miR-K1-5p相关的G1/S期基因编码的蛋白在卡波西肉瘤中的表达
2023-01-11彭靖淇
张 静,彭靖淇
(1.新疆医科大学附属中医医院病理科,乌鲁木齐 830000;2.新疆医科大学附属中医医院外科,乌鲁木齐 830000)
卡波西肉瘤主要是由卡波西肉瘤相关病毒(KSHV)感染内皮细胞引起的血管源性恶性肿瘤[1]。miRNAs 是一种非编码小分子RNA,通过结合靶基因的3'非翻译区(3'UTR)去降低或沉默靶基因的表达而发挥强大的调控作用。KSHV miRNA 也能通过复杂的机制诱导卡波西肉瘤的发生。课题组前期实验中通过对卡波西肉瘤miRNA 差异表达谱的筛选,证实卡波西肉瘤中miR-K1-5p表达明显上调[2],进一步的体外实验发现在卡波西肉瘤细胞株中miR-K1-5p 可以促进G1/S 期转换,但其中的机制并不清楚。因此,本文检测miR-K1-5p 相关的G1/S 期基因编码的蛋白在卡波西肉瘤中的表达,以期为进一步研究miR-K1-5p对卡波西肉瘤细胞周期的调控奠定理论基础。
1 材料与方法
1.1 材料来源
收集新疆医科大学附属中医医院及市友谊医院存档的40 例卡波西肉瘤石蜡包埋块,以新疆医科大学附属中医医院40 例存档的血管瘤石蜡包埋块做对照(经医院伦理委员会批准实施,批件编号2019XE0133),由两名高年资病理医师独立阅片后纳入。卡波西肉瘤患者:男性35 例,女性5 例,年龄32~82 岁;血管瘤患者:男性24 例,女性16例,年龄1~80 岁。
1.2 主要试剂
免疫组化抗体均购自武汉博士德工程有限公司:细胞周期素依赖蛋白激酶抑制剂4(CDKN4)、细胞周期蛋白A(CCNA)、细胞周期蛋白D2(CCND2)、周期素依赖性激酶2(CDK2)、周期素依赖性激酶4(CDK4)。
1.3 筛选miR-K1-5p 的靶基因
通过生物信息软件miRDB 和TargetScan Custom 筛选miR-K1-5p 的靶基因。miRDB:www.mirdb.org;TargetScan: http://www.targetscan.org/vert_60/。
1.4 确定miR-K1-5p 和靶基因的信号通路,分析通路上关键基因
通过生物信息数据库Gene Ontology(GO)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)分析靶基因的信号通路及通路上的关键基因。
1.5 免疫组化(IHC)检测
切片放置65 ℃烤箱2 h;抗原修复,3%H2O2消除内源性过氧化物酶;加入CDKN4、CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 一抗,4 ℃过夜;二抗孵育;DAB显色复染,封片。
1.6 结果判断
随机选择10 个400 倍(直径0.05 cm)视野判读结果。1)着色情况:无着色为0 分,淡黄色为1分,棕黄色为2 分,棕褐色为3 分。2)阳性细胞数:1%~10%为1 分,11%~50%为2 分,51%~75%为3分,≥76%为4 分。两者相加的和<3 分视为阴性表达,≥3 分视为阳性表达。CDKN4、CCNA、CCND2、CDK4 为肿瘤梭形细胞胞核着色;CDK2 以肿瘤梭形细胞胞浆着色为主,部分胞核着色。由两名高年资病理医师共同判读结果。
1.7 统计学方法
使用SPSS 20.0统计学软件进行数据分析,计数资料组间比较采用卡方检验,相关性分析采用Spearman 秩相关分析。P≤0.05 为差异有统计学意义。
2 结果
2.1 miR-K1-5p 的靶基因
通过生物信息软件筛选CDKN4 基因为miRK1-5p 的靶基因,结合位点如表1所示。
表1 3'UTR of CDKN4 与miR-K1-5p 的结合位点
2.2 miR-K1-5p 与靶基因的信号通路和通路上的关键基因
通过生物信息数据库GO 和KEGG 分析:miR-K1-5p 和靶基因CDKN4 参与细胞周期信号通路,通路下游的关键基因为CCNA、CCND2、CDK2、CDK4。
2.3 CDKN4、CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 在卡波西肉瘤与血管瘤中的表达
卡波西肉瘤与血管瘤中CDKN4、CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 的表达情况见图1。CDKN4 在卡波西肉瘤中的阳性率低于血管瘤中的阳性率(P<0.05);CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 在卡波西肉瘤中的阳性率均高于血管瘤中的阳性率(P均<0.05),见表2。
表2 免疫组化检测CDKN4、CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 在卡波西肉瘤及血管瘤中的表达[例(%)]
图1 免疫组化检测CDKN4、CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 在卡波西肉瘤及血管瘤中的表达
2.4 CDKN4、CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 与卡波西肉瘤患者性别、年龄的关系
不同性别、年龄卡波西肉瘤患者的CDKN4、CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 阳性表达率差异均无统计学意义(P 均>0.05),见表3。
表3 CDKN4、CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 与卡波西肉瘤患者性别、年龄的关系[例(%)]
2.5 卡波西肉瘤中CDKN4、CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 表达的相关性分析
在卡波西肉瘤患者中,CDKN4 的表达与CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 均呈负相关,CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 的表达互为正相关关系(P 均<0.05),见表4。
表4 卡波西肉瘤中CDKN4、CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 表达的相关性(rs 值)
3 讨论
卡波西肉瘤是血管及梭形细胞增生伴侵袭特征的恶性间叶源性肿瘤[3],分为经典型、艾滋病病毒(AIDS)相关型、非洲型及免疫抑制型。编码miRNA 的KSHV 是引起卡波西肉瘤最主要的致瘤病毒。miRNA 作为一类特殊的调控分子已受到科学界的广泛关注[4-7],它们调控细胞的周期、增殖、凋亡、转移、侵袭等多种生物学行为,并广泛参与基因表达及细胞通路转导等[8],与肿瘤学、病毒学等领域密切相关[9-10]。KSHV miRNA 也可以通过沉默转录因子、调控宿主细胞的周期等不同途径诱导卡波西肉瘤的发生。Wu 等[11]对卡波西肉瘤及瘤旁组织行RTq-PCR 检测后,发现包括miR- K1-5p 在内的13 个KSHV miRNA 在卡波西肉瘤中表达均上调,推测KSHV miRNA 扮演促癌角色[12]。进一步的细胞功能实验证实miRK1-5p 能够缩短细胞周期,加速细胞增殖,推测miR-K1-5p 可能与细胞周期的调控密切相关。
由于miRNA 通过影响靶基因的翻译而发挥其生物学作用,因此研究miRNA 功能的核心是寻找靶基因。本研究通过基因软件筛选CDKN4为miR-K1-5p 的靶基因,通过基因数据库分析靶基因参与细胞周期信号通路,通路下游的关键基因为CCNA、CCND2、CDK2、CDK4,它们编码的蛋白在细胞周期中发挥重要作用。细胞周期有G1/S 期和G2/M 期两个重要检查点,从细胞周期进程来看,G1/S 期的检查点比G2/M 期更重要。CDKN4 属于细胞周期非特异性抑制蛋白,是G1期负性调控蛋白,通过与CCN-CDK 复合物结合并抑制其活性,发挥阻碍G1/S 期转化和细胞增殖的作用,避免DNA 错误复制[13-15]。CCNA 在G1晚期表达,CCND2 在G1 期早期表达[16-17],CDK2和CDK4 是G1 期-S 期转变的主要限速因子,形成CCNA/CDK2 及CCND2/CDK4 复合物后促进G1/ S转化[18-19]。因此,CDKN4、CCNA、CCND2、CDK2 和CDK4 是调控G1/S 期转换的5 个重要蛋白,其表达异常可能导致肿瘤的发生。
本研究使用免疫组化的方法在卡波西肉瘤(血管瘤为对照组)中检测CDKN4、CCNA、CCND2、CDK2 和CDK4 的表达情况。血管瘤是血管源性的良性肿瘤,全身任何部位均可发生,大体上形成境界较清楚的蓝-紫-红色的斑点或结节,光镜下由大小不等的血管腔构成;卡波西肉瘤是血管源性的恶性肿瘤/肉瘤,多发生在四肢,初为蓝-红色的斑片(斑点),后形成斑块及结节,光镜下以梭形细胞增生及血管之间含有红细胞的狭缝状腔隙为特点。血管瘤与卡波西肉瘤是组织起源相同的良恶性肿瘤,大体形态及镜下特征均有相似之处,具有良好的可比性。本研究发现:与血管瘤(对照组)相比,CDKN4 在卡波西肉瘤中表达下调;CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 在卡波西肉瘤中表达上调。在卡波西肉瘤中CDKN4 的表达与CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 均呈负相关,CCNA、CCND2、CDK2、CDK4 的表达互为正相关,推测在卡波西肉瘤中miR-K1-5p 靶向CDKN4 使其表达明显下调,减弱了对CCNA/CDK2、CCND2/CDK4的抑制作用,引起其表达上调(CCNA 与CCND2的过度表达可导致CDK2 和CDK4 的激活),损伤G1/S 关卡,引起细胞增殖、周期紊乱,导致肿瘤发生。在卡波西肉瘤中,CDKN4、CCNA/CDK2、CCND2/CDK4 与患者的性别、年龄均无关,可能与它们在卡波西肉瘤发生中功能的复杂性有关。
综上所述,卡波西肉瘤中,CDKN4、CCNA/CDK2、CCND2/CDK4 的异常表达可能在肿瘤的发生、发展中起重要作用。CDKN4 的表达下调和CCNA/CDK2、CCND2/CDK4 的过度表达可作为引起卡波西肉瘤细胞周期异常的生物学指标,其分子机制可能与CDKN4/CCN/CDK 通路有关,而它们作为G1/S 期相关的重要蛋白,有望成为卡波西肉瘤的治疗靶点。