鸭流感病毒HA基因遗传变异分析
2012-11-20马德明解观增杨志隆河北省故城县畜牧水产局河北衡水253800庄燕飞常维山山东农业大学动科院山东泰安
马德明 解观增 杨志隆 (河北省故城县畜牧水产局 河北 衡水 253800) 庄燕飞 常维山 (山东农业大学动科院 山东 泰安)
鸭流感病毒HA基因遗传变异分析
马德明 解观增 杨志隆 (河北省故城县畜牧水产局 河北 衡水 253800) 庄燕飞 常维山*(山东农业大学动科院 山东 泰安)
本文根据近年来中国医学机构发表的分离自我国鸭群的流感病毒HA基因,与我国正在使用的流感疫苗等毒株的HA基因进行了遗传进化分析。结果显示,目前我国流行的鸭流感病毒与H5N1 Re-5最接近,但是也有一定程度的变异。
鸭流感病毒 血凝素基因 遗传变异
引起鸭发病并造成损失的流感病毒以H5亚型毒株最为常见,一般小鸭比老鸭易感。健康鸭接触病鸭或被病毒污染的饲料、设备、运载工具、蛋筐、衣物、鞋帽等就会感染发病,并迅速传播开来。该病一年四季均可发生,但以每年冬季至次年初夏多发,特别是气候骤变、寒流过后或阴雨连绵的天气最易暴发。该病传播极快,在数天内即可蔓延到邻近鸭场。单纯鸭流感死亡率很低或无死亡,多因继发感染而导致死亡,但是近年来单纯鸭流感病毒感染也可造成严重的损失。本文分析了两株我国医学机构发表的分离自我国鸭粪便和圈养鸭群的流感病毒HA基因与我国正在使用的禽流感疫苗等毒株的HA基因的进行了遗传变异分析。
1 材料与方法
1.1 基因来源 见表1。
表1 基因来源
注:CY098790由中国疾病预防与控制中心分离[1],JN646713由杭州某医院分离[2], GU596984由扬州大学分离[3]。
1.2 同源性比较与进化树分析 将表1中病毒序列从GENBANK上下载,利用DNAStar软件比较同源性、制作进化树。
2 结果
2.1 鸭流感病毒HA基因同源性比较 近年我国来分离的鸭流感病毒与其他流感病毒HA基因同源性比较,见表2。
表2 近年来分离的鸭流感病毒与其他流感病毒HA基因同源性比较
由表2可以看出2009年分离的CY098790与Re-5的HA基因的同源性为97.3%;2011年分离的JN646713与Re-5的同源性为94%。
2.2 鸭流感病毒HA基因遗传进化树 近年我国来分离的鸭流感病毒与其他鸭流感病毒HA进化关系,见图1。
图1 鸭流感病毒HA基因遗传进化树
由图1可以看出,2009年分离的CY098790与Re-5和2008年分离的GU596984可聚为同一支,2011年分离的JN935004与CY098751为另一支,Re-1和Re-4与上述毒株相距更远。
3 讨论
近年来,国内兽医领域鲜有鸭高致病性禽流感病毒的研究报告。我国目前使用的H5N1 Re-4、H5N1 Re-5疫苗原始毒株都是2006年分离的[4],距今已6年,本文证明在此期间我国流行的H5N1已发生了一定程度的变异。
根据遗传进化树图可知,2009年以前分离的鸭流感病毒可与Re-5分为一支,2011年分离的鸭流感病毒与目前使用的三株疫苗毒株H5N1 Re-1,Re-4,Re-5亲缘关系都有一定距离,虽然与Re-5亲缘关系相对较近,但是已不属于同一家族。有鉴于此,我国疫苗研发部门应尽快推出新的鸭用流感(H5N1)疫苗。
[1] Xiu-Feng Wan,Libo Dong,Yu Lan,et al.Indications that Live Poultry Markets Are a Major Source of Human H5N1 Influenza Virus Infection in China. J Virol. 2011,85(24): 13432–13438
[2] Hai-Bo,W., Chao-Tan,G., Ru-Feng,L.,et al.Characterization of a highly pathogenic H5N1 avian influenza virus isolated from ducks in Eastern China in 2011. Arch. Virol. 2012,157(6): 1131-1136
[3] 顾敏, 刘文博, 曹军平等. 1株含H9N2内部基因的H5N1亚型基因重配禽流感病毒的全基因测序及遗传进化分析[J]. 病毒学报, 2010, 26(4): 298-304.
[4] 田国彬, 曾显营, 钟功勋等. H5N1亚型禽流感变异株灭活疫苗种毒Re-4株的生物学特性及免疫原性研究[J]. 中国预防兽医学报, 2009, 31(9): 717-720.
(2012–07–29)
S834.2
A
1007-1733(2012)08-0014-02