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广东省部分地区非综合征性耳聋患者GJB2 和SLC26A4 基因突变位点分析

2023-11-23周惠玲张卓成陈建勇梁惠强曹令仪

实用检验医师杂志 2023年3期
关键词:杂合耳聋基因突变

周惠玲 张卓成 陈建勇 梁惠强 曹令仪

耳聋是人类常见的感觉缺陷性疾病,位列各类残疾之首,严重影响患者的日常沟通交流,降低其生活质量。耳聋可发生于各年龄段,导致耳聋的原因主要有环境因素和遗传因素,其中60%以上与遗传因素有关[1],而遗传性耳聋是由基因或染色体异常等遗传缺陷导致的,具有高度的遗传异质性[2]。根据临床表型是否伴有耳外其他器官功能障碍和异常可分为综合征性耳聋(syndromic hearing loss,SHI)和非综合征性耳聋(non-syndromic hearing loss,NSHI),其中NSHI 占60%~70%[3]。根据遗传方式不同耳聋可分为常染色体隐性遗传(约占80%)、常染色体显性遗传(约占15%)、线粒体突变母系遗传(约占1%)或X 连锁遗传(占2%~5%)[4]。

近年来,随着现代科学技术的进步以及分子生物学和分子遗传学的飞速发展,人类已克隆了50 多个遗传性耳聋基因,定位了100 多个NSHL 相关基因位点。但国内耳聋基因的分子流行病学研究表明,我国大部分NSHI 由为数不多的几个基因突变引起[5],其中GJB2 和SLC26A4 基因是导致NSHI 常染色体隐性遗传的主要致病基因,SLC26A4 基因突变仅次于GJB2 基因[6-9]。目前对耳聋的治疗效果并不显著,因此及时发现耳聋并且明确其病因,给予早期治疗及科学指导,从而延缓病情进展就显得尤为重要[10]。本研究通过收集广东省部分地区100 例NSHI 患者的临床资料,并采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)-荧光杂交发法检测GJB2和SLC26A4 基因的14 个突变位点,分析该地区耳聋基因的流行情况,为遗传性耳聋的防治工作提供理论依据,现将结果报告如下。

1 资料和方法

1.1 研究对象 选择2022年5月—2023年4月在本院耳鼻喉科就诊的感音神经性耳聋患者中,经病史采集、体格检查、听力学及影像学检查确诊为NSHI的100 例患者作为研究对象。其中男性39 例,女性61 例;年龄8~87 岁,平均(50.19±19.45)岁。

1.1.1 纳入标准 ① 患者籍贯均为广东地区,主要包括江门、中山、珠海等地;② 患者本人或监护人均对本研究内容知情同意。

1.1.2 排除标准 SHI 或其他中枢性及外周性明确致病因素导致的耳聋患者。

1.1.3 伦理学 本研究符合医学伦理学标准,并经本院医学伦理委员会审批(审批号:2023-102),所有检测均获得过受检对象或家属的知情同意。

1.2 仪器与试剂 本研究使用的核酸提取试剂盒为广州美基生物科技有限公司提供的DNA 提取试剂盒(证书编号:粤穗械备20150062 号),扩增仪器为ABI Proflex梯度PCR仪(美国应用生物系统公司),使用Luminex MagPix 多功能悬浮点阵检测仪(美国Luminex 公司)进行检测并分析结果。

1.3 听力学诊断 采用电生理检测方法,使用丹麦国际听力公司提供的ECLISPE 听觉脑干诱发电位测试仪对患者在隔音屏蔽室内进行测试。嘱患者取舒适平卧位,闭目休息,保持平静;给予短声交替波刺激,刺激速率21.1 次/s,平均叠加次数为1 024 次,采用刺激强度为90 dBnHL 的记录曲线,以两次稳定波形的叠加标识Ⅰ、Ⅲ、Ⅴ波;以Ⅴ波反应阈值作为2~4 kHz 听力参考指标,Ⅴ波反应阈值<30 dBnHL为正常听力指标。根据听力损伤程度分级标准[11],轻度聋:波V 反应阈值为31~50 dBnHL;中度聋:51~70 dBnHL;重度聋:71~90 dBnHL;极重度聋:≥91 dBnHL。

1.4 影像学检查 对疑似前庭水管病变的患者行64 排颞骨CT 平扫,诊断标准及分类按照Sennaroglu分类标准,分为单纯前庭水管扩大、大前庭导水管综合征(large vestibular aqueduct syndrome,LVAS)、其他内耳畸形及内耳结构正常[12]。

1.5 耳聋基因检测 收集患者2 mL 外周血〔以乙二胺四乙酸(ethylenediamine tetra-acetic acid,EDTA)抗凝〕,使用核酸提取试剂盒提取DNA。应用PCR 仪对GJB2基因(包括508_511dup、299_300del、35delG、109 G>A、176_191del、235delC位点)和SLC26A4基因(包括754T>C、IVS7-2A>G、1174A>T、1229C>T、1692dup、1975G>C、2086C>T、2168A>G 位点)的14 个常见突变位点进行扩增,将扩增产物与试剂盒微珠进行杂交,使用多功能悬浮点阵检测仪及配套软件进行检测及信号收集,根据野生型探针/突变型探针信号(normal/mutation,N/M)的高低对检测结果进行判读。

1.6 统计学分析 采用SPSS 26.0 软件对数据进行统计分析,两组间比较使用χ2检验,如果n<40,采用Fisher精确检验。P<0.05 为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 听力学检查结果 49 例研究对象为轻度至极重度感音神经性聋,双侧听力下降28 例,单侧听力下降21 例。见表1。

表1 100 例NSHL 患者听力学耳聋分类

2.2 耳聋基因检测结果 100 例NSHL 患者中检出34 例耳聋基因突变,突变检出率为34.00%(34/100),其中单基因纯合突变11 例,单基因杂合突变23 例,多基因复合突变2 例。双侧听力下降组基因突变阳性检出率为51.78%(29/56),单侧听力下降组阳性检出率为11.36%(5/44),比较差异有统计学意义(χ2=17.91,P=0.00)。

本研究检出GJB2 基因突变携带者34 例,检出率为34.00%(34/100)。双侧听力下降组阳性检出率为51.78%(29/56),单侧听力下降组阳性检出率为11.36%(5/44),差异有统计学意义(χ2=17.91,P=0.00)。其中单基因纯合突变11 例,单基因杂合突变23 例。突变位点主要为c.109 G>A,占比为91.17%(31/34),其次为c.235delC 突变,占比为8.82%(3/34),其中1 例为c.235delC 纯合突变。检出SLC26A4 基因突变携带者2 例,检出率为2.00%(2/100),检出c.IVS7-2A>G 和c.1229C>T 突变各1 例,均为双侧听力下降组,且合并GJB2 突变,多基因复合突变率为2.00%。耳聋基因突变的检出情况见表2。

表2 NSHL 患者基因突变位点的检出情况

2.3 GJB2 基因c.109 G>A 位点分析 GJB2 基因的c.109G>A 位点突变在本研究中的检出率较高,其中杂合突变21 例,纯合突变10 例,患者受累耳数目与突变类型的关系无统计学意义(P=0.576)。见表3。患侧耳听力障碍严重程度与突变类型的关系见表4。c.109G>A 位点纯合突变者以中、重度耳聋为主,杂合突变者以轻度耳聋为主。

表3 NSHL 患者受累耳数目与突变类型的关系

表4 NSHL 患者患侧耳听力障碍程度与突变类型的关系

GJB2 基因的c.109 G>A (p.Val37Ile)位点突变是一种错义突变,导致其编码的37 位氨基酸发生突变(缬氨酸变为异亮氨酸)。检索ClinVar 数据库,致病性突变评分见图1,将该点突变定义为致病性突变。使用SWISS-MODLE 数据库预测突变位点模型,见图2~3。

图1 ClinVar 数据库致病性突变评分

图2 野生型GJB2 分子模型

图3 GJB2 基因c.109 G >A(p.Val37Ile)位点分子模型

3 讨论

遗传性耳聋是临床上常见的遗传病,其发生由基因或染色体异常等遗传缺陷导致,具有高度的遗传异质性,不同国家、地区和人群中耳聋基因的突变方式、突变频率和突变位点均存在巨大差异,且不同人种和民族也有其自身特点。在我国的遗传性耳聋患者中,约有35.5%与GJB2 或SLC26A4 基因突变有关[13]。本研究通过对广东省部分地区NSHI患者的GJB2 及SLC26A4 基因突变位点进行分析,了解该地区耳聋基因的突变热点,从而为防聋治聋工作提供指导。

GJB2 基因突变是最常见的致聋原因,NSHI 患者携带率高达28%,常见的突变形式包括235delC、176-191dell、167delT、35delG 等位点[14]。GJB2 基因主要编码缝隙连接蛋白26(connexin26,Cx26),该蛋白以六聚体形式结合,形成缝隙连接,是耳蜗内钾离子的运输通道,可维持耳蜗内较高的水平电位,GJB2 基因突变可导致Cx26 蛋白出现功能缺陷,影响细胞间信号传递,减少钾离子的再循环效率,导致患者听力受损[15]。本研究中GJB2 基因的突变率为34.00%,高于全国GJB2 总致病突变率(12.88%)[16],且明显高于王蒙等[17]报道的广东地区NSHI 患者的GJB2 基因突变携带率为9.47%,这可能是由于本研究检测的突变位点数量较多,因此增加了检出率。本研究可检的GJB2 基因突变位点虽多,但100 例患者中只检出c.235delC 和c.109G>A 两种突变,可能是纳入研究的患者数量较少,导致突变检出类型较少,且入组的患者年龄偏大,可能与迟发型耳聋相关。本研究中GJB2 基因c.235delC 位点的突变检出率为3.00%,与王蒙等[17]报道一致。GJB2 基因突变所致的耳聋多发生于婴幼儿时期,如本研究中年龄最小的患儿8 岁,为GJB2 基因c.235delC 位点纯合突变携带者,较早出现严重的听力损伤。一般不认为GJB2 基因c.235delC 位点单杂合突变能致病,但本研究中有1 例35 岁患者携带c.235delC 位点单杂合突变,出现双耳中度听力下降,与李琦等[18]研究一致,c.235delC 位点单杂合突变携带者中年时即可出现中/高频听力损失。

GJB2 基因c.109 G>A(p.Val37Ile)突变是一种错义突变,导致其编码的氨基酸发生变化(缬氨酸变为异亮氨酸)。该变异在我国人群中有较高的检出率(8%~12%),本研究中NSHI 患者的检出率为34.00%(34/100),明显高于人群携带率。过去认为该突变是一种多态性改变,并不会直接导致遗传性耳聋的发生[19]。但随着研究深入,当c.109 G>A(p.Val37Ile)位点纯合或单杂合变异与另一个单杂合致病突变同时存在时,可导致耳聋疾病发生[20]。Li等[21]研究表明,c.109 G>A 位点纯合或杂合突变可导致患者出生时轻度听力下降,并随着年龄的增长进行性加重,这可能是由于该位点突变增加了由不良环境因素导致的耳聋概率。查阅ClinVar 数据库,将此突变定义为致病性突变,应用SWISS-MODLE数据库预测突变位点模型,可以看出突变的氨基酸导致肽链空间结构发生变化,这可能导致蛋白质功能的改变,从而引起一系列病变。本研究中NSHI患者的c.109 G>A 位点突变携带率较高,表明该基因突变可能是出生后听力下降的高危因素。

SLC26A4 基因是在我国第二高发的突变致聋基因,约有14.5%的耳聋患者携带该基因突变[22]。SLC26A4 基因有21 个外显子,能够编码溶脂蛋白(Pendrin 蛋白),异常的Pendrin 蛋白失去正常离子转运功能,导致耳蜗内淋巴离子环境失衡,进而导致耳聋。SLC26A4 基因突变可导致LVAS、NSHI 和先天性耳聋伴甲状腺肿综合征[23]。本研究SLC26A4基因突变率为2.00%,低于全国检出水平,可能是由于广东地区SLC26A4 基因突变携带率低或标本量少导致的低检出率。SLC26A4 基因检出了在我国居民中较常见的突变热点c.IVS7-2A>G 和少见的c.1229C>T 突变各1 例,均为双侧听力下降组,且合并GJB2 突变,为双基因杂合突变。翻查CT 报告,两例携带者均无前庭导水管扩大,但临床医生应叮嘱患者避免头部外伤,预防呼吸道感染,不进行潜水活动,避免乘坐飞机等,以免压力变化导致疾病的发生发展。

本研究使用的PCR-流式荧光检测技术又称液态悬浮点阵检测技术,是一种新的适用于临床的高通量、自动化分析技术[24-25]。该方法的优势为在核酸扩增的基础上,将产物与标记微珠进行杂交染色,提高检测结果的敏感度和特异度;高通量可将多个基因突变整合到同一检测系统中,一次性完成多个位点的检测;实验步骤简单,大大缩短检测时间。

4 结论

综上所述,广东省部分地区NSHI 患者主要的致病基因为GJB2,主要的突变位点为c.109 G>A,该地区耳聋基因与其他地区有明显差异。在临床工作中,应早期开展耳聋基因检测,明确病因,预测病情变化,协助耳聋预防及治疗,同时应指导并阻断耳聋遗传,预防下一代耳聋发生。而在耳聋基因检测中,应用PCR-流式荧光检测技术可以实现高通量、便捷等优点,作为现有检测方法的一种补充,具有广阔的临床应用前景。

利益冲突所有作者均声明不存在利益冲突

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