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中国荷斯坦牛IL8基因SNP-233(G>A)不同基因型的表达差异研究

2013-08-04陈仁金王珍珍杨章平毛永江冀德君朱孝荣

中国牛业科学 2013年6期
关键词:基因型定量乳房

陈仁金,王珍珍,杨章平,毛永江,冀德君,朱孝荣

(1.徐州医学院实验动物中心,江苏 徐州 212004;2.徐州医学院神经生物学研究中心,江苏 徐州 212004;3.扬州大学动科学院,江苏 扬州 22500)

乳房炎是奶牛最常见的疾病之一,在世界范围内造成了巨大的经济损失,研究者尝试许多方法用于控制这种复杂的疾病,包括改进牧场的管理、对干奶牛进行抗生素治疗、注射疫苗和监控临床乳房炎等。随着分子生物技术的发展,用生物技术手段来预防和控制乳房炎成为热点之一。

IL-8自发现以来,成为在趋化性细胞因子中是一个比较活跃的研究领域,各种非特异性炎症的病理发生过程中频繁地有IL-8的参与,以及IL8基因易于受到外界的刺激而被激活,因此IL-8可能在炎症、免疫反应和机体防御反应中具有广泛的作用。对于IL-8在人类上研究较多[1-3],而与奶牛疾病方面的研究最近几年越来越受关注。IL-8易于受到外界的刺激而被激活,已研究证明IL-8蛋白和mRNA的表达与奶牛乳房炎有密切的联系[4]。当牛乳房受感染后,IL-8能诱导宿主防御系统抵抗病菌的侵入,同时IL-8会大量聚集。IL8基因的表达量也显著增加[5-7]。研究发现IL8基因-233(G>A)和2789(A>G)&2862(T>C)位点对SCS显著相关;了探索该位点不同基因型个体在血液中的表达差异,对该位点形成的不同基因型个体荧光定量PCR分析。对IL8基因的抗病机理进行初步探索,为奶牛抗乳房炎性状候选基因的研究积累基础分子数据。

1 材料与方法

1.1 实验动物

选取扬大牧场健康的中国荷斯坦牛30头。胎次在2~3胎,处于泌乳中期。保证IL8基因各个基因型10头。尾静脉采血,ACD抗凝剂,新鲜血样提取RNA,提取的RNA-70℃保存。

1.2 引物设计

根据用于荧光定量的目的基因IL8基因的mRNA序列(GenBank:NM_173925)设计引物,内参基因β-actin引物根据 mRNA序列(GenBank:AY141970)设计。引物由上海生工生物工程有限公司合成。引物见表1。

表1 荧光定量PCR引物

1.3 RT-PCR

反应过程参照TaKaRa RNA AL PCRTMKit(AMV)反转录试剂盒使用说明,按步骤进行。将血液中总RNA作为模板在灭菌的0.2mL PCR离心管中依次加入以下组分的样品。反转录体系为20 μL(反应液在冰上配制):在0.2mL的PCR管中加入1μg的总RNA,Oligo dT Primer 1μL,5×PrimeScriptTMBuffer 4μL,Random primers 1μL,PrimeScriptTMRT Enzyme Mix I 1μL,加 RNase Free dH2O至总体积为20μL。将加好试剂的PCR管瞬时离心后放在PCR仪上进行反应。反转录条件如下:37℃15min(反转录反应)85℃5sec(反转录酶的失活反应)所得产物即为cDNA,-20℃保存备用。

1.4 实时荧光定量PCR

采用SYBR GreenⅠ染料法进行荧光定量,荧光定量PCR体系为20μL:

以上步骤均为冰上操作,每个样本设三个重复。

荧光定量PCR扩增程序:95℃预变性1min;95℃变性30s,60℃退火15s,72℃延伸34s(data collection),40个循环;为分析扩增产物的特异性,PCR扩增结束后采集多个信息点进行溶解曲线分析,程序为:95℃ 15s,60 ℃ 1min;95 ℃ 15s,60℃15s。

1.5 统计软件与方法

Primer Premier 5.0,SPSS11.0统计分析软件荧光定量计算采用2-△△CT方法[8]。

2 结果与分析

2.1 RNA的提取

RNA提取结果见图1总RNA经1%琼脂糖凝胶电泳检出3条亮带,从上到下分别为28s,18s和5s,说明提取的RNA完整性良好,无明显降解,其OD260/OD280在1.8左右,纯度较高,可用于后续的实验。

2 结果与分析

2.2 IL8基因突变位点3种基因的相对定量表达分析

IL8基因-233(G>A)位点的突变产生3种基因型。AA、AG和GG 3种基因型在血液中的荧光定量的△CT见表2,GG基因型的△CT极显著低于AA和AG基因型(P<0.01)。GG基因型的相对表达量极显著高于AA和AG基因型(P<0.05)(图2)。

图2 IL8基因-233(G>A)位点不同基因型的表达量

表2 IL8基因-233(G>A)位点不同基因型个体的△CT和RQ值

3 讨论

IL8是一种重要的趋化因子,具有刺激中性粒细胞、淋巴细胞发生趋化游走,介导细胞在炎症部位聚集、活化以及修复损伤的组织等功能[9]。然而,这些作用必须通过其与相应受体(interleukin-8receptor,IL8R,即CXCR)结合并借助信号转导来实现[10]。在大肠杆菌感染引起的乳房炎的奶中,IL-8含量显著增加[11,12]。在金黄色葡萄球菌感染的奶牛乳房炎泌乳物中,能检测到IL-8趋化活性,但在非乳房炎泌乳物中没有此活性[13]。所以在乳房炎发生时,IL-8诱导激发中性粒细胞时起着重要的作用。

对于IL8基因的-233(G>A)位点,GG基因型的表达量显著高于其它两种基因型(P<0.05),所以GG基因型有较强的乳房炎抗性。233(G>A)位点位于IL8基因的5′侧翼区,该突变可能影响该基因表达调控,结果显示,突变使该基因的表达量下降。对于其机理,需要进一步进行分析研究。

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