在免疫检查点阻断期间，自身反应性napsin A特异性T细胞在肺肿瘤和炎症性肺损伤中富集

采用免疫检查点阻断的癌症治疗（ICB），通常会诱发免疫相关的不良事件（irAEs）。研究人员假设在肿瘤和正常细胞中共表达的蛋白可能是irAEs中的抗原靶点，并在此描述了用于鉴定它们的DITAS（肿瘤相关自身抗原的发现）。基于单样本基因集富集分析，DITAS计算了肺肿瘤和健康肺组织之间的转录相似性。

本研究鉴定了10个在肺肿瘤中高度表达的肺组织特异性基因。将计算分析与功能性T细胞分析和抗原特异性T细胞的单细胞RNA测序相结合，以验证肺肿瘤自身抗原。在接受ICB治疗的非小细胞肺癌（NSCLC）患者中，napsin A是一种自身抗原，可引发强烈的CD8+T细胞应答，与无应答者相比，ICB应答者携带这些CD8+T细胞的频率更高。源于napsin A的人白细胞抗原（HLA）I类配体存在于人肺肿瘤和非肿瘤肺组织中，napsin A四聚体证实了非小细胞肺癌患者血液和肿瘤中存在napsin A特异性CD8+T细胞。Napsin A特异性T细胞克隆型在肺肿瘤和ICB诱导的炎症性肺损伤中富集，并且可以离体杀死永生化的与HLA匹配的NSCLC细胞。单细胞RNA测序显示这些T细胞克隆型表达促炎细胞因子和细胞毒性标志物。

因此，DITAS成功鉴定了自身抗原，包括napsin A，它们可能在NSCLC中介导有效的抗肿瘤T细胞反应，并可能同时支持肺irAEs。