APP下载

铅对烟草种子萌发影响的Meta分析.

2012-05-25成剑波李云平杨志敏陈玉成

中国烟草科学 2012年4期
关键词:培养皿体长异质性

成剑波,肖 琳,李云平,杨志敏*,陈玉成

(1.三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆 400715;2.西南大学资源环境学院,重庆 400716;3.重庆市烟草公司巫山分公司,重庆 404700)

数据挖掘能识别隐藏于数据间和数据中的宝贵信息[1]。Meta analysis(或称整合分析、二次分析等)作为一种有效的数据挖掘方法[2],现已广泛用于社会科学、医学、经济学和生态学等领域,如对各种生态效应的研究[3]。它将不同的统计学定量法组织到同一架构中,可完成某一领域不同研究成果的定量概化[4]。目前,Meta分析往往用于多个同类研究的结果的定量总结(宏观),如某领域的文献综述,其用于单个研究的结果的定量表达鲜有报道(微观)。笔者通过Meta分析重金属对作物种子萌发的影响,以实现Pb2+对烟草种子萌发的影响的定量化和概化,探究 Meta分析在研究重金属对作物生长发育影响中的微观应用。

1 材料与方法

1.1 供试材料

试验所用烟草种子为中国烟草总公司重庆市公司提供的K326,所用的外源重金属Pb为实验室配制的Pb(NO3)2溶液。

1.2 试验方法

将约1 cm厚的脱脂棉平铺于18个直径9 cm的培养皿内,再将滤纸铺在脱脂棉上,按每个培养皿40粒种子的标准,将种子均匀分布在各个培养皿内。将培养皿均分为C0、C1、C2、C3、C4、C56组,其对应的 Pb2+浓度分别为0、0.2、0.5、1.0、3.0、5.0 mg/L;将培养皿置于恒温箱中,在23 ℃、80%的相对湿度和13 h/d的光照条件下,定期加入纯水(C0组)和Pb2+溶液,以保持培养床的湿润状态;从种子萌芽时(第 11天)开始,每天记录每个浓度的3个平行样本CX1、CX2和CX3的已发芽总数;于第 20天量取已发芽种子的根长和茎长并结束试验。

1.3 Meta分析方法

Meta分析实为一类数学和统计学方法的多层次组织方式,其作用因方法和方法组合方式不同而不同,且实用范围广。因此,它本身也是一项研究,需要认真设计[5]。一般地,Meta分析通过效应指标量化研究结果(数据)所含的规律,通过加权整合概化同类研究的不同结果,进而较直观简略地表达客观规律。上述过程存在着效应指标的选择、各待整合效应间异质性的分析、效应整合方式的选择等主要环节,同时也隐含着偏性等问题。现有 lnR、Hedges's d、risk ratio等指标和 RevMan、Stata、CMA等软件可帮助完成Meta分析。基于发芽数、根长、茎长和体长(叶除外)数据,为表征Pb2+对种子萌发过程(萌芽+发育)的影响,本研究在计算 Pb2+组对比纯水组而得到的分效应e(lnOR和lnR)后,借助CMA[6]整合了分效应e得到了综合效应E。以本试验为例,视加Pb2+液为处理,加纯水为对照[7],简介本文涉及的效应指标机会odds、机会比OR和响应比 R[6]:odds = n已萌芽/n未萌芽,可表现出某环境下种子萌芽相对不萌芽优势或萌芽的机会;OR =oddsT/oddsC,可表现出Pb2+液对萌芽机会的影响;可表现出 Pb2+对根发育(或茎发育、体长)的影响。在表征萌发过程时,之所以纳入体长,是因为:(1)虽单粒种子的体长 = 根长+茎长,但数据预处理会丢掉各数据组的离群值和异常离群值,则单粒种子的根长、茎长和体长不一定同时被采纳,故大量种子的体长 ≠ 根长+茎长;(2)相对于根、茎长,体长更能反映种子对包衣营养物质的吸收和转化能力;(3)从更多角度去分析结果,可更客观地还原试验过程。在量化Pb2+液的影响时,之所以未直接使用OR和R而采用lnOR和lnR,是因为[7-9]:(a)对数化指标能平等反映正效应和负效应,如发芽机会增至100倍或减为1/100其效应大小均为4.6;(b)对数化指标能等效反映T和C而不偏重任一方,对数化前,若分子/分母变为(分子×100)/分母则该变化效应值为﹢99(由 100-1算得),若变为分子/(分母×100)则该变化效应值仅为-0.99而非-99,对数化后,两种变化的效应大小均为 4.6;(c)由比值型指标得到的效应值构成的小样本为偏分布而非正态分布,对数化后的样本会更接近正态分布,对客观规律更具表征力。

Pb2+在每个浓度处对种子萌芽影响的计算过程分 3步:(1)在 CMA中,视加 Pb2+液为 T处理;加纯水为 C处理,选用 lnOR从 10个时间尺度(10~19 d)计算 3个培养皿的发芽总数数据(图1a),得到分效应e10~e19;(2)在CMA中判定分效应间的异质性[10];(3)结合异质性判定结果,用CMA的随机模型将同质分效应整合为综合效应E。Pb2+在每个浓度处对种子萌发(根发育、茎发育或体长)影响的计算过程分5步:(1)用SPSS分别丢掉3个培养皿的长度数据中的离群值和异常离群值;(2)视加Pb2+液为T处理,加纯水为C处理,为每个培养皿设计3个对比(图1b);(3)根据式1和2[7],用Excel算出3×3个分效应e1~e9(lnR)及其误差(νlnR);(4)在CMA中判定分效应间异质性[10];(5)用CMA的随机模型将同质分效应整合为综合效应E。

图1 种子萌发中Pb2+所产生效应的构造Fig.1 Calculation design for quantifying Pb2+ effect on seeds bourgeon

2 结果与讨论

2.1 Pb2+对烟草种子萌芽的影响

0.2 和0.5 mg/L的各分效应组均无异质性,1、3和5 mg/L的各分效应组的I2均在25%~50%之间属中度异质(表1),说明对各组e10-e19的整合均有效,所得的E均能表征Pb2+对种子萌芽的影响。每个E的95%CI的上限都小于0,表明各浓度 Pb2+液均能降低种子萌芽的机会,能明显抑制并推迟种子萌芽(表1和图2)。在(0,1.5 mg/L)内,抑制作用随浓度增加而快速增大。在1.5 mg/L处,抑制作用升至最大,效应值达到-1.58。在(1.5,5.0 mg/L)内,抑制作用缓慢回落至较稳定水平,效应值定在-0.8左右,但仍比0.2 mg/L大80%。

表1 Pb2+对种子萌芽的影响Table1 Pb2+ effect on seed germination

图2 Pb2+对种子萌芽的影响Fig.2 Pb2+ effect on seed germination

2.2 Pb2+对烟草种子发育的影响

各浓度3个效应组I2均低于50%,说明各效应组均无显著异质性,对各组e1-e9的整合均有效,所得的E均能表征Pb2+对种子发育的影响(表2)。

根的响应均为负,表明各浓度Pb2+溶液均会抑制根的发育(表2和图3a)。所有浓度(除0.2 mg/L外)的响应上限均小于 0,说明它们对根的发育有明显的抑制作用。从0.2 mg/L开始,抑制作用增强。到0.7 mg/L处,响应变为-0.8,抑制作用达到较大水平。在随后的浓度翻倍后,响应减为-0.3。在随后的浓度再翻倍后,抑制作用再次增大。3 mg/L后,抑制作用继续增大但增速变缓。故认为0.7 mg/L和1.5 mg/L为抑制作用的拐点。

各浓度Pb2+溶液对茎的发育均有明显的抑制作用,抑制作用的变化在不同浓度区间差异较大(表2和图 3b)。经过 0.2~0.7 mg/L后抑制作用增加109.68%,而经过0.7~5.0 mg/L后抑制作用仅仅增加17.85%。到0.7 mg/L处,响应为-0.33,抑制作用较大。到5 mg/L响应为-0.38,抑制作用最大。

体长的响应趋势虽与根、茎大体相同,但仍有差别(表2和图3)。0.5、1.0、3.0和5 mg/L对体长的抑制作用大小处于根、茎之间,但0.2 mg/L对体长的抑制作用大小却大于根和茎,说明0.2 mg/L处对体长的影响较乏规律性,或说明在0.2 mg/L处引入了较多随机因素。

表2 Pb2+对种子幼芽的影响Table2 Pb2+ effect on seed growth

图3 Pb2+对种子幼芽的影响Fig.3 Pb2+ effect on seed growth

2.3 Pb2+对烟草种子萌发影响的波动性分析

从各效应图(图2和图3)可看出,各效应值的95%CI上下限间构成了较为明显的作用带,作用带中的任何一点均可能代表真实作用。作用带越宽,该作用越不稳定。随着Pb2+液对种子萌发抑制作用的增大,作用带宽也趋向于增大,Pb2+作用的波动性随之增大(图4)。大部分散点在趋势线以下,说明在0.2~5 mg/L内上述波动性总体较为保守。0.2 mg/L的散点多在趋势线以上,说明在0.2 mg/L处上述波动性较为激烈,这与研究体长的响应时的发现相符。

图4 作用带宽随作用大小的变化Fig.4 Volatility values of Pb2+ effects

3 结 论

初步认为 Meta分析能量化并概化重金属对作物生长发育的影响,可用于重金属对作物生长发育影响的研究。0.2~5.0 mg/L的Pb2+液会抑制烟草种子的萌芽和发育,对萌芽和发育的抑制作用均在0.2 mg/L处最小。随着浓度的增大,对萌芽的抑制作用呈“增→减→稳”,对根、茎发育的抑制作用均呈“增→减→增”且对根的抑制约为对茎的 1.7~3.4倍,种子对营养物的转化受到抑制且末端抑制作用为起始处的 5.7倍。此外,Pb2+作用的波动性随作用增大而增大,总体较为保守,但在0.2 mg/L处较为激烈。

[1]McCue C.Data Mining and Predictive Analysis[M].Burlington: Butterworth-Heinemann, 2007: 25.

[2]E.Bayam, J Liebowitz, W Agresti.Older drivers and accidents: A meta analysis and data mining application on traffic accident data[J].Expert Systems with Applications, 2005, 29(3): 598-629.

[3]Gavin Stewart.Meta-analysis in applied ecology[J].Biology Letters, 2010(6): 78-81.

[4]Arnqvist G, D Wooster.Meta-analysis: synthesizing research findings in ecology and evolution[J].Trends in Ecology & Evolution, 1995, 10(6): 236-240.

[5]彭少麟,郑凤英.Meta分析及MetaWin软件[J].土壤与环境,1999,8(4):295-299.

[6]Borenstein M, Hedges L, Higgins J, et al.Comprehensive Meta Analysis, version 2.0: introduction to the program[CP/OL].Comprehensive Meta Analysis, 2005:[2011-7-20].http://www.meta- analysis.com.

[7]H Hillebrand.Meta-analysis in Ecology [J/OL].Encyclopedia of life science, 2008: [2011-7-20].http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/9780470015902.a0003272.

[8]Larry V.Hedges, Jessica Gurevitch, Peter S.Curtis.The meta-analysis of response ratios in experimental ecology[J].Ecology, 1999, 80(4): 1150-1156.

[9]Chen Xuezhong, Yin Xiangchu.Application of the Load/Unload Response Ratio Theory to Predictions of Moderate Earthquakes (7.0>M≥6.0)[J].Earthquake Research in China, 1995, 9(3): 225-229.

[10]Julian P T Higgins, Simon G Thompson, Jonathan J Deeks,et al.Measuring inconsistency in meta-analyses[J].BMJ,2003, 327(7414): 557-560.

猜你喜欢

培养皿体长异质性
Meta分析中的异质性检验
脖子占体长一半的巨龙——新疆巨龙
18F-FDG PET/CT代谢参数及代谢异质性与胃癌临床病理特征的相关性
外泌体长链非编码RNA在膀胱癌中的研究进展
基于可持续发展的异质性债务治理与制度完善
NASA and Space Exploration
无处不在的细菌
本体支持的生物医学领域元数据异质性与可兼容性研究
微生物“长”出惊艳画作
卫宝香皂:培养皿告诉你细菌真相