尖叶胡枝子种子贮藏蛋白分析
2012-03-13王清郦孙启忠赵淑芬郭艳艳周国栋
王清郦,孙启忠,赵淑芬,郭艳艳,周国栋
(1.中国农业科学院研究生院,北京 100081; 2.中国农业科学院草原研究所,内蒙古 呼和浩特 010010;3.林西县草原工作站,内蒙古 林西 025025; 4.内蒙古农业大学生态环境学院,内蒙古 呼和浩特 010019)
尖叶胡枝子(Lespedezahedysaroides)为中旱生草本小半灌木,在森林和森林草原带的草甸草原群落中为优势种或伴生种,或为草原带的山地灌丛伴生成分,常见于草甸草原带的丘陵坡地、沙质地上或林缘[1-2]。尖叶胡枝子具有抗旱、耐寒、耐瘠薄及适应性广等特性,是荒地造林、水土保持和土壤改良的先锋植物,并且具有返青早、枯黄晚、叶量大、花期长、泌蜜量大、营养价值高、再生能力强、适口性好等特点,可用作饲料、薪炭林、蜜源植物和药用植物[3-5]。
种子贮藏蛋白(Seed Storage Proteins,SSP),是指高等植物在种子成熟过程中合成并大量贮存的贮藏蛋白质,为植物的生长发育提供重要的碳源、氮源和硫源。贮藏蛋白质占种子总蛋白含量的60%~80%,豆科植物中总蛋白含量较高,已成为人类除肉类外重要的蛋白质来源[6-8]。种子贮藏蛋白根据溶解特性可分为四大类,即溶于水的清蛋白、盐溶蛋白(包括白蛋白和球蛋白)、醇溶蛋白和溶于稀酸或稀碱溶液的谷蛋白。蛋白的组成由基因决定、几乎不受外界环境的影响,蛋白组分的差异可以反映出基因型的不同,因此,种子贮藏蛋白也被称为生化“指纹”[9]。研究种子贮藏蛋白的方法有多种,蛋白质电泳谱带具有较高的多态性、专一性和稳定性,在植物的生化水平遗传多样性研究、品种鉴定、种群或居群间的遗传变异以及遗传结构的研究等方面得到了广泛应用[10-11]。十二烷基磺酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)因其多种优良特性而得到研究者的青睐,如电泳速度只与分子量大小有关、电泳结果稳定、不受贮藏年限和外界环境影响等[12-13]。本试验采用SDS-PAGE电泳技术对3个不同类型尖叶胡枝子的种子贮藏蛋白进行比较研究,从生化水平上探讨尖叶胡枝子的遗传多样性,从而了解胡枝子属的遗传背景,以期为胡枝子属种质资源的研究和合理开发利用提供方法依据[14]。
1 材料与方法
1.1试验区自然概况 试验地设在赤峰市林西县城北5 km处的农研场。海拔900 m,属于半干旱大陆性季风气候;年均气温4~5 ℃,7月最热,平均气温20~22 ℃,极端最高气温40.4 ℃,1月最冷,平均气温-17~-13 ℃,极端最低气温-32.2 ℃,≥10 ℃积温2 600 ℃·d,年均日照时数2 985.9 h;年均降水量320~380 mm,降水主要集中在6-8月,占全年的76.7%,年蒸发量1 800 mm以上,是降水量的4.95倍;无霜期125~130 d;土壤为栗钙土。
1.2试验材料 供试材料为尖叶胡枝子,有3个不同类型,其中一个类型是已经通过审查登记的品种科尔沁尖叶胡枝子,另外2个类型是在科尔沁尖叶胡枝子多年的栽培过程中发现的具有稳定遗传的种群分化类型。以科尔沁尖叶胡枝子自命名为普通型,其他两种根据形态特性自命名为浓绿型和高杆型。于2008年6月3日播种,播种量为6.0 kg·hm-2。行距45 cm,开沟溜种,覆土1.5~2.0 cm。苗期除草2次,播种当年浇冻水,第2年返青后除草2遍。
1.3试验方法 采用SDS-PAGE垂直平板电泳方法,具体操作参照《蛋白质技术手册》[15]。分别对各类种子贮藏蛋白(清蛋白、谷蛋白、醇溶蛋白和盐溶蛋白)及总贮藏蛋白进行电泳分析。
1.3.1种子贮藏蛋白的提取 不同溶剂的蛋白质提取液配方及用量:①清蛋白提取液:去离子水,提取用量350 μL;②盐溶蛋白提取液:0.25 mmol·L-1Na3PO4、2 mol·L-1NaCl,pH值7.0,提取用量350 μL;③醇溶蛋白提取液:75%乙醇溶液,提取用量350 μL;④谷蛋白提取液:0.2%NaOH溶液,提取用量350 μL;⑤贮藏蛋白提取液:5 mL 10%SDS,1.5 mL 2-ME,1.25 g溴酚兰,3.44 mL甘油,2.0 mL 1 mol·L-1Tris-HCl,pH值 6.8,加双蒸水定容到25 mL,提取用量350 μL。
取20粒种子洗净擦干,放入研钵中研碎,置于1.5 mL离心管中,加入上述配置的蛋白提取液[16-18][其中盐溶蛋白在加提取液之前需要进行前处理:在加有研碎种子的离心管中加入200 μL脱脂剂(氯仿∶甲醇∶丙酮=2∶1∶1),振荡混匀,常温下脱脂2 h,10 000 r·min-1离心10 min,弃上清后备用,待加盐溶蛋白提取液]。室温振荡浸提2 h,10 000 r·min-1离心10 min,取上清液置于4 ℃冰箱备用。以1∶1的比例加入上样缓冲液,煮沸5 min后点样。
1.3.2SDS-PAGE电泳 SDS-PAGE的浓缩胶浓度3%,分离胶浓度12%。各类贮藏蛋白及总的贮藏蛋白的上样量15 μL,标准蛋白D532S(分子量6.5~200 kDa),上样量5 μL,用北京六一电泳仪器厂生产的DYZ-28B型电泳槽,浓缩时电压恒压200 V,分离时电流恒流60 mA电泳,室温下电泳约7 h,至指示剂跑到距底部1 cm处,电泳结束后剥下胶片,染色3~10 h,脱色至条带清晰为止,照相并进行统计[18]。
1.4统计分析 根据SDS-PAGE电泳的特点,蛋白质的电泳迁移率主要取决于它的分子量,而与所带电荷和形状无关,单体电泳迁移率与蛋白单体分子量的关系为:
lgMW=K1-bm
式中,MW为蛋白单体分子量,m为蛋白单体迁移率,K1和b为常数。
蛋白质相对迁移率(Rf)=
通过已知分子量的标准蛋白(Protein Marker)在相同电泳条件下的迁移率,绘制出分子量与迁移率的标准曲线,然后计算供试材料的蛋白单体迁移率和分子量。对清晰蛋白质条带的有无进行标记,有为1,无为0,得出(0,1)矩阵。利用Popgene 1.31软件进行Nei’s遗传距离(D)和遗传一致度(I)分析。利用NTSYS-pc 2.1系统进行聚类分析[19]。通过SAS软件对不同提取液做差异显著性检验。
2 结果与分析
利用SDS-PAGE电泳技术对3个不同类型的尖叶胡枝子种子贮藏蛋白进行电泳,获得清晰稳定的遗传蛋白图谱(图1)。
图1 3个不同类型尖叶胡枝子的蛋白电泳图谱Fig.1 Electrophoregrams of seed storage proteins of three Lespedeza hedysaroides
2.1清蛋白、谷蛋白和醇溶蛋白电泳结果 经电泳染色、脱色后,点样孔加入清蛋白和谷蛋白的泳道无清晰谱带出现,点样孔加入醇溶蛋白的泳道中出现几条痕迹很浅的条带。
2.2盐溶蛋白谱带遗传多样性分析 3份供试材料的盐溶蛋白质谱带存在差异,共检测出19条蛋白谱带,其中6条谱带为稳定表达谱带,表达率为100%;其余13条为不同程度表达的多态性谱带,多态性数目占总条带的68.42%。把整个蛋白谱带划分为4个区域:α区、β区、γ区和ω区,其中α区相对迁移率为0.7~1.0,β区相对迁移率为0.3~0.7,γ区相对迁移率为0.1~0.3,ω区相对迁移率为0~0.1。盐溶蛋白的各区域均有条带出现,其中α区有4条,β区有6条,γ区有6条,ω区有3条,分子量大小13.57~154.53 KDa(表1)。
计算3个不同类型尖叶胡枝子盐溶蛋白的Nei’s的遗传距离和遗传一致度(表2),普通型与浓绿型的遗传距离最小,为0.021 3;普通型与高杆型的遗传距离最大,为1.035 5。高杆型与普通型的遗传一致度最小,为0.355 1,浓绿型与普通型的遗传一致度最大,为0.978 9。
表1 3个不同类型尖叶胡枝子盐溶蛋白电泳出现频率和蛋白分子量Table 1 Frequency of bands and molecular weight of salt-soluble protein of three L. hedysaroides
表2 盐溶蛋白 Nei’s遗传一致度(右上角)和遗传距离(左下角)Table 2 Nei’s of genetic identity (upper right corner) and genetic distance (lower left corner) of salt-soluble protein
根据3份供试材料的遗传距离和遗传一致度信息聚类得到聚类图(图2)。1(普通型)与2(浓绿型)之间距离系数为0.00,聚为一类;1、2与3(高杆型)的距离系数为0.56,3单独聚为一类。
图2 3个不同类型尖叶胡枝子的盐溶蛋白聚类图Fig.2 Dendrogram based on Nei’s genetic distance of salt-soluble proteins
2.3贮藏蛋白谱带遗传多样性分析 3份供试材料之间的贮藏蛋白质谱带存在差异,共检测到28条蛋白谱带,其中19条谱带为稳定表达谱带,表达率为100%;剩余9条为不同程度表达的多态性谱带,多态率32.14%。α区有5条,β区有16条,γ区有7条,ω区无谱带出现,分子量大小12.43~107.78 KDa。
表3 3个不同类型尖叶胡枝子贮藏蛋白电泳出现频率和蛋白分子量Table 3 Frequency of bands and molecular weinght of storage protein of three L.hedysaroides
计算3个不同类型尖叶胡枝子贮藏蛋白的Nei’s遗传距离和遗传一致度(表4),普通型与浓绿型的遗传距离最小,为0.025 1;普通型与高杆型的遗传距离最大,为0.238 2。高杆型与普通型的遗传一致度最小,为0.788 0;浓绿型与普通型的遗传一致度最大,为0.975 2。
表4 贮藏蛋白 Nei’s遗传一致度(右上角)和遗传距离(左下角)Table 4 Nei’s of genetic identity (upper right corner) and genetic distance (lower left corner) of seed storage protein
根据3份供试材料的贮藏蛋白聚类结果可知(图3),1(普通型)与2(浓绿型)之间距离系数为0.02,聚为一类;1、2与3(高杆型)的距离系数为0.10,3单独聚为一类。
图3 3个不同类型尖叶胡枝子的贮藏蛋白聚类图Fig.3 Dendrogram based on Nei’s genetic distance of seed storage protein
2.4不同提取液的遗传系数方差分析 对盐溶蛋白和贮藏蛋白提取液的遗传距离和遗传一致度进行方差分析,结果显示两种提取液的遗传系数之间没有显著差异(P>0.05)。
3 讨论与结论
蛋白质作为基因表达的直接稳定产物,能在生化水平上反映DNA组成上的差异,种子贮藏蛋白在种子细胞内的积累、含量高低及组分的变化受相关基因的严格调控[20]。因此,种子贮藏蛋白被广泛应用于种质资源的研究中,包括新品种登记和保护、品种亲缘关系和分类研究以及构建蛋白质指纹图谱等方面[21-22]。赵杨等[16]通过对二色胡枝子(L.bicolor)种子贮藏蛋白的研究发现,14个居群贮藏蛋白电泳总谱带数为28条,总多态带为23条,多态带率82.14%,胡枝子总遗传多样性指数为0.255,居群内平均遗传多样性指数为0.136,占总遗传多样性指数的53.33%,说明居群内变异是胡枝子基因结构变异的主要来源。此外,各居群间也存在较高的遗传分化。闫伟红等[18]通过对40个野生居群的胡枝子属植物种贮蛋白研究表明,供试材料的种贮蛋白谱带的多态性达90.6%,这说明胡枝子属植物无论在种间还是种内都具有丰富的蛋白质多态性。通过对胡枝子属的蛋白质电泳研究可以发现,遗传变异大多来自胡枝子属种内或居群间,推断导致遗传变异的可能原因是长期生物进化而积累的遗传物质的变异以及由于优胜劣汰而逐渐适应生境的不同生态型之间的差异。
对3个不同类型尖叶胡枝子的蛋白电泳谱带位点进行统计,不同提取液所获得的蛋白谱带各不相同。其中使用去离子水和0.2%NaOH溶液提取的尖叶胡枝子种子清蛋白和谷蛋白几乎没有或者含量甚微,使用75%乙醇溶液提取的尖叶胡枝子种子醇溶蛋白含量较少,在此不做详细讨论。利用盐溶蛋白和贮藏蛋白提取液所得的总蛋白谱带的分子量介于12.43~154.53 KDa,相对迁移率0.05~0.94。从电泳结果可以看出,盐溶蛋白的γ区域是谱带颜色、宽窄和多态性位点差异最明显的区域;β区是贮藏蛋白均匀表达稳定且集中的区域,γ区是谱带多态性位点出现差异的区域[23-24]。盐溶蛋白的蛋白谱带总数为19条,多态率为68.42%,贮藏蛋白的为28条,多态率为32.14%,说明3份材料的盐溶蛋白的条带位点少于贮藏蛋白而种内变异大于贮藏蛋白。聚类结果表明,利用盐溶蛋白和贮藏蛋白获得的蛋白质图谱能很好地区分鉴别3个不同类型的尖叶胡枝子,通过对盐溶蛋白和贮藏蛋白的遗传一致度进行方差分析,结果显示两者之间没有显著差异。供试材料分为两类:一类为普通型和浓绿型尖叶胡枝子;另一类为高杆型尖叶胡枝子,这从生化水平上证明高杆型尖叶胡枝子是尖叶胡枝子的种内变异种。盐溶蛋白是豆科植物种子中主要的贮藏蛋白质[25],且谱带的多态性和分辨率较高,建议使用盐溶蛋白对胡枝子属植物的种内(居群内)变异进行遗传多样性进行研究,效果更好。
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