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大蒜硫醚对葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的抑制作用

2022-07-19檀德宏吴朝霞纪淑娟

中国食品学报 2022年6期
关键词:氢键磷酸大蒜

吕 航,可 钦,檀德宏,周 倩,吴朝霞,纪淑娟,白 冰*

(1 沈阳农业大学食品学院 沈阳 110866 2 赤峰学院附属医院 内蒙古赤峰 024005)

大蒜为百合科葱属植物。大蒜不仅是重要的调味品,还具有抗氧化[1-2]、抗菌[3]、抗炎[4-5]、抗癌[6]、抗动脉粥样硬化[7-8],调节血糖[9]、血脂[10]、降压[11]等功能。研究表明,大蒜的生物活性主要是源自于其含量较高的有机硫化物,目前在大蒜中检测出30多种硫化物[12]。其中大蒜油是一种挥发油,主要由一些挥发性硫化物组成,包括二烯丙基二硫醚(Diallyl Disulfide,DADS)、二烯丙基三硫醚(Diallyl Trisulfide,DATS)[13]。

葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(Glucose 6 Phosphate Dehydrogenase,G6PD)是戊糖磷酸途径的限速酶,可催化D-葡萄糖-6-磷酸氧化为6-磷酸葡萄糖酸内酯。戊糖磷酸途径可提供增殖所需的核苷酸前体和NADPH,在肿瘤细胞增殖过程中,G6PD 的表达都是上调的,以满足肿瘤细胞的生长需要[14-16]。G6PD 在肿瘤细胞中的过表达和活性增加,进一步导致肿瘤组织的快速扩张[17-19]。对G6PD 活性的抑制成为控制肿瘤增殖的一种重要方式,因此对G6PD 抑制剂的研究也日渐增多。类固醇类抑制剂,如脱氢表雄甾酮(DHEA)[20]、表雄甾酮(EA)[21]等被证实可抑制G6PD 活性。来自大蒜的脂溶性硫化物DADS 和DATS 对G6PD 的抑制研究目前鲜有报道。

本研究以大蒜油的主要成分DADS/DATS 为研究对象,利用分子荧光实时监测技术揭示DADS/DATS 对G6PD 的活性具有部分抑制效果。以酶动力学原理分析其抑制类型,采用分子荧光光谱揭示DADS/DATS 对G6PD 的荧光淬灭机制,并分析结合位点数、热力学参数和相互作用力。利用3D 和2D 分子对接技术印证DADS/DATS 对G6PD 的作用力种类和结合方式。

1 材料与方法

1.1 试剂与仪器

大蒜(白皮大蒜),沈阳农业大学农贸市场;大蒜油(提取自大蒜),沈阳农业大学食品学院食品化学实验室提供;二烯丙基二硫醚、二烯丙基三硫醚(优级纯),美国Sigma 公司;葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(150 U/mg,微生物来源),上海源叶公司;D-葡萄糖-6-磷酸,上海麦克林公司;氧化型辅酶NAD,北京索莱宝公司;其它试剂均为国产分析纯,国药公司。

7890A-5975C 气相色谱-质谱联用仪,安捷伦科技有限公司;F-4600 分子荧光光谱仪,日本日立公司;紫外可见分光光度计,北京普析通用公司;XMTD-8222 型电热恒温水浴锅,上海精宏公司;FA224 电子天平,上海舜宇恒平科学仪器有限公司;PHS-3C 型pH 计,上海仪电公司;RE-52A型旋转蒸发仪,上海中光仪器仪表有限公司。

1.2 方法

1.2.1 大蒜油的提取 提取方法参照文献,略有改动[22]。新鲜大蒜去皮洗净捣碎,取适量蒜泥,40 ℃pH 6.5 条件下使大蒜内蒜氨酸和蒜氨酸酶充分反应1 h。按料液比1∶4(V/V)加入无水乙醇,40 ℃下超声提取30 min,过滤并浓缩得到大蒜油。

GC-MS 方法参照文献,略有改动[23]:色谱柱:DB-17MS(30 m×0.25 μm);载气:He(纯度99.999%);EI 离子源温度:230 ℃;进样口温度:250 ℃;监测器温度:250 ℃;程序升温条件:90 ℃保持1 min,10 ℃/min 速度升温至250 ℃;样品浓度:1 μL/L;进样量:1 μL;不分流模式。

1.2.2 大蒜油、DADS、DATS 对G6PD 活性的影响 通用Tris-HCl 缓冲液(0.1 mol/L,pH 7.5)。大蒜油/DADS/DATS 经乙醇溶解,分别配制成大蒜油(50~200 μL/mL)、DADS/DATS(1.25~5 mmol/L)。G6PD(0.1 mg/mL)分别与大蒜油/DADS/DATS 以1 ∶1(V/V)混匀,37 ℃水浴30 min,作为酶处理液。

G6PD 酶活测定体系,Tris-HCl 缓冲液400 μL、D-葡萄糖-6-磷酸100 μL(0.03 mg/mL)、NAD溶液20 μL(10 mg/mL),最后加入酶处理液40 μL,加盖摇匀,迅速放入分子荧光光谱仪,激发波长350 nm,每5 s 记录460 nm 荧光强度,连续测定195 s。

1.2.3 DADS、DATS 对G6PD 抑制类型分析 反应体系,Tris-HCl 缓冲液120 μL、D-葡萄糖-6-磷酸50 μL(0.01~0.05 mg/mL),NAD 溶液10 μL(10 mg/mL),最后加入酶处理液20 μL,加盖摇匀,立即监测340 nm 处吸光值。绘制Lineweaver-Burk双倒数图,判定抑制类型。

1.2.4 DADS、DATS 对G6PD 蛋白的荧光淬灭 G6PD(0.5 mg/mL)与DADS/DATS(0~5 mmol/L)等体积混合,分别在298,308,318 K 水浴10 min。取此溶液100 μL,加入Tris-HCl 缓冲液400 μL,加盖摇匀,迅速放入分子荧光光谱仪,激发波长280 nm,扫描290~450 nm 范围的荧光光谱。

1.2.5 荧光淬灭机理分析 结合Stern-Volmer 方程(1),在298,308,318 K 下,以未处理的G6PD的荧光强度(F0)与加入DADS/DATS 后G6PD 的荧光强度(F)的比值对DADS/DATS 浓度([Q])作图。

式中:Ksv——淬灭常数;Kq——淬灭速率常数;τ——生物分子的平均荧光寿命(10-8s)。

1.2.6 DADS、DATS 与G6PD 的结合常数和热力学参数 以lg[(F0-F)/F]对lg[Q]作图,根据式(2)可求结合常数(Ka)和结合位点数(n)。

以lnKa对1/T 作图,根据式(3)可求焓变ΔH、熵变ΔS,由式(4)可求吉布斯自由能变ΔG。

1.2.7 分子对接技术 G6PD 晶体结构取自PDB蛋白数据库(PDBID:2BHL),DADS、DATS 的分子结构来自ZINC 数据库(1531082,1633229)。利用软件Autodock4.2 进行分子对接,使用拉马克遗传算法,选择自由能最低的结合模式分析,利用PYMOL 和LIGPLOT 软件导出结果。

2 结果与分析

2.1 大蒜油的GC-MS 分析

图1为大蒜油的总离子流图和质谱图,主要包含2 种硫醚:DADS(图1c 峰1)、DATS(图1c 峰2)。DADS、DATS 保留时间分别为4.9,6.8 min。图1a 和图1b 分别为保留时间4.9,6.8 min 时的质谱图,质谱图中出现了质量/电荷比(m/z)为41,73,113,146,178 的主要碎片,m/z 41 对应CH2=CHCH2-,m/z 73 对应CH2=CH-CH2-S-。146(Ma)和178(Mb) 分别为DADS(C6H10S2,146) 和DATS(C6H10S3,178)的分子离子碎片。

图1 大蒜油总离子流图(TIC)(c)及DADS(a)、DATS(b)的质谱图(MS)Fig.1 Total ion current chromatogram(TIC)(c) and mass spectrum(MS) of DADS(a),DATS(b)

2.2 大蒜油/DADS/DATS 对G6PD 活性抑制作用

如图2a~2c 所示,利用分子荧光光谱仪实时监测了大蒜油对G6PD 活性的影响,荧光强度与酶活成正比,发现50~200 μL/mL 的大蒜油具有部分抑制G6PD 活性作用。进一步考察大蒜油主要成分DADS/DATS 对G6PD 活性的影响,1.25~5 mmol/L 的DADS/DATS 均具有抑制G6PD 活性的作用,且呈浓度依赖关系。

图2 不同浓度的大蒜油(a)、DADS(b)、DATS(c)对G6PD 活性影响Fig.2 Impact on G6PD activity of different concentrations of garlic oil(a),DADS(b),DATS(c)

2.3 DADS/DATS 对G6PD 的抑制类型

Lineweaver-Burk 双倒数曲线,如图3a 和3b,在反应体系中加入不同浓度的DADS/DATS 后得到一簇斜率不同,交于第二象限的直线。交点未落在X 轴(非竞争性抑制)或者Y 轴(竞争性抑制),判断DADS/DATS 对G6PD 的抑制类型为可逆抑制中的混合性抑制,即兼具竞争性抑制和非竞争性抑制。说明DADS/DATS 可通过两种方式对G6PD 产生抑制:一种方式是与底物竞争G6PD 的结合位点产生竞争性抑制,另一种方式是和G6PD的非活性部位结合形成复合物产生非竞争性抑制。

图3 DADS(a)/DATS(b)对G6PD 抑制的Lineweaver-Burk 图Fig.3 Lineweaver-Burk plots for G6PD inhibition types of DADS(a)/DATS(b)

2.4 DADS/DATS 对G6PD 的荧光淬灭

图4a 和4b 为298 K 时不同浓度的DADS/DATS 作用下的G6PD 的荧光光谱,随着DADS/DATS 浓度(0~5 mmol/L)的增大,333 nm 处G6PD蛋白的荧光强度逐步降低,说明DADS/DATS 与G6PD 蛋白产生了相互作用,导致了荧光的淬灭。

图4 不同浓度的DADS(a)/DATS(b)作用下的G6PD 荧光光谱Fig.4 Fluorescence spectra of G6PD with different concentrations of DADS(a)/DATS(b)

2.5 DADS/DATS 对G6PD 的荧光淬灭机理

荧光淬灭分为动态淬灭和静态淬灭,为判断其淬灭类型,分别在298,308,318 K 3 个温度下,以F0/F 对[Q](方程式1)作图,绘制Stern-Volmer曲线,如图5a 和5b。由曲线的斜率可求Ksv和Kq,列于表1。对于DADS/DATS 而言,随着温度的升高,Ksv值减小,且Kq值均大于淬灭剂对大分子物质的最大碰撞速率常数2×1010mol/L/s。因此,DADS/DATS 对G6PD 蛋白的荧光淬灭属于静态淬灭。

表1 不同温度下DADS/DATS 与G6PD相互作用的KSV 和Kq 值Table 1 KSV and Kq values of the interaction between DADS/DATS and G6PD at different temperatures

图5 不同温度下DADS(a)/DATS(b)与G6PD 相互作用的Stern-Volmer 曲线Fig.5 Stern-Volmer curves of the interaction between DADS(a)/DATS(b) and G6PD at different temperatures

2.6 DADS/DATS 与G6PD 相互作用的结合常数和结合位点数

分别在298,308,318 K 3 个温度下,以lg[(F0-F)/F]对lg[Q](方程式2)作图,如图6a 和6b。通过曲线截距和斜率可求DADS/DATS 与G6PD的结合常数Ka和结合位点数n,如表2。所有n 值均接近于1,说明DADS/DATS 和G6PD 之间存在一个结合位点。在308,318 K 时,DADS 的Ka值大于DATS 的Ka值,说明在308,318 K 时,DADS 与G6PD 之间的结合力较强。

图6 不同温度下DADS(a)/DATS(b)与G6PD 相互作用的双对数曲线Fig.6 Double logarithmic curves of the interaction between DADS(a)/DATS(b)and G6PD at different temperatures

表2 不同温度下DADS/DATS 与G6PD相互作用的Ka 和n 值Table 2 Ka and n values of the interaction between DADS/DATS and G6PD at different temperatures

2.7 DADS/DATS 与G6PD 相互作用的热力学参数和作用力

淬灭剂小分子与生物大分子之间可通过氢键、静电作用力、疏水相互作用和范德华力等相互作用。可通过反应的焓变ΔH、熵变ΔS、吉布斯自由能变ΔG 来判断作用力类型。以lnKa对1/T(方程式3)作图,如图7a 和7b。可通过曲线斜率和截距求出ΔH 和ΔS,再根据热力学方程(方程式4)可求ΔG,热力学参数列于表3。对于DADS,ΔH>0,且ΔS>0,说明DADS 和G6PD 主要是通过疏水相互作用结合的;对于DATS,ΔH<0,且ΔS<0,说明DATS 和G6PD 主要是通过氢键和范德华力结合的。ΔG 值均小于0,说明DADS/DATS 与G6PD 相互作用都是自发进行的。

表3 不同温度下DADS/DATS 与G6PD作用的热力学参数Table 3 Thermodynamic parameters of the interration between DADS/DATS and G6PD at different temperatures

图7 不同温度下DADS(a)/DATS(b)与G6PD 相互作用的Van't Hoff 曲线Fig.7 Van't Hoff curves of the interaction between DADS(a)/DATS(b) and G6PD at different temperatures

2.8 DADS/DATS 与G6PD 蛋白的分子对接

进一步利用分子对接技术解释DADS/DATS与G6PD 的相互作用机制。在对接结果中选择结合能最低的构象作为最优,进一步分析相互作用机制。结果表明DADS 和DATS 均可进入G6PD分子内部。其中DADS 与G6PD 结合能为-2.69 kcal/mol,结合性能较好,见表4。

表4 DADS/DATS 与G6PD 蛋白分子对接的结合能Table 4 The binding energies of the docking of DADS/DATS and G6PD

DADS 与G6PD 结合的3D 图和2D 图,如图8a 和8b,揭示出DADS 与G6PD 蛋白结合位点周围存在多个贡献较大的氨基酸残基。Ala-377、Val-376、Phe-216、Gly-222、Phe-221、Pro-223 等疏水性氨基酸残基可通过疏水作用与DADS 结合,Arg-219、Asn-218、Lys-275、Arg-215、Trp-225等极性氨基酸残基可通过静电吸引与DADS 结合。

图8c 和8d 分别是DATS 与G6PD 结合的3D图和2D 图。同样地,Phe-253、Gly-254、Ala-335、Ile-472、Ile-255、Leu-469、Leu-305 等疏水性氨基酸残基与Arg-175、Lys-476、Arg-257、Thr-334、Thr-333、Glu-473 等极性氨基酸残基,分别对DATS 形成疏水作用和静电吸引;且Phe235 还可与DATS 中心位置的S 形成氢键,键长为3.2Å,作用力以氢键为主。这些结果与热力学分析表明的DADS/DATS 和G6PD 相互作用的结论相吻合。因此,DADS 与G6PD 通过疏水作用和静电吸引等方式实现相互作用的,以疏水相互作用为主;DATS与G6PD 通过疏水作用、静电吸引、氢键等方式实现相互作用,以氢键为主,进而实现DADS/DATS对G6PD 活性的抑制。

图8 DADS 和DATS 分别与G6PD 相互作用的分子对接图Fig.8 Molecular docking of G6PD interacted with DADS and DATS

3 结论

本研究从大蒜中提取了大蒜油并通过酶活实时监测、酶动力学分析、荧光光谱法以及分子对接等技术研究了DADS/DATS 与G6PD 蛋白的相互作用机制。结果表明,DADS/DATS 均可部分抑制G6PD 的活性,且该抑制作用属于混合性抑制;DADS/DATS 均可使G6PD 蛋白产生内源荧光淬灭,且为静态淬灭;分子荧光光谱和3D/2D 分子对接技术共同揭示了DADS 与G6PD 以疏水作用和静电力相互作用,且以疏水作用为主,DATS 与G6PD 蛋白以疏水作用、静电力和氢键相互作用,且以氢键为主。

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