样本量估计及其在nQuery和SAS软件上的实现*——相关分析
2012-09-07周立志姚阿玲陈平雁
周立志 姚阿玲 陈平雁
样本量估计及其在nQuery和SAS软件上的实现*
——相关分析
周立志1姚阿玲1陈平雁2△
*:教育部重点课题(DIA070113)资助
1.南方医科大学公共卫生与热带医学学院生物统计学系2008级本科生
2.南方医科大学公共卫生与热带医学学院生物统计学系
△通信作者
4.相关分析
4.1.单样本相关性分析
4.1.1.差异性检验
4.1.1.1.kappa 系数检验(二分类变量)
方法:Donner和 Eliasziw(1992)〔1〕给出的单样本二分类变量kappa系数双侧检验的样本量估计方法,是建立在自由度为1,非中心参数为λ(1,1-β,α)的非中心χ2分布上的,其样本量的计算公式为:
式中,π为研究对象被判为阳性的概率,κ0为原假设kappa系数,κ1为备择假设kappa系数。在自由度为1的情况下,非中心参数λ(1,1-β,α)近似等于(Z1-α/2+Z1-β)2,在计算样本量时,将其代入(4-1)进行计算。
例4-1 某项研究欲评价影像(CT)诊断和病理切片诊断对恶性肿瘤诊断的吻合程度。已知病理切片对恶性肿瘤诊断的阳性率为65%。若CT诊断与病理切片诊断的吻合度达0.6以上为临床有效,即κ0=0.6,根据预试验结果,两者的kappa系数为0.8,则假设κ1=0.8。试估计检验水准为α=0.05,检验效能为1-β=90%,双侧检验欲验证CT诊断临床有效所需的样本量。
nQuery Advisor 7.0实现:设定检验水准α=0.05;双侧检验,即s=2;检验效能取1-β=90% 。其他数据相应代入。
在nQuery Advisor 7.0主菜单选择:
Goal:Make Conclusion Using:⊙Agreement
Number of Groups:⊙One
Analysis Method:⊙Test
方法框中选择:Kappa(binary outcome)。
在弹出的样本量计算窗口将各参数键入,如图4-1所示,结果为n=184。即本试验所需的最少样本量为184例。
图4-1 nQuery Advisor 7.0关于例4-1样本量估计的参数设置与计算结果
SAS9.2软件实现:
SAS运行结果:
图4-2 SAS9.2关于例4-1样本量估计的参数设置与计算结果
4.1.1.2.相关系数检验(连续变量)
方法:Dixon和Massey〔2〕给出的两连续变量相关系数检验的样本量估计方法,是基于大样本近似正态分布理论上的,其样本量的计算公式为:
例4-2 某临床试验欲验证一款新研发的血气分析仪的临床有效性。根据美国国家临床实验室标准化委员会制定的CLSI EP9-A2标准,试验仪器与阳性对照仪器的检测结果的相关系数不得低于0.975。预期本试验的相关系数为0.982以上。试估计检验水准为α=0.05,检验效能为1-β=80%,单侧检验欲验证本款血气分析仪临床有效所需的样本量。
nQuery Advisor 7.0实现:根据题意,ρ0=0.975,ρ1=0.982,检验水准 α =0.05,s=1,检验效能取1-β =80%。
在nQuery Advisor 7.0主菜单选择:
方法框中选择:Correlation coefficient(continue outcome)。
在弹出的样本量计算窗口将各参数键入,如图4-3所示,结果为n=228,即本试验所需的最少样本量为228例。
图4-3 nQuery Advisor 7.0关于例4-2样本量估计的参数设置与计算结果
SAS9.2软件实现:
SAS运行结果:
图4-4 SAS9.2关于例4-2样本量估计的参数设置与计算结果
4.1.1.3.Lin和谐系数检验(连续变量)
方法:Lin和 Hedayat等(2002)〔3〕给出的两连续变量Lin和谐系数检验的样本量估计方法,是基于大样本近似正态分布理论上的,其样本量的计算公式为:
式中,ρc0为原假设和谐系数,η0为原假设方差;ρc1为备择假和谐系数,η1为备择假设方差。原假设及备择假设下的和谐系数及其方差按如下公式计算:
式中,ρm为直线相关系数为尺度比(Scale ratio),m=0表示原假设条件下的参数,m=1表示备择假设条件下的参数。
例4-3 某研究欲研发一种自动测量血压的仪器,以取代人工测量血压。研发时要求自动测压仪与人工测压的直线相关系数为0.8,均差(mean difference)为0.15,尺度比(scale ratio)为1.15。预试验测得两者直线相关系数为0.9,均差为0.20,尺度比为1.05。若想在检验水准为α=0.05,检验效能为1-β=90%的水平上,经双侧检验得到Lin和谐系数有统计学差异的结论,试估计样本量。
nQuery Advisor 7.0实现:设定检验水准 α=0.05;双侧检验,即s=2;检验效能取1-β=90% 。其他数据相应代入。
在nQuery Advisor 7.0主菜单选择:
Goal:Make Conclusion Using:⊙Agreement
Number of Groups:⊙One
Analysis Method:⊙Test
方法框中选择:Lin's concordance coefficient(continuous outcome)。
这里,和谐系数及其方差项可通过辅助计算获得。在菜单栏中选择:
Assistants:⊙Compute Effect Size
在弹出的计算窗口将各参数键入,如图4-5所示,结果为c0=0.74,v0=0.84;c1=0.82,v1=0.77(结果保留两位小数)。
图4-5 nQuery Advisor 7.0关于例4-3样本量估计的参数计算结果
点击Transfer按钮后将参数结果传送至主菜单,再键入其他参数,如图4-6所示,结果为n=208。即本试验的最少样本量为208例。
SAS9.2软件实现:
图4-6 nQuery Advisor 7.0关于例4-3样本量估计的参数设置与计算结果
N〔label=“n”〕;end;finish AOT2;run AOT2(0.05,90,2,0.80,0.15,1.15,0.90,0.20,1.05);quit;SAS运行结果:
图4-7 SAS9.2关于例4-2样本量估计的参数设置与计算结果
(致谢:我们在此感谢nOuery Advisor软件全球供销商“爱尔兰Statistical Solutions有限公司”为本研究提供的支持和帮助。)
1.Donner A,Eliasziw M.A goodness-of-fit approach to inference procedures for the kappa statistic:confidence interval construction,significance-testing and sample size estimation.Statistics in Medicine,1992,11:1511-1519.
2.Dixon WJ,Massey FJ.Introduction to Statistical Analysis.4th Edition.New York:McGraw-Hill,1983.
3.Lin L,Hedayat AS,Sinha B,et al.Statistical methods in assessing agreement:models,issues,and tools.Journal of the American Statistical Association,2002,97:257-270.
(责任编辑:郭海强)