTML5 ［EB/OL］.［2013-08-02］.http：//www.heliconbooks.com/article/epub3vshtml5

8 International Digital Publishing Forum.EPUB Content Documents 3.0 ［EB/OL］.［2013-04-28］.http：//www.idpf.org/epub/30/spec/epub30-contentdocs.html

9 刘华星，杨庚.HTML5— —下一代Web开发标准研究.计算机技术与发展，2011， 21（8）：54-62

10 陈春芳，李岩.基于SVG的空间定位模型.计算机工程，2009，35（24）： 268-273

11 Etherington GJ， Maclean D.SVGenes： a library for rendering genomic features in scalable vector graphic format.Bioinformatics，2013， 29（15）：1890-1892

12 Kelly L.JATS to EPUB： Unraveling the Mystery［M/OL］.［2013-08-02］.http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK47314/

13 JATS.Main Page［EB/OL］.［2013-04-28］.http：//webservices.itcs.umich.edu/mediawiki/jats/index.php/Main_Page

14 刘冰，游苏宁.我国科技期刊应尽快实现基于结构化排版的生产流程再造.编辑学报，2010，22（3）：262-266