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LncRNA 作为ceRNA 调控miRNA 在NSCLC 中的作用

2022-10-10郭居斗1杜振宗2宋剑非

医学信息 2022年15期
关键词:靶点编码调控

在我国,肺癌的发病率、死亡率已跃居第1 位,成为导致肿瘤患者死亡的主要疾病

。非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)约占肺癌总数的80%~85%,其病情发展迅速,转移速度快,复发率较高,很多患者发现时已发展至中晚期,预后差。早期接受治疗的NSCLC 患者复发率较高,且70%以上患者被发现时已是局部侵犯或远隔转移而无法手术

。因此治疗非小细胞肺癌已经成为临床治疗的难点,为提升患者的治疗效果和延长生存时间,探索新型治疗模式具有非常重要的临床意义。lncRNA一段长度超过200 bp 具有一定功能的非编码RNA,lncRNA 参与肿瘤过程并且通过多种模式,包括染色质重塑、转录调控、选择性剪接、miRNA 竞争性吸附、mRNA 稳定调控、调控蛋白质的翻译、降解、结构与功能

。miRNA 是一段编码少于20 bp 广泛存在于生物体内的非编码RNA 分子,在调控基因表达过程中起着重要作用,它们与DNA 转录出来的mRNA 中3'-UTR 相结合,从而导致mRNA 的翻译受到抑制

。近年来,竞争性内源性RNA(ceRNA)作为一种新兴的研究模式,在肿瘤发生机制及进展等方面扮演重要角色,尤其是在非小细胞肺癌的研究中。lncRNA 可以通过ceRNA 活性发挥miRNA 海绵作用,进而调节肿瘤的进程。本文主要就近年lncRNA 作为ceRNA 调控miRNA 机制在非小细胞肺癌中的研究进行综述,旨在阐明这种新的RNA 作用模式将导致对基因调控网络的新的认识,以期为肺癌的治疗提供新靶点、新途径。

4.3 双边合作是武术对外教材“走出去”的重要保障语言障碍造成了多年来武术对外教材“走出去”的主要问题,而丰富武术对外教材,冲破语言障碍,则需要更多的专业人士做出努力,两国间的双边合作也是必不可少的。东西方文化的交融需要双方国家共同做出努力,在教材内容的翻译工作中,中国人更加了解武术专业内容,而国外学者则能够更好地解决语言翻译问题,如此,双边的合作是促成武术对外教材标准化提升的关键因素。与此同时,文化的交融还需要持久地,潜移默化地发展,双边合作能够促成更多的两国合作,有效促进两国文化交流在潜移默化中发展。

1 lncRNA 作为ceRNA 调控miRNA 的机制

2011 年Salmena 首次提出了ceRNA 假说,即LncRNA 可以通过miRNA 中的反应元件(microRNAs response elements,MREs)与mRNA 竞争性结合miRNA 来调节下游基因的表达,该假说巩固了转录本并构成了一个调控RNA 网络,ceRNA 可以作为miRNA 的海绵,并在功能上阻止这些靶向转录的mRNA 被miRNA 降解

。lncRNA 通过竞争性结合miRNA 而起到竞争内源性RNA 的作用,作为海绵一样缓冲并抑制其下游相关基因的表达,从而发挥“miRNA-sponges”的功能

。因此,lncRNA 具有其独特而又多样的功能,使之成为天然的miRNA 海绵发挥ceRNA 作用,成为在抗肿瘤或促肿瘤过程中不可缺少的一员。

2 lncRNA 作为ceRNA 调控miRNA 促进非小细胞肺癌进展

2.1 lncRNA NORAD DNA 损伤激活的非编码RNA(non-coding RNA activated by DNA damage,NORAD)是一种特殊的非编码RNA,调节基因组稳定性,与其他lncRNAs 相比,NORAD 高度保守。NORAD 最初被认为是Chr20q11.23 的外显子编码转录本,在胰腺癌和骨肉瘤中被发现上调,因此它被确定为一种癌基因,并与各种癌症的不良预后相关

。NORAD 作为ceRNA,通过miRNA 调节不同癌症的下游机制。Wan Y 等

研究发现,NORAD 在非小细胞肺癌组织中高表达,在体内外均能促进非小细胞肺癌的生长和转移。与正常细胞相比,miR-520a-3p在肿瘤细胞中的表达显著降低。通过数据库筛选出miR-520a-3p 为NORAD 的靶基因,荧光素酶结果表明NORAD 通过靶向NORAD 基因的3'UTR 调节其表达。此外,野生型NORAD WT 可降低A549 细胞中miR-520-3p 的表达,而NORAD 敲除A549 细胞中上调miR-520-3p 的水平。该研究结果表明,lncRNA NORAD 可能与miR-520a-3p 结合,并且NORAD 可以作为ceRNA 来调节miR-520a-3p,从而影响PI3k/Akt/mTOR 信号通路,促进非小细胞肺癌的进展

。近年来,上皮间质转化(epithelial-mesenchymal tansition,EMT)成为包括肺癌在内的恶性肿瘤基础研究的热点,肿瘤细胞发生EMT 后侵袭性明显增强,更容易发生转移。研究表明

,EMT 过程中伴随着上皮细胞分子标志物E-钙粘蛋白(Ecadherin)的表达减少和间质细胞分子标记物N-钙粘蛋白(N-cadherin)的表达增加,肿瘤细胞向间充质细胞形态发生变化,能动性和侵袭能力显著增强,具有明显的间充质细胞的特性。Chen Z 等

研究发现,lncRNA NORAD 通过吸附miR-422a 在非小细胞肺癌中发挥促癌作用,NORAD 通过下调miR-422a 促进非小细胞肺癌发生EMT 过程,增加Ncadherin 的蛋白表达水平,并显著降低了E-cadherin 的表达水平,从而促进非小细胞肺癌的迁移与侵袭。

2.2 lncRNA DANCR 位于4 号染色体上的分化拮抗非蛋白编码RNA(differentiation antagonizing nonprotein coding RNA,DANCR)是一种有价值的肿瘤相关lncRNA,其表达失调见于多种恶性肿瘤,包括肝细胞癌

、乳腺癌

、结直肠癌

、胃癌

和肺癌

。DANCR 的异常表达已被证明可促进癌细胞的增殖、迁移和侵袭,其可能作为一种有用的疾病生物标志物或治疗癌症的靶点

。Huang YF 等

研究发现,DANCR 在体内和体外可显著增加非小细胞肺癌细胞的增殖、迁移和侵袭。根据ceRNA 假说,采用StarBase 和TargetScan 预测,miR-758-3p 被确定为DANCR 的下游,实时定量PCR 显示非小细胞肺癌细胞中miR-758-3p 的表达受DANCR 控制。此外,集落形成和侵袭实验表明DANCR/miR-758-3p 轴对非小细胞肺癌的发生有显著影响。综上所述,lncRNA DANCR 在非小细胞肺癌中作为肿瘤启动子发挥作用,它通过直接靶向肿瘤抑制因子miR-758-3p 促进细胞增殖、侵袭和迁移

。Bai Y 等

的研究发现,DANCR 可以吸附miR-138 以促进非小细胞肺癌细胞的增殖、迁移和侵袭,说明miR-138是DANCR 的抑制靶点。此外,该研究还显示,DANCR 通过竞争性结合miR-138 发挥Sry 相关高迁移率族盒4(Sry-related high-mobility group box 4,Sox4)基因的ceRNA 的作用,而miR-138 的过度表达或Sox4 的敲除并不能完全消除DANCR 过度表达增加的增殖、迁移和侵袭;荧光素酶和芯片分析的结果表明,转录因子Sox4 可以结合到DANCR 基因的启动子区域,激活其转录。因此推测DANCR 通过充当ceRNA 上调SOX4 的表达,而Sox4 可反向触发DANCR 转录,揭示了lncRNA DANCR 和Sox4之间的正反馈调节回路。

3.1 lncRNA MEG3 母源表达基因3(maternally expressed gene 3,MEG3)是位于染色体14q32.3 上的长链非编码RNA。研究发现,在多种癌症中起作用的lncRNA MEG3 在非小细胞肺癌中低表达并与不良预后有关

。Lv D 等

的研究表明,过表达的lncRNA MEG3 可抑制miR-21-5p 表达水平,MEG3通过充当miR-21-5p 海绵抑制H1299 细胞的迁移和侵袭,磷酸酶和张力蛋白同源物(phosphatase and tensin homolog,PTEN)通过负性调节PI3K/AKT 信号通路发挥肿瘤抑制作用,其中PTEN 是miR-21-5p 的直接靶点,MEG3 过度表达导致PTEN 表达水平增加,miR-21-5p 可降低PTEN 表达水平,MEG3通过吸附miR-21-5p 来上调PTEN 的表达水平,随后减弱PI3K/AKT 信号通路,从而抑制非小细胞肺癌H1299 细胞的迁移和侵袭。肿瘤细胞的衰老是重要的抑癌机制

。Tao Y 等

研究了MEG3 在肿瘤细胞衰老过程中的作用及其通过与miR-16-5p 竞争结合调节编码退化样家族成员4(encoding vestigial like family member 4,VGLL4)表达的潜在分子机制。该研究采用依托泊苷构建肿瘤细胞衰老模型,检测lncRNA MEG3、miR-16-5p 和VGLL4 在衰老或非衰老细胞中的表达,双荧光素酶报告基因检测miR-16-5p、lncRNA MEG3 和VGLL4 的结合,使用蛋白质印迹检测衰老相关标志物(p21 和p16)的mRNA和蛋白质表达水平,结果显示与对照组相比,MEG3和VGLL4 在衰老细胞中的表达显著上调,MEG3 和VGLL4 的敲低降低了衰老程度以及p21 和p16 的表达,MEG3 通过竞争性结合抑制衰老A549 细胞中miR-16-5p 的表达,VGLL4 的表达受miR-16-5p 在衰老A549 细胞中的调控,MEG3 通过miR-16-5p/VGLL4 轴参与依托泊苷诱导的肿瘤细胞衰老进程。Wu JL 等

研究表明,lncRNA MEG3、乳腺癌1 号基因(Breast Cancer No.1 gene,BRCA1)在非小细胞肺癌组织和A549 细胞系中的表达显著低于正常组,lncRNA MEG3 和BRCA1 在A549 细胞系中的过表达导致肺癌细胞凋亡增加。双荧光素酶报告基因检测表明,MEG3 可以通过竞争性结合miR-7-5p 形成lncRNA MEG3/miR-7-5p/BRCA1 调控网络来调节BRCA1 的表达。总之,lncRNA MEG3 在非小细胞肺癌中显著下调,它可以通过与miR-7-5p 竞争性结合来调节BRCA1 的表达。

2.4 lncRNA XIST X 灭活特异性转录本(X inactivate-specific transcript,XIST)是在哺乳动物中发现的首批lncRNAs 之一,是雌性哺乳动物X 染色体转录沉默所必需的,在顺式染色体中包裹X 染色体,并在X 染色体失活(X chromosome inactivation,XCI)中发挥重要作用。最近的研究表明,XIST 在多种肿瘤中显著上调,XIST 基因敲除可下调增殖和侵袭相关蛋白,包括增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)、重组细胞周期蛋白D1(recombinant cyclin D1,CCND1)和基质金属肽酶9(matrix metallopeptidase 9,MMP9)

。Jiang Q 等

的研究发现,XIST 在非小细胞肺癌中升高,miR-142-5p 是XIST 的靶点,沉默miR-142-5p 可逆转非小细胞肺癌细胞中XIST 基因敲除介导的抗肿瘤功能,配对盒6(Paired box 6,PAX6)基因被证实是miR142-5p 的靶点,PAX6 的过度表达减弱了miR-142-5p 恢复对非小细胞肺癌细胞恶性表型的抑制作用,而且XIST 可通过在体内和体外吸附miR-142-5p 间接调节PAX6 的表达。因此,lncRNA XIST通过调节miR-1425p/PAX6 轴促使人非小细胞肺癌的细胞致瘤性。转化生长因子β(Transforming growth factorβ,TGF-β)介导的EMT 过程是肿瘤细胞迁移和侵袭的主要机制之一

。Li C 等

研究观察到转移性非小细胞肺癌组织中lncRNA-XIST 和锌指因子(ZEB2)的表达增加,敲除lncRNA-XIST可抑制ZEB2 的表达,还可抑制TGF-β 诱导的EMT和非小细胞肺癌细胞的迁移和侵袭。这些结果表明,lncRNA-XIST 对TGF-β 诱导的EMT 的作用可能在一定程度上依赖于ZEB2 的表达,生物信息学分析预测ZEB2 是miR-367 和miR-141 的靶点,荧光素酶报告基因分析在转染miR-367 或miR-141 的非小细胞肺癌细胞中评估的结果验证了该预测。Li C等

研究还发现,lncRNA-XIST 分别与miR-367 和miR-141 存在相互抑制,该结论支持lncRNA-XIST通过调节非小细胞肺癌细胞中的miR-367/miR-141-ZEB2 轴在EMT 诱导中的作用。

3 lncRNA 作为ceRNA 调控miRNA 抑制非小细胞肺癌进展

2.3 lncRNA SNHG6 小核仁RNA 宿主基因6(Small nucleolar RNA host gene 6,SNHG6)是人类5’TOP家族的管家基因,SNHG6 位于染色体8q13 上,SNHG6 通过一些癌细胞(如肝细胞和结直肠癌细胞)的细胞质和核RNA 部分优先定位于细胞质中

。根据最近的研究,与相应的非癌组织以及不同的癌细胞系相比,SNHG6 在癌组织中过度表达,SNHG6 上调与患者的晚期肿瘤进展和短期生存有关

。Li K 等

研究发现SNHG6 的表达增加与病理分期和淋巴结浸润有关,并作为非小细胞肺癌患者肿瘤复发的独立预后因素;沉默SNHG6 的表达可抑制细胞生长和侵袭,SNHG6 还可以与miR-101-3p 结合并负调节miR-101-3p 的表达;因此,SNHG6 可能作为miR-101-3p 的海绵来调节染色质Y 样(Chromodomain Y-like,CDYL)基因的表达,进而促进非小细胞肺癌细胞生长。在Dong Z 等

的研究中表明,SNHG6 显著促进非小细胞肺癌细胞的增殖并抑制其凋亡,其中SNHG6、重塑和间隔因子1(remodeling and spacing factor 1,RSF1)基因的表达上调,而在非小细胞肺癌肿瘤和细胞中miR-490-3p的表达下调,miR-490-3p 表达与SNHG6 或RSF1表达呈负相关。随后的荧光素酶报告分析验证了miR-490-3p 与SNHG6 或RSF1 之间的相互作用。更重要的是,SNHG6 基因敲除减缓了细胞生长,然而miR-490-3p 抑制剂取消了SNHG6 沉默诱导的对生存能力的抑制和对凋亡的促进。而RSF1 恢复了SNHG6 沉默介导的增殖抑制和凋亡加速。体内实验表明,SNHG6 基因敲除通过抑制RSF1 促进细胞凋亡来抑制肿瘤生长。

Structure and quasi-balanced feature analyses of the mesoscale vortex during a flash-flood-producing

3.2 lncRNA GAS5 生长停滞特异性转录本5(Growth arrest-specific transcript 5,GAS5)最早从NIH3T3 细胞中分离出来,位于染色体1q25,长度约630 nt,GAS5 通过促进多种细胞的生长阻滞和凋亡而发挥抑癌作用

。研究发现

,它通过抑制糖皮质激素介导的几种应答基因的诱导,在细胞中积聚并使细胞对凋亡敏感。除了调节多种癌细胞的增殖、侵袭和转移外,GAS5 下调也被认为是癌症化疗耐药的主要调节因子

。Chen L 等

的研究检测了3个可能是GAS5 靶点的miRNA 的表达,发现lncRNA GAS5 照射A549 细胞后,只有miR-21 受到影响,结果表明,虽然GAS5 过表达在正常情况下可以下调miR-21 的水平,但在电离辐射(ionizing radiation,IR)时这种抑制作用明显增强,表明GAS5 与miR-21 之间的相互作用可能是一种IR 特异性反应。PTEN 是PI3K/Akt 信号通路的抑制剂,PTEN/Akt轴是IR 诱导细胞凋亡的关键调控通路。该研究还发现miR-21 在PTEN 3'UTR 上有潜在的结合位点,GAS5 过表达或抑制miR-21 可使PTEN 水平升高,Akt 磷酸化水平降低,尤其是在IR 过程中,这说明lncRNA GAS5 通过竞争内源性调节miR-21,进而靶向到PTEN/Akt 通路,增强了A549 细胞的放射敏感性。该研究揭示了lncRNA GAS5 与非小细胞肺癌明显的放射敏感性相关,在临床放射治疗中作为放射增敏剂或放射敏感性指标有很大的潜力。磷酸赖氨酸磷酸组氨酸无机焦磷酸磷酸酶(phospholysinephosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase,LHPP)可能会降低非小细胞肺癌的耐药能力,LHPP 首次从猪脑组织中分离出来,可抑制人肝癌和宫颈癌

。Yang X 等

的研究证实,GAS5 在非小细胞肺癌组织和顺铂(DDP)耐药非小细胞肺癌细胞系中表达减少,且GAS5 表达增加与非小细胞肺癌患者的临床病理特征呈负相关,GAS5 通过抑制EMT 进展来抑制顺铂耐药非小细胞肺癌细胞的转移,GAS5 在体内抑制非小细胞肺癌/DDP 肿瘤的生长,GAS5 作为miR-217 的ceRNA 提高了顺铂耐药非小细胞肺癌细胞系中LHPP 的表达水平,从而抑制非小细胞肺癌顺铂耐药、转移和EMT 进展。

(6)从试验成果可知,南夹江实施裁弯后老河道淤积呈先快后慢、逐步趋稳的态势,随着上游来沙量的减少,老河道淤积有可能进一步减缓,老河道作为泄洪通道和水生态重要生境的功能将长期存在[18]。裁弯后老河道建闸既有利于防洪,又保持了老河道与长江的联通,建闸后老河道的水位、流速、河道淤积等与不建闸相比,变化不大。

4 总结

ceRNA 介导的基因之间相互调控是一种新兴的研究领域,使人们对疾病尤其是肿瘤的探索中有了全新的认识。随着生物信息学分析技术的高速发展,lncRNA 作为ceRNA 调控miRNA 在非小细胞肺癌中的机制研究得到深入,未来会有更多种lncRNA与miRNA 被筛选出来,彼此形成ceRNA 调节网络,共同参与到肺癌的发病机制、诊断,为肺癌的诊断治疗提供新方法。

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